<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">microbe</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Проблемы особо опасных инфекций</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Problems of Particularly Dangerous Infections</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">0370-1069</issn><issn pub-type="epub">2658-719X</issn><publisher><publisher-name>Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe”</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.21055/0370-1069-2023-3-108-117</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">microbe-1862</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Сравнительный анализ структуры возбудителей внебольничных и внутрибольничных пневмоний у пациентов в медицинских организациях Ростовской, Тюменской областей и Хабаровского края в современный период пандемии новой коронавирусной инфекции</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Comparative Analysis of the Pathogen Structure in Patients with Community-Acquired and Nosocomial Pneumonia in Medical Organizations of the Rostov, Tyumen Regions and Khabarovsk Territory at the Current Stage of a New Coronavirus Infection Pandemic</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-8287-4294</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Павлович</surname><given-names>Н. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Pavlovich</surname><given-names>N. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Павлович Наталья Владимировна</p><p>Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М . Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">pavlovich_nv@antiplague.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4059-2878</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Чемисова</surname><given-names>О. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Chemisova</surname><given-names>O. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М . Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-7772-9276</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Аронова</surname><given-names>Н. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Aronova</surname><given-names>N. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М . Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4091-649X</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Цимбалистова</surname><given-names>М. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Tsimbalistova</surname><given-names>M. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М . Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4010-2138</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Анисимова</surname><given-names>А. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Anisimova</surname><given-names>A. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М . Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-6114-9891</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Гудуева</surname><given-names>Е. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Gudueva</surname><given-names>E. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М . Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Колотова</surname><given-names>О. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kolotova</surname><given-names>O. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 625026, Тюмень, ул. Республики, 147</p><p>ORCID: https://orcid.org/0000-0001-0798-5549</p></bio><bio xml:lang="en"><p>147, Respubliki St., Tyumen, 625026, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">info@tniikip.rospotrebnadzor.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9966-8454</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Катаева</surname><given-names>Л. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kataeva</surname><given-names>L. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 625026, Тюмень, ул. Республики, 147</p></bio><bio xml:lang="en"><p>147, Respubliki St., Tyumen, 625026, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">info@tniikip.rospotrebnadzor.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-5420-0919</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Степанова</surname><given-names>К. Б.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Stepanova</surname><given-names>K. B.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 625026, Тюмень, ул. Республики, 147</p></bio><bio xml:lang="en"><p>147, Respubliki St., Tyumen, 625026, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">info@tniikip.rospotrebnadzor.