microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2021-3-72-82microbe-1550Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESСравнительный анализ молекулярно-генетических свойств нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae O1 биовара Эль Тор, изолированных в России и на эндемичных по холере территорияхComparative Analysis of Molecular-Genetic Properties in Non-Toxigenic Vibrio cholerae O1 Strains Biovar El Tor, Isolated in Russia and on Cholera Endemic Territorieshttps://orcid.org/0000-0002-5506-4285КрицкийА. А.KritskyA. A.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

rusrapi@microbe.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7115-6286СмирноваН. И.SmirnovaN. I.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

КаляеваТ. Б.KalyaevaT. B.

Российская Федерация, 358000, Элиста, Главпочтамт, а/я 28

28, Elista, 358000, Russian Federation

ОброткинаН. Ф.ObrotkinaN. F.

Российская Федерация, 358000, Элиста, Главпочтамт, а/я 28

28, Elista, 358000, Russian Federation

https://orcid.org/0000-0001-6757-6977ГрачеваИ. В.GrachevaI. V.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

КатышевА. Д.KatyshevA. D.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

https://orcid.org/0000-0003-3788-3452КутыревВ. В.KutyrevV. V.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»РоссияRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”Russian FederationФКУЗ «Элистинская противочумная станция»РоссияElista Plague Control StationRussian Federation202123102021037282Copyright © Крицкий А.А., Смирнова Н.И., Каляева Т.Б., Оброткина Н.Ф., Грачева И.В., Катышев А.Д., Кутырев В.В., 20212021Крицкий А.А., Смирнова Н.И., Каляева Т.Б., Оброткина Н.Ф., Грачева И.В., Катышев А.Д., Кутырев В.В.Kritsky A.A., Smirnova N.I., Kalyaeva T.B., Obrotkina N.F., Gracheva I.V., Katyshev A.D., Kutyrev V.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1550

Цель – сравнительный анализ молекулярно-генетических свойств нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae O1 биовара Эль Тор, изолированных в Республике Калмыкия и на эндемичных по холере территориях, и установление их филогенетических связей с токсигенными изолятами.

Материалы и методы

Материалы и методы. Проведен биоинформационный анализ полногеномных последовательностей 60 штаммов холерных вибрионов из эндемичных по холере регионов и Калмыкии. Определено присутствие в их геномах островов патогенности и пандемичности. Показаны их ST-типы и проведен полногеномный SNP-анализ.

Результаты и обсуждение

Результаты и обсуждение. Показано, что нетоксигенные холерные вибрионы Эль Тор, изолированные в Калмыкии, относятся к двум основным генотипам: ctxA–tcpA+VPI-2+VSP– и ctxA–tcpA–VPI-2Δ+VSP–, где VPI-2Δ+ означает наличие делеций разной протяженности в геноме этого острова патогенности. Среди них лишь последние обнаружены в регионах, эндемичных по холере. Кроме того, в эндемичных очагах холеры циркулируют популяции вибрионов ctxA–tcpA+VPI-2+VSP+, не обнаруженные в Калмыкии. Среди всех изученных штаммов выявлено 17 сиквенс-типов (по семи локусам генов «домашнего хозяйства»). Филогенетический анализ, проведенный с помощью SNP-типирования, показал отсутствие тесной генетической связи вибрионов из Калмыкии ctxA–tpA+VPI-2+VSP– как с токсигенными, так и с нетоксигенными вибрионами с иным составом островов патогенности и пандемичности. В то же время выявлена генетическая близость холерных вибрионов ctxA–tcpA–VPI-2Δ+VSP– из эндемичных очагов холеры с таковыми, изолированными в Калмыкии, что может указывать на возможность их периодического завоза на территорию России. Нетоксигенные штаммы V. cholerae, циркулирующие на территории Калмыкии, отличаются высоким генетическим разнообразием. Циркулирование штаммов уникальных сиквенс-типов позволяет сделать предположение об их способности к длительной персистенции на данной территории. Вместе с тем филогенетическая близость и идентичность некоторых штаммов со штаммами эндемичных территорий могут свидетельствовать о периодическом заносе.

