microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2025-4-110-120microbe-2257Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESСлучай выделения в медицинской организации штамма возбудителя бруцеллеза от пациента с инфекционным эндокардитомA Case of Isolation of a Brucella melitensis Strain from a Patient with Infectious Endocarditis in Medical Organizationhttps://orcid.org/0000-0002-8334-9173ПортенкоС. А.PortenkoS. A.

Портенко Светлана Анатольевна, 

410005, Саратов, ул. Университетская, 46

Svetlana A. Portenko, 

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005

rusrapi@microbe.ruhttps://orcid.org/0000-0002-2572-8933БилькоЕ. А.Bil’koE. A.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005

rusrapi@microbe.ruhttps://orcid.org/0000-0003-1790-0411КазанцевА. В.KazantsevA. V.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005

rusrapi@microbe.ruhttps://orcid.org/0009-0008-2029-0646КорешковаО. А.KoreshkovaO. A.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005

rusrapi@microbe.ruhttps://orcid.org/0000-0003-0954-5683ОсинаН. А.OsinaN. A.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005

rusrapi@microbe.ruhttps://orcid.org/0009-0005-4582-6863ДемахинаК. Р.DemakhinaK. R.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005

rusrapi@microbe.ruhttps://orcid.org/0000-0002-2766-2624СитмбетовД. А.SitmbetovD. A.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005

rusrapi@microbe.ruhttps://orcid.org/0000-0002-4909-2394КрасновЯ. М.KrasnovYa. M.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005

rusrapi@microbe.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8260-4670КатышевА. Д.KatyshevA. D.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005

rusrapi@microbe.ruhttps://orcid.org/0009-0000-7575-653XКатышевС. Д.KatyshevS. D.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005

rusrapi@microbe.ruhttps://orcid.org/0000-0001-5308-0022ОсинА. В.OsinA. V.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005

rusrapi@microbe.ruТитоваО. А.TitovaO. A.

410086, Саратов, Московское шоссе, сооружение 133К

Bld. 133K, Moskovskoe Highway, Saratov, 410086

sarodikb@yandex.ruРазумоваИ. В.RazumovaI. V.

410086, Саратов, Московское шоссе, сооружение 133К

Bld. 133K, Moskovskoe Highway, Saratov, 410086

sarodikb@yandex.ruСофьинаА. В.Sof’inaA. V.

410012, Саратов, ул. Большая Казачья, 112

112, Bolshaya Kazachya St., Saratov, 410012

meduniv@sgmu.ruЛяпинаЕ. П.LyapinaE. P.

410012, Саратов, ул. Большая Казачья, 112

112, Bolshaya Kazachya St., Saratov, 410012

meduniv@sgmu.ruhttps://orcid.org/0009-0002-9860-527XВяткинИ. Н.VyatkinI. N.

 410028, Саратов, ул. Вольская, 7

7, Volskaya St., Saratov, 410028

ФКУН «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»РоссияRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe” of the RospotrebnadzorRussian FederationГУЗ «Саратовская областная инфекционная больница имени Н.Р. Иванова»РоссияSaratov Regional Infectious Diseases Hospital named after N.R. IvanovRussian FederationФГБОУ ВО «Саратовский государственный медицинский университет имени В.И. Разумовского» Министерства здравоохранения Российской ФедерацииРоссияSaratov State Medical University named after V.I. Razumovsky of the Ministry of Health of the Russian FederationRussian FederationУправление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Саратовской областиРоссияRospotrebnadzor Administration in the Saratov RegionRussian Federation20251401202604110120Copyright © Портенко С.А., Билько Е.А., Казанцев А.В., Корешкова О.А., Осина Н.А., Демахина К.Р., Ситмбетов Д.А., Краснов Я.М., Катышев А.Д., Катышев С.Д., Осин А.В., Титова О.А., Разумова И.В., Софьина А.В., Ляпина Е.П., Вяткин И.Н., 20262026Портенко С.А., Билько Е.А., Казанцев А.В., Корешкова О.А., Осина Н.А., Демахина К.Р., Ситмбетов Д.А., Краснов Я.М., Катышев А.Д., Катышев С.Д., Осин А.В., Титова О.А., Разумова И.В., Софьина А.В., Ляпина Е.П., Вяткин И.Н.Portenko S.A., Bil’ko E.A., Kazantsev A.V., Koreshkova O.A., Osina N.A., Demakhina K.R., Sitmbetov D.A., Krasnov Y.M., Katyshev A.D., Katyshev S.D., Osin A.V., Titova O.A., Razumova I.V., Sof’ina A.V., Lyapina E.P., Vyatkin I.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2257

Цель работы – верификация и расширенная идентификация штамма возбудителя бруцеллеза, выделенного в медицинской организации от пациента с диагнозом «инфекционный эндокардит с обширным поражением трикуспидального клапана».

