microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2016-4-51-55microbe-347Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯMICROBIOLOGYСлучай заболевания человека чумой в Кош-Агачском районе Республики Алтай в 2015 г. Сообщение 2. Микробиологическая и молекулярно-генетическая характеристика изолированных штаммовA Case of Human Plague in Kosh-Agach Region of the Republic of Altai in 2015. Communication 2. Microbiological and Molecular-Genetic Characteristics of the Isolated StrainsБалахоновС. В.BalakhonovS. V.

664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78

78, Trilissera St., Irkutsk, 664047

adm@chumin.irkutsk.ruЯрыгинаМ. Б.YaryginaM. B.

664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78

78, Trilissera St., Irkutsk, 664047

adm@chumin.irkutsk.ruРождественскийЕ. Н.RozhdestvenskyE. N.

649002, Горно-Алтайск, ул. Заводская, 2

2, Zavodskaya St., Gorno-Altaisk, 649002

chuma@mail.gorny.ruБазароваГ. Х.BazarovaG. Kh.

649002, Горно-Алтайск, ул. Заводская, 2

2, Zavodskaya St., Gorno-Altaisk, 649002

chuma@mail.gorny.ruВитязеваС. А.VityazevaS. A.

664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78

78, Trilissera St., Irkutsk, 664047

adm@chumin.irkutsk.ruОстякА. С.OstyakA. S.

664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78

78, Trilissera St., Irkutsk, 664047

adm@chumin.irkutsk.ruМихайловЕ. П.MikhailovE. P.

649002, Горно-Алтайск, ул. Заводская, 2

2, Zavodskaya St., Gorno-Altaisk, 649002

chuma@mail.gorny.ruМищенкоА. И.MishchenkoA. I.

649002, Горно-Алтайск, ул. Заводская, 2

2, Zavodskaya St., Gorno-Altaisk, 649002

chuma@mail.gorny.ruДенисовА. В.DenisovA. V.

649002, Горно-Алтайск, ул. Заводская, 2

2, Zavodskaya St., Gorno-Altaisk, 649002

chuma@mail.gorny.ruКосилкоС. А.KosilkoS. A.

664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78

78, Trilissera St., Irkutsk, 664047

adm@chumin.irkutsk.ruКорзунВ. М.KorzunV. M.

664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78

78, Trilissera St., Irkutsk, 664047

adm@chumin.irkutsk.ruФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока», ИркутскРоссияIrkutsk Research Anti-Plague Institute of Siberia and Far East, IrkutskRussian FederationФКУЗ «Алтайская противочумная станция», Горно-АлтайскРоссияAltai Plague Control Station, Gorno-AltaiskRussian Federation201620122016045155Copyright © Балахонов С.В., Ярыгина М.Б., Рождественский Е.Н., Базарова Г.Х., Витязева С.А., Остяк А.С., Михайлов Е.П., Мищенко А.И., Денисов А.В., Косилко С.А., Корзун В.М., 20162016Балахонов С.В., Ярыгина М.Б., Рождественский Е.Н., Базарова Г.Х., Витязева С.А., Остяк А.С., Михайлов Е.П., Мищенко А.И., Денисов А.В., Косилко С.А., Корзун В.М.Balakhonov S.V., Yarygina M.B., Rozhdestvensky E.N., Bazarova G.K., Vityazeva S.A., Ostyak A.S., Mikhailov E.P., Mishchenko A.I., Denisov A.V., Kosilko S.A., Korzun V.M.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/347

Цель работы. Комплексное фено- и генотипическое изучение штаммов Y. pestis И-3595 и Y. pestis И-3596, изолированных от сурков, послуживших источником заражения человека в 2015 г. Материалы и методы. С помощью современных методов проведено углубленное микробиологическое, молекулярно- генетическое и масс-спектрометрическое изучение штаммов Yersinia pestis ssp. pestis, которые были изолированы от двух серых сурков, послуживших источником инфицирования человека в Горно- Алтайском высокогорном очаге в 2015 г. Результаты и выводы. Установлено, что изученные штаммы чумного микроба принадлежат к основному подвиду. Результаты плазмидного скрининга, мультилокусного VNTR- и масс-спектрометрического анализов показали, что эти штаммы близки к варианту возбудителя чумы, обнаруженному в очаге в 2012 и 2014 гг. и циркулирующему на территории Северо- Западной Монголии и в Тувинском природном очаге. 

Objective of the study was a complex pheno- and genotypic investigation of Yersinia pestis I-3595 and Y. pestis I-3596 strains, isolated from marmots that were the source of human infection in 2015. Materials and methods. A comprehensive microbiological, molecular-genetic and mass-spectrometric studying of Y. pestis ssp. pestis strains, isolated from two grey marmots that became a cause of the plague case in Gorno-Altai high-mountain focus in 2015, was performed using up-to-date methods. Results and conclusions. It was established that the studied Y. pestis strains belonged to the main subspecies. Results of plasmid screening, multilocus VNTR-and mass-spectrometric analyses showed that those strains were closely related to Y. pestis variant detected in the focus in 2012 and in 2014, and circulating in Northwest Mongolia and Tuva natural focus. 

