microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2014-3-57-60microbe-164Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯMICROBIOLOGYКонструирование комплекта праймеров для детекции генов антибиотикоустойчивости у возбудителей опасных бактериальных инфекций на примере штаммов Yersinia pestis, Vibrio сholerae, Escherichia coliDevelopment of a Set of Primers for Drug-Resistance Genes Detection in the Agents of Dangerous Bacterial Infections as Exemplified by Yersinia pestis, Vibrio cholerae, Escherichia coli StrainsНикифоровК. А.NikiforovK. A.rusrapi@microbe.ruАнисимоваЛ. В.AnisimovaL. V.rusrapi@microbe.ruОдиноковГ. Н.OdinokovG. N.rusrapi@microbe.ruФадееваА. В.FadeevaA. V.rusrapi@microbe.ruНовичковаЛ. А.NovichkovaL. A.rusrapi@microbe.ruЕрошенкоГ. А.EroshenkoG. A.rusrapi@microbe.ruКутыревВ. В.KutyrevV. V.rusrapi@microbe.ruРоссийский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»РоссияRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”Russian Federation201420092014035760Copyright © Никифоров К.А., Анисимова Л.В., Одиноков Г.Н., Фадеева А.В., Новичкова Л.А., Ерошенко Г.А., Кутырев В.В., 20142014Никифоров К.А., Анисимова Л.В., Одиноков Г.Н., Фадеева А.В., Новичкова Л.А., Ерошенко Г.А., Кутырев В.В.Nikiforov K.A., Anisimova L.V., Odinokov G.N., Fadeeva A.V., Novichkova L.A., Eroshenko G.A., Kutyrev V.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/164

Для быстрого и эффективного выявления антибиотикоустойчивых штаммов возбудителей опасных бактериальных инфекций с помощью ПЦР сконструирован комплект праймеров для детекции генов устойчивости к стрептомицину ( strA, strB ), тетрациклину ( tetA, tetR ), хлорамфениколу ( catА ), канамицину ( npt , aphA ), ванкомицину ( sanA ), полимиксину ( pmrD ). Эффективность сконструированных праймеров подтверждена на выборке из 40 штаммов Yersinia pestis , 49 штаммов Vibrio cholerae и двух штаммов Escherichia coli из Государственной коллекции патогенных бактерий при РосНИПЧИ «Микроб». У штаммов возбудителя чумы выявлены гены антибиотикоустойчивости - ntp и catA ; у штаммов возбудителя холеры - strA, strB , npt , aphA , tetA и tetR ; у патогенного штамма кишечной палочки О157:H7 - strA , tetR , ntp и aphA . Установлена универсальность рассчитанных праймеров для детекции генов антибиотикоустойчивости у этих видов патогенных бактерий.

A set of primers for detection of genes encoding resistance to streptomycin ( strA, strB ), tetracyclin ( tetA, tetR ), chloramphenicol ( catА ), kanamycin ( npt , aphA ), vankomycin ( sanA ), polymyxin ( pmrD ) has been developed with the aim of rapid and effective detection of drug-resistant strains of dangerous bacterial infections agents. Efficacy of constructed primers has been confirmed against a panel of 40 Yersinia pestis, 49 Vibrio cholerae, and 2 Escherichia coli strains from the State collection of pathogenic bacteria of the RAPI “Microbe”. Drug-resistance genes ntp and catA have been detected in plague agent strains , strA, strB , npt , aphA , tetA and tetR - in cholera agent; strA , tetR , ntp and aphA - in pathogenic strain E. coli О157:H7. Determined is universal character of the designed primers for drug-resistance genes detection in these pathogenic bacteria species.