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-9197-8519</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Бондаренко</surname><given-names>А. П.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Bondarenko</surname><given-names>A. P.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 680610, Хабаровск, ул.  Шевченко, 2</p></bio><bio xml:lang="en"><p>2, Shevchenko St., Khabarovsk, 680610, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">adm@hniiem.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-3585-7026</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Теплякова</surname><given-names>Е. Д.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Teplyakova</surname><given-names>E. D.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 344065, Ростов-на-Дону, ул. 1-й Конной Армии, 33</p></bio><bio xml:lang="en"><p>33, 1st Konnoy Armii St., Rostov-on-Don, 344065, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">minzdrav@donland.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-3050-4472</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Троценко</surname><given-names>О. Е.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Trotsenko</surname><given-names>O. E.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 680610, Хабаровск, ул.  Шевченко, 2</p></bio><bio xml:lang="en"><p>2, Shevchenko St., Khabarovsk, 680610, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">adm@hniiem.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-6289-6274</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Степанова</surname><given-names>Т. Ф.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Stepanova</surname><given-names>T. F.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 625026, Тюмень, ул. Республики, 147</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-0550-2221</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Носков</surname><given-names>А. К.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Noskov</surname><given-names>A. K.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М . Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation</p></bio><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Rostov-on-Don Research Anti-Plague Institute</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>ФБУН «Тюменский научно-исследовательский институт краевой инфекционной патологии»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Tyumen Research Institute of Regional Infectious Pathology</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-3"><aff xml:lang="ru"><institution>ФБУН «Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-4"><aff xml:lang="ru"><institution>Министерство здравоохранения Ростовской области</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Ministry of Health of the Rostov Region</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2023</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>04</day><month>10</month><year>2023</year></pub-date><volume>0</volume><issue>3</issue><fpage>108</fpage><lpage>117</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Павлович Н.В., Чемисова О.С., Аронова Н.В., Цимбалистова М.В., Анисимова А.С., Гудуева Е.Н., Колотова О.Н., Катаева Л.В., Степанова К.Б., Бондаренко А.П., Теплякова Е.Д., Троценко О.Е., Степанова Т.Ф., Носков А.К., 2023</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Павлович Н.В., Чемисова О.С., Аронова Н.В., Цимбалистова М.В., Анисимова А.С., Гудуева Е.Н., Колотова О.Н., Катаева Л.В., Степанова К.Б., Бондаренко А.П., Теплякова Е.Д., Троценко О.Е., Степанова Т.Ф., Носков А.К.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Pavlovich N.V., Chemisova O.S., Aronova N.V., Tsimbalistova M.V., Anisimova A.S., Gudueva E.N., Kolotova O.N., Kataeva L.V., Stepanova K.B., Bondarenko A.P., Teplyakova E.D., Trotsenko O.E., Stepanova T.F., Noskov A.K.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1862">https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1862</self-uri><abstract><p>Цель работы – сравнительный анализ спектра и антибиотикорезистентности возбудителей вторичных пневмоний, выделенных на территориях Ростовской, Тюменской областей и Хабаровского края на фоне пандемии новой коронавирусной инфекции.