<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">microbe</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Проблемы особо опасных инфекций</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Problems of Particularly Dangerous Infections</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">0370-1069</issn><issn pub-type="epub">2658-719X</issn><publisher><publisher-name>Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe”</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.21055/0370-1069-2025-3-93-98</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">microbe-2211</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Фаготипирование штаммов холерных вибрионов О1-серогруппы, выделенных из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 2024 г.</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Phage Typing of Cholera Vibrio Strains of Serogroup O1, Isolated in the Territory of the Russian Federation in 2024</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-0762-3628</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Гаевская</surname><given-names>Н. Е.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Gaevskaya</surname><given-names>N. E.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-7831-7767</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Сизова</surname><given-names>Ю. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Sizova</surname><given-names>Yu. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-9359-3997</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Тюрина</surname><given-names>А. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Tyurina</surname><given-names>A. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9779-3577</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Погожова</surname><given-names>М. П.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Pogozhova</surname><given-names>M. P.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-6540-2778</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Кругликов</surname><given-names>В. Д.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kruglikov</surname><given-names>V. D.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0009-0009-0502-8727</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Богдан</surname><given-names>О. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Bogdan</surname><given-names>O. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40</p></bio><bio xml:lang="en"><p>117/40, M. Gor’kogo St., Rostov-on-Don, 344002</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Rostov-on-Don Research Anti-Plague Institute</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2025</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>06</day><month>10</month><year>2025</year></pub-date><volume>0</volume><issue>3</issue><fpage>93</fpage><lpage>98</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Гаевская Н.Е., Сизова Ю.В., Тюрина А.В., Погожова М.П., Кругликов В.Д., Богдан О.А., 2025</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Гаевская Н.Е., Сизова Ю.В., Тюрина А.В., Погожова М.П., Кругликов В.Д., Богдан О.А.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Gaevskaya N.E., Sizova Y.V., Tyurina A.V., Pogozhova M.P., Kruglikov V.D., Bogdan O.A.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2211">https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2211</self-uri><abstract><p>Холера остается актуальным инфекционным заболеванием, требующим особой настороженности специалистов системы здравоохранения и санитарно-эпидемиологической службы. Особый интерес представляют отслеживание вероятного распространения штаммов при завозе, выявление связи между эпидемическими вспышками или единичными случаями заболевания и оценка происхождения выделенных штаммов. Одним из инструментов решения таких задач является фаготипирование. Цель исследования – провести фаготипирование штаммов холерных вибрионов О1-серогруппы, поступивших в Референс-центр по мониторингу за холерой в 2024 г. Материалы и методы. В работе использовали 300 нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae O1 El Tor, выделенных в течение 2024 г. из объектов окружающей среды в различных регионах Российской Федерации при проведении мониторинговых исследований на холеру. Определена чувствительность к бактериофагам диагностическим классическому, эльтор, типирующим и экспериментальным фаговым коктейлям. Результаты и обсуждение. Исследования показали, что 100 % штаммов устойчивы к классическому диагностическому холерному бактериофагу, в то время как к фагу эльтор чувствительны 17 %. Применение типирующих холерных бактериофагов позволило определить фаготипы 11 культур (в г. Ростове-на-Дону – одиннадцатый, в г. Элисте Республики Калмыкия – четвертый и первый, в Донецкой Народной Республике – двенадцатый, в Херсонской области – семнадцатый), что составило 5,6 % от общего количества. При этом выявлены фаготипы, не встречавшиеся ранее на территориях данных субъектов РФ, что свидетельствует о завозном характере выделенных штаммов. Чувствительными к компонентам экспериментальных фаговых коктейлей К1 и К2 оказались 42 культуры (К1 – 8 %, К2 – 6 % всех штаммов). Результаты проведенных исследований свидетельствуют о нарастании фагоустойчивости выделяемых штаммов холерных вибрионов и актуальности регулярного поиска новых бактериофагов с оценкой возможности их использования в качестве компонентов диагностических и профилактических препаратов.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Currently, cholera remains a relevant infectious disease that requires special vigilance from healthcare professionals and sanitary-epidemiological services. In this regard, the ability to track the likely spread of strains when imported, identify the link between epidemic outbreaks or isolated cases of the disease, and assess the origin of the isolated strains is of particular interest. Phage typing is one of the tools for solving such problems. The aim was to conduct phage typing of strains of cholera vibrios of serogroup O1 received by the Reference Center for Cholera Monitoring in 2024. Materials and methods. The work used 300 non-toxigenic strains of Vibrio cholerae O1 El Tor, isolated from environmental objects in various regions of the Russian Federation during monitoring studies for cholera in 2024. Sensitivity to diagnostic bacteriophages classical, El Tor, typing and experimental phage cocktails was determined. Results and discussion. The studies have shown that 100 % of the strains were resistant to the classic diagnostic cholera bacteriophage, while 17 % were sensitive to the El Tor phage. The use of typing cholera bacteriophages made it possible to determine the phage types of 11 cultures (in Rostov-on-Don – the eleventh one, in Elista, Republic of Kalmykia – the fourth and first ones, in the Donetsk People’s Republic – the twelfth, in the Kherson Region – the seventeenth), which amounted to 5.6 % of the total. At the same time, phage types were identified that had not previously been encountered in the territories of these entities of the Russian Federation, which indicates the imported nature of the isolated strains. 