microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2017-4-23-26microbe-432Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESОценка эффективности молекулярной диагностики Yersinia pestis в полевом материале из Сарыджазского очага в КыргызстанеEvaluation of Effectiveness of Yersinia pestis Molecular Diagnostics in the Field Material from Sarydzhas Focus in KyrgyzstanДжапароваА. К.DzhaparovaA. K.

Кыргызская Республика, Бишкек, ул. Скрябина, 92.

92, Skryabina St., Bishkek, Kyrgyz Republic

ai_moon74@mail.ruАбдикаримовС. Т.AbdikarimovS. T.

Кыргызская Республика, Бишкек, ул. Скрябина, 92.

92, Skryabina St., Bishkek, Kyrgyz Republic

ЕрошенкоГ. А.EroshenkoG. A.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

rusrapi@microbe.ruНосовН. Ю.NosovN. Yu.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

КуклеваЛ. М.KuklevaL. M.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

АдамбековД. А.AdambekovD. A.

Кыргызская Республика, Бишкек, ул. Ахунбаева, 92.

92, Akhunbaeva St., Bishkek, Kyrgyz Republic

kgma@land.ruАльджамбаеваИ. Ш.Al’dzhambaevaI. Sh.

Кыргызская Республика, Бишкек, ул. Ахунбаева, 92.

92, Akhunbaeva St., Bishkek, Kyrgyz Republic

Республиканский центр карантинных и особо опасных инфекций Министерства здравоохранения Кыргызской РеспубликиКыргызстанRepublican Center on Quarantine and Particularly Dangerous Infections of the Ministry of Health of the Kyrgyz RepublicKyrgyzstanФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»РоссияRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”Russian FederationКыргызская государственная медицинская академия им. И.АхунбаеваКыргызстанI.Akhunbaev Kyrgyz State Medical AcademyKyrgyzstan201720122017042326Copyright © Джапарова А.К., Абдикаримов С.Т., Ерошенко Г.А., Носов Н.Ю., Куклева Л.М., Адамбеков Д.А., Альджамбаева И.Ш., 20172017Джапарова А.К., Абдикаримов С.Т., Ерошенко Г.А., Носов Н.Ю., Куклева Л.М., Адамбеков Д.А., Альджамбаева И.Ш.Dzhaparova A.K., Abdikarimov S.T., Eroshenko G.A., Nosov N.Y., Kukleva L.M., Adambekov D.A., Al’dzhambaeva I.S.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/432

Цель исследования. Оценка эффективности методов молекулярной диагностики и идентификации штаммов Yersinia pestis в полевом материале, полученном в условиях Сарыджазского высокогорного очага в Кыргызской Республике. Материалы и методы. Исследованы образцы полевого материала, выделенные в 2016 г. в Сарыджазском высокогорном очаге чумы, с помощью классических методов лабораторной диагностики и методом ПЦР с гибридизационно-флуоресцентным и электрофоретическим учетом результатов. Результаты и выводы. Показано, что в ряде случаев молекулярно-генетический метод обладает большим разрешением по сравнению с традиционными методами лабораторной диагностики чумы. Это доказывает необходимость более широкого использования молекулярно-диагностических методов в эпизоотологическом мониторинге чумы в природных очагах в Кыргызской Республике.

Objective of the study is to assess the effectiveness of the methods for molecular diagnostics and identification of Yersinia pestis strains in the field material obtained from Sarydzhas high-mountain focus in Kyrgyz Republic. Materials and methods. Investigated were the samples of the field material, isolated in 2016 in Sarydzhas high-mountain plague focus, using conventional methods of laboratory diagnostics and PCR with hybridization-fluorescent and electrophoretic registration of results. Results and conclusions. It is demonstrated that in a number of cases molecular-genetic method has a higher resolution as compared to conventional methods of laboratory diagnostics of plague. It proves the necessity of wider usage of molecular-diagnostic methods in epizootiological monitoring of plague in natural foci in Kyrgyz Republic.

