microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2019-1-42-49microbe-1124Research ArticleОБЗОРЫREVIEWSОбзор эпидемиологической ситуации по высокопатогенному вирусу гриппа птиц в России в 2018 г.Overview of the Epidemiological Situation on Highly Pathogenic Avian Influenza Virus in Russia in 2018МарченкоВ. Ю.MarchenkoV. Yu.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

marchenko_vyu@vector.nsc.ruГончароваН. И.GoncharovaN. I.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

ЕвсеенкоВ. А.EvseenkoV. A.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

СуслопаровИ. М.SusloparovI. M.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

ГавриловаЕ. В.GavrilovaE. V.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

МаксютовР. А.MaksyutovR. A.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

РыжиковА. Б.RyzhikovA. B.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»РоссияState Scientific Center of Virology and Biotechnology “Vector” of the RospotrebnadzorRussian Federation201902042019014249Copyright © Марченко В.Ю., Гончарова Н.И., Евсеенко В.А., Суслопаров И.М., Гаврилова Е.В., Максютов Р.А., Рыжиков А.Б., 20192019Марченко В.Ю., Гончарова Н.И., Евсеенко В.А., Суслопаров И.М., Гаврилова Е.В., Максютов Р.А., Рыжиков А.Б.Marchenko V.Y., Goncharova N.I., Evseenko V.A., Susloparov I.M., Gavrilova E.V., Maksyutov R.A., Ryzhikov A.B.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1124

Рассмотрена современная эпидемиологическая ситуация по высокопатогенному вирусу гриппа птиц в 2018 г. и сделан прогноз возможного дальнейшего распространения вирусов на территории России. В 2018 г. в России складывалась неблагополучная эпидемиологическая ситуация по высокопатогенному гриппу птиц. Это связано с распространением вирусов клады 2.3.4.4, которые продолжили вызывать множественные вспышки гриппа среди сельскохозяйственной птицы в Европейской части России. Помимо этого, в ходе мониторинга вируса на территории Саратовской области впервые в России зарегистрирована циркуляция вируса гриппа A/H5N6 клады 2.3.4.4. Весной 2018 г. в Приморском крае и Амурской области впервые также зарегистрирована циркуляция двух различных генетических линий вируса гриппа A/H9N2, которые выделены во время вспышек на территории нескольких птицефабрик. Впоследствии данный субтип вируса продолжил распространяться в России, что зафиксировано детекцией вируса гриппа A/H9N2 у диких птиц на территории Хабаровского края и Томской области. Таким образом, в очередной раз показано, что территория России играет важную географическую роль в распространениивируса гриппа птиц. 

Analyzed was modern epidemiological situation on highly pathogenic avian flu in 2018. Prognosis for possible further distribution of viruses in the territory of Russia was made. In 2018, the situation on highly pathogenic avian flu in Russia was challenging. This was due to the spread of the viruses clade 2.3.4.4, which caused multiple outbreaks among wild birds and poultry in European part of Russia. In addition, A/H5N6 avian influenza virus circulation was for the first time detected in the Saratov Region during routine avian influenza virus surveillance. In May, 2018 two different lineages of avian influenza A/H9N2 were isolated during the outbreaks that occurred at several poultry plants in Primorsk Territory and Amur Region of Russia. Subsequently, that virus subtype continued spreading in Russia, which was recorded by detection of the A/H9N2 influenza virus in wild birds in the Khabarovsk and Tomsk Regions of Russia. Thus, it is shown yet again that the territory of Russia plays an  important geographical role in the spread of avian influenza viruses.