Горно-Алтайский высокогорный природный очаг чумыYersinia pestisплазмидный скринингмультилокусный VNTR-анализмасс-спектрометрический анализGorno-Altai high-mountain natural plague focusYersinia pestisplasmid screeningmultilocus VNTR-analysismass-spectrometric assayReferencesАшмарин И.П., Воробьев А.А. Статистические методы в микробиологических исследованиях. Л.: МЕДГИЗ; 1962. 179 с.Ashmarin I.P., Vorob’ev A.A. [Statistical Methods in Microbiological Studies]. L.: MEDGIZ; 1962. 179 p.Балахонов С.В., Цэнджав С., Эрдэнэбат А. Новые плазмидовары штаммов возбудителя чумы, изолированных в Монголии. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 1991; 11:27–9.Balakhonov S.V., Tsendzhav S., Erdenebat A. [New plasmidovars of plague agent strains, isolated in Mongolia]. Mol. Genet. Mikrobiol. Virusol. 1991; 11:27–9.Балахонов С.В., Балахонов С.В., Вержуцкий Д.Б., Иннокентьева Т.И. Эпидемиологическая оценка современного состояния природных очагов чумы в Сибири. Эпидемиол. и вакцинопрофилакт. 2010; 2:34–7.Balakhonov S.V., Verzhutsky D.B., Innokent’eva T.I. [Epidemiological assessment of the current state of natural plague foci in Siberia]. Epidemiol. Vaktsinoprofilakt. 2010; 2:34–7.Балахонов С.В., Афанасьев М.В., Шестопалов М.Ю., Остяк А.С., Витязева С.А., Корзун В.М., Вержуцкий Д.Б., Михайлов Е.П., Мищенко А.И., Денисов А.В., Ивженко Н.И., Рождественский Е.Н., Висков Е.Н., Фомина Л.А. Первый случай выделения Yersinia pestis subsp. pestis в Алтайском горном при- родном очаге чумы. Сообщение 1. Микробиологическая характеристика, молекулярно-генетическая и масс-спектрометрическая идентификация изолята. Пробл. особо опасных инф. 2013; 1:60–5.Balakhonov S.V., Afanas’ev M.V., Shestopalov M.Yu., Ostyak A.S., Vityazeva S.A., Korzun V.M., Verzhutsky D.B., Mikhailov E.P., Mishchenko A.I., Denisov A.V., Ivzhenko N.I., Rozhdestvensky E.N., Viskov E.N., Fomina L.A. [The first case of Yersinia pestis subsp. pestis isolation in the territory of Altai mountain natural plague focus. Communication 1. Microbiological characteristics, molecular-genetic and mass-spectrometric identification of the isolate]. Probl. Osobo Opasn. Infek. 2013; 1:60–5.Балахонов С.В., Корзун В.М., Вержуцкий Д.Б., Михайлов Е.П., Рождественский Е.Н., Денисов А.В. Первый случай выде- ления Yersinia pestis subsp. pestis в Алтайском горном природном очаге чумы. Сообщение 2. Вероятные пути и механизмы заноса возбудителя чумы основного подвида на территорию очага. Пробл. особо опасных инф. 2013; 2:5–10.Balakhonov S.V., Korzun V.M., Verzhutsky D.B., Mikhaylov E.P., Rozhdestvensky E.N., Denisov A.V. [The first case of Yersinia pestis subsp. pestis isolation in the territory of the Altai mountain natural plague focus. Communication 2. Probable ways and mechanisms of plague agent main sub- species importation into the territory of the focus]. Probl. Osobo Opasn. Infek. 2013; 2:5–10.Балахонов С.В., Попова А.Ю., Мищенко А.И., Михайлов Е.П., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Денисов А.В., Рождественский Е.Н., Базарова Г.Х., Щучинов Л.В., Зарубин И.В., Семёнова Ж.Е., Маденова Н.М., Дюсенбаев Д.К., Ярыгина М.Б., Чипанин Е.В., Косилко С.А., Носков А.К., Корзун В.М. Случай заболевания человека чумой в Кош-Агачском районе Республики Алтай в 2015 г. Сообщение 1. Клинико-эпидемиологические и эпизоотологические аспекты. Пробл. особо опасных инф. 2016; 1:55–60.Balakhonov S.V., Popova A.Yu., Mishchenko A.I., Mikhailov E.P., Ezhlova E.B., Demina Yu.V., Denisov A.V., Rozhdestvensky E.N., Bazarova G.Kh., Shchuchinov L.V., Zarubin I.V., Semenova Zh.E., Madenova N.M., Dyusenbaev D.K., Yarygina M.B., Chipanin E.V., Kosilko S.A., Noskov A.K., Korzun V.M. [A case of human infection with plague in the Kosh￾Agach Region of the Republic of Altai in 2015. Communication 1. Clinicalepidemiological and epizootiological aspects]. Probl. Osobo Opasn. Infek. 