microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2022-3-120-128microbe-1733Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESОпределение тропизма ВИЧ у лиц с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии в Архангельской областиDetermination of HIV Tropism in Patients with Antiretroviral Therapy Failure in Arkhangelsk Regionhttps://orcid.org/0000-0003-2270-8897ОстанковаЮ. В.OstankovaYu. V.

Останкова Юлия Владимировна

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14

Yulia V. Ostankova

14, Mira St., St. Petersburg, 197101

shenna1@yandex.ruДавыденкоВ. С.DavydenkoV. S.

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14

14, Mira St., St. Petersburg, 197101

pasteur@pasteurorg.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3139-3674ЩемелевА. Н.ShchemelevA. N.

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14

14, Mira St., St. Petersburg, 197101

pasteur@pasteurorg.ruhttps://orcid.org/0000-0002-0579-110XЗуеваЕ. Б.ZuevaE. B.

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14

14, Mira St., St. Petersburg, 197101

pasteur@pasteurorg.ruВиролайненП. А.VirolainenP. A.

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14

14, Mira St., St. Petersburg, 197101

pasteur@pasteurorg.ruhttps://orcid.org/0000-0003-4571-8799ТотолянАрег  А.TotolyanAreg A.

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14

14, Mira St., St. Petersburg, 197101

pasteur@pasteurorg.ruФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера»РоссияSaint-Petersburg Pasteur Research Institute of Epidemiology and MicrobiologyRussian Federation20223010202203120128Copyright © Останкова Ю.В., Давыденко В.С., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Виролайнен П.А., Тотолян А.А., 20222022Останкова Ю.В., Давыденко В.С., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Виролайнен П.А., Тотолян А.А.Ostankova Y.V., Davydenko V.S., Shchemelev A.N., Zueva E.B., Virolainen P.A., Totolyan A.A.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1733

Цель работы – определение на основании анализа нуклеотидной последовательности V3‑петли гена env тропизма ВИЧ у пациентов с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии в Архангельской области.

Материалы и методы

Материалы и методы. Материалом исследования служили образцы плазмы крови 76 ВИЧ-инфицированных лиц с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии. Методом ПЦР с последующим секвенированием исследовали нуклеотидную последовательность региона C2-V3-C3 гена env ВИЧ. Определение генотипа исследуемых штаммов проводили на основании анализа их филогенетических отношений с референсными последовательностями из международной базы данных GenBank, а также с использованием специализированных программ. Для прогнозирования вирусного тропизма применяли правило Гарридо и биоинформатический онлайн-инструмент Geno2Pheno[coreceptor], который на основании анализа нуклеотидной последовательности V3‑петли гена env определяет коэффициент отсечения ложноположительных результатов (false positive rate – FPR).

Результаты и обсуждение

Результаты и обсуждение. Показана более низкая представленность R5X4/X4-тропных вариантов ВИЧ у длительное время инфицированных лиц с вирусом субсубтипа А6 по сравнению с вирусом субтипа В. Для всех алгоритмов отсечения FPR наблюдали достоверную корреляцию между субтипом и тропизмом ВИЧ (p=0,0014 и p=0,013 для FPR 10 % и FPR 20 % соответственно). В то время как среди штаммов субтипа B по меньшей мере 57 % определены как R5X4/X4-тропные варианты (для FPR 10 %), в том числе два штамма отнесены к X4-тропным, среди ВИЧ субсубтипа А6 даже при FPR 20 % частота R5X4/X4-тропных образцов лишь незначительно превышала 22 %. Можно предположить, что динамика изменения тропности ВИЧ зависит от субтипа вируса. Показаны достоверные отличия распределения аминокислотных остатков последовательности V3-региона в обследуемой группе между R5-тропными и R5X4/X4-тропными штаммами субсубтипа А6 для позиций 18 (χ2=7,616, p=0,0058), 21 (χ2=7,281, p=0,007), 24 (χ2=5,587, p=0,0181) и 34 (χ2=5,144, p=0,0233). Среди R5X4/X4-тропных штаммов субсубтипа А6 представлены аминокислотные замены в позициях 6, 19, 21, 26, 29, 30, не обнаруженные у R5-тропных штаммов А6. Высокая частота встречаемости ряда мутаций, ранее описанных как связанные с устойчивостью к маравироку и подобным ему препаратам, может свидетельствовать о характерном для субсубтипа А6 естественном полиморфизме, не имеющем корреляции с резистентностью к антагонистам корецептора CCR5.

