References

microbe

Проблемы особо опасных инфекций

Problems of Particularly Dangerous Infections

0370-10692658-719X

Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe”

10.21055/0370-1069-2018-4-15-19

microbe-1081

Research Article

ОБЗОРЫ

REVIEWS

Отряд Bunyavirales

Bunyavirales Order

https://orcid.org/0000-0001-8176-6582

Львов

Д. К.

Lvov

D. K.

Львов Дмитрий Константинович.

Москва.

Lvov Dmitry Konstantinovich.

Moscow.

dk_lvov@mail.ru

https://orcid.org/0000-0001-6913-5841

Альховский

С. В.

Alkhovsky

S. V.

Альховский Сергей Владимирович.

Москва.

Alkhovsky Sergey Vladimirovich.

Moscow.

salkh@ya.ru

Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского, ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологииимени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияD.I. Ivanovsky Institute of Virology, N.F. Gamaleya National Research Center on Microbiology and Epidemiology of Ministry of Health of the Russian FederationRussian Federation

2018

28122018

041519

2018

Львов Д.К., Альховский С.В.

Lvov D.K., Alkhovsky S.V.

Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.

This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.

https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1081

В 2017 г. Международным комитетом по таксономии вирусов (International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTY) установлен и утвержден новый отряд Bunyavirales, который объединил эволюционно связанные вирусы, чей геном представлен сегментированной линейной одноцепочечной рнк отрицательной или амбисенс (ambisense) полярности. В настоящее время отряд Bunyavirales включает 10 семейств вирусов, которые инфицируют позвоночных животных, беспозвоночных (членистоногие) и растения. На территории Северной Евразии изолировано не менее 41 зоонозного буньявируса, многие из которых имеют значение в патологии человека. В настоящем обзоре представлен состав семейств, входящих в порядок Bunyavirales, и представлен список зоонозных буньявирусов, циркулирующих на территории северной Евразии с указанием их современного таксономического положения. Большинство из них являются арбовирусами, экологически связанными с разными видами комаров или аргасовых и иксодовых клещей.

In 2017 the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTY) established and approved a new order Bunyavirales that unite evolutionary related viruses whose genome is represented by a segmented linear single-stranded RNA of negative or ambisense polarity. Currently, the order Bunyavirales includes 10 families that infect vertebrate animals, invertebrates (arthropods), and plants. At least 41 zoonotic bunyaviruses, including pathogenic for human, were isolated on the territory of Northern Eurasia. This review presents the data on the composition of the families belonging to the order Bunyavirales and a list of zoonotic bunyaviruses, isolated in Northern Eurasia, indicating their modern taxonomy. Most of them are arboviruses, associated with different species of mosquitoes or ticks.

Буньявирусытаксономия вирусовМеждународный комитет по таксономии вирусов

bunyavirusesvirus taxonomyInternational Committee on Taxonomy of Viruses

References1

Calisher C.H., Charrel R.N., Choi I.R., Clegg C.S., de la Torre J.C., Delwart E., DeRisi J.L., Di Bello P.L., Di Serio F., Digiaro M., Dolja V.V., Drosten C., Druciarek T.Z., Du J., Ebihara H., Elbeaino T., Gergerich R.C., Gillis A.N., Gonzalez J.J., Haenni A.L., Hepojoki J., HetZel U., Ho T., Hong N., Jain R.K., Jansen van Vuren P., Jin Q., Jonson M.G., Junglen S., Keller K.E., Kemp A., Kipar A., Kondov N.O., Koonin E.V., Kormelink R., Korzyukov Y, Krupovic M., Lambert A.J., Laney A.G., LeBreton M., Lukashevich I.S., Marklewitz M., Markotter W., Martelli G.P., Martin R.R., Mielke-Ehret N., Muhlbach H.P., Navarro B., Ng T.F.F., Nunes M.R.T., Palacios G., Pawqska J.T., Peters C.J., Plyusnin A., Radoshitzky S.R., Romanowski V, Salmenpera P., Salvato M.S., Sanfacon H., Sasaya T., Schmaljohn C., Schneider B.S., Shirako Y, Siddell S., Sironen T.A., Stenglein M.D., Storm N., Sudini H., Tesh R.B., Tzanetakis I.E., Uppala M., Vapalahti O., Vasilakis N., Walker P.J., Wang G., Wang L., Wang Y, Wei T., Wiley M.R., Wolf Y.I., Wolfe N.D., Wu Z., Xu W., Yang L., Yang Z., Yeh S.D., Zhang Y.Z., Zheng Y, Zhou X., Zhu C., Zirkel F., Kuhn J.H. Taxonomy of the family Arenaviridae and the order Bunyavirales: update 2018. Arch Virol. 2018; 163(8):2295-310. DOI: 10.1007/s00705-018-3843-5.