2016; 1:55–60.Корзун В.М., Балахонов С.В., Чипанин Е.В., Денисов А.В., Михайлов Е.П., Мищенко А.И., Ярыгина М.Б., Рождественский Е.Н., Фомина Л.А. Формирование, развитие и функционирование природного очага чумы в Горном Алтае. Мед. паразитол. и паразитарн бол. 2016; 1:17–25Korzun V.M., Balakhonov S.V., Chipanin E.V., Denisov A.V., Mikhailov E.P., Mishchenko A.I., Yarygina M.B., Rozhdestvensky E.N., Fomina L.A. [Formation, development and functioning of natural plague fo- cus in Gorny Altai]. Med. Parazitol. Parazitarn. Bol. 2016; 1:17–25.Кутырев В.В., Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Пакскина Н.Д., Щучинов Л.В., Михайлов Е.П., Мищенко А.И., Рождественский Е.Н., Базарова Г.Х., Денисов А.В., Шарова И.Н., Попов Н.В., Кузнецов А.А. Заболевание человека чумой в Горно-Алтайском высокогорном природном очаге в 2014 г. Сообщение 1. Эпидемиологические и эпизоотологические особенности проявлений чумы в Горно-Алтайском высокогорном (Сайлюгемском) природном очаге чумы. Пробл. особо опасных инф. 2014; 4:9–16.Kutyrev V.V., Popova A.Yu., Ezhlova E.B., Demina Yu.V., Pakskina N.D., Shchuchinov L.V., Mikhailov E.P., Mishchenko A.I., Rozhdestvensky E.N., Bazarova G.Kh., Denisov A.V., Sharova I.N., Popov N.V., Kuznetsov A.A. [Infection of an individual with plague in the Gorno-Altaisk highmountain natural focus in 2014. Communication 1. Epidemiological and epizootiological peculiarities of plague manifestations in the Gorno-Altaisk high-mountain (Sailyugemsky) natural plague focus]. Probl. Osobo Opasn. Infek. 2014; 4:9–16.Кутырев В.В., Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Пакскина Н.Д., Шарова И.Н., Мищенко А.И.,.Рождественский Е.Н, Базарова Г.Х., Михайлов Е.П., Ерошенко Г.А., Краснов Я.М., Куклева Л.М., Черкасов А.В., Оглодин Е.Г., Куклев В.Е., Одиноков Г.Н., Щербакова С.А., Балахонов С.В., Афанасьев М.В., Витязева С.А., Шестопалов М.Ю., Климов В.Т. Заболевание человека чумой в Горно-Алтайском высокогорном природном очаге в 2014 г. Сообщение 2. Особенности лабораторной диагностики и молекулярно-генетическая характеристика выделенных штаммов. Пробл. особо опасных инф. 2014; 4:43–51.Kutyrev V.V., Popova A.Yu., Ezhlova E.B., Demina Yu.V., Pakskina N.D., Sharova I.N., Mishchenko A.I., Rozhdestvensky E.N., Bazarova G.Kh., Mikhailov E.P., Eroshenko G.A., Krasnov Ya.M., Kukleva L.M., Cherkasov A.V., Oglodin E.G., Kuklev V.E., Odinokov G.N., Shcherbakova S.A., Balakhonov S.V., Afanas’ev M.V., Vityazeva S.A., Shestopalov M.Yu., Klimov V.T. [Infection of an individual with plague in the Gorno-Altaisk high-mountain natural focus in 2014. Communication 2. Peculiarities of laboratory diagnostics and molecular-genetic characterization of the isolated strains]. Probl. Osobo Opasn. Infek. 2014; 4:43–51.Онищенко Г.Г., Кутырев В.В. Лабораторная диагностика особо опасных инфекционных болезней: Практическое руко- водство. М.: Издательство «Медицина», издательство «Шико»; 2009. 272 с.Onishchenko G.G., Kutyrev V.V. [Laboratory Diagnostics of Particularly Dangerous Infectious Diseases: Practice Guidelines]. M.: “Meditsina”, “Shiko”; 2009. 272 p.Erdenebat A., Batbold J., Dashnyam B. Plasmid content and distribution of Y. pestis isolated in Mongolia. Scientific Journal. Center for Infectious Diseases With Natural Foci, 2001; 9:87–91.Erdenebat A., Batbold J., Dashnyam B. Plasmid content and dis- tribution of Y. pestis isolated in Mongolia. Scientific Journal. Center for Infectious Diseases With Natural Foci, 2001; 9:87–91.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.