microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2019-4-102-108microbe-1221Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESМолекулярная эпидемиология патогенных хантавирусов на Дальнем Востоке России, 2015-2018 гг.Molecular Epidemiology of Pathogenic Hantaviruses in the Far East of Russia, 2015-2018ЯшинаЛ. Н.YashinaL. N.

Яшина Людмила Николаевна.

630559, Новосибирская обл., п. Кольцово.

Lyudmila N. Yashina.

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559.

vector@vector.nsc.ruСметанниковаН. А.SmetannikovaN. A.

630559, Новосибирская обл., п. Кольцово.

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559.

vector@vector.nsc.ruКомпанецГ. Г.KompanetsG. G.

Владивосток, Сельская, 1.

1, Selskaya St., Vladivostok.

ЗдановскаяН. И.ZdanovskayaN. I.

680031, Хабаровск, Санитарный пер., 7.

7, Sanytarny Lany, Khabarovsk, 680031.

chum@chum.khv.ruИвановЛ. И.IvanovL. I.

680031, Хабаровск, Санитарный пер., 7.

7, Sanytarny Lany, Khabarovsk, 680031.

chum@chum.khv.ruГосударственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»РоссияState Scientific Centre of Virology and Biotechnology “Vector”Russian FederationНаучно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. СомоваРоссияG.P. Somov Research Institute of Epidemiology and MicrobiologyRussian FederationХабаровская противочумная станцияРоссияKhabarovsk Plague Control StationRussian Federation20191801202004102108Copyright © Яшина Л.Н., Сметанникова Н.А., Компанец Г.Г., Здановская Н.И., Иванов Л.И., 20202020Яшина Л.Н., Сметанникова Н.А., Компанец Г.Г., Здановская Н.И., Иванов Л.И.Yashina L.N., Smetannikova N.A., Kompanets G.G., Zdanovskaya N.I., Ivanov L.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1221

Патогенные хантавирусы, принадлежащие к семейству Hantaviridae рода Orthohantavirus, широко распространены во многих регионах мира и являются возбудителями геморрагической лихорадки с почечным синдромом (ГЛПС) в Европе и Азии. на Дальнем Востоке России возбудителями ГЛПС являются три хантавируса: Хантаан (HTNV), Амур (AMRV) и Сеул (SEOV) - при этом в регионе циркулирует еще семь хантавирусов, значение которых в патологии человека остается неисследованным. Цель работы - генетическое типирование возбудителей ГЛПС, циркулировавших на Дальнем Востоке России в 2015-2018 гг. Материалы и методы. Для исследования использована кровь 64 больных ГЛПС, проживающих на территории Еврейской АО, Приморского и Хабаровского краев. все образцы проанализированы методом обратной транскрипции - полимеразной цепной реакции с последующим секвенированием и филогенетическим анализом. Результаты и обсуждение. Генотипированы 19 РНК изолятов хантавирусов от больных ГЛПС. Возбудителями заболевания явились три патогенных хантавируса: HTNV (13 РНК изолятов), AMRV (3 изолята), SEOV (3 изолята). Установлено, что среди исследованных образцов вирус HTNV представлен тремя генетическими вариантами, вирус AMRV - двумя вариантами, вирус SEOV - одним вариантом, более близким к штаммам из Юго-Восточной Азии, чем из приграничных стран.

Human pathogenic hantaviruses, belonging to the family Hantaviridae, genus Orthohantavirus, are disseminated worldwide and cause hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS) in Europe and Asia. In the Far East of Russia Hantaan (HTNV), Amur (AMRV) and Seoul (SEOV) viruses are etiologic agent of HFRS, while the human pathogenic potential of other seven hantaviruses, circulating in this region, has not been researched adequately yet. Objective of the study was genetic identification of hantaviruses, associated with HFRS in the Far East of Russia during 2015-2018. Materials and methods. Blood samples of 64 HFRS patients from Jewish Autonomous Region, Khabarovsk and Primorsky Territories were analyzed for hantavirus RNA using reverse transcription polymerase chain reaction. Results and discussion. A total of 19 viral RNA isolates from HFRS patients were genetically typed. Etiologic agents of HFRS were three pathogenic hantaviruses: HTNV (13 isolates), AMRV (3 isolates), SEOV (3 isolates). Three genetic lineages were identified among HTNV, two lineages among AMRV One genetic variant of SEOV virus was identified among HFRS patients, which was more close to the strains from South-Eastern Asia than to those from the neighboring countries.