Objective of the study was to perform a comparative analysis of molecular-genetic properties in non-toxigenic Vibrio cholerae O1 strains biovar El Tor, isolated in the Republic of Kalmykia and on cholera endemic territories and to reveal their phylogenetic relations to toxigenic isolates.

Materials and methods

Materials and methods. We have carried out bio-information analysis of whole genome sequences of 60 cholera vibrio strains from endemic as regards cholera regions and from Kalmykia. The presence of pathogenicity and endemicity islands in their genomes has been determined. Specifed have been the sequence-types of the examined strains and whole genome SNP-analysis conducted.

Results and discussion

Results and discussion. Non-toxigenic El Tor vibrios circulating in Kalmykia are clustered into two major genotypes: ctxA–tcpA+VPI-2+VSP– and ctxA–tcpA–VPI-2Δ+VSP–, where VPI-2 Δ+ signifes the presence of deletions of varying length in the genome of this pathogenicity island. Only the latter one is found in regions endemic for cholera. In addition, ctxA– tcpA+VPI-2+VSP+ populations circulate in cholera endemic foci, not found in Kalmykia. 17 sequence-types were identifed among the studied strains (by seven housekeeping gene loci). Phylogenetic analysis performed using SNP-typing demonstrated the absence of close genetic relation between the ctxA–tcpA+VPI-2+VSP– vibrios from Kalmykia and both toxigenic and non-toxigenic vibrios with different composition of pathogenicity and pandemicity islands in the genome. At the same time, genetic proximity of ctxA–tcpA–VPI-2Δ+VSP– cholera vibrios from endemic cholera foci with those isolated in Kalmykia was detected, which may indicate the possibility of their recurrent importation into the territory of Russia. Non-toxigenic V. cholerae strains found in the territory of Kalmykia are characterized by a high genetic diversity. Circulation of the strains with unique sequence-types suggests their potential for long-term persistence on this territory. At the same time, phylogenetic closeness and identity of certain strains with strains from endemic territories can be an evidence of repeated importation.