</p><sec><title>Материалы и методы</title><p>Материалы и методы. Исследованы образцы мокроты от SARS‑CoV‑2-позитивных и SARS‑CoV‑2-негативных пациентов с внебольничными пневмониями из медицинских организаций с использованием бактериологического метода, ПЦР , масс-спектрометрии.</p></sec><sec><title>Результаты и обсуждение</title><p>Результаты и обсуждение. Изучение этиологической структуры возбудителей вторичных пневмоний, выделенных от больных в медицинских организациях Южного, Уральского и Дальневосточного федеральных округов, показало, что доминирующими культурами у SARS‑CoV‑2-позитивных и SARS‑CoV‑2-негативных пациентов являются дрожжи и дрожжеподобные грибы. Обнаружено, что при разнообразии изолированных грибов превалировал вид Candida albicans. Бактериальная микрофлора представлена разнообразными грамположительными и грамотрицательными бактериями, из которых наиболее часто в мокроте присутствовали Staphylococcus aureus и Klebsiella pneumoniaе. Установлено также, что еще до госпитализации больных внебольничные пневмонии могут быть обусловлены микроорганизмами группы ESKAPE (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniaе, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter spp.), которые обычно рассматриваются как полиантибиотикорезистентные возбудители нозокомиальных инфекций. Более того, у SARS‑CoV‑2-позитивных пациентов с вторичной внебольничной пневмонией эти возбудители выделялись в 2–3 раза чаще, чем у SARS‑CoV‑2-негативных больных. При анализе чувствительности/устойчивости изолированных штаммов к антибактериальным препаратам установлена общая тенденция: большинство штаммов, вне зависимости от вида, характеризовались узким спектром чувствительности, имея три и более маркеров антибиотикорезистентности. Это подтверждает необходимость и целесообразность микробиологического сопровождения больного в течение всего инфекционного процесса. Наиболее адекватными препаратами выбора, обеспечивающими активность против 60–70 % штаммов семейства Enterobacteriaceae, являются амикацин и цефоперазон/сульбактам.</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>The aim of the study was to conduct a comparative analysis of the spectrum and antibiotic resistance of secondary pneumonia pathogens isolated in the territories of the Rostov, Tyumen Regions and Khabarovsk Territory against the background of a new coronavirus infection pandemic.</p><sec><title>Materials and methods</title><p>Materials and methods. We investigated sputum samples from coronavirus-positive and coronavirus-negative patients with community-acquired pneumonia from medical organizations using bacteriological method, PCR mass spectrometry.</p></sec><sec><title>Results and discussion</title><p>Results and discussion. The study of the etiological structure of secondary pneumonia agents isolated from patients in medical organizations of the Southern, Ural and Far Eastern Federal Districts has revealed that the dominant cultures in SARS‑CoV‑2 “+” and SARS‑CoV‑2 “–” patients were yeast and yeast-like fungi. It has been found that under diversity of isolated fungi, Candida albicans species prevailed. The bacterial microflora is represented by a variety of gram-positive and gram-negative bacteria, of which Staphylococcus aureus and Klebsiella pneumoniaе were most often present in sputum. It has also been established that even before hospitalization of patients, community-acquired pneumonia could be caused by microorganisms of the ESKAPE group (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniaе, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter spp.), which are usually considered as polyantibiotic-resistant pathogens of nosocomial infections. Moreover, in coronavirus-positive patients with secondary community-acquired pneumonia, those pathogens were isolated 2–3 times more frequently than in coronavirus-negative ones. Assessment of sensitivity/resistance of isolated strains to antibacterial drugs has revealed a general trend: the majority of the strains, regardless of the type, were characterized by a narrow spectrum of sensitivity, having 3 or more markers of antibiotic resistance. This confirms the necessity and expediency of microbiological support of the patient during the entire infectious process. The most adequate drugs of choice, providing activity against 60–70 % of strains of the Enterobacteriaceae family, are amikacin and cefoperazone/sulbactam.