хантавирусГЛПСДальний ВостокhantavirusHFRSFar EastReferencesJonsson C.B., Figueiredo L.T.M., Vapalahti O. A global perspective on hantavirus ecology, epidemiology, and disease. Clin. Microbiol. Rev. 2010; 23(2):412-41. DOI: 10.1128/CMR.00062-09.Jonsson C.B., Figueiredo L.T.M., Vapalahti O. A global perspective on hantavirus ecology, epidemiology, and disease. Clin. Microbiol. Rev. 2010; 23(2):412-41. DOI: 10.1128/CMR.00062-09.Ткаченко Е.А., Бернштейн А.Д, Дзагурова Т.К., Башкирцев В.Н., Седова Н.С., Малкин А.Е., Горбачкова Е.А., Балакирев А.Е., Дроздов С.Г., Сикора И.В., Щукина И.А., Савельев С.И., Богатова И.С., Транквилевский Д.В., Чубирко М.И., Торубарова Е.С., Нургалеева Р.Г., Минин Г.Д., Загидуллин И.М., Иванова А.А., Жуков В.И., Морозов С.Г., Хайбулина С.Ф., Морзунов С.П. Сравнительный анализ эпидемических вспышек геморрагической лихорадки с почечным синдромом, вызванных вирусами Пуумала и Добрава/Белград. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2005; 4:28-34.Tkachenko E.A., Bernshtein A.D., Dzagurova T.K., Bashkirtsev V.N., Sedova N.S., Malkin A.E., Gorbachkova E.A., Balakirev A.E., Drozdov S.G., Sikora I.V., Shchukina I.A., Savel’ev S.I., Bogatova I.S., Trankvilevsky D.V., Chubirko M.I., Torubarova E.S., Nurgaleeva R.G., Minin G.D., Zagidullin I.M., Ivanova A.A., Zhukov V.I., Morozov S.G., Haibulina S.F., Morzunov S.P. [Comparative analysis of epidemic outbreaks of hemorrhagic fever with renal syndrome, caused by Puumula, and Dobrava/Belgrade viruses]. Epidemiologiya i Vaktsinoprofilaktika [Epidemiology and Vaccinal Prevention]. 2005; 4:28-34.Klempa B., Tkachenko E.A., Dzagurova T.K., Yunicheva Y.V., Morozov V.G., Okulova N.M., Slyusarenko G.P., Smirnov A., Kruger D.H. Hemorrhagic fever with renal syndrome caused by 2 lineages of Dobrava hantavirus, Russia. Emerg. Inf Dis. 2008; 14(4):617-25. DOI: 10.3201/eid1404.071310.Klempa B., Tkachenko E.A., Dzagurova T.K., Yunicheva Y.V., Morozov V.G., Okulova N.M., Slyusarenko G.P, Smirnov A., Kruger D.H. Hemorrhagic fever with renal syndrome caused by 2 lineages of Dobrava hantavirus, Russia. Emerg. Inf Dis. 2008; 14(4):617-25. DOI: 10.3201/eid1404.071310.Слонова Р.А., Кушнарева Т.В., Компанец Г.Г., Максема И.Г., Симонова Т.Л., Симонов С.Б. Хантавирусная инфекция в Приморском крае - эпидемиологическая ситуация в очагах циркуляции разных серотипов вируса. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2006; S3:74-7.Slonova R.A., Kushnareva T.V., Kompanets G.G., Maksema I.G., Simonova T.L., Simonov S.B. [Hantavirus infection in the Primorsky Territory - epidemiological situation in the foci, where various serotype circulate]. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii [Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology]. 2006; S3:74-7.Yashina L.N., Patrushev N.A., Ivanov L.I., Slonova R.A., Mishin V, Kompanez G.G., Zdanovskaya N.I., Kuzina I.I., Safronov P.F., Chizhikov V.E., Schmaljohn С., Netesov S.V. Genetic diversity of hantaviruses associated with hemorrhagic fever with renal syndrome in the Far East of Russia. Virus Res. 2000; 70(1-2):31-44. DOI: 10.1016/s0168-1702(00)00203-3.Yashina L.N., Patrushev N.A., Ivanov L.I., Slonova R.A., Mishin V, Kompanez G.G., Zdanovskaya N.I., Kuzina I.I., Safronov P.F., Chizhikov V.E., Schmaljohn С., Netesov S.V. Genetic diversity of hantaviruses associated with hemorrhagic fever with renal syndrome in the Far East of Russia. Virus Res. 2000; 70(1-2):31-44. DOI: 10.1016/s0168-1702(00)00203-3.Yashina L., Mishin V, Zdanovskaya N., Schmaljohn C., Ivanov L. A newly discovered variant of a hantavirus in Apodemus peninsulae, Far Eastern Russia. Emerg. Infect. Dis. 2001; 7:912-913.Yashina L., Mishin V, Zdanovskaya N., Schmaljohn C., Ivanov L. A newly discovered variant of a hantavirus in Apodemus peninsulae, Far Eastern Russia. Emerg. Infect. Dis. 2001; 7:912-913.Kariwa H., Yoshimatsu K., Arikawa J. Hantavirus infection in East Asia. Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis. 2007; 30(5-6): 341-56. DOI: 10.1016/j.cimid.2007.05.011.Kariwa H., Yoshimatsu K., Arikawa J. Hantavirus infection in East Asia. Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis. 2007; 30(5-6): 341-56. DOI: 10.1016/j.cimid.2007.05.011.Zhang Y.Z., Zou Y, Yao L.S., Hu G.W., Du Z.S., Jin L.Z., Liu YY, Wang H.X., Chen X., Chen H.X., Fu Z.F. Isolation and characterization of hantaviruses carried by Apodemus peninsulae in Jilin, China. J. Gen. Virol. 2007; 88(Pt4):1295-331. DOI: 10.1099/vir.0.82534-0.Zhang Y.Z., Zou Y, Yao L.S., Hu G.W., Du Z.S., Jin L.Z., Liu YY., Wang H.X., Chen X., Chen H.X., Fu Z.F. Isolation and characterization of hantaviruses carried by Apodemus peninsulae in Jilin, China. J. Gen. Virol. 2007; 88(Pt4):1295-331. DOI: 10.1099/vir.0.82534-0.Kariwa H., Yoshikawa K., Tanikawa Y, Seto T., Sanada T., Saasa N., Ivanov L.I., Slonova R., Zakharycheva T.A., Nakamura I., Yoshimatsu K., Arikawa J., Yoshii K., Takashima I. Isolation and characterization of hantaviruses in Far East Russia and etiology of hemorrhagic fever with renal syndrome in the region. Am. J. Prop. Med. Hyg. 2012; 86(3):545-53. DOI: 10.4269/ajtmh.2012.11-0297Kariwa H., Yoshikawa K., Tanikawa Y, Seto T., Sanada T., Saasa N., Ivanov L.I., Slonova R., Zakharycheva T.A., Nakamura I., Yoshimatsu K., Arikawa J., Yoshii K., Takashima I. Isolation and characterization of hantaviruses in Far East Russia and etiology of hemorrhagic fever with renal syndrome in the region. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2012; 86(3):545-53. DOI: 10.4269/ajtmh.2012.11-029fMaes P., Adkins S., Alkhovsky S.V, Avsic-Zupanc T., Ballinger M.J., Bente D.A., Beer M., Bergeron E., Blair C.D., Briese T., Buchmeier M.J., Burt F.J., Calisher C.H., Charrel R.N., Choi I.R., Clegg J.C.S., Juan Carlos de la Torre, Xavier de Lamballerie, DeRisi J.L., Digiaro M., Drebot M., Ebihara H., Elbeaino T., Ergunay K., Fulhorst C.F., Garrison A.R., Gao G.F., Gonzalez J.-P.J., Groschup M.H., Gunther S., Haenni A.-L., Hall R.A., Hewson R., Hughes H.R., Jain R.K., Jonson M.G., Junglen S., Klempa B., Klingslrom J., Kormelink R., Lambert A.J., S.A. Langevin, Lukashevich I.S., Marklewitz M., Giovanni P. Martelli, Mielke-Ehret N., Mirazimi A., Muhlbach H.-P, Naidu R., Nunes M.R.T., Palacios G., Papa A., Paw^ska J.T., Peters C.J., Plyusnin A.,. Radoshitzky S.R, Resende R.O., Romanowski V, Sall A.A., Salvato M.S., Sasaya T., Schmaljohn C., Shi X., Shirako Y, Simmonds P, Sironi M., Song J.-W., Spengler J.R., Stenglein M.D., Tesh R.B., Turina M., Wei T., Whitfield A.E., Yeh S.-D., Zerbini F.M., Zhang Y-Z., Zhou X., Kuhn J.H. Taxonomy of the order Bunyavirales: Second update 2018. Arch. Virol. 2019; 164(3):927-41. DOI: 10.1007/s00705-018-04127-3.Maes P., Adkins S., Alkhovsky S.V, Avsic-Zupanc T., Ballinger M.J., Bente D.A., Beer M., Bergeron E., Blair C.D., Briese T., Buchmeier M.J., Burt F.J., Calisher C.H., Charrel R.N., Choi I.R., Clegg J.C.S., Juan Carlos de la Torre, Xavier de Lamballerie, DeRisi J.L., Digiaro M., Drebot M., Ebihara H., Elbeaino T., Ergunay K., Fulhorst C.F., Garrison A.R., Gao G.F., Gonzalez J.