нетоксигенные штаммы Vibrio cholerae O1 Эль Торбиоинформационный анализгенотипсиквенс-типSNP-типированиеnon-toxigenic Vibrio cholerae O1 El Tor strainsbio-information analysisgenotypesequence-typeSNP-typingReferencesHu D., Liu B., Feng L., Ding P., Guo X., Wang M., Cao B., Reeves P.R., Wang L. Origins of the current seventh cholera pandemic. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2016; 113(48):Е7730–Е7739. DOI: 10.1073/pnas.1608732113.Hu D., Liu B., Feng L., Ding P., Guo X., Wang M., Cao B., Reeves P.R., Wang L. Origins of the current seventh cholera pandemic. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2016; 113(48):Е7730–Е7739. DOI: 10.1073/pnas.1608732113.Москвитина Э.А., Янович Е.Г., Куриленко М.Л., Кругликов В.Д., Титова С.В., Левченко Д.А., Водопьянов А.С., Лопатин А.А., Иванова С.М., Мишанькин Б.М., Кривенко А.С., Анисимова Г.Б., Носков А.К. Холера: мониторинг эпидемиологической обстановки в мире и России (2010–2019 гг.). Прогноз на 2020 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 2:38–47. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-2-38-47.Moskvitina E.A., Yanovich E.G., Kurilenko M.I., Kruglikov V.D., Titova S.V., Levchenko D.A., Vodop’yanov A.S., Lopatin A.A., Ivanova S.M., Mishan’kin B.M., Krivenko A.S., Anisimova G.B., Noskov A.K. [Cholera: monitoring of epidemiological situation around the world and in Russia (2010–2019). Forecast for 2020]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2020; (2):38–47. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-2-38-47.Миронова Л.В. Современные представления о закономерностях эпидемического процесса при холере: экологические и молекулярно-биологические аспекты. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2018; 23(5):242–50. DOI: 10.18821/1560-9525-2018-23-5-242-250.Mironova L.V. [Current views on objective laws of a cholera epidemic process: ecological and molecular-biological aspects]. Epidemiologiya i Infectionnye Bolezni [Epidemiology and Infectious Diseases]. 2018; 23(5):242–50. DOI: 10.18821/1560-9525-2018-23-5-242-250.Karaolis D.K., Johnson J.A., Bailey C.C., Boedeker E.C., Kaper J.B., Reeves P.R. A Vibrio cholerae pathogenicity island associated with epidemic and pandemic strains. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1998; 95(6):3134–9. DOI: 10.1073/pnas.95.6.3134.Karaolis D.K., Johnson J.A., Bailey C.C., Boedeker E.C., Kaper J.B., Reeves P.R. A Vibrio cholerae pathogenicity island associated with epidemic and pandemic strains. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1998; 95(6):3134–9. DOI: 10.1073/pnas.95.6.3134.Waldor M.K., Mekalanos J.J. Lysogenic conversion by a flamentous phage encoding cholera toxin. Science. 1996; 272(5270):1910–4. DOI: 10.1126/science.272.5270.1910.Waldor M.K., Mekalanos J.J. Lysogenic conversion by a flamentous phage encoding cholera toxin. Science. 1996; 272(5270):1910–4. DOI: 10.1126/science.272.5270.1910.Jermyn W.S., Boyd E.F. Characterization of a novel Vibrio pathogenicity island (VPI-2) encoding neuraminidase (nanH) among toxigenic Vibrio cholerae isolates. Microbiology (Reading). 2002; 148(Pt 11):3681–93. DOI: 10.1099/00221287-148-11-3681.Jermyn W.S., Boyd E.F. Characterization of a novel Vibrio pathogenicity island (VPI-2) encoding neuraminidase (nanH) among toxigenic Vibrio cholerae isolates. Microbiology (Reading). 2002; 148(Pt 11):3681–93. DOI: 10.1099/00221287-148-11-3681.Dziejman M., Balon E., Boyd D., Fraser C.M., Heidelberg J.F., Mekalanos J.J. Comparative genomic analysis of Vibrio cholerae: genes that correlate with cholera endemic and pandemic disease. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2002; 99(3):1556–61. DOI: 10.1073/pnas.042667999.Dziejman M., Balon E., Boyd D., Fraser C.M., Heidelberg J.F., Mekalanos J.J. Comparative genomic analysis of Vibrio cholerae: genes that correlate with cholera endemic and pandemic disease. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2002; 99(3):1556–61. DOI: 10.1073/pnas.042667999.Смирнова Н.И., Кульшань Т.А., Баранихина Е.Ю., Краснов Я.М., Агафонов Д.А., Кутырев В.