microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2025-3-160-169microbe-2220Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESВыявление возбудителей природно-очаговых инфекционных болезней бактериальной природы в отдельных районах Херсонской и Запорожской областей в 2023 г.Identification of Pathogens of Natural Focal Infectious Diseases of Bacterial Origin in Certain Areas of the Kherson and Zaporozhe Regions in 2023https://orcid.org/0000-0001-7754-2201УльшинаД. В.Ul’shinaD. V.

355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15.

13–15, Sovetskaya St., Stavropol, 355035

vladidiana@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8882-6477ВасильеваО. В.Vasil’evaO. V.

355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15.

13–15, Sovetskaya St., Stavropol, 355035

https://orcid.org/0000-0002-9044-1808ГнусареваО. А.GnusarevaO. A.

355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15.

13–15, Sovetskaya St., Stavropol, 355035

https://orcid.org/0000-0001-9442-6966СирицаЮ. В.SiritsaYu. V.

355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15.

13–15, Sovetskaya St., Stavropol, 355035

https://orcid.org/0000-0001-5554-5882ВолынкинаА. С.VolynkinaA. S.

355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15.

13–15, Sovetskaya St., Stavropol, 355035

https://orcid.org/0009-0000-3647-2550МихайловаМ. Е.MikhailovaM. E.

355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15.

13–15, Sovetskaya St., Stavropol, 355035

https://orcid.org/0000-0002-3207-6742ШапошниковаЛ. И.ShaposhnikovaL. I.

355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15.

13–15, Sovetskaya St., Stavropol, 355035

https://orcid.org/0000-0002-9362-3949КуличенкоА. Н.KulichenkoA. N.

355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15.

13–15, Sovetskaya St., Stavropol, 355035

ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт»РоссияStavropol Research Anti-Plague InstituteRussian Federation20250610202503160169Copyright © Ульшина Д.В., Васильева О.В., Гнусарева О.А., Сирица Ю.В., Волынкина А.С., Михайлова М.Е., Шапошникова Л.И., Куличенко А.Н., 20252025Ульшина Д.В., Васильева О.В., Гнусарева О.А., Сирица Ю.В., Волынкина А.С., Михайлова М.Е., Шапошникова Л.И., Куличенко А.Н.Ul’shina D.V., Vasil’eva O.V., Gnusareva O.A., Siritsa Y.V., Volynkina A.S., Mikhailova M.E., Shaposhnikova L.I., Kulichenko A.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2220

Цель работы – определение видовой принадлежности и генетического разнообразия возбудителей бактериальных природно-очаговых инфекций для уточнения спектра циркулирующих патогенов в отдельных районах Херсонской и Запорожской областей. Материалы и методы. Проведено эпизоотологическое обследование территории Верхнерогачикского, Генического, Новотроицкого районов Херсонской области, Акимовского, Бердянского, Васильевского, Веселовского, Мелитопольского, Пологовского районов Запорожской области. Исследование полевого материала осуществлялось молекулярно-генетическими, серологическим, биологическим методами. Выполнено секвенирование изолятов ДНК боррелий по фрагменту гена 16S рРНК, фрагментов генов (gltA, ompB) изолятов ДНК Rickettsia spр., MLVA-25-типирование штаммов Francisella tularensis. Статистический анализ результатов лабораторных исследований проводили с использованием программы Microsoft Excel 2010. Картографическим методом данные проанализировали с применением программы ArcGIS 10.3. Результаты и обсуждение. Установлена циркуляция возбудителей туляремии, лептоспироза (Leptospira icterohaemorrhagiae, L. grippotyphosa), риккетсиозов (Rickettsia aeschlimannii, R. heilongjiangensis, R. conorii, R. slovaca, R. vini), иксодового клещевого боррелиоза (Borrelia afzelii, B. miyamotoii) на территории отдельных районов Херсонской и Запорожской областей. В Запорожской области выявлены маркеры Anaplasma phagocytophilum. Полученные данные свидетельствуют о возможной совместной циркуляции возбудителей лептоспироза, клещевых риккетсиозов, иксодового клещевого боррелиоза в Геническом районе Херсонской области; туляремии, лептоспироза, клещевых риккетсиозов, иксодового клещевого боррелиоза, гранулоцитарного анаплазмоза человека в Мелитопольском районе Запорожской области; лептоспироза, клещевых риккетсиозов, иксодового клещевого боррелиоза, гранулоцитарного анаплазмоза человека в Бердянском районе Запорожской области. Получена информация о циркуляции возбудителей туляремии, лептоспироза, риккетсиозов, иксодового клещевого боррелиоза на территории отдельных районов Херсонской и Запорожской областей, что позволяет предположить наличие очагов сочетанных инфекций. На обследованной территории возможна вспышечная и спорадическая заболеваемость природноочаговыми инфекциями. Для оценки эпидемического потенциала территорий требуется дальнейшее эпизоотологическое обследование, оценка численности и видового состава носителей и переносчиков возбудителей природно-очаговых инфекций, анализ заболеваемости.