The aim of the study was to determine the tropism of the human immunodeficiency virus in patients with virological failure of antiretroviral therapy (ART) from the Arkhangelsk Region based on the analysis of the env gene V3 loop nucleotide sequence.

Materials and methods. We used blood plasma samples obtained from 76 HIV-infected persons from the Arkhangelsk Region with virological failure of antiretroviral therapy. The nucleotide sequences of the HIV env gene C2-V3-C3 region were studied by PCR followed by sequencing. The genotype of the studied strains was determined based on the analysis of their phylogenetic relations with reference sequences from the international GenBank database, as well as using specialized programs. To predict viral tropism, the Garrido rule and the online bioinformatic tool Geno2Pheno[coreceptor] were used. The Geno2Pheno[coreceptor] algorithm, determines the false positive rate (FPR) based on the analysis of the env gene V3 loop nucleotide sequence. Results and discussion. Significantly lower representation of R5X4/X4-tropic HIV variants in long-term infected persons with subsubtype A6 virus compared to subtype B virus has been shown. For all FPR cut-off algorithms, a significant correlation between subtype and HIV tropism was observed (p=0.0014 and p=0.013 for FPR 10 % and FPR 20 %, respectively). While among subtype B strains, at least 57 % were identified as R5X4/X4-tropic variants (for an FPR of 10 %), including two strains classified as X4-tropic; among HIV subsubtype A6 even at an FPR of 20 %, the frequency of R5X4/X4-tropic samples only slightly exceeded 22 %. It can be assumed that the dynamics of changes in HIV tropism depends on the virus subtype. Significant differences in the distribution of amino acid residues of the V3 region sequences in the examined group between R5-tropic and R5X4/X4-tropic strains of subsubtype A6 for positions 18 (χ2=7.616, p=0.0058), 21 (χ2=7.281, p=0.007), 24 (χ2=5.587, p=0.0181), and 34 (χ2=5.144, p=0.0233) have been demonstrated. Among the R5X4/X4-tropic strains of the A6 subsubtype, amino acid substitutions were registered at positions 6, 19, 21, 26, 29, 30, which were not found in the R5-tropic A6 strains. The high occurrence frequency of a number of mutations previously described as presumably associated with resistance to maraviroc and similar drugs may indicate a natural polymorphism characteristic of the A6 subsubtype, which does not correlate with resistance to CCR5 co-receptor antagonists.