</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>возбудители внебольничной и внутрибольничной пневмонии</kwd><kwd>антибиотикорезистентность</kwd><kwd>COVID-19</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>community-acquired and nosocomial pneumonia</kwd><kwd>antibiotic resistance</kwd><kwd>COVID-19</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Aslam B., Wang W., Arshad M.I., Khurshid M., Muzammil S., Rasool M.H., Nisar M.A., Alvi R.F., Aslam M.A., Qamar M.U., Salamat M.K.F., Baloch Z. Antibiotic resistance: a rundown of a global crisis. Infect. Drug Resist. 2018; 11:1645–58. DOI: 10.2147/IDR.S173867.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Aslam B., Wang W., Arshad M.I., Khurshid M., Muzammil S., Rasool M.H., Nisar M.A., Alvi R.F., Aslam M.A., Qamar M.U., Salamat M.K.F., Baloch Z. Antibiotic resistance: a rundown of a global crisis. Infect. Drug Resist. 2018; 11:1645–58. DOI: 10.2147/IDR.S173867.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Lansbury L., Lim B., Baskaran V., Lim W.S. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J. Infect. 2020; 81(2):266–75. DOI: 10.1016/j.jinf.2020.05.046.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Lansbury L., Lim B., Baskaran V., Lim W.S. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J. Infect. 2020; 81(2):266–75. DOI: 10.1016/j.jinf.2020.05.046.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Sharov K.S. SARS‑CoV‑2-related pneumonia cases in pneumonia picture in Russia in March-May 2020: Secondary bacterial pneumonia and viral co-infections. J. Glob. Health. 2020; 10(2):020504. DOI: 10.7189/jogh.10.020504.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sharov K.S. SARS‑CoV‑2-related pneumonia cases in pneumonia picture in Russia in March-May 2020: Secondary bacterial pneumonia and viral co-infections. J. Glob. Health. 2020; 10(2):020504. DOI: 10.7189/jogh.10.020504.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Катаева Л.В., Вакарина А.А., Степанова Т.Ф., Степанова К.Б. Микробиота нижних дыхательных путей при внебольничных пневмониях, в том числе ассоциированных c SARS‑CoV‑2. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021; 98(5):528–37. DOI: 10.36233/0372-9311-107.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kataeva L.V., Vakarina A.A., Stepanova T.F., Stepanova K.B. [Microbiota of the lower respiratory tract in case of community-acquired pneumonia, including those associated with SARS‑CoV‑2]. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii [Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology]. 2021; 98(5):528–37. DOI: 10.36233/0372-9311-107.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Павлович Н.В., Цимбалистова М.В., Аронова Н.В., Анисимова А.С., Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Гудуева Е.Н., Сагакянц М.М., Ковалев Е.В., Носков А.К. Внебольничные пневмонии бактериальной этиологии и спектр чувствительности возбудителей к антибиотикам у коронапозитивных и коронанегативных больных г. Ростова-на-Дону. Антибиотики и химиотерапия. 2021; 66(1-2):26–32. DOI: 10.37489/0235-2990-2021-66-1-2-26-32.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Pavlovich N.V., Tsimbalistova M.V., Aronova N.V., Anisimova A.S., Vodop’yanov S.O., Vodop’yanov A.S., Gudueva E.N., Sagakyants M.M., Kovalev E.V., Noskov A.K. [Communityacquired pneumonia of bacterial etiology and antibiotic sensitivity spectrum in coronavirus-positive and coronavirus-negative patients in Rostov-on-Don]. Antibiotiki i Khimioterapiya [Antibiotics and Chemotherapy]. 2021; 66(1-2):26–32. DOI: 10.37489/0235-2990-2021-66-1-2-26-32.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Бондаренко А.П., Шмыленко В.А., Троценко О.Е., Котова В.О., Бутакова Л.В., Базыкина Е.А. Характеристика бактериальной микрофлоры, выделенной из проб мокроты больных пневмонией в Хабаровске и Хабаровском крае в начальный период пандемии COVID-19 (май–июнь 2020 г.). Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 3:43–9. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-3-43-49.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bondarenko A.P., Shmylenko V.A., Trotsenko O.E., Kotova V.O., Butakova L.V., Bazykina E.A. [Characteristics of bacterial microflora isolated from sputum of patients with pneumonia registered in Khabarovsk city and Khabarovsk Territory in the initial period of COVID-19 pandemic in May–June, 2020]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2020; (3):43–9. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-3-43-49.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Носков А.