Calisher C.H., Charrel R.N., Choi I.R., Clegg C.S., de la Torre J.C., Delwart E., DeRisi J.L., Di Bello P.L., Di Serio F., Digiaro M., Dolja V.V., Drosten C., Druciarek T.Z., Du J., Ebihara H., Elbeaino T., Gergerich R.C., Gillis A.N., Gonzalez J.J., Haenni A.L., Hepojoki J., Hetzel U., Ho T., Hong N., Jain R.K., Jansen van Vuren P, Jin Q., Jonson M.G., Junglen S., Keller K.E., Kemp A., Kipar A., Kondov N.O., Koonin E.V., Kormelink R., Korzyukov Y, Krupovic M., Lambert A.J., Laney A.G., LeBreton M., Lukashevich I.S., Marklewitz M., Markotter W., Martelli G.P., Martin R.R., Mielke-Ehret N., Muhlbach H.P, Navarro B., Ng T.F.F., Nunes M.R.T., Palacios G., Pawqska J.T., Peters C.J., Plyusnin A., Radoshitzky S.R., Romanowski V., Salmenpera P, Salvato M.S., Sanfacon H., Sasaya T., Schmaljohn C., Schneider B.S., Shirako Y, Siddell S., Sironen T.A., Stenglein M.D., Storm N., Sudini H., Tesh R.B., Tzanetakis I.E., Uppala M., Vapalahti O., Vasilakis N., Walker P.J., Wang G., Wang L., Wang Y, Wei T., Wiley M.R., Wolf Y.I., Wolfe N.D., Wu Z., Xu W., Yang L., Yang Z., Yeh S.D., Zhang Y.Z., Zheng Y, Zhou X., Zhu C., Zirkel F., Kuhn J.H. Taxonomy of the family Arenaviridae and the order Bunyavirales: update 2018. Arch Virol. 2018; 163(8):2295-310. DOI: 10.1007/s00705-018-3843-5.

Plyusnin A., Beaty B.J., Elliot R.M., Goldbach R., Kormelink R., Lundkvist A. Family Bunyaviridae. In: A.M. King, M.J. Adams, E.B. Carstens, E.J. Lefkowitz, eds. Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London: Elsevier; 2012. P. 725-41.

Marklewitz M., Zirkel F., Rwego I.B., Heidemann H., Trippner P., Kurth A., Kallies R., Briese T., Lipkin W.I., Drosten C., Gillespie T.R., Junglen S. Discovery of a unique novel clade of mosquito-associated bunyaviruses. J. Virol. 2013; 87(23):12850-65. DOI: 10.1128/JVI.01862-13.

Marklewitz M., Zirkel F., Rwego I.B., Heidemann H., Trippner P, Kurth A., Kallies R., Briese T., Lipkin W.I Drosten C., Gillespie T.R., Junglen S. Discovery of a unique novel clade of mosquito-associated bunyaviruses. J. Virol. 2013; 87(23):12850-65. DOI: 10.1128/JVI.01862-13.

Li C.X., Shi M., Tian J.H., Lin X.D., Kang Y.J., Chen L.J., Qin X.C., Xu J., Holmes E.C., Zhang Y.Z. Unprecedented genomic diversity of RNA viruses in arthropods reveals the ancestry of negative-sense RNA viruses. Elife. 2015; 4:e05378. DOI: 10.7554/eLife.05378.