The aim of the study was to determine the species affiliation and genetic diversity of pathogens of bacterial natural focal infections in order to refine the spectrum of circulating agents in certain areas of the Kherson and Zaporozhe Regions. Materials and methods. An epizootiological survey of the territory of Verkhnerogachik, Genichesk, Novotroitsk districts of the Kherson Region, Akimov, Berdyansk, Vasilievsk, Veselovsky, Melitopol, Pologovsky districts of the Zaporozhe Region was conducted. The study of field material was carried out by molecular-genetic, serological, and biological methods. Sequencing of Borrelia DNA isolates by a fragment of the 16S rRNA gene, fragments of genes (gltA, ompB) of Rickettsia spp. DNA isolates, MLVA-25 typing of Francisella tularensis strains were performed. Statistical analysis of the laboratory test results was performed using Microsoft Excel 2010. The data were analyzed using the cartographic method applying ArcGIS 10.3. Results and discussion. The circulation of pathogens of tularemia, leptospirosis (Leptospira icterohaemorrhagiae, L. grippotyphosa), rickettsiosis (Rickettsia aeschlimannii, R. heilongjiangensis, R. conorii, R. slovaca, R. vini), Ixodidae tick-borne borreliosis (Borrelia afzelii, B. miyamotoii) in individual areas of the Kherson and Zaporozhe Regions has been established. Markers of Anaplasma phagocytophilum have been identified in the Zaporozhe Region. The data obtained indicate a possible joint circulation of pathogens of leptospirosis, tick-borne rickettsiosis, Ixodidae tick-borne borreliosis in the Genichesky district of the Kherson Region; tularemia, leptospirosis, tick-borne rickettsiosis, Ixodidae tick-borne borreliosis, human granulocytic anaplasmosis in the Melitopol district of the Zaporozhe Region; leptospirosis, tick-borne rickettsiosis, Ixodidae tick-borne borreliosis, human granulocytic anaplasmosis in the Berdyansk district of the Zaporozhe Region. Based on the results of the conducted studies, information on the circulation of pathogens of tularemia, leptospirosis, rickettsiosis, Ixodidae tick-borne borreliosis in certain areas of the Kherson and Zaporozhe Regions has been obtained, which suggests the presence of foci of combined infections. Outbreak and sporadic incidence of natural focal infections is possible in the surveyed area. To assess the epidemic potential of territories, further epizootiological examination, assessment of the number and species composition of carriers and vectors of pathogens of natural focal infections, and an analysis of morbidity are required.