-P.J., Groschup M.H., Gunther S., Haenni A.-L., Hall R.A., Hewson R., Hughes H.R., Jain R.K., Jonson M.G., Junglen S., Klempa B., Klingslrom J., Kormelink R., Lambert A.J., S.A. Langevin, Lukashevich I.S., Marklewitz M., Giovanni P. Martelli, Mielke-Ehret N., Mirazimi A., Muhlbach H.-P., Naidu R., Nunes M.R.T., Palacios G., Papa A., Paw^ska J.T., Peters C.J., Plyusnin A.,. Radoshitzky S.R, Resende R.O., Romanowski V, Sall A.A., Salvato M.S., Sasaya T., Schmaljohn C., Shi X., Shirako Y., Simmonds P., Sironi M., Song J.-W., Spengler J.R., Stenglein M.D., Tesh R.B., Turina M., Wei T., Whitfield A.E., Yeh S.-D., Zerbini F.M., Zhang Y-Z., Zhou X., Kuhn J.H. Taxonomy of the order Bunyavirales: Second update 2018. Arch. Virol. 2019; 164(3):927-41. DOI: 10.1007/s00705-018-04127-3.Zou Y., Hu J., Wang Z.X., Wang D.M., Li M.H., Ren G.D., Duan Z.X., Fu Z.F., Plyusnin A., Zhang YZ. Molecular diversity and phylogeny of Hantaan virus in Guizhou, China: evidence for Guizhou as a radiation center of the present Hantaan virus. J. Gen. Virol. 2008; 89(Pt8):1987-97. DOI: 10.1099/vir.0.2008/000497-0.Zou Y, Hu J., Wang Z.X., Wang D.M., Li M.H., Ren G.D., Duan Z.X., Fu Z.F., Plyusnin A., Zhang YZ. Molecular diversity and phylogeny of Hantaan virus in Guizhou, China: evidence for Guizhou as a radiation center of the present Hantaan virus. J. Gen. Virol. 2008; 89(Pt8):1987-97. DOI: 10.1099/vir.0.2008/000497-0.Слонова Р.А., Яшина Л.Н., Компанец Г.Г., Мишин В.А. Антигенная и генетическая характеристика штаммов вируса Сеул - возбудителя геморрагической лихорадки с почечным синдромом. Вопросы вирусологии. 2003; 48(3):10—4.Slonova R.A., Yashina L.N., Kompanets G.G., Mishin VA. Antigen and genetic characteristics of Seoul virus strains - agent of hemorrhagic fever with renal syndrome. Voprosy Virusologii [Problems ofVirology]. 2003; 48(3):10-4.Honing J., Chizhikov V, Lundkvist A., Jonsson M., Ivanov A., Dekonenko A., Niklasson B., Dzagurova T., Peters C.J., Tkachenko E., Nichol S. Khabarovsk virus: a phylogenetically and serologically distinct hantavirus isolated from Microtus fortis trapped in far-east Russia. J. Gen. Virol. 1996; 77(Pt):687-94. DOI: 10.1099/0022-1317-77-4-687.Horling h Chizhikov V, Lundkvist A., Jonsson M., Ivanov A., Dekonenko A., Niklasson B., Dzagurova T Peters C.J., Tkachenko E., Nichol S. Khabarovsk virus: a phylogenetically and serologically distinct hantavirus isolated from Microtus fortis trapped in far-east Russia. J. Gen. Virol. 1996; 77(Pt):687-94. DOI: 10.1099/0022-1317-77-4-687.Яшина Л.Н., Иванов Л.И., Слонова РА., Компанец Г.Г, Гуторов В.В., Кушнарева Т.В., Высочина Н.П., Абрамов С.А., Дупал Т.А., Пуховская Н.М., Здановская Н.И. Хантавирусы, циркулирующие в полевках Microtus fortis и Microtus maximowiczii. Тихоокеанский медицинский журнал. 2008; 2:47-9.Yashina L.N., Ivanov L.I., Slonova R.A., Kompanets G.G., Gutorov V.V., Kushnareva T.V., Vysochina N.P., Abramov S.A., Dupal T.A., Pukhovskaya N.M., Zdanovskaya N.I. [Hantaviruses circulating in voles Microtus fortis and Microtus maximowiczii], Tikhookeansky Meditsinskii Zhurnal [Pacific Medical Journal]. 2008; 2:47-9.Zou Y, Wang J.B., Gaowa H.S., Yao L.S., Hu G.W., Li M.H., Chen H.X., Plyusnin A., Shao R., Zhang YZ. Isolation and genetic characterization of hantaviruses carried by Microtus voles in China. J. Med. Virol. 