Материалы и методы

Материалы и методы. Исследовали клинический материал от больного (кровь, сыворотка крови), выделенную культуру возбудителя бруцеллеза. В медицинской организации проводили исследование крови на стерильность с использованием анализатора гемокультур BC60 и идентификацией выросших колоний на масс-спектрометре VITEK® MS. В Центре индикации проводили исследования проб клинического материала от больного и углубленное изучение полученного из медицинской организации штамма Brucella spp. 1079 с применением бактериологического, серологического, масс-спектрометрического, молекулярно-генетического методов и высокопроизводительного секвенирования.

Результаты и обсуждение

Результаты и обсуждение. В лаборатории медицинской организации из пробы крови больного выделен штамм, предварительно идентифицированный как Brucella spp. При углубленных исследованиях в Центре индикации на основании комплекса фенотипических и молекулярно-биологических методов данный штамм верифицирован и отнесен к виду Brucella melitensis генотипа IIi. Исследуемая культура чувствительна к гентамицину, стрептомицину, левофлоксацину, доксициклину, рифампицину, амикацину, канамицину, тетрациклину, промежуточно устойчива к налидиксовой кислоте и ципрофлоксацину, не чувствительна к цефтриаксону и триметоприму-сульфаметоксазолу. В пробах крови и сыворотке крови от указанного пациента выявлены нуклеотидные последовательности генов бруцелл omp25 и omp2a, на основании анализа которых установлено наличие в исследуемых образцах B. melitensis. В сыворотке крови больного выявлены IgМ и IgG к возбудителю бруцеллеза. В результате проведенного исследования выделенная в медицинской организации от пациента с диагнозом «инфекционный эндокардит с обширным поражением трикуспидального клапана» культура возбудителя бруцеллеза верифицирована и идентифицирована как B. melitensis генотипа IIi. Данный случай подтверждает необходимость формирования настороженности персонала лечебных учреждений в отношении особо опасных инфекций, а также координированной работы учреждений различных ведомств.

The aim of the work consisted in verification and detailed identification of the causative agent of brucellosis isolated from a patient diagnosed with infectious endocarditis with extensive tricuspid valve damage.

Materials and methods

Materials and methods. We investigated the clinical material from the affected person (blood, blood serum) and the obtained culture of brucellosis agent. Medical organization performed tests for sterility of blood using a BC60 hemoculture analyzer. Identification of the grown colonies was carried out on a VITEK® MS mass spectrometer. The Indication Center conducted studies of clinical material samples from the patient and an in-depth study of the Brucella spp. 1079 strain obtained from the medical organization using bacteriological, serological, mass spectrometric, molecular-genetic methods, and high-throughput sequencing.

Results and discussion

Results and discussion. The strain, primarily identified as Brucella spp., was isolated from a patient’s blood sample in a laboratory at the medical facility. Following in-depth testing at the Indication Center using a combination of phenotypic and molecular biological methods, this strain was verified and assigned to Brucella melitensis genotype IIi. The culture is sensitive to gentamicin, streptomycin, levofloxacin, doxycycline, rifampicin, amikacin, kanamycin, and tetracycline. It is intermediately resistant to nalidixic acid and ciprofloxacin, and is insensitive to ceftriaxone and trimethoprim-sulfamethoxazole. Nucleotide sequences of the omp25 and omp2a genes of Brucella were detected in blood and serum samples from the patient. These sequences confirmed the presence of B. melitensis in the samples. IgM and IgG antibodies to the causative agent of brucellosis were detected in the patient’s blood serum. As a result of the study, the brucellosis agent isolate obtained at the medical facility from a patient diagnosed with infectious endocarditis with extensive tricuspid valve damage was verified and identified as B. melitensis genotype IIi. This case confirms the need for increased awareness among healthcare personnel regarding particularly dangerous infections, as well as coordinated efforts across various agencies.