природно-очаговые инфекцииидентификацияХерсонская областьЗапорожская областьтуляремиялептоспирозклещевые риккетсиозыиксодовый клещевой боррелиозnatural focal infectionsidentificationKherson RegionZaporozhe Regiontularemialeptospirosistickborne rickettsiosisIxodidae tick-borne borreliosisReferencesДедок Л.А., Марущак Л.В., Полупан И.Н., Меженский А.А. Серологический мониторинг лихорадки Ку среди поголовья сельскохозяйственных животных на территории Украины. Ветеринарна біотехнологія. 2020; (37):31–6.Dedok L.A., Marushchak L.V., Polupan I.N., Mezhenskyi A.A. [The serological monitoring of Q fever in farm animals in Ukraine]. Veterinarna Biotekhnologiya [Veterinary Biotechnology]. 2020; (37):31–6.Hightower J., Kracalik I.T., Vydayko N., Goodin D., Glass G., Blackburn J.K. Historical distribution and host-vector diversity of Francisella tularensis, the causative agent of tularemia, in Ukraine. Parasit. Vectors. 2014; 7:453. DOI: 10.1186/s13071-014-0453-2.Hightower J., Kracalik I.T., Vydayko N., Goodin D., Glass G., Blackburn J.K. Historical distribution and host-vector diversity of Francisella tularensis, the causative agent of tularemia, in Ukraine. Parasit. Vectors. 2014; 7:453. DOI: 10.1186/s13071-014-0453-2.Kovryha N., Tsyhankova A., Zelenuchina O., Mashchak O., Terekhov R., Rogovskyy A.S. Prevalence of Borrelia burgdorferi and Anaplasma phagocytophilum in ixodid ticks from Southeastern Ukraine. Vector Borne Zoonotic Dis. 2021; 21(4):242–6. DOI: 10.1089/vbz.2020.2716.Kovryha N., Tsyhankova A., Zelenuchina O., Mashchak O., Terekhov R., Rogovskyy A.S. Prevalence of Borrelia burgdorferi and Anaplasma phagocytophilum in ixodid ticks from Southeastern Ukraine. Vector Borne Zoonotic Dis. 2021; 21(4):242–6. DOI: 10.1089/vbz.2020.2716.Романенко Т.А., Скрипка Л.В. Анализ заболеваемости туляремией населения Донецкого региона. Университетская клиника. 2021; 4(41):100–7. DOI: 10.26435/uc.v0i4(41).750.Romanenko T.A., Skripka L.V. [The analysis of the incidence of tularemia in the population of the Donetsk region]. Universitetskaya Klinika [University Clinic]. 2021; 4(41):100–7. DOI: 10.26435/uc.v0i4(41).750.Сокиркина Е.Н., Носков А.К., Пичурина Н.Л., Цай А.В., Симакова Д.И., Ковалев Е.В. Современная эпизоотологоэпидемиологическая ситуация по коксиеллезу на территориях Южного, Северо-Кавказского федеральных округов, Донецкой, Луганской Народных Республик, Запорожской и Херсонской областей. Медицинский вестник Юга России. 2024; 15(2):142–54. DOI: 10.21886/2219-8075-2024-15-2-142-154.Sokirkina E.N., Noskov A.K., Pichurina N.L., Tsay A.V., Simakova D.I., Kovalev Y.V. [The current epizootic and epidemiological situation of coxiellosis in the territories of the Southern, North Caucasian Federal Districts, Donetsk, Lugansk People’s Republics, Zaporizhe and Kherson regions]. Meditsinsky Vestnik Yuga Rossii [Medical Herald of the South of Russia]. 2024; 15(2):142–54. DOI: 10.21886/2219-8075-2024-15-2-142-154.Мельник О.А. Проблемные вопросы лептоспироза (на примере Северного Причерноморья). Клиническая инфектология и паразитология. 2019; 8(4):476–83.Melnik O. [Problem issues of leptospirosis (on the example of the northern Black Sea coast]. Klinicheskaya Infektologiya i Parazitologiya [Clinical Infectology and Parasitology]. 