К., Ковалев Е.В. Чемисова О.С., Твердохлебова Т.И., Павлович Н.В., Водопьянов С.О., Цимбалистова М.В., Гаевская Н.Е., Воловикова С.Ф., Стенина С.И., Гудуева Е.Н., Сагакянц М.М., Алешукина А.В., Слись С.С. Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 4:99–105. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-4-99-105.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Popova A.Yu., Ezhlova E.B., Demina Yu.V., Noskov A.K., Kovalev E.V., Chemisova O.S., Tverdokhlebova T.I., Pavlovich N.V., Vodop’yanov S.O., Tsimbalistova M.V., Gaevskaya N.E., Volovikova S.V., Stenina S.I., Gudueva E.N., Sagakyants M.M., Aleshukina A.V., Slis’ S.S. [Features of etiology of community-acquired pneumonia associated with COVID-19]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2020; (4):99–105. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-4-99-105.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Patil R.H., Luptáková D., Havlíček V. Infection metallomics for critical care in the post-COVID era. Mass Spectrom. Rev. 2021; Dec 2. DOI: 10.1002/mas.21755.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Patil R.H., Luptáková D., Havlíček V. Infection metallomics for critical care in the post-COVID era. Mass Spectrom. Rev. 2021; Dec 2. DOI: 10.1002/mas.21755.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Фесенко О.В., Швайко С.Н. Пневмонии, вызванные Klebsiella pneumonia (фридлендеровские пневмонии). Практическая пульмонология. 2019; 1:22–31.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Fesenko O.V., Shvaiko S.N. [Pneumonia caused by Klebsiella pneumonia (Friedländer pneumonia)]. Prakticheskaya Pul’monologiya [Practical Pulmonology]. 2019; (1):22–31.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Харитонов М.А., Салухов В.В., Крюков Е.В., Паценко М.Б., Рудаков Ю.В., Богомолов А.Б., Иванов В.В., Минаков А.А. Вирусные пневмонии: новый взгляд на старую проблему (обзор литературы). Медицинский совет. 2021; 16:60–77. DOI: 10.21518/2079-701X-2021-16-60-77.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kharitonov M.A., Salukhov V.V., Kryukov E.V., Patsenko M.B., Rudakov Yu.V., Bogomolov A.B., Ivanov V.V., Minakov A.A. [Viral pneumonia: a new approach to an old problem (literature review)]. Meditsinsky Sovet [Medical Advice]. 2021; (16):60–77. DOI: 10.21518/2079-701X-2021-16-60-77.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Авдеева М.Г., Кулбужева М.И., Зотов С.В., Журавлева Е.В., Яцукова А.В. Микробный пейзаж у госпитальных больных с новой коронавирусной инфекцией COVID-19, сравнительная антибиотикорезистентность с «доковидным» периодом: проспективное исследование. Кубанский научный медицинский вестник. 2021; 28(5):14–28. DOI: 10.25207/1608-6228-2021-28-5-14-28.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Avdeeva M.G., Kulbuzheva M.I., Zotov S.V., Zhuravleva E.V., Yatsukova A.V. [Microbial landscape in hospitalized patients with new coronavirus infection COVID-19, comparative antibiotic resistance with pre-COVID period: a prospective study]. Kubansky Nauchny Meditsinsky Vestnik [Kuban Scientific Medical Bulletin]. 2021; 28(5):14–28. DOI: 10.25207/1608-6228-2021-28-5-14-28.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Эсауленко Н.Б., Каменева О.А., Косякова К.Г., Зайцев А.А., Казаков С.П., Тутельян А.В., Акимкин В.Г. Нозокомиальные инфекции и микробиологический мониторинг в многопрофильных лечебных учреждениях. Медицинский алфавит. 2018; 2(35):14–9.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Esaulenko N.B., Kameneva O.A., Kosyakova K.G., Zaitsev A.A., Kazakov S.P., Tutel’yan A.V., Akimkin V.G. [Nosocomial infections and microbiological monitoring in multi-functional medical treatment institutions]. Meditsinsky Alfavit [Medical Alphabet]. 2018; 2(35):14–9.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Steinbach W.J., Roilides E., Berman D., Hoffman J.A., Groll A.H., Bin-Hussain I., Palazzi D.L., Castagnola E., Halasa N., Velegraki A., Dvorak C.C., Charkabarti A., Sung L., Danziger-Isakov L., Lachenauer C., Arrieta A., Knapp K., Abzug M.J., Ziebold C., Lehrnbecher T., Klingspor L., Warris A., Leckerman K., Martling T., Walsh T.J., Benjamin D.K. Jr, Zaoutis T.E. Results from a prospective, international, epidemiologic study of invasive candidiasis in children and neonates. Pediatr. Infect. Dis. J. 2012; 31(12):1252–7. DOI: 10.1097/INF.0b013e3182737427.