вирус гриппа птицмониторингвспышкиH5N8H5N6H9N2Россияavian influenza virussurveillanceoutbreaksH5N6H5N8H9N2RussiaReferencesKrammer F., Smith G.J.D., Fouchier R.A.M., Peiris M., Kedzierska K., Doherty P.C., Palese P., Shaw M.L., Treanor J., Webster R.G., García-Sastre A. Influenza. Nat. Rev. Dis. Primers. 2018; 4(1):3. DOI: 10.1038/s41572-018-0002-y.Krammer F., Smith G.J.D., Fouchier R.A.M., Peiris M., Kedzierska K., Doherty P.C., Palese P., Shaw M.L., Treanor J., Webster R.G., García-Sastre A. Influenza. Nat. Rev. Dis. Primers. 2018; 4(1):3. DOI: 10.1038/s41572-018-0002-y.Tong S., Li Y., Rivailler P., Conrardy C., Castillo D.A., Chen L-M., Recuenco S., Ellison J.A., Davis C.T., York I.A., Turmelle A.S., Moran D., Rogers S., Shi M., Tao Y., Weil M.R., Tang K., Rowe L.A., Sammons S., Xu X., Frace M., Lindblade K.A., Cox N.J., Anderson L.J., Rupprecht C.E., Donis R.O. A distinct lineage of influenza A virus from bats. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2012; 109(11):4269–74. DOI: 10.1073/pnas.1116200109.Tong S., Li Y., Rivailler P., Conrardy C., Castillo D.A., Chen L-M., Recuenco S., Ellison J.A., Davis C.T., York I.A., Turmelle A.S., Moran D., Rogers S., Shi M., Tao Y., Weil M.R., Tang K., Rowe L.A., Sammons S., Xu X., Frace M., Lindblade K.A., Cox N.J., Anderson L.J., Rupprecht C.E., Donis R.O. A distinct lineage of influenza A virus from bats. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2012; 109(11):4269–74. DOI: 10.1073/pnas.1116200109.Tong S., Zhu X., Li Y., Shi M., Zhang J., Bourgeois M., Yang H., Chen X., Recuenco S., Gomez J., Chen L-M., Johnson A, Tao Y., Dreyfus C., Yu W., McBride R., Carney P.J., Gilbert A.T., Chang J., Guo Z., Davis C.T., Paulson J.C., Stevens J., Rupprecht C.E., Holmes E.C., Wilson I.A., Donis R.O. New World Bats Harbor Diverse Influenza A Viruses. PLoS Pathog. 2013; 9(10):e1003657. DOI: 10.1371/journal.ppat.1003657.Tong S., Zhu X., Li Y., Shi M., Zhang J., Bourgeois M., Yang H., Chen X., Recuenco S., Gomez J., Chen L-M., Johnson A, Tao Y., Dreyfus C., Yu W., McBride R., Carney P.J., Gilbert A.T., Chang J., Guo Z., Davis C.T., Paulson J.C., Stevens J., Rupprecht C.E., Holmes E.C., Wilson I.A., Donis R.O. New World Bats Harbor Diverse Influenza A Viruses. PLoS Pathog. 2013; 9(10):e1003657. DOI: 10.1371/journal.ppat.1003657.Olsen B., Munster V.J., Wallensten A., Waldenström J., Osterhaus A.D., Fouchier R.A. Global patterns of influenza a virus in wild birds. Science. 2006; 312(5772):384–8. DOI: 10.1126/science.1122438.Olsen B., Munster V.J., Wallensten A., Waldenström J., Osterhaus A.D., Fouchier R.A. Global patterns of influenza a virus in wild birds. Science. 2006; 312(5772):384–8. DOI: 10.1126/science.1122438.Webster R.G., Bean W.J., Gorman O.T., Chambers T.M., Kawaoka Y. Evolution and ecology of influenza A viruses. Microbiol Rev. 1992; 56(1):152–79. PMID: 1579108. PMCID: PMC372859.Webster R.G., Bean W.J., Gorman O.T., Chambers T.M., Kawaoka Y. Evolution and ecology of influenza A viruses. Microbiol Rev. 1992; 56(1):152–79. PMID: 1579108. PMCID: PMC372859.Yoon S.W., Webby R.J., Webster R.G. Evolution and ecology of influenza A viruses. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 2014; 385:359–75. DOI: 10.1007/82_2014_396.Yoon S.W., Webby R.J., Webster R.G. Evolution and ecology of influenza A viruses. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 2014; 385:359–75. DOI: 10.1007/82_2014_396.Toward a Unified Nomenclature System for Highly Pathogenic Avian Influenza Virus (H5N1). WHO, OIE, FAO, H5N1 Evolution Working Group. Emerg. Infect. Dis. 2008; 14(7):e1. DOI: 10.3201/eid1407.071681.Toward a Unified Nomenclature System for Highly Pathogenic Avian Influenza Virus (H5N1). WHO, OIE, FAO, H5N1 Evolution Working Group. Emerg. Infect. Dis. 2008; 14(7):e1. DOI: 10.3201/eid1407.071681.Xu X., Subbarao K., Cox N.J., Guo Y. Genetic characterization of the pathogenic influenza A/Goose/Guangdong/1/96 (H5N1) virus: similarity of its hemagglutinin gene to those of H5N1 viruses from the 1997 outbreaks in Hong Kong. Virology 1999; 261(1):15–9. DOI: 10.1006/viro.1999.9820.Xu X., Subbarao K., Cox N.J., Guo Y. Genetic characterization of the pathogenic influenza A/Goose/Guangdong/1/96 (H5N1) virus: similarity of its hemagglutinin gene to those of H5N1 viruses from the 1997 outbreaks in Hong Kong. Virology 1999; 261(1):15–9. DOI: 10.1006/viro.1999.9820.Cumulative number of confirmed human cases of avian influenza A(H5N1) reported to WHO. World Health Organization (WHO). [Электронный ресурс]. URL: https://www.who.int/influenza/human_animal_interface/H5N1_cumulative_table_archives/en/ (дата обращения: 21.01.2019 г.).Cumulative number of confirmed human cases of avian influenza A(H5N1) reported to WHO. World Health Organization (WHO). [Internet]. (Cited 21 Jan 2019). Available from: https://www.who.int/influenza/human_animal_interface/H5N1_cumulative_table_archives/en/.Adlhoch С., Brouwer A., Kuiken T., Miteva A., Mulatti P., Smietanka K., Staubach C., Gogin A., Muñoz Guajardo I., Baldinelli F. Avian influenza overview August–November 2018. EFSA Journal. 16(12):e05573. DOI: 10.2903/j.efsa.2018.5573.Adlhoch С., Brouwer A., Kuiken T., Miteva A., Mulatti P., Smietanka K., Staubach C., Gogin A., Muñoz Guajardo I., Baldinelli F. Avian influenza overview August–November 2018. EFSA Journal. 16(12):e05573. DOI: 10.2903/j.efsa.2018.5573.Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza viruses and candidate vaccine viruses developed for potential use in human vaccines. World Health Organization (WHO). [Электронный ресурс]. URL: https://www.who.int/influenza/vaccines/virus/201809_zoonotic_vaccinevirusupdate.pdf?ua=1 (дата обращения: 21.01.2019 г.).Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza viruses and candidate vaccine viruses developed for potential use in human vaccines. World Health Organization (WHO). [Internet]. (Cited 21 Jan 2019). Available from: https://www.who.int/influenza/vaccines/virus/201809_zoonotic_vaccinevirusupdate.pdf?ua=1.Марченко В.Ю., Суслопаров И.М., Игнатьев В.Э., Гаврилова Е.В., Максютов Р.А., Рыжиков А.Б. Обзор ситуации по высокопатогенному вирусу гриппа птиц субтипа H5 в России в 2016–2017 гг. Проблемы особо опасных инфекций. 2018; 1:30–35. DOI: 10.21055/0370-1069-2018-1-30-35.Marchenko V.Yu., Susloparov I.M., Ignat’ev V.E., Gavrilova E.V., Maksyutov R.A., Ryzhikov A.B. [Overview of the situation on highly pathogenic avian influenza virus H5 in Russia in 2016–2017]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2018; 1:30–5. DOI: 10.21055/0370-1069-2018-1-30-35.Update on highly pathogenic avian influenza in animals (types h5 and h7). World organization for animal health (OIE). Paris: OIE; 2018. [Электронный ресурс]. URL: http://www.oie.int/en/animal-health-in-the-world/update-on-avian-influenza/2018/ (дата обращения: 21.01.2019 г.).Update on highly pathogenic avian influenza in animals (types h5 and h7). World organization for animal health (OIE). Paris: OIE; 2018. [Internet]. (Cited 21 Jan 2019). Available from: http://www.oie.int/en/animal-health-in-the-world/update-on-avianinfluenza/2018/.H7N9 situation update. Food and Agriculture Organization of the United Nation (FAO). [Электронный ресурс] URL: http://www.fao.org/ag/againfo/programmes/en/empres/H7N9/situation_update.html (дата обращения: 21.01.2019).H7N9 situation