42 cultures were sensitive to the components of the experimental phage cocktails K1 and K2 (K1 – 8 %, K2 – 6 % of all strains). The results of the conducted studies indicate an increase in the phage resistance of the isolated strains of cholera vibrios and the relevance of a regular search for new bacteriophages with an assessment of the possibility of their use as components of diagnostic and prophylactic drugs.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>холера</kwd><kwd>мониторинг</kwd><kwd>бактериофаги</kwd><kwd>фаготипирование</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>cholera</kwd><kwd>monitoring</kwd><kwd>bacteriophages</kwd><kwd>phage typing</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Попова А.Ю., Носков А.К., Ежлова Е.Б., Кругликов В.Д., Монахова Е.В., Чемисова О.С., Лопатин А.А., Иванова С.М., Подойницына О.А., Водопьянов А.С., Левченко Д.А., Савина И.В. Эпидемиологическая ситуация по холере в Российской Федерации в 2023 г. и прогноз на 2024 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2024; (1):76–88. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-1-76-88.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Popova A.Yu., Noskov A.K., Ezhlova E.B., Kruglikov V.D., Monakhova E.V., Chemisova O.S., Lopatin A.A., Ivanova S.M., Podoynitsyna O.A., Vodop’yanov A.S., Levchenko D.A., Savina I.V. Epidemiological situation on cholera in the Russian Federation in 2023 and forecast for 2024. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2024; (1):76–88. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-1-76-88.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ломов Ю.М., Сомова А.Г., Кудрякова Т.А. Холерные фаги. Ростов н/Д; 1990. 160 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Lomov Yu.M., Somova A.G., Kudryakova T.A. Cholera Phages. Rostov-on-Don; 1990. 160 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Rouard C., Njamkepo E., Quilici M.-L., Weill F.X. Contribution of microbial genomics to cholera epidemiology. C. R. Biol. 2022; 345(1):37–56. DOI: 10.5802/crbiol.77.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rouard C., Njamkepo E., Quilici M.-L., Weill F.X. Contribution of microbial genomics to cholera epidemiology. C. R. Biol. 2022; 345(1):37–56. DOI: 10.5802/crbiol.77.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Rowe B., Frost J.A. Vibrio phages and phage-typing. In: Barua D., Greenough W.B., editors. Cholera. Part of Current Topics in Infectious Disease. Boston; 1992. P. 95–105. DOI: 10.1007/978-1-4757-9688-9_5.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rowe B., Frost J.A. Vibrio phages and phage-typing. In: Barua D., Greenough W.B., editors. Cholera. Part of Current Topics in Infectious Disease. Boston; 1992. P. 95–105. DOI: 10.1007/978-1-4757-9688-9_5.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Chattopadhyay D.J., Sarkar B.L., Ansari M.Q., Chakrabarti B.K., Roy M.K., Ghosh A.N., Pal S.C. New phage typing scheme for Vibrio cholerae O1 biotype El Tor strains. J. Clin. Microbiol. 1993; 31(6):1579–85. DOI: 10.1128/jcm.31.6.1579-1585.1993.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Chattopadhyay D.J., Sarkar B.L., Ansari M.Q., Chakrabarti B.K., Roy M.K., Ghosh A.N., Pal S.C. New phage typing scheme for Vibrio cholerae O1 biotype El Tor strains. J. Clin. Microbiol. 1993; 31(6):1579–85. DOI: 10.1128/jcm.31.6.1579-1585.1993.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Sarkar B.L., De S.P., Saha M.R., Niyogi S.K., Roy M.K. Validity of new phage typing scheme against Vibrio cholerae О1 biotype El Tor strains. Indian J. Med. Res. 1994; 99:159–61.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sarkar B.L., De S.P., Saha M.R., Niyogi S.K., Roy M.K. Validity of new phage typing scheme against Vibrio cholerae О1 biotype El Tor strains. Indian J. Med. Res. 1994; 99:159–61.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Челдышова Н.Б., Заднова С.П., Абрамова Е.Г., Никифоров А.К., Девдариани З.Л. Холерные бактериофаги: история открытия, строение и применение. Проблемы особо опасных инфекций. 2024; (4):42–53. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-4-42-53.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Cheldyshova N.B., Zadnova S.P., Abramova E.G., Nikiforov A.K., Devdariani Z.L. Cholera bacteriophages: history of discovery, structure and application. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2024; (4):42–53. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-4-42-53.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Дрожевкина М.С., Арутюнов Ю.И. Способ фаготипирования холерных вибрионов. Патент SU550850A1, опубл. 23.09.1977. Бюл. № 35.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Drozhevkina M.S., Arutyunov Yu.I. Method for phage typing of cholera vibrios. Patent SU550850A1, published 23 Sept 1977. Bulletin No. 35.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Попова А.Ю., Кутырев В.В., редакторы. Холера: эпидемиология, диагностика, клиника, лечение, профилактика. Ростов н/Д: ООО «Мини-Тайп»; 2024. 718 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Popova A.Yu., Kutyrev V.V., editors. Cholera: Epidemiology, Diagnostics, Clinical Picture, Treatment, Prevention. Rostov-onDon: LLC “Mini-Type”; 2024. 718 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Дрожевкина М.С., Арутюнов Ю.И., составители. Методические рекомендации по фаготипированию холерных вибрионов. М.; 1983. 10 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Drozhevkina M.S., Arutyunov Yu.I., compilers. Methodical Recommendations for Phage Typing of Cholera Vibrios. Moscow; 1983. 10 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