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Steinbach W.J., Roilides E., Berman D., Hoffman J.A., Groll A.H., Bin-Hussain I., Palazzi D.L., Castagnola E., Halasa N., Velegraki A., Dvorak C.C., Charkabarti A., Sung L., Danziger-Isakov L., Lachenauer C., Arrieta A., Knapp K., Abzug M.J., Ziebold C., Lehrnbecher T., Klingspor L., Warris A., Leckerman K., Martling T., Walsh T.J., Benjamin D.K. Jr, Zaoutis T.E. Results from a prospective, international, epidemiologic study of invasive candidiasis in children and neonates. Pediatr. Infect. Dis. J. 2012; 31(12):1252–7. DOI: 10.1097/INF.0b013e3182737427.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kathuria S., Singh P.K., Sharma C., Prakash A., Masih A., Kumar A., Meis J.F., Chowdhary A. Multidrug-resistant Candida auris misidentified as Candida haemulonii: characterization by matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry and DNA sequencing and its antifungal susceptibility profile variability by Vitek 2, CLSI broth microdilution, and Etest method. J. Clin. Microbiol. 2015; 53(6):1823–30. DOI: 10.1128/JCM.00367-15.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kathuria S., Singh P.K., Sharma C., Prakash A., Masih A., Kumar A., Meis J.F., Chowdhary A. Multidrug-resistant Candida auris misidentified as Candida haemulonii: characterization by matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry and DNA sequencing and its antifungal susceptibility profile variability by Vitek 2, CLSI broth microdilution, and Etest method. J. Clin. Microbiol. 2015; 53(6):1823–30. DOI: 10.1128/JCM.00367-15.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Багирова Н.С., Дмитриева Н.В. Резистентность Candida spp. к амфотерицину B у онкологических больных. Журнал инфектологии. 2016; 8(1):26–31.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bagirova N.S., Dmitrieva N.V. [Resistance of Candida spp. to amphotericin B in cancer patients]. Zhurnal Infektologii [Journal of Infectology]. 2016; 8(1):26–31.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Канашенко М.Е., Карцев Н.Н., Мицевич И.П., Храмов М.В., Светоч Э.А. Elizabethkingia meningoseptica как значимый клинический патоген. Бактериология. 2019; 4(1):58–63. DOI: 10.20953/2500-1027-2019-1-58-63.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kanashenko M.E., Kartsev N.N., Mitsevich I.P., Khramov M.V., Svetoch E.A. [Elizabethkingia meningoseptica as a significant clinical pathogen]. Bakteriologiya [Bacteriology]. 2019; 4(1):58–63. DOI: 10.20953/2500-1027-2019-1-58-63.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Канашенко М.Е., Мицевич И.П., Карцев Н.Н., Асташкин Е.И., Детушева Е.В., Храмов М.В., Светоч Э.А., Фурсова Н.К. Elizabethkingia meningoseptica – характеристика клинически значимого патогена. Бактериология. 2021; 6(1):8–15. DOI: 10.20953/2500-1027-2021-1-8-15.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kanashenko M.E., Mitsevich I.P., Kartsev N.N., Astashkin E.I., Detusheva E.V., Khramov M.V., Svetoch E.A., Fursova N.K. [Elizabethkingia meningoseptica: characteristics of a clinically significant pathogen]. Bakteriologiya [Bacteriology]. 2021; 6(1):8–15. DOI: 10.20953/2500-1027-2021-1-8-15.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Гельфанд Б.Р., Проценко Д.Н., Белоцерковский Б.З., редакторы. Нозокомиальная пневмония у взрослых: Российские национальные рекомендации. 2-е изд., перераб. и доп. М.: Изд-во «Медицинское информационное агентство»; 2016. 176 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Gelfand B.R., Protsenko D.N., Belotserkovsky B.Z., editors. [Nosocomial Pneumonia in Adults: Russian National Guidelines]. 2nd ed., revised and expanded. Moscow: Publishing House “Medical Information Agency”; 2016. 176 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Анисимова А.С., Полеева М.В., Аронова Н.В., Цимбалистова М.В., Павлович Н.В. Особенности идентификации грибов рода Candida с помощью масс-спектрометрического анализа (MALDI-ToF MS). Клиническая лабораторная диагностика. 2022; 67(4):244–9. DOI: 10.51620/0869-2084-2022-67-4-244-249.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Anisimova A.S., Poleeva M.V., Aronova N.V., Tsimbalistova M.V., Pavlovich N.V. [Peculiarities of fungi identification of the genus Candida using mass spectrometric analysis (MALDI-ToF MS)]. Klinicheskaya Laboratornaya Diagnostika [Clinical Laboratory Diagnostics]. 2022; 67(4):244–9. DOI: 10.51620/0869-2084-2022-67-4-244-249.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