update. Food and Agriculture Organization of the United Nation (FAO). [Internet]. (Cited 21 Jan 2019). Available from: http://www.fao.org/ag/againfo/programmes/en/empres/H7N9/situation_update.html.Human infection with avian influenza A(H7N9) virus –China: Update. World Health Organization (WHO). [Электронный ресурс]. URL: https://www.who.int/csr/don/05-september-2018-ah7n9-china/en/ (дата обращения: 21.01.2019 г.).Human infection with avian influenza A(H7N9) virus – China: Update. World Health Organization (WHO). [Internet]. (Cited 21 Jan 2019). Available from: https://www.who.int/csr/don/05-september-2018-ah7n9-china/en/.Marchenko V., Goncharova N., Susloparov I., Kolosova N., Gudymo A., Svyatchenko S., Danilenko A., Durymanov A., Gavrilova E., Maksyutov R., Ryzhikov A. Isolation and characterization of H5Nx highly pathogenic avian influenza viruses of clade 2.3.4.4 in Russia. Virology. 2018; 525:216–23. DOI: 10.1016/j.virol.2018.09.024.Marchenko V., Goncharova N., Susloparov I., Kolosova N., Gudymo A., Svyatchenko S., Danilenko A., Durymanov A., Gavrilova E., Maksyutov R., Ryzhikov A. Isolation and characterization of H5Nx highly pathogenic avian influenza viruses of clade 2.3.4.4 in Russia. Virology. 2018; 525:216–23. DOI: 10.1016/j.virol.2018.09.024.Волков М.С., Ирза В.Н., Варкентин А.В. Опыт ликвидации высокопатогенного гриппа птиц на территории Российской Федерации в 2016–2017 гг. Ветеринария сегодня. 2018; 1:3–10. DOI: 10.29326/2304-196X-2018-1-24-3-7.Volkov M.S., Irza V.N., Varkentin A.V. [History of Highly Pathogenic Avian Influenza Eradication in the Russian Federation in 2016–2017]. Veterinariya Segodnya. (Veterinary Science Today). 2018; (1):3–10. (In Russ.). DOI: 10.29326/2304-196X-2018-1-24-3-7.Update on highly pathogenic avian influenza in animals (types h5 and h7). World organization for animal health (OIE). Paris: OIE; 2019. [Электронный ресурс]. URL: http://www.oie.int/en/animal-health-in-the-world/update-on-avian-influenza/2019/ (дата обращения: 21.01.2019 г.).Update on highly pathogenic avian influenza in animals (types h5 and h7). World organization for animal health (OIE). Paris: OIE; 2019. [Internet]. (Cited 21 Jan 2019). Available from: http://www.oie.int/en/animal-health-in-the-world/update-on-avianinfluenza/2019/.Whitworth D., Newman S.H., Mundkur T., Harris P. Wild Birds and Avian Influenza: an introduction to applied field research and disease sampling techniques. FAO Animal Production and Health Manual. Rome; 2007. No. 5. 120 p.Whitworth D., Newman S.H., Mundkur T., Harris P. Wild Birds and Avian Influenza: an introduction to applied field research and disease sampling techniques. FAO Animal Production and Health Manual. Rome; 2007. No. 5. 120 p.Verhagen J.H., Herfst S., Fouchier R.A.M. How a virus travels the world. Science. 2015; 347(6222):616–7. DOI: 10.1126/science.aaa6724.Verhagen J.H., Herfst S., Fouchier R.A.M. How a virus travels the world. Science. 2015; 347(6222):616–7. DOI: 10.1126/science.aaa6724.Veen J., Yurlov A.K., Delany S.N., Mihantiev A.I., Selivanova M.A., Boere G.C. An atlas of movements of Southwest Siberian waterbirds. Wetlands International; 2005. P. 60. [Электронный ресурс]. URL: http://gull-research.org/barabensis/imagesross1/atlas_SE_siberinan_waterbirds_2.pdf (дата обращения: 21.01.2019 г.).Veen J., Yurlov A.K., Delany S.N., Mihantiev A.I., Selivanova M.A., Boere G.C. An atlas of movements of Southwest Siberian waterbirds. Wetlands International; 2005. P. 60. [Internet]. (Cited 21 Jan 2019). Available from: http://gull-research.org/barabensis/imagesross1/atlas_SE_siberinan_waterbirds_2.pdf.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.