вирус иммунодефицита человека (ВИЧ)корецепторный тропизм ВИЧCCR5CXCR4антагонисты рецептора CCR5ген envгенотипическая диагностикаhuman immunodeficiency virus (HIV)HIV co-receptor tropismCCR5CXCR4CCR5 receptor antagonistsenv genegenotypic diagnosticsReferencesUNAIDS data 2021. [Электронный ресурс]. URL: https://www.unaids.org/en/resources/documents/2021/2021_unaids_data (дата обращения 31.05.2022).UNAIDS data 2021. data (Cited 31 May 2022). [Internet]. Available from https://www.unaids.org/en/resources/documents/2021/2021unaids_data.Rhee S.Y., Kassaye S.G., Jordan M.R., Kouamou V., Katzenstein D., Shafer R.W. Public availability of HIV-1 drug resistance sequence and treatment data: a systematic review. Lancet Microbe. 2022; 3(5):e392-e398. DOI: 10.1016/S26665247(21)00250-0.Rhee S.Y., Kassaye S.G., Jordan M.R., Kouamou V., Katzenstein D., Shafer R.W. Public availability of HIV-1 drug resistance sequence and treatment data: a systema¬ tic review. Lancet Microbe. 2022; 3(5):e392-e398. DOI: 10.1016/S2666-5247(21)00250-0.Aiamkitsumrit B., Dampier W., Antell G., Rivera N., Martin-Garcia J., Pirrone V., Nonnemacher M.R., Wigdahl B. Bioinformatic analysis of HIV-1 entry and pathogenesis. Curr. HIV Res. 2014; 12(2):132–61. DOI: 10.2174/1570162x12666140526121746.Aiamkitsumrit B., Dampier W., Antell G., Rivera N., MartinGarcia J., Pirrone V., Nonnemacher M.R., Wigdahl B. Bioinformatic analysis of HIV-1 entry and pathogenesis. Curr. HIV Res. 2014; 12(2):132–61. DOI: 10.2174/1570162x12666140526121746.Riemenschneider M., Cashin K.Y., Budeus B., Sierra S., Shirvani-Dastgerdi E., Bayanolhagh S., Kaiser R., Gorry P.R., Heider D. Genotypic prediction of co-receptor tropism of HIV-1 subtypes A and C. Sci. Rep. 2016; 6:24883. DOI: 10.1038/srep24883.Riemenschneider M., Cashin K.Y., Budeus B., Sierra S., Shirvani-Dastgerdi E., Bayanolhagh S., Kaiser R., Gorry P.R., Heider D. Genotypic prediction of co-receptor tropism of HIV-1 subtypes A and C. Sci. Rep. 2016; 6:24883. DOI: 10.1038/srep24883.Щемелев А.Н., Семенов А.В., Останкова Ю.В., Зуева Е.Б., Валутите Д.Э., Семенова Д.А., Давыденко В.С., Тотолян А.А. Генетическое разнообразие и мутации лекарственной устойчивости ВИЧ-1 в Ленинградской области. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2022; 99(1):28–37. DOI: 10.36233/0372-9311-216.Shchemelev A.N., Semenov A.V., Ostankova Yu.V., Zueva E.B., Valutite D.E., Semenova D.A., Davydenko V.S., Totolyan A.A. [Genetic diversity and drug resistance mutations of HIV-1 in the Leningrad Region]. Zhurnal Mikrobiologii, Èpidemiologii i Immunobiologii [Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology]. 2022; 99(1):28–37. DOI: 10.36233/0372-9311-216.Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Поляков А.Н., Букин Е.К., Kaiser R., Luebke N., Куевда Д.А., Шипулин Г.А. Первый опыт применения стандартизированной генотипической методики определения тропизма ВИЧ. Клиническая лабораторная диагностика. 2013; 6:46–8.Lopatukhin A.E., Kireev D.E., Polyakov A.N., Bukin E.K., Kaiser R., Luebke N., Kuevda D.A., Shipulin G.A. [The first experience of using a standardized genotypic method for determining HIV tropism]. Klinicheskaya Laboratornaya Diagnostika [Clinical Laboratory Diagnostics]. 2013; (6):46–8.Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol. Biol. Evol. 2016; 33(7):1870–4. DOI: 10.1093/molbev/msw054.Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol. Biol. Evol. 2016; 33(7):1870–4. DOI: 10.1093/molbev/msw054.Struck D., Lawyer G., Ternes A.