антибиотикоустойчивостьгеныполимеразная цепная реакциявозбудители опасных инфекцийdrug-resistancegenespolymerase chain reactiondangerous infections agentsReferencesЕрошенко Г.А., Одиноков Г.Н., Анисимова Л.В., Шавина Н.Ю., Виноградова Н.А., Кутырев В.В. Антибиотикоустойчивые штаммы возбудителя чумы и разработка способа их детекции методом полимеразной цепной реакции. Пробл. особо опасных инф. 2011; 1(107):33-7.1 Eroshenko G.A., Odinokov G.N., Anisimova L.V., Shavina N.Yu., Vinogradova N.A., Kutyrev V.V. [ Drug-resistant strains of plague agent and development of their detection method using polymerase chain reaction]. Probl. Osobo Opasn. Infek. 2011; 1(107):33–7.Организация работ лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности. МУ 1.3.2569-09.[Organization of work of the laboratories using methods of nucleic acids amplification while working with material containing microorganisms of I–IV pathogenicity groups]. MR 1.3.2569-09.Ряпис Л.А., Филатов Н.И., Сомова Н.Я., Сизых Е.В., Герасимов А.И., Светоч Э.А., Степашин Ю.Г., Баннов В.А., Ерусланов Б.В., Борзинов В.А., Храмов М.В., Гусев В.В. Характеристика штаммов Escherichia coli О157:H7, изолированных на территориях Центрального Федерального округа. Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 2005; 1:7-11.Ryapis L.A., Filatov N.I., Somova N.Ya., Sizykh E.V., Gerasimov A.I., Svetoch E.A., Stepashin Yu.G., Bannov V.A., Eruslanov B.V., Borzinov V.A., Khramov M.V., Gusev V.V., [Characterization of Escherichia coli О157:H7 strains isolated in the territory of Central Federal District]. Zh. Mikrobiol. Epidemiol. Immunobiol. 2005; 1:7–11.Galimand M., Guiyoule A., Gerbaud G., Rahalison L., Chanteau S., Courvalin P., Carniel E. Multidrug resistance in Yersinia pestis mediated by a transferrable plasmid. N. Engl. J. Med. 1997; 337:677-80.Galimand M., Guiyoule A., Gerbaud G., Rahalison L., Chanteau S., Courvalin P., Carniel E. Multidrug resistance in Yersinia pestis mediated by a transferrable plasmid. N. Engl. J. Med. 1997; 337:677–80.Guiyoule A., Gerbaud G., Buchrieser C., Galimand M., Rahalison L., Chanteau S., Courvalin P., Carniel E. Transferable plasmid-mediated resistance to streptomycin in a clinical isolate of Yersinia pestis. Emerging Infect. Dis. 2001; 7(1):43-8.Guiyoule A., Gerbaud G., Buchrieser C., Galimand M., Rahalison L., Chanteau S., Courvalin P., Carniel E. Transferable plasmid-mediated resistance to streptomycin in a clinical isolate of Yersinia pestis. Emerging Infect. Dis. 2001; 7(1):43–8.Hayashi T., Makino K., Ohnishi M., Kurokawa K., Ishii K., Yokoyama K., Han C.G., Ohtsubo E., Nakayama K., Murata T., Tanaka M., Tobe T., Iida T., Takami H., Honda T., Sasakawa C., Ogasawara N., Yasunaga T., Kuhara S., Shiba T., Hattori M., Shinagawa H. Complete genome sequence of enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 and genomic comparison with a laboratory strain K-12. DNA Res. 2001; 8(1):11-22.Hayashi T., Makino K., Ohnishi M., Kurokawa K., Ishii K., Yokoyama K., Han C.G., Ohtsubo E., Nakayama K., Murata T., Tanaka M., Tobe T., Iida T., Takami H., Honda T., Sasakawa C., Ogasawara N., Yasunaga T., Kuhara S., Shiba T., Hattori M., Shinagawa H. Complete genome sequence of enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 and genomic comparison with a laboratory strain K-12. DNA Res. 2001; 8(1):11–22.Pan J.C., Ye R., Wang H.Q., Xiang H.Q., Zhang W., Yu X.F., Meng D.M., He Z.S. Vibrio cholerae O139 multiple-drug resistance mediated by Yersinia pestis pIP1202-like conjugative plasmids. Antimicrob. Agents Chemother. 2008; 52(11):3829-36.Pan J.C., Ye R., Wang H.Q., Xiang H.Q., Zhang W., Yu X.F., Meng D.M., He Z.S. Vibrio cholerae O139 multiple-drug resistance mediated by Yersinia pestis pIP1202-like conjugative plasmids. Antimicrob. Agents Chemother. 2008; 52(11):3829–36.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.