Jansen van Vuren P., Wiley M.R., Palacios G., Storm N., Markotter W., Birkhead M., Kemp A., Paweska J.T. Isolation of a novel orthobunyavirus from bat flies (Eucampsipoda africana). J. Gen Virol. 2017; 98(5):935-45. DOI: 10.1099/jgv.0.000753.

Jansen van Vuren P, Wiley M.R., Palacios G., Storm N., Markotter W., Birkhead M., Kemp A., Paweska J.T. Isolation of a novel orthobunyavirus from bat flies (Eucampsipoda africana). J. Gen Virol. 2017; 98(5):935—45. DOI: 10.1099/jgv.0.000753.

Лаврентьев М.В., Прилипов А.Г, Львов С.Д., Львов Д.К. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей штаммов вируса Хатанга - нового представителя серокомплекса Калифорнийского энцефалита, изолированных в различных регионах Российской Федерации. Вопросы вирусологии. 2008; 53(6):25-9.

Lavrent'ev M.V., Prilipov A.G., L'Vov S D., L'Vov D K. Phylogenetic analysis of the nucleotide sequences of Chatanga virus strains, the new representative of California encephalitis serocomplex, isolated in different regions of the Russian Federation. Voprosy Virusologii. 2008; 53(6):25-9.

Lvov D.K., Shchelkanov M.Y, Alkhovsky S.V., Deryabin P.G. Zoonotic viruses of Northern Eurasia. Taxonomy and Ecology. London: Academic Press; 2015. 452 p.

Lvov D.K., Shchelkanov M.Y., Alkhovsky S.V., Deryabin P.G. Zoonotic viruses of Northern Eurasia. Taxonomy and Ecology. London: Academic Press; 2015. 452 p.

Shirako Y., Falk B.W., Haenni A.L. Genus - Tenuivirus. In: A.M.Q. King, M.J. Adams, E.B. Carstens, E.J. Lefkowitz, eds. Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. San Diego: Elsevier Academic Press; 2012. P. 771-6.

Marklewitz M., Handrick S., Grasse W., Kurth A., Lukashev A., Drosten C., Ellerbrok H., Leendertz F.H., Pauli G., Junglen S. Gouleako virus isolated from West African mosquitoes constitutes a proposed novel genus in the family Bunyaviridae. J. Virol. 2011; 85(17):9227-34. DOI: 10.1128/JVI.00230-11.

Ballinger M.J., Bruenn J.A., Hay J., Czechowski D., Taylor D.J. Discovery and evolution of bunyavirids in arctic phantom midges and ancient bunyavirid-like sequences in insect genomes. J. Virol. 2014; 88(16):8783-94.

Muhlbach H.P., Mielke-Ehret N. Genus - Emaravirus. In: A.M.Q. King, M.J. Adams, E.B. Carstens, E.J. Lefkowitz, eds. Virus Taxonomy. San Diego: Elsevier; 2012. P 767-69.

Muhlbach H.P., Mielke-Ehret N. Genus - Emaravirus. In: A.M.Q. King, M.J. Adams, E.B. Carstens, E.J. Lefkowitz, eds. Virus Taxonomy. San Diego: Elsevier; 2012. P. 767-69.

Marklewitz M., Zirkel F., Kurth A., Drosten C., Junglen S. Evolutionary and phenotypic analysis of live virus isolates suggests arthropod origin of a pathogenic RNA virus family. Proc. Natl Acad Sci USA. 2015; 112(24):7536-41.

Di Bello PL., Laney A.G., Druciarek T., Ho T., Gergerich R.C., Keller K.E., Martin R.R., Tzanetakis I.E. A novel emaravirus is associated with redbud yellow ringspot disease. Virus Res. 2016; 222:41-7. DOI: 10.1016/j.virusres.2016.05.027.