-M., Schmit J.-C., Bercoff D.P. COMET: adaptive context-based modeling for ultrafast HIV-1 subtype identification. Nucleic Acids Res. 2014; 42(18):e144. DOI: 10.1093/nar/gku739.Struck D., Lawyer G., Ternes A.-M., Schmit J.-C., Bercoff D.P. COMET: adaptive context-based modeling for ultrafast HIV-1 subtype identification. Nucleic Acids Res. 2014; 42(18):e144. DOI: 10.1093/nar/gku739.Seclén E., Garrido C., González M.M., González-Lahoz J., de Mendoza C., Soriano V., Poveda E. High sensitivity of specific genotypic tools for detection of X4 variants in antiretroviral-experienced patients suitable to be treated with CCR5 antagonists. J. Antimicrob. Chemother. 2010; 65(7):1486–92. DOI: 10.1093/jac/dkq137.Seclén E., Garrido C., González M.M., González-Lahoz J., de Mendoza C., Soriano V., Poveda E. High sensitivity of specific genotypic tools for detection of X4 variants in antiretroviral-experienced patients suitable to be treated with CCR5 antagonists. J. Antimicrob. Chemother. 2010; 65(7):1486–92. DOI: 10.1093/jac/dkq137.Попова Е.С., Сорокина Т.А. Информационный бюллетень центра по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями Государственного автономного учреждения здравоохранения Архангельской области «Архангельский клинический кожно-венерологический диспансер». 2018. № 1(38). [Электронный ресурс]. URL: http://www.kotlasgb.ru/for_patients/profilact/2017%20%D0%B3%D0%BE%D0%B4%20%D0%98%D0%BD%D1%84%D0%BE%D1%80%D0%BC%20%D0%B1%D1%8E%D0%BB%D0%BB%D0%B5%D1%82%D0%B5%D0%BD%D1%8C.doc (дата обращения 04.06.2022).Popova E.S., Sorokina T.A. [Information bulletin of the Center for the Prevention and Control of AIDS and Infectious Diseases of the State Autonomous Healthcare Institution of the Arkhangelsk Region “Arkhangelsk Clinical Dermatovenerological Dispensary”. Arkhangelsk]. 2018. No. 1(38). (Cited 04 Jun 2022). [Internet]. Available from: http://www.kotlasgb.ru/for_patients/profilact/2017%20%D0%B3%D0%BE%D0%B4%20%D0%98%D0%BD%D1%84%D0%BE%D1%80%D0%BC%20%D0%B1%D1%8E%D0%BB%D0%BB%D0%B5%D1%82%D0%B5%D0%BD%D1%8C.doc.Бобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ. М.: Человек; 2014. 288 с.Bobkova M.R. [Drug Resistance of HIV]. Moscow: Chelovek; 2014. 288 p.Останкова Ю.В., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Чурина М.А., Валутите Д.Э., Семенов А.В. Молекулярная эпидемиология и фармакорезистентность ВИЧ у пациентов с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии в Архангельской области. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2019; 11(4):79–90. DOI: 10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90.Ostankova Yu.V., Shchemelev A.N., Zueva E.V., Churina M.A., Valutite D.E., Semenov A.V. [HIV molecular epidemiology and pharmaco-resistance in patients with antiretroviral therapy failure in Arkhangelsk Region]. VICH Infektsiya i Immunosupressii [HIV Infection and Immunosuppressive Disorders]. 2019; 11(4):79– 90. DOI: 10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90.Martínez-Montesinos Y., Kourí-Cordellá V., Pérez-Santos L., Han R., Pintos-Saavedra Y., Alemán-Campos Y., Soto-Brito Y., Baños-Morales Y., Caturla-Fernández Y. Subtype-dependent coreceptor tropism in Cuban HIV-1-infected patients: implications for maraviroc treatment. MEDICC Rev. 2021; 23(3-4):29–36. DOI: 10.37757/MR2021.V23.N3.6.Martínez-Montesinos Y., Kourí-Cordellá V., Pérez-Santos L., Han R., Pintos-Saavedra Y., Alemán-Campos