2019; 8(4):476–83.Ukhovskyi V., Pyskun A., Korniienko L., Aliekseieva H., Moroz O., Pyskun O., Kyivska G., Mezhenskyi A. Serological prevalence of Leptospira serovars among pigs in Ukraine during the period of 2001–2019. Vet. Med. (Praha). 2022; 67(1):13–27. DOI: 10.17221/50/2021-VETMED.Ukhovskyi V., Pyskun A., Korniienko L., Aliekseieva H., Moroz O., Pyskun O., Kyivska G., Mezhenskyi A. Serological prevalence of Leptospira serovars among pigs in Ukraine during the period of 2001–2019. Vet. Med. (Praha). 2022; 67(1):13–27. DOI: 10.17221/50/2021-VETMED.Полищук С.В., Быченко Д.Д. Ландшафтно-географические и природно-климатические условия для формирования природных очагов лептоспироза в Республике Крым на примере Джанкойского района и Присивашья. Известия сельскохозяйственной науки Тавриды. 2021; (28):125–37.Polishchuk S.V., Bychenko D.D. [Landscape-geographical and climatic conditions for the formation of natural foci of leptospirosis in the Republic of Crimea on the example of Dzhankoy district and Prisivashye]. Izvestiya Sel’skokhozyaistvennoy Nauki Tavridy [Bulletin of Taurida Agricultural Science]. 2021; (28):125–37.Pyskun A., Ukhovskyi V., Pyskun O., Nedosekov V., Kovalenko V., Nychyk S., Sytiuk M., Iwaniak W. Presence of antibodies against Leptospira interrogans serovar hardjo in serum samples from cattle in Ukraine. Pol. J. Microbiol. 2019; 68(3):295–302. DOI: 10.33073/pjm-2019-031.Pyskun A., Ukhovskyi V., Pyskun O., Nedosekov V., Kovalenko V., Nychyk S., Sytiuk M., Iwaniak W. Presence of antibodies against Leptospira interrogans serovar hardjo in serum samples from cattle in Ukraine. Pol. J. Microbiol. 2019; 68(3):295–302. DOI: 10.33073/pjm-2019-031.Темякова С.Ю., Водопьянов А.С., Писанов Р.В. Молекулярно-генетический анализ штамма B. afzellii, выделенного на территории ДНР в 2023 году. В кн.: Проблемы и перспективы развития инновационных технологий. СПб.; 2023. С. 5–8. DOI: 10.37539/230922.2023.26.36.003.Temyakova S.Yu., Vodopyanov A.S., Pisanov R.V. [Molecular genetic analysis of the B. afzelli, strain isolated in the DPR territory in 2023]. In: [Problems and Prospects for the Development of Innovative Technologies]. St. Petersburg; 2023. P. 5–8. DOI: 10.37539/230922.2023.26.36.003.Panteleienko O.V., Chernenko L.M., Vydayko N.B., Ukhovskyi V.V., Melnyk A.Y., Tsarenko T.M. Lyme borreliosis in humans and dogs: One Health perspective. Regulatory Mechanisms in Biosystems. 2023; 14(4):570–5. DOI: 10.15421/022383.Panteleienko O.V., Chernenko L.M., Vydayko N.B., Ukhovskyi V.V., Melnyk A.Y., Tsarenko T.M. Lyme borreliosis in humans and dogs: One Health perspective. Regulatory Mechanisms in Biosystems. 2023; 14(4):570–5. DOI: 10.15421/022383.Иващенко Ю.Г., Ермачкова П.А. Исследование распространенности Rickettsia spp. в клещах в Крыму с использованием ПЦР в режиме реального времени. В кн.: Теоретические и практические аспекты современной медицины: Материалы Всероссийской научно-практической конференции с международным участием, посвященной проведению Международного года фундаментальных наук в интересах устойчивого развития (26 апреля 2022 г., Симферополь). Симферополь: Медицинская академия имени С.И. Георгиевского; 2022. С. 108–10.Ivashchenko Yu.G., Ermachkova P.A. [A study of the prevalence of Rickettsia spp. in ticks in Crimea using real-time PCR]. In: [Theoretical and Practical Aspects of Modern Medicine: Proceedings of the All-Russian Scientific and Practical Conference with International Participation Dedicated to the International Year of Fundamental Sciences for Sustainable Development (April 26, 2022, Simferopol)]. Simferopol: S.I. Georgievsky Medical Academy; 2022. P. 108–10.