Di Bello P.L., Laney A.G., Druciarek T., Ho T., Gergerich R.C., Keller K.E., Martin R.R., Tzanetakis I.E. A novel emaravirus is associated with redbud yellow ringspot disease. Virus Res. 2016; 222:41-7. DOI: 10.1016/j.virusres.2016.05.027.

Elbeaino T., Digiaro M., Uppala M., Sudini H. Deep sequencing of dsRNAs recovered from mosaic-diseased pigeonpea reveals the presence of a novel emaravirus: pigeonpea sterility mosaic virus 2. Arch. Virol. 2015; 160(8):2019-29.

Elbeaino T., Digiaro M., Uppala M., Sudini H. Deep se-quencing of dsRNAs recovered from mosaic-diseased pigeonpea reveals the presence of a novel emaravirus: pigeonpea sterility mosaic virus 2. Arch. Virol. 2015; 160(8):2019-29

Zheng Y., Navarro B., Wang G., Wang Y, Yang Z., Xu W., Zhu C., Wang L., Serio F.D., Hong N. Actinidia chlorotic ringspot-associated virus: a novel emaravirus infecting kiwifruit plants. Mol. Plant. Pathol. 2017; 18(4):569-81. DOI: 10.1111/mpp.12421.

Arai S., Kang H.J., Gu S.H., Ohdachi S.D., Cook J.A., Yashina L.N., Tanaka-Taya K., Abramov S.A., Morikawa S., Okabe N., Oishi K., Yanagihara R. Genetic Diversity of Artybash Virus in the Laxmann's Shrew (Sorex caecutiens). Vector Borne Zoonotic Dis. 2016; 16(7):468-75. DOI: 10.1089/vbz.2015.1903.

Arai S., Kang H.J., Gu S.H., Ohdachi SiD., Cook J.A., Yashina L.N., Tanaka-Taya K., Abramov S.A., Morikawa S., Okabe N., Oishi K., Yanagihara R. Genetic Diversity of Artybash Virus in the Laxmann’s Shrew (Sorex caecutiens). Vector Borne Zoonotic Dis. 2016; 160:468-75. DOI: 10.1089/vbz.2015.1903.

Tkachenko E.A., Witkowski P.T., Radosa L., Dzagurova T.K., Okulova N.M., Yunicheva Y.V., Vasilenko L., Morozov VG., Malkin G.A., Kruger D.H., Klempa B. Adler hantavirus, a new genetic variant of Tula virus identified in Major's pine voles (Microtus majori) sampled in southern European Russia. Infect. Genet. Evol. 2015; 29:156-63. DOI: 10.1016/j.meegid.2014.11.018.

Tkachenko E.A., Witkowski PT., Radosa L., Dzagurova T.K., Okulova N.M., Yunicheva Y.V., Vasilenko L., Morozov VG., Malkin G.A., Kruger D.H., Klempa B. Adler hantavirus, a new genetic variant of Tula virus identified in Major’s pine voles (Microtus majori) sampled in southern European Russia. Infect. Genet. Evol. 2015; 29:156-63. DOI: 10.1016/j.meegid.2014.11.018.

Dzagurova T.K., Witkowski P.T., Tkachenko E.A., Klempa B., Morozov V.G., Auste B., Zavora D.L., Iunicheva I.V., Mutnih E.S., Kruger D.H. Isolation of sochi virus from a fatal case of hantavirus disease with fulminant clinical course. Clin. Infect. Dis. 2012; 54(1):e1-4. DOI: 10.1093/cid/cir746.

Dzagurova T.K., Witkowski PT., Tkachenko E.A., Klempa B., Morozov V.G., Auste B., Zavora D.L., Iunicheva I.V., Mutnih E.S., Kruger D.H. Isolation of sochi virus from a fatal case of hanta¬virus disease with fulminant clinical course. Clin. Infect. Dis. 2012; 54(1):e1-4. DOI: 10.1093/cid/cir746.

Ткаченко Е.А., Дзагурова Т.К., Ткаченко П.Е. Хантавирусы: экология, молекулярная биология, морфология, патогенез и диагностика хантавирусных инфекций. Молекулярная медицина. 2009; (5):36—41.

