microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2017-1-100-104microbe-378Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯMICROBIOLOGYУСТАНОВЛЕНИЕ АУТЕНТИЧНОСТИ РЕФЕРЕНТНЫХ ШТАММОВ ПАТОГЕННЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ С ПРИМЕНЕНИЕМ АВТОМАТИЧЕСКОГО МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОГО АНАЛИЗАТОРА VITEK 2AUTHENTICATION OF REFERENCE STRAINS OF PATHOGENIC MICROORGANISMS APPLYING AUTOMATED MICROBIOLOGICAL ANALYZER “VITEK 2”ЧервяковаН. С.ChervyakovaN. S.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46, e-mail: rusrapi@microbe.ru

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, e-mail: rusrapi@microbe.ru

rusrapi@microbe.ruОсинА. В.OsinA. V.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46, e-mail: rusrapi@microbe.ru

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, e-mail: rusrapi@microbe.ru

rusrapi@microbe.ruРоссийский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»РоссияRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”Russian Federation20172003201701100104Copyright © Червякова Н.С., Осин А.В., 20172017Червякова Н.С., Осин А.В.Chervyakova N.S., Osin A.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/378

Целью работы являлось проведение идентификации референтных штаммов патогенных микроорганизмов из фонда Государственной коллекции патогенных бактерий ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб» с применением микробиологического анализатора Vitek 2 с последующим установлением их биохимических маркеров аутентичности.

Материалы и методы

Материалы и методы. В основу методического подхода заложено применение автоматизированной системы Vitek 2 Bio-Mérieux с последующим проведением анализа полученных результатов в программе bionumerics 7.5.

Результаты и выводы

Результаты и выводы. Проведено подтверждение аутентичности 103 референтных штаммов патогенных микроорганизмов из ГКПБ ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб». Установлено, что семь из них (6,8 %) не соответствовали своим паспортным данным и не могут использоваться в научно-практической деятельности, вследствие чего были заменены на подтвержденные аналоги. Анализ результатов взаимодействия изучаемых штаммов с дифференцирующими субстратами, позволил определить для каждого из них маркеры аутентичности, необходимые для контроля подлинности коллекционной культуры при ее воспроизводстве и хранении. На основе полученных данных были обновлены паспорта изученных референтных штаммов.

Objective of the study was to carry out identification of reference strains of pathogenic microorganisms from stores of the State Collection of Pathogenic Bacteria (SCPB) at RusRAPI “Microbe”, using microbiological analyzer Vitek 2, followed by determination of their biochemical authenticity markers.

Materials and methods

Materials and methods. Methodological approach was based on application of automated system Vitek 2 Bio-Mérieux with the subsequent assessment of the results obtained, using BioNumerics 7.5 software package.

Results and conclusions

Results and conclusions. Verified was authenticity of 103 reference strains of pathogenic microorganisms stored in SCPB, RusRAPI “Microbe”. It was established that 7 out of 103 strains (6.8 %) did not conform to the claimed feature profiles and cannot be used in scientific-practical activities, in consequence of which they were replaced with reliable authentic analogues. Evaluation of the data on interaction between the tested strains and differentiating substrates allowed for determination of authenticity markers for each of them, necessary for control of collection culture identity under reproduction and storage. On the basis of the data gathered, the profiles of the studied reference strains were regenerated.

аутентичность референтных штаммовбактериологический анализатор Vitek 2видовые маркерыBioNumericsauthenticity of reference strainsbacteriologic analyzer Vitek 2species markersBioNumericsReferencesБелова Л.Н., Мошенцева В.Н. Биологические коллекции Российской Федерации. В кн.: Микробные биотехнологии: фундаментальные и прикладные аспекты. 2013. Т. 5. С. 10-8.Belova L.N., Moshentseva V.N. [Biological collections of the Russian Federation]. In: [Microbial Biotechnologies: Fundamental and Applied Aspects]. 2013. Vol. 5. P. 10-8.Биргер М.О. Справочник по микробиологическим и вирусологическим методам исследования. М.: Медицина; 1982. 464 с.Birger M.O. [Reference Book on Microbiological and Virological Methods of Investigation]. M.: "Meditsina"; 1982. 464 p.Голубева И.В., Килессо В.А., Киселёва Б.С. Энтеробактерии. М.: Медицина; 1985. 321 с.Golubeva I.V., Kilesso V.A., Kiseleva B.S. [Enterobacterial M.: "Meditsina"; 1985, 321 p.Лабинская А.С., Блинкова Л.П., Ещина А.С. Общая и санитарная микробиология с техникой микробиологических исследований. М.: Медицина; 2004. 576 с.Labinskaya A.S., Blinkova L.P., Eshchina A.S. [General and Sanitary Microbiology with Microbiological Study Technique]. M.: "Meditsina"; 2004, 576 p.Леванова Г.Ф., Ефимов Е.И. Фенотаксономия и геносистематика локтобацилл. Н.Новгород: Изд. Ю.А.Николаев; 2009. 248 с.Levanova G.F., Efimov E.I. [Pheno-Taxonomy and Geno-Systematics of Lactobacillus]. N. Novgorod: Yu.A.Nikolaev Publishing House; 2009. 248 p.Bergey's manual of Systematic Bacteriology. Second Edition. Volume Three. The Firmicutes. 2009. P. 244-57. DOI: 10.1007/9780-387-68489-5.Efstratiou A., Glorge R.C. Laboratory guiidelines for the diagnosis of infections caused by Corynebacterium diphtheriae and C. ulcerans. Commun. Dis. Public Health. 1999; 2(4):250-7.Efstratiou A., Glorge R.C. Laboratory guidelines for the diagnosis of infections caused by Corynebacterium diphtheriae and C. ulcerans. Commun. Dis. Public Health. 1999; 2(4):250-7.Guidance for the operation of biological research Centers (BRCS) OECD. 2004. Part 1. P. 1-16. SGuidance for the operation of biological research Centers (BRCS) OECD. 2004. Part 1. P. 1-16.Smith David. Culture Collections. Microbiology. 2012; 79:73-118. DOI: 10.1016/B978-0-12-394318-7.00004-8.Smith D. Culture Collections. Microbiology. 2012; 79:73118. DOI: 10.1016/B978-0-12-394318-7.00004-8.Stackebrandt E., Frederiksen W., Garrity G., Grimont P., Mouden M., Rossello-Mora R., Swings J., Ward A., Whitman B. Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002; 52(Pt 3):1043-7. DOI: 10.1099/00207713-523-1043.Stackebrandt E., Frederiksen W., Garrity G., Grimont P., Mouden M., Rossello-Mora R., Swings J., Ward A., Whitman B. Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002; 52(Pt 3):1043-7. DOI: 10.1099/00207713-52-3-1043.Stackebrandt E., Frederiksen W., Garrity G., Grimont P., Mouden M., Rossello-Mora R., Swings J., Ward A., Whitman B. Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002; 52(Pt 3):1043-7. DOI: 10.1099/00207713-523-1043.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.