Гафарова М.Т., Бондаренко Е.И., Малый К.Д., Алиева Э.Э., Евстафьев И.Л., Товпинец Н.Н., Малая Н.К., Кубышкин А.В. Распространённость возбудителей трансмиссивных клещевых риккетсиозов на Крымском полуострове. Клиническая лабораторная диагностика. 2022; 67(3):170–6. DOI: 10.51620/0869-2084-2022-67-3-170-176.Gafarova M.T., Bondarenko E.I., Мaliy K.D., Alieva E.E., Evstafiev I.L., Tovpinec N.N., Мalaya N.K., Kubyshkin A.V. [Prevalence of causative agents of transmissive tick-borned ricketsioses in the Crimean peninsula]. Klinicheskaya Laboratornaya Diagnostika [Russian Clinical Laboratory Diagnostics]. 2022; 67(3):170–6. DOI: 10.51620/0869-2084-2022-67-3-170-176.Yin X., Guo S., Ding C., Cao M., Kawabata H., Sato K., Ando S., Fujita H., Kawamori F., Su H., Shimada M., Shimamura Y., Masuda S., Ohashi N. Spotted fever group Rickettsiae in Inner Mongolia, China, 2015–2016. Emerg. Infect. Dis. 2018; 24(11):2105–7. DOI: 10.3201/eid2411.162094.Yin X., Guo S., Ding C., Cao M., Kawabata H., Sato K., Ando S., Fujita H., Kawamori F., Su H., Shimada M., Shimamura Y., Masuda S., Ohashi N. Spotted fever group Rickettsiae in Inner Mongolia, China, 2015–2016. Emerg. Infect. Dis. 2018; 24(11):2105–7. DOI: 10.3201/eid2411.162094.Wijnveld M., Shhötta A.-M., Pintér A., Stockinger H., Stanek G. Novel Rickettsia raoultii strain isolated and propagated from Austrian Dermacentor reticulatus ticks. Parasit. Vectors. 2016; 9(1):567. DOI: 10.1186/s13071-016-1858-x.Wijnveld M., Shhötta A.-M., Pintér A., Stockinger H., Stanek G. Novel Rickettsia raoultii strain isolated and propagated from Austrian Dermacentor reticulatus ticks. Parasit. Vectors. 2016; 9(1):567. DOI: 10.1186/s13071-016-1858-x.Johansson A., Farlow J., Larsson P., Dukerich M., Chambers E., Byström M., Fox J., Chu M., Forsman M., Sjöstedt A., Keim P. Worldwide genetic relationships among Francisella tularensis isolates determined by multiple-locus variable-number tandem repeat analysis. J. Bacteriol. 2004; 186(17):5808–18. DOI: 10.1128/JB.186.17.5808-5818.2004.Johansson A., Farlow J., Larsson P., Dukerich M., Chambers E., Byström M., Fox J., Chu M., Forsman M., Sjöstedt A., Keim P. Worldwide genetic relationships among Francisella tularensis isolates determined by multiple-locus variable-number tandem repeat analysis. J. Bacteriol. 2004; 186(17):5808–18. DOI: 10.1128/JB.186.17.5808-5818.2004.Fukunaga M., Hamase A., Okada K., Inoue H., Tsuruta Y., Miyamoto K., Nakao M. Characterization of spirochetes isolated from ticks (Ixodes tanuki, Ixodes turdus, and Ixodes columnae) and comparison of the sequences with those of Borrelia burgdorferi sensu lato strains. Appl. Environ. Microbiol. 1996; 62(7):2338−44. DOI: 10.1128/aem.62.7.2338-2344.1996.Fukunaga M., Hamase A., Okada K., Inoue H., Tsuruta Y., Miyamoto K., Nakao M. Characterization of spirochetes isolated from ticks (Ixodes tanuki, Ixodes turdus, and Ixodes columnae) and comparison of the sequences with those of Borrelia burgdorferi sensu lato strains. Appl. Environ. Microbiol. 