В. Структура генома и происхождение нетоксигенных штаммов Vibrio choleraе биовара Эль Тор с различной эпидемиологической значимостью. Генетика. 2016; 52(9):1029–41. DOI: 10.7868/S0016675816060126.Smirnova N.I., Kul’shan T.A., Baranikhina E.Yu., Krasnov Ya.M., Agafonov D.A., Kutyrev V.V. [Genome structure and origin of non-toxigenic Vibrio cholerae El Tor strains with different epidemiological signifcance]. Genetika [Genetics]. 2016; 52(9):1029–41. DOI: 10.7868/S0016675816060126.Siriphap A., Leekitcharoenphon P., Kaas R.S., Theethakaew Ch., Aarestrup F.M., Sutheinkul O., Hendriksen R.S. Characterization and genetic variation of Vibrio cholerae isolated from clinical and environmental sources in Thailand. PLoS ONE. 2017; 12(1):eb169324. DOI: 10.1371/journal.pone.0169324.Siriphap A., Leekitcharoenphon P., Kaas R.S., Theethakaew Ch., Aarestrup F.M., Sutheinkul O., Hendriksen R.S. Characterization and genetic variation of Vibrio cholerae isolated from clinical and environmental sources in Thailand. PLoS ONE. 2017; 12(1):eb169324. DOI: 10.1371/journal.pone.0169324.Wang H., Yang Ch., Sun Z., Zheng W., Yu H., Wu Y., Didelot X., Yang R., Pan J., Cui Y. Genomic epidemiology of Vibrio cholerae reveals the regional and global spread of two epidemic nontoxigenic lineages. PLoS Negl. Trop. Dis. 2020; 14(2):e0008046. DOI: 10.1371/journal.pntd.0008046.Wang H., Yang Ch., Sun Z., Zheng W., Yu H., Wu Y., Didelot X., Yang R., Pan J., Cui Y. Genomic epidemiology of Vibrio cholerae reveals the regional and global spread of two epidemic nontoxigenic lineages. PLoS Negl. Trop. Dis. 2020; 14(2):e0008046. DOI: 10.1371/journal.pntd.0008046.Левченко Д.А., Кругликов В.Д., Водопьянов А.С., Титова С.В., Архангельская И.В., Непомнящая Н.Б., Ежова М.И. ГИС: возможности анализа данных фено- и генотипирования холерных вибрионов О1 серогруппы Эль Тор, изолированных из водных объектов окружающей среды на территории Российской Федерации. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2016; 6:19–25. DOI: 10.36233/0372-9311-2016-6-19-25.Levchenko D.A., Kruglikov V.D, Vodop’yanov A.S., Titova S.V., Arkhangel’skaya I.V., Nepomnyashchaya N.B., Ezhova M.I. [GIS: capabilities of data analysis of pheno- and genotyping of El Tor O1 serogroup cholera vibrios isolated from surface water bodies in the Russia Federation]. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii [Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology]. 2016; 6:19–25. DOI: 10.36233/0372-9311-2016-6-19-25.Кулешов К.В., Маркелов М.Л., Дедков В.Г., Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Керманов А.В., Писанов Р.В., Кругликов В.Д., Мазрухо А.Б., Малеев В.В., Шипулин Г.А. Филогенетический анализ геномов штаммов Vibrio cholerae, выделенных на территории Ростовской области. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2013; 6:13–20.Kuleshov K.V., Markelov M.L., Dedkov V.G., Vodop’yanov S.O., Vodop’yanov A.S., Kermanov A.V., Pisanov R.V., Kruglikov V.D., Mazrukho A.B., Maleev V.V., Shipulin G.A. [Phylogenetic analysis of genomes of Vibrio cholerae strains isolated on the territory of Rostov region]. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii [Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology]. 2013; 6:13–20.Зубкова Д.А., Кругликов В.Д., Архангельская И.В., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б., Водопьянов С.О. Генетические особенности штаммов холерных вибрионов О1 серогруппы ctxA–tcpA+, выделенных из водных объектов Российской Федерации, охарактеризованные с помощью новой геоинформационной системы. Здоровье населения и среда обитания. 2014; 9:32–5.Zubkova D.A., Kruglikov V.D., Arkhangel’skaya I.V., Vodop’yanov A.S., Nepomnyashchaya N.B., Vodop’yanov S.O. [Genetic features of strains of Vibrio cholerae O1 ctxA–tcpA+, isolated from water bodies of the Russian Federation, described using a new geo-information systems]. Zdorov’e Naseleniya i Sreda Obitaniya [Public Health and Life Environment]. 2014; 9(258):32–5.Титова С.В., Монахова Е.В. О потенциальной опасности нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, содержащих гены токсин-коррегулируемых пилей адгезии. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2016; 5:65–72.Titova S.V., Monakhova E.V. [Potential hazard of non-toxigenic Vibrio cholerae strains containing genes of toxin-coregulated pilus of adhesion]. Epidemiologiya i Infektsionnye Bolezni. Aktualnye Voprosy [Epidemiology and Infectious Diseases. Current Items]. 2016; 5:65–70.Миронова Л.В., Пономарева А.С., Хунхеева Ж.Ю., Гладких А.С., Балахонов С.В. Генетическое разнообразие Vibrio cholerae О1 El Tor при эпидемических осложнениях в Сибирском и Дальневосточном регионах. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2019; 37(4):165–72. DOI: 10.17116/molgen201937041165.Mironova L.V., Ponomareva A.S., Khunkheeva Zh.Yu., Gladkikh A.S., Balakhonov S.V. [Genetic diversity of Vibrio cholerae O1 El Tor during epidemic complications in the Siberian and Far East regions]. Molekulyarnaya Genetika, Mikrobiologiya i Virusologiya [Molecular Genetics, Microbiology and Virology]. 2019; 37(4):165–72. DOI: 10.17116/molgen201937041165.MukhopadhyayA.K., Chakraborty S., Takeda Y., Nair G.B., Berg D.E. Characterization of VPI pathogenicity island and CTXphi prophage in environmental strains of Vibrio cholerae. J. Bacteriol. 2001; 183(16):4737–46. DOI: 10.1128/JB.183.16.4737-4746.2001.Mukhopadhyay A.K., Chakraborty S., Takeda Y., Nair G.B., Berg D.E. Characterization of VPI pathogenicity island and CTXphi prophage in environmental strains of Vibrio cholerae. J. Bacteriol. 2001; 183(16):4737–46. DOI: 10.1128/JB.183.16.4737-4746.2001.Faruque S.M., Chowdhury N., Kamruzzaman M., Dziejman M., Rahman M.H., Sack D.A., Nair G.B., Mekalanos J.J. Genetic diversity and virulence potential of environmental Vibrio cholerae population in a cholera-endemic area. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2004; 101(7):2123–8. DOI: 10.1073/pnas.0308485100.Faruque S.M., Chowdhury N., Kamruzzaman M., Dziejman M., Rahman M.H., Sack D.A., Nair G.B., Mekalanos J.J. Genetic diversity and virulence potential of environmental Vibrio cholerae population in a cholera-endemic area. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2004; 101(7):2123–8. DOI: 10.1073/pnas.0308485100.O’Shea Y.A., Reen F.J., Quirke A.M., Boyd E.F. Evolutionary genetic analysis of the emergence of epidemic Vibrio cholerae isolates on the basis of comparative nucleotide sequence analysis and multilocus virulence gene profles. J. Clin. Microbiol. 2004; 42(10):4657–71. DOI: 10.1128/JCM.42.10.4657-4671.2004.O’Shea Y.A., Reen F.J., Quirke A.M., Boyd E.F. Evolutionary genetic analysis of the emergence of epidemic Vibrio cholerae isolates on the basis of comparative nucleotide sequence analysis and multilocus virulence gene profles. J. Clin. Microbiol. 2004; 42(10):4657–71. DOI: 10.1128/JCM.42.10.4657-4671.2004.Pang B., Yan M., Cui Z., Ye X., Diao B., Ren Y., Gao S., Zhang L., Kan B. Genetic diversity of toxigenic and nontoxigenic Vibrio cholerae serogrups O1 and O139 revealed by array-based comparative genomic hybridization. J. Bacteriol. 2007; 189(13):4837–49. DOI: 10.1128/JB.01959-06.Pang B., Yan M., Cui Z., Ye X., Diao B., Ren Y., Gao S., Zhang L., Kan B. Genetic diversity of toxigenic and nontoxigenic Vibrio cholerae serogrups O1 and O139 revealed by array-based comparative genomic hybridization. J. Bacteriol. 2007; 189(13):4837–49. DOI: 10.1128/JB.01959-06.Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б., Сучков И.Ю., Мишанькин Б.Н. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio choleraе. Биотехнология. 2001; 6:85–8.Vodop’yanov A.S., Vodop’yanov S.O., Mishan’kin M.B., Suchkov I.Yu., Mishan’kin B.N. [Variable tandem repeats, revealed in computer analysis of Vibrio cholerae genome]. Biotetekhnologya [Biotechnology]. 2001; 6:85–8.Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Олейников И.П., Мишанькин Б.Н. INDEL-типирование штаммов Vibrio cholerae. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2017; 22(4):195–200. DOI: 10.18821/1560-9529-2017-22-4-195-200.Vodop’yanov A.S., Vodop’yanov S.O., Oleynikov I.P., Mishan’kin B.N. [INDEL-genotyping of Vibrio cholerae strains]. Epidemiologiya i Infektsionnye Bolezni [Epidemiology and Infectious Diseases]. 