microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2013-2-46-48microbe-31Research ArticleДИАГНОСТИКАDIAGNOSTICSСовершенствование и стандартизация лабораторной диагностики особо опасных, «новых» и «возвращающихся» инфекционных болезнейImprovement and Standardization of Laboratory Diagnostics Procedures as Concerns Particularly Dangerous, “Emerging”, and “Reemerging” Infectious DiseasesШароваИ. Н.SharovaI. N.rusrapi@microbe.ruКазаковаЕ. С.KazakovaE. S.rusrapi@microbe.ruПортенкоС. А.PortenkoS. A.rusrapi@microbe.ruКрасовскаяТ. Ю.KrasovskayaT. Yu.rusrapi@microbe.ruОсинаН. А.OsinaN. A.rusrapi@microbe.ruКуклевВ. Е.KuklevV. E.rusrapi@microbe.ruКарнауховИ. Г.KarnaukhovI. G.rusrapi@microbe.ruЩербаковаС. А.ShcherbakovaS. A.rusrapi@microbe.ruТопорковА. В.ToporkovA. V.rusrapi@microbe.ruЧесноковаМ. В.ChesnokovaM. V.adm@chumin.irkutsk.ruКуличенкоА. Н.KulichenkoA. N.snipchi@mail.stv.ruКутыревВ. В.KutyrevV. V.rusrapi@microbe.ruРоссийский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»РоссияRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”Russian FederationИркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего ВостокаРоссияIrkutsk Research Anti-Plague Institute of Siberia and Far EastRussian FederationСтавропольский научно-исследовательский противочумный институтРоссияStavropol Research Anti-Plague InstituteRussian Federation201320062013024648Copyright © Шарова И.Н., Казакова Е.С., Портенко С.А., Красовская Т.Ю., Осина Н.А., Куклев В.Е., Карнаухов И.Г., Щербакова С.А., Топорков А.В., Чеснокова М.В., Куличенко А.Н., Кутырев В.В., 20132013Шарова И.Н., Казакова Е.С., Портенко С.А., Красовская Т.Ю., Осина Н.А., Куклев В.Е., Карнаухов И.Г., Щербакова С.А., Топорков А.В., Чеснокова М.В., Куличенко А.Н., Кутырев В.В.Sharova I.N., Kazakova E.S., Portenko S.A., Krasovskaya T.Y., Osina N.A., Kuklev V.E., Karnaukhov I.G., Shcherbakova S.A., Toporkov A.V., Chesnokova M.V., Kulichenko A.N., Kutyrev V.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/31

Представлены основные этапы стандартизации лабораторной диагностики особо опасных инфекционных болезней и совершенствования нормативно-методической базы по порядку организации и проведения лабораторной диагностики в соответствии с трехуровневой структурой. Определены принципы, схема индикации и идентификации ПБА новых, ранее не известных, атипичных микроорганизмов, основанных на использовании современных автоматизированных систем и высокотехнологичного оборудования.

Represented are the data on the key stages of laboratory diagnostics practices standardization as regards particularly dangerous infectious diseases and on the improvement of the normative-regulatory framework on the procedure for organization and carrying out laboratory diagnostics in accordance with three-level system. Worked out are the principles, scheme of indication and identification of pathogenic biological agents of emerging, previously unknown, and atypical microorganisms using modern computerized systems and high-tech equipment.