возбудитель чумыдиагностикаПЦРштаммыplague agentdiagnosticsPCRstrainsReferencesАйкимбаев А.М., Литвак Я.И., Шварц А.В. Руководство по эпидемиологическому надзору в горных очагах чумы Тянь-Шаня и Алая. Алма-Ата; 1991. 123 с.Aikimbaev A.M., Litvak Ya.I., Shvarts A.V. [Guidelines on Epidemiological Surveillance in the Mountain Plague Foci of Tien-Shan and Alai]. Alma-Ata; 1991. 123 p.Дмитриевская М.Е., Крылов Д.Г., Тарасов П.П. Опыт выявления и некоторые особенности чумных эпизоотий в Сарыджасских сыртах. В кн.: Труды Средне-Азиатского научно-исследовательского противочумного института. Алма-Ата– Фрунзе; 1961. Т. 7. С. 61–71.Dmitrievskaya M.E., Krylov D.G., Tarasov P.P. [Experience in detection and certain peculiarities of plague epizooties in Sarydzhas syrtas]. In: [Works of Central-Asian Research Anti-Plague Institute]. Alma-Ata–Frunze; 1961. Vol. 7. P. 61–71.Дмитриевская М.Е., Тарасова Н.Е. Случай выделения культуры чумного микроба от лисицы в Центральном Тянь-Шане. В кн.: Труды Средне-Азиатского научно-исследовательского противочумного института. Алма-Ата; 1959. Т. 5. С. 271–2.Dmitrievskaya M.E., Tarasova N.E. [A case of plague microbe culture isolation from a fox in Central Tien-Shan]. In: [Works of Central-Asian Research Anti-Plague Institute]. Alma-Ata; 1959. Vol. 5. P. 271–2.Ерошенко Г.А., Одиноков Г.Н., Куклева Л.М., Павлова А.И., Краснов Я.М., Шавина Н.Ю., Гусева Н.П., Виноградова Н.А., Кутырев В.В. Стандартный алгоритм молекулярного типирования штаммов Yersinia pestis. Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 2012; 3:25–35.Eroshenko G.A., Odinokov G.N., Kukleva L.M., Pavlova A.I., Krasnov Ya.M., Shavina N.Yu., Guseva N.P., Vinogradova N.A., Kutyrev V.V. [Standard algorithm of molecular typing of Yersinia pestis strains]. Zh. Mikrobiol. Epidemiol. Immunobiol. 2012; 3:25–35.Кутырев В.В., Попова А.Ю., редакторы. Кадастр эпидемических и эпизоотических проявлений чумы на территории Российской Федерации и стран ближнего зарубежья (с 1876 по 2016 год). Саратов: ООО «Амирит»; 2016. 248 с.Kutyrev V.V., Popova A.Yu., editors. [Cadastre of Epidemic and Epizootic Manifestations of Plague in the Territory of the Russian Federation and Neighboring Countries (1876–2016)]. Saratov: “Amirit”; 2016. 248 p.Лаврентьев А.Ф., Популях П.А. Случай обнаружения спонтанных зараженных чумой неспецифических носителей. В кн.: Труды Средне-Азиатского научно-исследовательского противочумного института. Алма-Ата; 1959. Т. 5. С. 273–7.Lavrentiev A.F., Populyakh P.A. [A case of detection of spontaneous plague infected non-specific carriers]. In: [Works of Central-Asian Research Anti-Plague Institute]. Alma-Ata; 1959. Vol. 5. P. 273–7.Лабораторная диагностика полевого материала на чуму. Методическое руководство. Бишкек; 2006.[Laboratory Diagnostics of Field Material for the Presence of Plague Microbe]. Methodological Recommendations. Bishkek; 2006.Онищенко Г.Г., Кутырев В.В., редакторы. Лабораторная диагностика опасных инфекционных болезней. М.: ЗАО «Шико»; 2013. 560 сOnishchenko G.G., Kutyrev V.V., editors. [Laboratory Diagnostics of Dangerous Infectious Diseases]. Practice Guidelines. 2nd edition, revised and updated. M.: “Shiko”; 2013. 560 p.Организация работ лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I–IV групп патогенности. МУ 1.3.2569–09. М.; 2009.[Management of laboratories using methods of nucleotide acids am- plification when handling materials containing microorganisms of the I–IV groups of pathogenicity]. MR 1.3.2569-09. M.; 2009.Eroshenko G.A., Nosov N.Y., Krasnov Y.M., Oglodin Y.G., Kukleva L.M., Guseva N.P., Kuznetsov A.A., Abdikarimov S.T., Dzhaparova A.K., Kutyrev V.V. Yersinia pestis strains of ancient phylogenetic branch 0.ANT are widely spread in the high-mountain plague foci of Kyrgyzstan. PLoS One. 2017; 12(10):e0187230. DOI: 10.1371/journal.pone.0187230.Eroshenko G.A., Nosov N.Y., Krasnov Y.M., Oglodin Y.G., Kukleva L.M., Guseva N.P., Kuznetsov A.A., Abdikarimov S.T., Dzhaparova A.K., Kutyrev V.V. Yersinia pestis strains of ancient phylogenetic branch 0.ANT are widely spread in the high-mountain plague foci of Kyrgyzstan. PLoS One. 2017; 12(10):e0187230. DOI: 10.1371/journal.pone.0187230.Tsuzuki S., Lee H., Miura F., Chan Y.H., Sung-mok Jung S.M., Akhmetzhanov A.H., Nishiura H. Dynamics of the pneumonic plague epidemic in Madagascar, August to October 2017. Euro Surveill. 2017 Nov; 22(46). DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2017.22.46.17-00710. PMID: 291622.Tsuzuki S., Lee H., Miura F., Chan Y.H., Sung-mok Jung S.M., Akhmetzhanov A.H., Nishiura H. Dynamics of the pneumonic plague epidemic in Madagascar, August to October 2017. Euro Surveill. 2017 Nov; 22(46). DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2017.22.46.17-00710. PMID: 291622.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.