Tkachenko E.A., Dzagurova T.K., Tkachenko PE. Hantaviruses: ecology, molecular biology, morphology, pathogenesis and diagnostics of hantavirus infections. Molekulyarnaya meditsina. 2009; (5):36-41.

Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchetinin A.M., Deriabin P.G., Shchelkanov M.Y, Aristova V.A. Morozova T.N., Gitelman A.K., Palacios G.F., Kuhn J.H. Complete Genome Coding Sequences of Artashat, Burana, Caspiy, Chim, Geran Tamdy, and Uzun-Agach Viruses (Bunyavirales: Nairoviridae: Orthonairovirus). Genome Announc. 2017; 5(40):e01098-17. DOI: 10.1128/genomeA.01098-17.

Alkhovsky S.V., Lvov D.K., Shchetinin A.M., Deriabin P.G., Shchelkanov M.Y, Aristova V.A. Morozova T.N., Gitelman A.K., Palacios G.F., Kuhn J.H. Complete Genome Coding Sequences of Artashat, Burana, Caspiy, Chim, Geran, Tamdy, and Uzun-Agach Viruses (Bunyavirales: Nairoviridae: Orthonairovirus). Genome Announc. 2017; 5(40):e01098-17. DOI: 10.1128/genomeA.01098-17.

Щетинин А.М., Львов Д.К., Альховский C.B., Щелканов М.Ю., Аристова В.А., Морозова Т.Н., Гительман А.К., Дерябин П.Г., Ботиков А.Г. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов вируса Батаи (BATV-Bataivirus) и ново¬го вируса Анадырь (ANADV - Anadyr virus) группы Буньямвера (Bunyaviridae, Orthobunyavirus), выделенных на территории России. Вопросы вирусологии. 2014; 59(6):16-22.

Shchetinin A.M., L’vov D.K., Al’hovsky S.V., Shchelkanov M.YU., Aristova V.A., Morozova T.N., Gitel’man A.K., Deryabin P.G., Botikov A.G. Complete genome analysis of the Batai virus (BATV) and the new Anadyr virus (ANADV) of the Bunyamwera group (Bunyaviridae, Orthobunyavirus) isolated in Russia. Voprosy Virusologii. 2014; 59(6):16-22

Альховский С.В., Щетинин А.М., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Дерябин П.Г., Львов Д.Н., Самохвалов Е.И., Гительман А.К., Ботиков А.Г. Вирус Хурдун (KHURV): новый вирус рода Orthobunyavirus (Bunyaviridae). Вопросы вирусологии. 2013; 58(4):10-3.

Al’kovskhovskii S.V., Shchetinin A.M., L’Vov D.K., Shchelkanov M.I., Deriabin P.G., L’Vov D.N., Samokhvalov E.I., Gitel’man A.K., Botikov A.G. The Khurdun virus (KHURV): a new representative of the orthobunyavirus (Bunyaviridae). Voprosy virusologii. 2013; 58(4):10-3.

Palacios G., Savji N., Travassos da Rosa A., Guzman H., Yu X., Desai A., Rosen G.E., Hutchison S., Lipkin W.I., Tesh R. Characterization of the Uukuniemi virus group (Phlebovirus: Bunyaviridae): evidence for seven distinct species. J. Virol. 2013; 87(6):3187-95. DOI: 10.1128/JVI.02719-12.

Palacios G., Tesh R.B., Savji N., Travassos da Rosa A.P., Guzman H., Bussetti A.V., Desai A., Ladner J., Sanchez-Seco M., Lipkin W.I. Characterization of the Sandfly fever Naples species complex and description of a new Karimabad species complex (genus Phlebovirus, family Bunyaviridae). J. Gen. Virol. 2014; 95(Pt 2):292-300. DOI: 10.1099/vir.0.056614-0.

Dilcher M., Alves M.J., Finkeisen D., Hufert F., Weidmann M. Genetic characterization of Bhanja virus and Palma virus, two tick-borne phleboviruses. Virus Genes. 2012; 45(2):311-5.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.