бруцеллезинфекционный эндокардитвыделение и идентификация культурыBrucella melitensisгенотипидентификация по вариабельности гена omp25brucellosisinfective endocarditisisolation and identification of cultureBrucella melitensisgenotypeidentification by omp25 gene variabilityReferencesПономаренко Д.Г., Матвиенко А.Д., Хачатурова А.А., Жаринова И.В., Скударева О.Н., Транквилевский Д.В., Логвиненко О.В., Ракитина Е.Л., Костюченко М.В., Кондратьева Ю.В., Малецкая О.В., Куличенко А.Н. Анализ ситуации по бруцеллезу в мире и Российской Федерации. Проблемы особо опасных инфекций. 2024; (2):36–50. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-2-36-50.Ponomarenko D.G., Matvienko A.D., Khachaturova A.A., Zharinova I.V., Skudareva O.N., Trankvilevsky D.V., Logvinenko O.V., Rakitina E.L., Kostyuchenko M.V., Kondrat’eva Yu.V., Maletskaya O.V., Kulichenko A.N. Analysis of the situation on brucellosis around the world and in the Russian Federation. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2024; (2):36–50. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-2-36-50.Нурпейсова А.Х., Березкина Г.В., Стасенко Т.П., Ляпина Е.П., Антонова А.С., Михайлова С.А. Проявления хронического бруцеллеза у больных с риском профессионального заражения. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2021; 10(3):92–7. DOI: 10.33029/2305-3496-2021-10-3-92-97.Nurpeisova A.Kh., Berezkina G.V., Stasenko T.P., Lyapina E.P., Antonova A.S., Mikhailova S.A. Chronic brucellosis in patients with professional risk of infection. Infektsionnye Bolezni: Novosti, Mneniya, Obuchenie [Infectious Diseases: News, Opinions, Training]. 2021; 10(3):92–7. DOI: 10.33029/2305-3496-2021-10-3-92-97.Информационный бюллетень. Бруцеллёз в Российской Федерации в 2021 году. Приложение к письму Роспотребнадзора от 25.07.2022 № 02/15360-2022-32. [Электронный ресурс]. URL: https://snipchi.ru/updoc/Издания/INF_B_BRUZ_2021.pdf (дата обращения 04.06.2025).Information bulletin. Brucellosis in the Russian Federation in 2021. Appendix to the letter of the Rospotrebnadzor dated July 25, 2022, No. 02/15360-2022-32. (Cited 04 June 2025). [Internet]. Available from: https://snipchi.ru/updoc/Издания/INF_B_BRUZ_2021.pdf.Пономаренко Д.Г., Костюченко М.В., Ракитина Е.Л., Логвиненко О.В., Хачатурова А.А., Лукашевич Д.Е., Курчева С.А., Русанова Д.В., Куличенко А.Н. Количественный анализ протективной активности Т-клеточного иммунитета к возбудителю бруцеллеза. Медицинская иммунология. 2024; 26(1):211–20. DOI: 10.15789/1563-0625-QAO-2604.Ponomarenko D.G., Kostyuchenko M.V., Rakitina E.L., Logvinenko O.V., Khachaturova A.A., Lukashevich D.E., Kurcheva S.A., Rusanova D.V., Kulichenko A.N. Quantitative analysis of the protective activity of T-cell immunity to the causative agent of brucellosis. Meditsinskaya Immunologiya [Medical Immunology]. 2024; 26(1):211–20. DOI: 10.15789/1563-0625-QAO-2604.Софьина А.В., Ляпина Е.П., Шульдяков А.А. Своевременность диагностики как предиктор течения бруцеллеза. Здоровье населения и среда обитания. 2016; (12):49−51.Sof’ina A.V., Lyapina E.P., Shul’dyakov A.A. Timeliness of diagnosis as a predictor of brucellosis progression. Zdorovie Naseleniya i Sreda Obitaniya [Public Health and Life Environment]. 2016; (12):49−51.Онищенко Г.Г., Куличенко А.Н., редакторы. Бруцеллёз. Современное состояние проблемы. Ставрополь: Губерния; 2019. 336 с.Onishchenko G.G., Kulichenko A.N., editors. Brucellosis. Current State of the Issue. Stavropol: “Guberniya”; 2019. 336 p.Малахаева А.Н., Саяпина Л.В., Барулина И.С., Касина И.В., Абдрашитова А.С., Осина Н.А., Шарова И.Н., Яцышина С.Б., Майоров Н.В., Зайцева Л.В., Миронова Н.П. Оценка нового набора реагентов «Aмплисенс® Brucella spp.-FL» с гибридизационно-флуоресцентной детекцией. Проблемы особо опасных инфекций. 2011; (3):58–60. DOI: 10.21055/0370-1069-2011-3(109)-58-60.Malakhaeva A.N., Sayapina L.V., Barulina I.S., Kasina I.V., Abdrashitova A.S., Osina N.A., Sharova I.N., Yatsyshina S.B., Mayorov N.V., Zaytseva L.V., Mironova N.P. Assessment of the new set of reagents AmpliSens Brucella spp.