microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2014-4-36-38microbe-182Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯ, ДИАГНОСТИКАMICROBIOLOGY, DIAGNOSTICSРезультаты изучения генетической гетерогенности РНК-изолятов хантавирусов, выделенных на территории Саратовской областиResults of Studies of Genetic Heterogeneity in Hantavirus RNA-Isolates, Found in the Territory of the Saratov RegionБилькоЕ. А.Bil’KoE. A.rusrapi@microbe.ruГаранинаС. Б.GaraninaS. B.rusrapi@microbe.ruМироноваН. И.MironovaN. I.noemail@neicon.ruЯковлевС. А.YakovlevS. A.rusrapi@microbe.ruЩербаковаС. А.ShcherbakovaS. A.rusrapi@microbe.ruРоссийский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»РоссияRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”Russian FederationГородская клиническая больница № 2 им. В.И.РазумовскогоРоссияV.I.Razumovsky Municipal Clinical Hospital No 2Russian Federation201420122014043638Copyright © Билько Е.А., Гаранина С.Б., Миронова Н.И., Яковлев С.А., Щербакова С.А., 20142014Билько Е.А., Гаранина С.Б., Миронова Н.И., Яковлев С.А., Щербакова С.А.Bil’Ko E.A., Garanina S.B., Mironova N.I., Yakovlev S.A., Shcherbakova S.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/182

С целью получения данных о внутривидовом разнообразии хантавирусов, циркулирующих на территории Саратовской области, проведено молекулярно-генетическое исследование полевого и клинического материала. Методом ПЦР РНК хантавирусов была обнаружена в 25 пробах от мелких млекопитающих и 15 пробах крови от людей с диагнозом ГЛПС. Секвенирование выделенных 14 РНК-образцов хантавирусов от грызунов и 3 РНК-образцов клинического материала позволило определить их таксономическую принадлежность к вирусу Пуумала. В ходе филогенетического анализа РНК-изолятов установлено, что все они имеют высокий уровень гомологии между собой (99,8 %) и значительные отличия от известных штаммов Пуумала, распространенных на территории РФ (3,6-21 %). Таким образом, с помощью молекулярно-генетических методов подтверждена циркуляция вируса Пуумала на территории Саратовской области. Выявленная генетическая дистанцированность Саратовских РНК-изолятов, в частности, открывает дальнейшие перспективы для определения места инфицирования больных ГЛПС.

With a view to obtain the data on intraspecific diversity of Hantaviruses circulating in the territory of the Saratov Region, carried out has been molecular-genetic testing of the field and clinical material. Using PCR assay, Hantavirus RNA has been detected in 25 samples obtained from small mammals and 15 blood samples of HFRS patients. Sequencing of 14 hantavirus RNA-isolates from rodents and 3 RNA-isolates from clinical material has made it possible to identify their taxonomic appurtenance to Puumala virus. Phylogenetic analysis of RNA-isolates has revealed that all of them are characterized by high degree of homology in between themselves (99.8 %) and substantial distinction from the known Puumala strains, frequently occurring in Russia (3.6-21 %). Therewith, verified has been circulation of Puumala virus in the territory of the Saratov Region using molecular-genetic techniques. Identified genetic differences of Saratov RNA-isolates, in particular, opens a further prospect for allocation of the sites where people can contract HFRS infection.

ГЛПСхантавирусывирус ПуумалагенотипированиеПЦРHFRShantavirusesPuumala virusgenotypingPCRReferencesЗаяц Н.А., Кузнецов В.И., Гаврилова И.Б., Сретенская Д.А., Царёва Т.Д., Бабиченко О.Е. Эпидемиологические и клинико-биохимические аспекты геморрагической лихорадки с почечным синдромом в Саратовской области. Усп. совр. естествознания. 2008; 6:91-2.Zayats N.A., Kuznetsov V.I., Gavrilova I.B., Sretenskaya D.A., Tsareva T.D., Babichenko O.E. [Epidemiological and clinical-biochemical aspects of hemorrhagic fever with renal syndrome in the Saratov Region]. Uspekhi Sovrem. Estestvozn. 2008; 6:91–2.Куличенко А.Н., Шульдяков А.А., Решетников А.А., Хорошун Е.В., Рамазанова К.Х., Сатарова С.А. Современные клинико-иммунологические особенности геморрагической лихорадки с почечным синдромом в Саратовской области. Инф. бол. 2008; 2:21-3.Kulichenko A.N., Shul’dyakov A.A., Reshetnikov A.A., Khoroshun E.V., Ramazanova K.Kh., Satarova S.A. [Modern clinical-immunological peculiarities of HFRS in the Saratov region]. Inf. Bol. 2008; 2: 21–3.Ткаченко Е.А., Дзагурова Т.К., Бернштейн А.Д., Окулова Н.М., Коротина Н.А., Транквилевский Д.В., Морозов Г.В., Юничева Ю.В., Завора Д.Л., Баловнева М.В., Соцкова С.Е., Мутных Е.С., Смирнова М.С., Леонович О.А., Шевелев А.Б., Малкин Г.А. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом в России - проблема XXI века. Вестник Российской акад. естественных наук. 2012; 1:48-54.Tkachenko E.A., Dzagurova T.K., Bernshtein A.D., Okulova N.M., Korotina N.A., Trankvilevsky D.V.Morozov G.V., Yunicheva Yu.V., Zavora D.L., Balovneva M.V., Sotskova S.E., Mutnykh E.S., Smirnova M.S., Leonovich O.A., Shevelev A.B., Malkin G.A. [HFRS in Russia – challenge of the XXI century]. Vestnik Ros. Akad. Estesstv. Nauk. 2012: 48–54.Рябова А.В., Чекашов В.Н., Матросов А.Н., Яковлев С.А., Шилов М.М., Попов Н.В. Очаги геморрагической лихорадки с почечным синдромом города Аткарска Саратовской области. ЗНиСО. 2014; 2:27-9.Ryabova A.V., Chekashov V.N., Matrosov A.N., Yakovlev S.A., Shilov M.M., Popov N.V. [HFRS foci in Atkarsk city of the Saratov region]. Zdor. Nas. Sreda Obit. 2014; 2: 27–9.Garanina S.B., Platonov A.E., Zhuravlev V.I., Murashkina A.N., Yakimenko V.V., Korneev A.G., Shipulin G.A. Genetic diversity and geographic distribution of Hantaviruses in Russia. Zoonoses Public Health. 2009; 6-7:297-309.Garanina S.B., Platonov A.E., Zhuravlev V.I., Murashkina A.N., Yakimenko V.V., Korneev A.G., Shipulin G.A. Genetic diversity and geographic distribution of Hantaviruses in Russia. Zoonoses Public Health. 2009; 6–7:297–309.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.