Y., Soto-Brito Y., Baños-Morales Y., Caturla-Fernández Y. Subtype-dependent coreceptor tropism in Cuban HIV-1-infected patients: implications for maraviroc treatment. MEDICC Rev. 2021; 23(3-4):29–36. DOI: 10.37757/MR2021.V23.N3.6.Chen X., Wang Z.X., Pan X.M. HIV-1 tropism prediction by the XGboost and HMM methods. Sci. Rep. 2019; 9(1):9997. DOI: 10.1038/s41598-019-46420-4.Chen X., Wang Z.X., Pan X.M. HIV-1 tropism prediction by the XGboost and HMM methods. Sci. Rep. 2019; 9(1):9997. DOI: 10.1038/s41598-019-46420-4.Archer J., Braverman M.S., Taillon B.E., Desany B., James I., Harrigan P.R., Lewis M., Robertson D.L. Detection of low-frequency pretherapy chemokine (CXC motif) receptor 4 (CXCR4)-using HIV-1 with ultra-deep pyrosequencing. AIDS. 2009; 23(10):1209– 18. DOI: 10.1097/QAD.0b013e32832b4399.Archer J., Braverman M.S., Taillon B.E., Desany B., James I., Harrigan P.R., Lewis M., Robertson D.L. Detection of low-frequency pretherapy chemokine (CXC motif) receptor 4 (CXCR4)-using HIV-1 with ultra-deep pyrosequencing. AIDS. 2009; 23(10):1209– 18. DOI: 10.1097/QAD.0b013e32832b4399.Brumme Z.L., Goodrich J., Mayer H.B., Brumme C.J., Henrick B.M., Wynhoven B., Asselin J.J., Cheung P.K., Hogg R.S., Montaner J.S., Harrigan P.R. Molecular and clinical epidemiology of CXCR4-using HIV-1 in a large population of antiretroviralnaive individuals. J. Infect. Dis. 2005; 192(3):466–74. DOI: 10.1086/431519.Brumme Z.L., Goodrich J., Mayer H.B., Brumme C.J., Henrick B.M., Wynhoven B., Asselin J.J., Cheung P.K., Hogg R.S., Montaner J.S., Harrigan P.R. Molecular and clinical epidemiology of CXCR4-using HIV-1 in a large population of antiretroviral-naive individuals. J. Infect. Dis. 2005; 192(3):466–74. DOI: 10.1086/431519.Schuitemaker H., Van’t Wout A. B., Lusso P. Clinical significance of HIV-1 coreceptor usage. J. Transl. Med. 2011; 9 (Suppl 1):S5. DOI: 10.1186/1479-5876-9-S1-S5.Schuitemaker H., Van’t Wout A. B., Lusso P. Clinical significance of HIV-1 coreceptor usage. J. Transl. Med. 2011; 9 (Suppl 1):S5. DOI: 10.1186/1479-5876-9-S1-S5.Nyamache A.K., Muigai A.W.T., Ng'ang'a Z., Khamadi S.A. Profile of HIV type 1 coreceptor tropism among Kenyan patients from 2009 to 2010. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2013; 29(8):1105–9. DOI: 10.1089/aid.2012.0284.Nyamache A.K., Muigai A.W.T., Ng’ang’a Z., Khamadi S.A. Profile of HIV type 1 coreceptor tropism among Kenyan patients from 2009 to 2010. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2013; 29(8):1105–9. DOI: 10.1089/aid.2012.0284.Esbjörnsson J., Månsson F., Martínez-Arias W., Vincic E., Biague A.J., da Silva Z.J., Fenyö E.M., Norrgren H., Medstrand P. Frequent CXCR4 tropism of HIV-1 subtype A and CRF02_AG during late-stage disease – indication of an evolving epidemic in West Africa. Retrovirology. 2010; 7:23. DOI: 10.1186/1742-4690-7-23.Esbjörnsson J., Månsson F., Martínez-Arias W., Vincic E., Biague A.J., da Silva Z.J., Fenyö E.M., Norrgren H., Medstrand P. Frequent CXCR4 tropism of HIV-1 subtype A and CRF02_AG du¬ ring late-stage disease – indication of an evolving epidemic in West Africa. Retrovirology. 2010; 7:23. DOI: 10.1186/1742-4690-7-23.Лебедев А.В., Нешумаев Д.А., Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Туманов А.С., Глущенко Н.В., Плотникова Ю.К., Пономарева О.А., Ярыгина Е.И., Бобкова М.Р. Сравнительный анализ генетических вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в Иркутской области в 1999 и 2012 гг. Вопросы вирусологии. 