-FL with hybridization-fluo¬ rescent detection. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2011; (3):58−60. DOI: 10.21055/0370-1069-2011-3(109)-58-60.Cekovska Z., Petrovska M., Jankoska G., Panovski N., Kaftandzieva A. Isolation, identification and antimicrobial susceptibility of Brucella blood culture isolates. Prilozi. 2010; 31(1):117–32. PMID: 20703187.Cekovska Z., Petrovska M., Jankoska G., Panovski N., Kaftandzieva A. Isolation, identification and antimicrobial susceptibility of Brucella blood culture isolates. Prilozi. 2010; 31(1):117–32. PMID: 20703187.Sagi M., Nesher L., Yagupsky P. The Bactec FX blood culture system detects Brucella melitensis bacteremia in adult patients within the routine 1-week incubation period. J. Clin. Microbiol. 2017; 55(3):942–6. DOI: 10.1128/JCM.02320-16.Sagi M., Nesher L., Yagupsky P. The Bactec FX blood culture system detects Brucella melitensis bacteremia in adult patients within the routine 1-week incubation period. J. Clin. Microbiol. 2017; 55(3):942–6. DOI: 10.1128/JCM.02320-16.Боронина Л.Г. Особенности микробиологической диагностики бруцеллеза на эпидемиологически благополучной территории. Вестник УГМУ. 2019; (1):37–41.Boronina L.G. Features of microbiological diagnostics of brucellosis in an epidemiologically safe territory. Vestnik Ural’skogo Gosudarstvennogo Meditsinskogo Universiteta [Bulletin of the Ural State Medical University]. 2019; (1):37–41.Cloeckaert A., Debbarh H.S., Vizcaíno N., Saman E., Dubray G., Zygmunt M.S. Cloning, nucleotide sequence, and expression of the Brucella melitensis bp26 gene coding for a protein immunogenic in infected sheep. FEMS Microbiol. Lett. 1996; 140(2-3):139–44. DOI: 10.1016/0378-1097(96)00169-3.Cloeckaert A., Debbarh H.S., Vizcaíno N., Saman E., Dubray G., Zygmunt M.S. Cloning, nucleotide sequence, and expression of the Brucella melitensis bp26 gene coding for a protein immunogenic in infected sheep. FEMS Microbiol. Lett. 1996; 140(2-3):139–44. DOI: 10.1016/0378-1097(96)00169-3.Осина Н.А., Булгакова Е.Г., Осин А.В., Швиденко И.Г., Щербакова С.А. Вариабельность генов omp25 и omp2a у штаммов бруцелл различного таксономического положения. Проблемы особо опасных инфекций. 2023; (4):125–34. DOI: 10.21055/0370-1069-2023-4-125-134.Osina N.A., Bulgakova E.G., Osin A.G., Shvidenko I.G., Shcherbakova S.A. Variability of omp25 and omp2a genes in Brucella strains of different taxonomic position. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2023; (4):125−34. DOI: 10.21055/0370-1069-2023-4-125-134.Filtlong. Github. [Электронный ресурс]. URL: https://github.com/rrwick/Filtlong (дата обращения 04.04.2025).Filtlong. Github. (Cited 04 April 2025). [Internet]. Available from: https://github.com/rrwick/Filtlong.Flye. Github. [Электронный ресурс]. URL: https://github.com/mikolmogorov/Flye (дата обращения 04.04.2025).Flye. Github. (Cited 04 April 2025). [Internet]. Available from: https://github.com/mikolmogorov/Flye.Snippy. Github. [Электронный ресурс]. URL: https://github.com/tseemann/snippy (дата обращения 04.04.2025).Snippy. Github. (Cited 04 April 2025). [Internet]. Available from: https://github.com/tseemann/snippy.PisarenkoS.V., KovalevD.A., VolynkinaA.S., Ponomarenko D.G., Rusanova D.V., Zharinova N.V., Khachaturova A.A., Tokareva L.E., Khvoynova I.G., Kulichenko A.N. Global evolution and phylogeography of Brucella melitensis strains. BMC Genomics. 2018; 19(1):353. DOI: 10.1186/s12864-018-4762-2.Pisarenko S.V., Kovalev D.A., Volynkina A.S., Ponomarenko D.G., Rusanova D.V., Zharinova N.V., Khachaturova A.A., Tokareva L.E., Khvoynova I.G., Kulichenko A.N. Global evolution and phylogeography of Brucella melitensis strains. BMC Genomics. 