1996; 62(7):2338−44. DOI: 10.1128/aem.62.7.2338-2344.1996.Basic Local Alignment Search Tool. [Электронный ресурс]. URL: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi.Basic Local Alignment Search Tool. [Internet]. Available from: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi.MLVAbank for Microbes Genotyping. [Электронный ресурс]. URL: https://microbesgenotyping.i2bc.paris-saclay.fr/databases/view/524/2?panel=911.MLVAbank for Microbes Genotyping. [Internet]. Available from: http://microbesgenotyping.i2bc.paris-saclay.fr/databases/view/524/2?panel=911.Гнусарева О.А., Котенев Е.С., Волынкина А.С., Чишенюк Т.И., Куличенко А.Н. Молекулярно-эпидемиологический анализ вспышки туляремии в Ставропольском крае в 2017 г. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2018; 7(3):57–61. DOI: 10.24411/2305-3496-2018-13008.Gnusareva O.A., Kotenev E.S., Volynkina A.S., Chishenyuk T.I., Kulichenko A.N. [Molecular-epidemiological analysis of the tularemia outbreak in the Stavropol Territory in 2017]. Infektsionnye Bolezni: Novosti, Mneniya, Obuchenie [Infectious Diseases: News, Opinions, Training]. 2018; 7(3):57–61. DOI: 10.24411/2305-3496-2018-13008.Цимбалистова М.В., Сорокин В.М., Аронова Н.В., Анисимова А.С., Пичурина Н.Л., Пасюкова Н.И., Селянская Н.А., Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Павлович Н.В., Ковалев Е.В., Носков А.К. Биологические свойства и генетическая характеристика штаммов Francisella tularensis, изолированных на территории Ростовской области в 2020 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2021; (3):134–40. DOI: 10.21055/0370-1069-2021-3-134-140.Tsimbalistova M.V., Sorokin V.M., Aronova N.V., Anisimova A.S., Pichurina N.L., Pasyukova N.I., Selyanskaya N.A., Vodop’yanov S.O., Vodop’yanov A.S., Pisanov R.V., Pavlovich N.V., Kovalev E.V., Noskov A.K. [Biological properties and genetic characteristics of Francisella tularensis strains isolated in the territory of the Rostov Region in 2020]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2021; (3):134–40. DOI: 10.21055/0370-1069-2021-3-134-140.Рудаков Н.В., Самойленко И.Е. Риккетсии и риккетсиозы группы клещевой пятнистой лихорадки. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучения. 2007; (2):43–8.Rudakov N.V., Samoylenko I.E. [Rickettsiae and rickettsioses of spotted fever group]. Infektsionnye Bolezni: Novosti, Mneniya, Obuchenie. [Infectious Diseases: News, Opinions, Training]. 2007; (2):43–8.Gafarova M.T., Eremeeva M.E. History and current status of Mediterranean Spotted Fever (MSF) in the Crimean Peninsula and neighboring regions along the Black Sea coast. Pathogens. 2023; 12(9):1161. DOI: 10.3390/pathogens12091161.Gafarova M.T., Eremeeva M.E. History and current status of Mediterranean Spotted Fever (MSF) in the Crimean Peninsula and neighboring regions along the Black Sea coast. Pathogens. 2023; 12(9):1161. DOI: 10.3390/pathogens12091161.Рудакова С.А., Теслова О.Е., Канешова Н.Е., Штрек С.В., Якименко В.В., Пеньевская Н.А. Геновидовое разнообразие боррелий в иксодовых клещах на территории юга Западной Сибири. Проблемы особо опасных инфекций. 2019; (4):92–6. DOI: 10.21055/0370-1069-2019-4-92-96.Rudakova S.A., Teslova O.E., Kaneshova N.E., Shtrek S.V., Yakimenko V.V., Penyevskaya N.A. [Genospecies diversity of borrelia in ixodes ticks of the West Siberia]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2019; (4):92–6. DOI: 10.21055/0370-1069-2019-4-92-96.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.