2008; 80(4):680-8. DOI: 10.1002/jmv.21119.Zou Y., Wang J.B., Gaowa H.S., Yao L.S., Hu G.W., Li M.H., Chen H.X., Plyusnin A., Shao R., Zhang YZ. Isolation and genetic characterization of hantaviruses carried by Microtus voles in China. J. Med. Virol. 2008; 80(4):680-8. DOI: 10.1002/jmv.21119.Иванов Л.И., Здановская Н.И., Ткаченко Е.А., Резапкин Г.В., Рыльцева Е.В., Гапонова Л.К., Воробьева Р.Н., Волков В.И. Ареал и природные резервуары вируса геморрагической лихорадки с почечным синдромом на Дальнем Востоке России. Вопросы вирусологии. 1989; 34(5):595-8.Ivanov L.I., Zdanovskaya N.I., Tkachenko E.A., Rezapkin G.V., Ryl’ceva E.V., Gaponova L.K., Vorob’eva R.N., Volkov VI. [Areal and natural reservoirs of the virus of hemorrhagic fever with renal syndrome in the Far East of Russia]. Voprosy Virusologii [Problems ofVirology]. 1989; 34(5):595-8.Kariwa H., Yashimatsu K., Sawabe J., Yokota E., Arikawa J., Takashima I., Fukushima H., Lundkvist A., Shubin F.N., Isachkova L.M., Slonova R.A., Leonova G.N., Hashimoto N. Genetic diversities of hantaviruses among rodents in Hokkaido, Japan and Far East Russia. Virus Res. 1999; 59(2):219-28. DOI: 10.1016/s0168-1702-(98)00141-5.Kariwa H., Yashimatsu K., Sawabe J., Yokota E., Arikawa J., Takashima I., Fukushima H., Lundkvist A., Shubin F.N., Isachkova L.M., Slonova R.A., Leonova G.N., Hashimoto N. Genetic diversities of hantaviruses among rodents in Hokkaido, Japan and Far East Russia. Virus Res. 1999; 59(2):219-28. DOI: 10.1016/s0168-1702-(98)00141-5.Яшина Л.Н., Слонова РА., Олейник О.В., Кузина И.И., Кушнарева Т.В., Компанец Г.Г., Симонов С.Б., Симонова Т.Л., Морзунов С.П., Нетесов С.В. Новый генетический вариант вируса Пуумала в Приморье и его природный носитель, красносерая полевка Clethrionomys rufocanus. Вопросы вирусологии. ; 49(6):34-8.Yashina L.N., Slonova R.A., Oleinik O.V, Kuzina I.I., Kushnareva T.V, Kompanets G.G., Simonov S.B., Simonova T.L., Morzunov S.P., Netesov S.V [New genetic variant of Puumala virus in Primorye and its natural carrier , red-grey vole Clethrionomys rufocanus]. Voprosy Virusologii [Problems of Virology]. 2004;Zhang YZ. Discovery of hantaviruses in bats and insectivores and the evolution of the genus Hantavirus. Virus Res. 2014; 187:15-21.Zhang YZ. Discovery of hantaviruses in bats and insectivores and the evolution of the genus Hantavirus. Virus Res. 2014; 187:15-21.Yashina L.N., Kartashov M.Yu., Wang W., Li K., Zdanovskaya N.I., Ivanov L.I., Zhang YZ. Co-circulation of distinct shrew-borne hantaviruses in the far east of Russia. Virus Res. 2019; 272:197717. DOI: 10.1016/j.virusres.2019.197717.Yashina L.N., Kartashov M.Yu., Wang W., Li K., Zdanovskaya N.I., Ivanov L.I., Zhang YZ. Co-circulation of distinct shrew-borne hantaviruses in the far east of Russia. Virus Res. 2019; 272:197717. DOI: 10.1016/j.virusres.2019.197717.Klempa B., Fichet-Calvet E., Lecompte E., Auste B., Aniskin V, Meisel H., Denys C., Koivogui L., Jan ter Meulen, Kruger D.H. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg. Infect. Dis. 2006; 12:838-40. DOI: 10/3201/eid1205.051487.Klempa B., Fichet-Calvet E., Lecompte E., Auste B., Aniskin V, Meisel H., Denys C., Koivogui L., Jan ter Meulen, Kruger D.H. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg. Infect. Dis. 2006; 12:838-40. DOI: 10/3201/eid1205.051487.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.