2018; 19(1):353. DOI: 10.1186/s12864-018-4762-2.iTOL v7. iTOL: Interactive tree of life. [Электронный ресурс]. URL: https://itol.embl.de (дата обращения 04.04.2025).iTOL v7. iTOL: Interactive tree of life. (Cited 04 April 2025). [Internet]. Available from: https://itol.embl.de.Пшеничная Н.Ю., Гопаца Г.В., Сергеева Т.В. Редкие клинические формы хронического бруцеллеза. Журнал инфектологии. 2023; 15(1):121–5. DOI: 10.22625/2072-6732-2023-15-1-121-125.Pshenichnaya N.Yu., Gopatsa G.V., Sergeeva T.V. Rare clinical forms of chronic brucellosis. Infektologiya [Journal of Infectology]. 2023; 15(1):121–5. DOI: 10.22625/2072-6732-2023-15-1-121-125.Jin M., Fan Z., Gao R., Li X., Gao Z., Wang Z. Research progress on complications of brucellosis. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2023; 13:1136674. DOI: 10.3389/fcimb.2023.1136674.Jin M., Fan Z., Gao R., Li X., Gao Z., Wang Z. Research progress on complications of brucellosis. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2023; 13:1136674. DOI: 10.3389/fcimb.2023.1136674.Narimisa N., Razavi S., Khoshbayan A., Masjedian Jazi F. Prevalence of Brucella endocarditis: A systematic review and meta-analysis. Health Sci. Rep. 2023; 6(5):e1301. DOI: 10.1002/hsr2.1301.Narimisa N., Razavi S., Khoshbayan A., Masjedian Jazi F. Prevalence of Brucella endocarditis: A systematic review and meta-analysis. Health Sci. Rep. 2023; 6(5):e1301. DOI: 10.1002/hsr2.1301.Luo L., Zhou B.T., Wang H.L., Dou H.T., Li T.S. [A clinical analysis of six patients with Brucella endocarditis and literature review]. Zhonghua Nei Ke Za Zhi. 2017; 56(10):734–7. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0578-1426.2017.10.005.Luo L., Zhou B.T., Wang H.L., Dou H.T., Li T.S. [A clinical analysis of six patients with Brucella endocarditis and literature review]. Zhonghua Nei Ke Za Zhi. 2017; 56(10):734–7. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0578-1426.2017.10.005.Щипелева И.А., Марковская Е.И., Кретенчук О.Ф. Антибиотикотерапия бруцеллёза. Современное состояние и перспективы совершенствования. Антибиотики и химиотерапия. 2022; 67(3-4):77–84. DOI: 10.37489/0235-2990-2022-67-3-4-77-84.Shchipeleva I.A., Markovskaya E.I., Kretenchuk O.F. Antibiotic therapy of brucellosis. Current status and prospects for improvement. Antibiotiki i Khimioterapiya [Antibiotics and Chemotherapy]. 2022; 67(3-4):77–84. DOI: 10.37489/0235-2990-2022-67-3-4-77-84.Tan K.K., Tan Y.C., Chang L.Y., Lee K.W., Nore S.S., Yee W.Y., Mat Isa M.N., Jafar F.L., Hoh C.C., AbuBakar S. Full genome SNP-based phylogenetic analysis reveals the origin and global spread of Brucella melitensis. BMC Genomics. 2015; 16(1):93. DOI: 10.1186/s12864-015-1294-x.Tan K.K., Tan Y.C., Chang L.Y., Lee K.W., Nore S.S., Yee W.Y., Mat Isa M.N., Jafar F.L., Hoh C.C., AbuBakar S. Full genome SNP-based phylogenetic analysis reveals the origin and global spread of Brucella melitensis. BMC Genomics. 2015; 16(1):93. DOI: 10.1186/s12864-015-1294-x.Кузнецова И.В., Ковалев Д.А., Писаренко С.В., Бобрышева О.В., Шапаков Н.А., Жиров А.М., Сафонова Н.С., Пономаренко Д.Г., Хачатурова А.А., Жилченко Е.Б., Сердюк Н.С., Куличенко А.Н. Генетическая характеристика штаммов Brucella melitensis, выделенных на территории Российской Федерации, на основе данных анализа единичных нуклеотидных полиморфизмов при полногеномном секвенировании. Проблемы особо опасных инфекций. 2024; (1):154–61. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-1-154-161.Kuznetsova I.V., Kovalev D.A., Pisarenko S.V., Bobrysheva O.V., Shapakov N.A., Zhirov A.M., Safonova N.S., Ponomarenko D.G., Khachaturova A.A., Zhilchenko E.B., Serdyuk N.S., Kulichenko A.N. Genetic profile of Brucella melitensis strains isolated on the territory of the Russian Federation, based on analysis of single nucleotide polymorphisms following whole genome sequencing. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2024; (1):154−61. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-1-154-161.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.