2017; 22(4):195–200. DOI: 10.18821/1560-9529-2017-22-4-195-200.Baddam R., Sarker N., Ahmed D., Mazumder R., Abdullah A., Morshed R., Hussain A., Begum S., Shahrin L., Khan A.I., Islam M.S., Ahmed T., Alam M., Clemens J.D., Ahmed N. Genome dynamics of Vibrio cholerae isolates linked to seasonal outbreaks of cholera in Dhaka, Bangladesh. mBio. 2020; 11(1):e03339-19. DOI: 10.1128/mBio.03339-19.Baddam R., Sarker N., Ahmed D., Mazumder R., Abdullah A., Morshed R., Hussain A., Begum S., Shahrin L., Khan A.I., Islam M.S., Ahmed T., Alam M., Clemens J.D., Ahmed N. Genome dynamics of Vibrio cholerae isolates linked to seasonal outbreaks of cholera in Dhaka, Bangladesh. mBio. 2020; 11(1):e03339-19. DOI: 10.1128/mBio.03339-19.Mavian C., Paisie T.K., Alam M.T., Browne C., Beau De Rochars V.M., Nembrini S., Cash M.N., Nelson E.J., Azarian T., Ali A., Morris J.G. Jr, Salemi M. Toxigenic Vibrio cholerae evolution and establishment of reservoirs in aquatic ecosystems. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2020; 117(14):7897–904. DOI: 10.1073/pnas.1918763117.Mavian C., Paisie T.K., Alam M.T., Browne C., Beau De Rochars V.M., Nembrini S., Cash M.N., Nelson E.J., Azarian T., Ali A., Morris J.G. Jr, Salemi M. Toxigenic Vibrio cholerae evolution and establishment of reservoirs in aquatic ecosystems. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2020; 117(14):7897–904. DOI: 10.1073/pnas.1918763117.Левченко Д.А., Архангельская И.В., Кругликов В.Д., Гаевская Н.Е., Ежова М.И., Ренгач М.В. Результаты мониторинга холерных вибрионов на территории Республики Калмыкия в 2013–2017 гг. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2019; 9(4):6–11. DOI: 10.18565/epidem.2019.94.6-11.Levchenko D.A., Arkhangel’skaya I.V., Kruglikov V.D, Gaevskaya N.E., Ezhova M.I., Rengach M.V. [Results of Vibrio cholerae monitoring in the Republic of Kalmykia in 2013–2017]. Epidemiologiya i Infektsionnye Bolezni. Aktualnye Voprosy [Epidemiology and Infectious Diseases. Current Items]. 2019; 9(4):6–11. DOI: 10.18565/epidem.2019.94.6-11.Смирнова Н.И., Агафонова Е.Ю., Щелканова Е.Ю., Агафонов Д.А., Краснов Я.М., Ливанова Л.Ф., Кутырев В.В. Геномное разнообразие нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae O1, выделенных на территории России и сопредельных стран. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2018; 36(2):76–86. DOI: 10.18821/0208-0613-2018-36-2-76-84.Smirnova N.I., Agafonova E.Y., Shchelkanova E.Y., Agafonov D.A., Krasnov Y.M., Livanova L.F., Kutyrev V.V. [Genomic diversity of non-toxigenic Vibrio cholerae O1 strains, isolated in the territory of Russia and neighboring states]. Molekulyarnaya Genetika, Mikrobiologiya i Virusologiya [Molecular Genetics Microbiology and Virology]. 2018; 3:76–84. DOI: 10.18821/0208-0613-2018-36-2-76-84.Миронова Л.В., Афанасьев М.В., Гольдапель Э.Г., Балахонов С.В. Мультилокусное сиквенс-типирование штаммов Vibrio cholerae разной эпидемической значимости. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2015; 33(2):26–32.Mironova L.V., Afanas’ev M.V., Gol’dapel E.G., Balakhonov S.V. [Multilocus sequence typing of Vibrio cholerae strains with different epidemic signifcance] Molekularnaya Genetika, Mikrobiologiya i Virusologiya [Molecular Genetics Microbiology and Virology]. 2015; 33(2):26–32.Миронова Л.В., Бочалгин Н.О., Гладких А.С., Феранчук С.И., Пономарева А.С., Балахонов С.В. Филогенетическое положение и особенности структуры геномов ctxAB–tcpA+ Vibrio cholerae из поверхностных водоемов на неэндемичной по холере территории. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 1:115–23. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-1-115-123.Mironova L.V., Bochalgin N.O., Gladkikh A.S., Feranchuk S.I., Ponomareva A.S., Balakhonov S.V. Phylogenetic afnity and genome structure features of ctxAB–tcpA+ Vibrio cholerae from the surface waterbodies in the territory that is non-endemic as regards cholera. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2020; 1:115–123. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-1-115-123.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.