2016; 61(3):112–8. DOI: 10.18821/0507-4088-2016-61-3-112-118.Lebedev A.V., Neshumaev D.A., Kazennova E.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Tumanov A.S., Glushchenko N.V., Plotnikova Yu.K., Ponomareva O.A., Yarygina E.I., Bobkova M.R. [Comparative ana¬ lysis of genetic variants of the HIV-1 circulating in the Irkutsk Region in 1999 and 2012]. Voprosy Virusologii [Problems of Virology]. 2016; 61(3):112–8. DOI: 10.18821/0507-4088-2016-61-3-112-118.Матиевская Н.В., Киреев Д.Е., Дмитрюкова М.Ю., Токунова И.О., Кондратович И.А. Клинико-иммунологические и эпидемиологические особенности ВИЧ-инфекции в зависимости от тропизма ВИЧ-1. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015; 7(1):52–9.Matievskaya N.V., Kireev D.E., Dmitryukova M.Yu., Tokunova I.O., Kondratovich I.A. [Clinical, immunological and epidemiological features of HIV infection depending upon HIV-1 tropism]. VICH Infektsiya i Immunosupressii [HIV Infection and Immunosuppressive Disorders]. 2015; 7(1):52–9.Котова В.О., Балахонцева Л.А., Янович О.А., Липская Н.А., Ломакина Е.А., Герец А.Г., Давудова И.В., Кузьменко Е.В., Кожевников А.А., Троценко О.Е. Результаты исследования тропизма ВИЧ-1 у ВИЧ-инфицированных Дальневосточного федерального округа Российской Федерации. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2015; 28:61–6.Kotova V.O., Balakhontseva L.A., Yanovich O.A., Lipskaya N.A., Lomakina E.A., Gerets A.G., Davudova I.V., Kuz’menko E.V., Kozhevnikov A.A., Trotsenko O.E. [Results of investigation of HIV-1 tropism in HIV-infected patients on the territory of Far Eastern Federal District]. Dal’nevostochny Zhurnal Infektsionnoi Patologii [Far Eastern Journal of Infectious Pathology]. 2015; (28):61–6.Васильев А.В., Казеннова Е.В., Бобкова М.Р. Анализ распространенности мутаций устойчивости к препаратамантагонистам корецептора CCR5 среди вариантов ВИЧ-1 в России. Вопросы вирусологии. 2011; 56(3):32–7.Vasil’ev A.V., Kazennova E.V., Bobkova M.R. [Analysis of the prevalence of CCR5 co-receptor antagonist resistance mutations among HIV-1 variants in Russia]. Voprosy Virusologii [Problems of Virology]. 2011; 56(3):32–7.Lewis M.E., Jubb B., Simpson P., Lopatukhin A., Kireev D., Bobkova M., Craig C., van der Ryst E., Westby M., Butler S.L. Highly prevalent Russian HIV-1 V3-loop sequence variants are susceptible to maraviroc. Antivir. Chem. Chemother. 2021; 29:20402066211025156. DOI: 10.1177/20402066211025156.Lewis M.E., Jubb B., Simpson P., Lopatukhin A., Kireev D., Bobkova M., Craig C., van der Ryst E., Westby M., Butler S.L. Highly prevalent Russian HIV-1 V3-loop sequence variants are susceptible to maraviroc. Antivir. Chem. Chemother. 2021; 29:20402066211025156. DOI: 10.1177/20402066211025156.Kitawi R.C., Hunja C.W., Aman R., Ogutu B.R., Muigai A.W., Kokwaro G.O., Ochieng W. Partial HIV C2V3 envelope sequence analysis reveals association of coreceptor tropism, envelope glycosylation and viral genotypic variability among Kenyan patients on HAART. Virol. J. 2017; 14(1):29. DOI: 10.1186/s12985-017-0703-y.Kitawi R.C., Hunja C.W., Aman R., Ogutu B.R., Muigai A.W., Kokwaro G.O., Ochieng W. Partial HIV C2V3 envelope sequence analysis reveals association of coreceptor tropism, envelope glycosylation and viral genotypic variability among Kenyan patients on HAART. Virol. J. 2017; 14(1):29. DOI: 10.1186/s12985-017-0703-y

The authors declare that there are no conflicts of interest present.