стандартизация лабораторной диагностикиособо опасные инфекциииндикация и идентификация «новых» и «возвращающихся» инфекционных болезнейstandardization of laboratory diagnostics practicesparticularly dangerous infectionsindication and identification of “emerging”and “reemerging” infectious diseasesReferencesОнищенко Г.Г., Кутырев В.В., редакторы. Лабораторная диагностика опасных инфекционных болезней. Практическое руководство. М.: Медицина, Шико; 2009. 472 с.Onishchenko G.G., Kutyrev V.V., editors. [Laboratory Diagnostics of Particularly Dangerous Infectious Diseases. Practice Guidelines]. M.: Meditsina, Shiko; 2009. 472 p.Bochner B.R. Global phenotypic characterization of bacteria. FEMS Microbiol. Rev. 2009; 33(1): 91–205.Bochner B.R. Global phenotypic characterization of bacteria. FEMS Microbiol. Rev. 2009; 33(1): 91–205.Crowley E., Bird P., Fisher K., Goetz K., Boyle M., Benzinger M.J. Jr., Juenger M., Agin J., Goins D., Johnson R. Evaluation of the VITEK 2 Gram-negative (GN) microbial identification test card: collaborative study. J. AOAC Int. 2012; 95(3):778–85.Crowley E., Bird P., Fisher K., Goetz K., Boyle M., Benzinger M.J. Jr., Juenger M., Agin J., Goins D., Johnson R. Evaluation of the VITEK 2Drevinek M., Dresler J., Klimentova J., Pisa L., Hubalek M. Evaluation of sample preparation methods for MALDI-TOF MS identification of highly dangerous bacteria. Lett. Appl. Microbiol. 2012; 55(1):40–6.Gram-negative (GN) microbial identification test card: collaborative study. J. AOAC Int. 2012; 95(3):778–85.Farfoura E., Leto J., Barritaulta M., Barberis C., Meyer J., Dauphin B., Le Guern A.-S., Leflиche A., Badell E., Guiso N., Leclercq A., Le Monnier A., Lecuit M., Rodriguez-Nava V., Bergeron E., Raymond J., Vimont S., Bille E., Carbonnelle E., Guet-Revillet H., Lйcuyer H., Beretti J.-L., Vay C., Berche P., Ferroni A., Nassif X., Join-Lambert O. Evaluation of the Andromas Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization–Time of Flight Mass Spectrometry System for Identification of Aerobically Growing Gram-Positive Bacilli. J. Clin. Microbiol. 2012; 50(8):2702–7.Drevinek M., Dresler J., Klimentova J., Pisa L., Hubalek M. Evaluation of sample preparation methods for MALDI-TOF MS identification of highly dangerous bacteria. Lett. Appl. Microbiol. 2012; 55(1):40–6.Ferreira L., Castan S.V., Sanchez-Juanes F., Gonzalez-Cabrero S., Menegotto F., Orduna-Domingo A., Gonzalez-Buitrago J.M., Munoz-Bellido J.L. Identification of Brucella by MALDI-TOF mass spectrometry. Fast and reliable identification from agar plates and blood cultures. PLoS One. 2010; 5:14235Farfoura E., Leto J., Barritaulta M., Barberis C., Meyer J., Dauphin B., Le Guern A.-S., Leflиche A., Badell E., Guiso N., Leclercq A., Le Monnier A., Lecuit M., Rodriguez-Nava V., Bergeron E., Raymond J., Vimont S., Bille E., Carbonnelle E., Guet-Revillet H., Lйcuyer H., Beretti J.-L., Vay C., Berche P., Ferroni A., Nassif X., Join-Lambert O. Evaluation of the Andromas Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization–Time of Flight Mass Spectrometry System for Identification of Aerobically Growing Gram-Positive Bacilli. J. Clin. Microbiol. 2012; 50(8):2702–7.Grif K., Dierich M.P., Much P., Hofer E., Allerberger F. Identifying and subtyping species of dangerous pathogens by automated ribotyping. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2003; 47:13–20.Ferreira L., Castan S.V., Sanchez-Juanes F., Gonzalez-Cabrero S., Menegotto F., Orduna-Domingo A., Gonzalez-Buitrago J.M., Munoz-Bellido J.L. Identification of Brucella by MALDI-TOF mass spectrometry. Fast and reliable identification from agar plates and blood cultures. PLoS One. 2010; 5:14235Grundt А., Findeisen P., Miethke T., Jäger E., Ahmad-Nejad P., Neumaier M. Rapid Detection of ampicillin resistance in Escherichia coli by quantitative mass spectrometry. J. Clin. Microbiol. 2012; 50(5):1727–9.Grif K., Dierich M.P., Much P., Hofer E., Allerberger F. Identifying and subtyping species of dangerous pathogens by automated ribotyping. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2003; 47:13–20.Janda J.M., Abbott S.L. 16S rRNA gene sequencing for bacterial identification in the diagnostic laboratory: pluses, perils, and pitfalls. J. Clin. Microbiol. 2007; 49(9):2761–4.Grundt А., Findeisen P., Miethke T., Jäger E., Ahmad-Nejad P., Neumaier M. Rapid Detection of ampicillin resistance in Escherichia coli by quantitative mass spectrometry. J. Clin. Microbiol. 2012; 50(5):1727–9.Köser C.U., Ellington M.J., Cartwright E.J.P., Gillespie S.H., Brown N.M., Farrington M., Holden M.T.G., Dougan G., Bentley S.D., Parkhill J., Peacock S.J. Routine Use of Microbial Whole Genome Sequencing in Diagnostic and Public Health Microbiology. PLoS Pathog. 2012; 8(8):е1002824.Janda J.M., Abbott S.L. 16S rRNA gene sequencing for bacterial identification in the diagnostic laboratory: pluses, perils, and pitfalls. J. Clin. Microbiol. 2007; 49(9):2761–4.Winstanley T.T., Courvalin P. Expert Systems in Clinical Microbiology. Clin. Microbiol. Rev. 2011; 24(3):515–56.Köser C.U., Ellington M.J., Cartwright E.J.P., Gillespie S.H., Brown N.M., Farrington M., Holden M.T.G., Dougan G., Bentley S.D., Parkhill J., Peacock S.J. Routine Use of Microbial Whole Genome Sequencing in Diagnostic and Public Health Microbiology. PLoS Pathog. 2012; 8(8):е1002824.Wolk D.M., Dunne W.M. Jr. New Technologies in Clinical Microbiology. J. Clin. Microbiol. 2011; 49(9):62–7.Winstanley T.T., Courvalin P. Expert Systems in Clinical Microbiology. Clin. Microbiol. Rev. 2011; 24(3):515–56. 12. Wolk D.M., Dunne W.M. Jr. New Technologies in Clinical Microbiology. J. Clin. Microbiol. 2011; 49(9):62–7.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.