microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2017-4-72-76microbe-442Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESЦиркуляция лиссавирусов (Lyssavirus) среди мелких млекопитающих на территории Гвинейской РеспубликиCirculation of Lyssaviruses (Lyssavirus) among the Small Mammals in the Territory of the Republic of GuineaПоршаковА. М.PorshakovA. M.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46.

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

rusrapi@microbe.ruКононоваЮ. В.KononovaYu. V.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

vector@vector.nsc.ruТерновойВ. А.TernovoyV. A.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

ЗайковскаяА. В.ZaikovskayaA. V.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

НикифоровК. А.NikiforovK. A.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46.

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

АгафоновД. А.AgafonovD. A.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46.

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

СеменцоваА. О.SementsovaA. O.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

KeitaN.KeitaN.

Гвинейская Республика, Киндия

Kindia, Republic of Guinea

ЯковлевС. А.YakovlevS. A.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46.

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

НестеровА. Е.NesterovA. E.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

СергеевА. А.SergeevA. A.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

ToureA.ToureA.

Гвинейская Республика, Киндия

Kindia, Republic of Guinea

BoumbalyS.BoumbalyS.

Гвинейская Республика, Киндия

Kindia, Republic of Guinea

НикитинП. П.NikitinP. P.

Российская Федерация, 410005, Саратов, ул. Университетская, 46.

46, Universitetskaya St., Saratov, 410005, Russian Federation

ЛопатинА. А.LopatinA. A.

Российская Федерация, 127490, Москва, ул. Мусоргского, 4.

4, Musorgskogo St., Moscow, 127490, Russian Federation

protivochym@nln.ruЛоктевВ. Б.LoktevV. B.

Российская Федерация, 630559, Новосибирская обл., п. Кольцово

Kol’tsovo, Novosibirsk Region, 630559, Russian Federation

ФКУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»РоссияRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”Russian FederationФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»РоссияState Scientific Center of Virology and Biotechnology “Vector”Russian FederationCentre Universitaire de Kindia-FoulayahГвинеяCentre Universitaire de Kindia-FoulayahGuineaInstitut de Recherche en Biologie Appliquée de Guinée à KindiaГвинеяInstitut de Recherche en Biologie Appliquée de Guinée à KindiaGuineaФКУЗ «Противочумный центр»РоссияPlague Control CenterRussian Federation201720122017047276Copyright © Поршаков А.М., Кононова Ю.В., Терновой В.А., Зайковская А.В., Никифоров К.А., Агафонов Д.А., Семенцова А.О., Keita N., Яковлев С.А., Нестеров А.Е., Сергеев А.А., Toure A., Boumbaly S., Никитин П.П., Лопатин А.А., Локтев В.Б., 20172017Поршаков А.М., Кононова Ю.В., Терновой В.А., Зайковская А.В., Никифоров К.А., Агафонов Д.А., Семенцова А.О., Keita N., Яковлев С.А., Нестеров А.Е., Сергеев А.А., Toure A., Boumbaly S., Никитин П.П., Лопатин А.А., Локтев В.Б.Porshakov A.M., Kononova Y.V., Ternovoy V.A., Zaikovskaya A.V., Nikiforov K.A., Agafonov D.A., Sementsova A.O., Keita N., Yakovlev S.A., Nesterov A.E., Sergeev A.A., Toure A., Boumbaly S., Nikitin P.P., Lopatin A.A., Loktev V.B.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/442

Цель работы. Изучение участия мелких млекопитающих Гвинейской Республики в циркуляции лиссавирусов. Материалы и методы. Исследования выполнены с использованием ОТ-ПЦР, нуклеотидная последовательность фрагментов кДНК лиссавирусов была определена при помощи секвенирования с последующим филогенетическим анализом. Результаты и выводы. На наличие РНК лиссавирусов методом ОТ-ПЦР с использованием родоспецифичных праймеров проанализировано 356 образцов головного мозга мелких млекопитающих, отловленных в пригородах г. Киндия в 2016 г. Образцы получены от диких животных, относящихся к отрядам Rodentia, Chiroptera, Eulipotyphla и Carnivora. РНК лиссавирусов обнаружена в 31 образце (8,7 %), для 14 ПЦР положительных образцов принадлежность к роду Lyssavirus была подтверждена определением и анализом нуклеотидных последовательностей полученных коротких кДНК фрагментов вирусного генома. Наличие РНК вируса бешенства в положительных пробах было исключено в ПЦР с помощью видоспецифических праймеров. В пуле образцов от черных крыс Rattus rattus, позитивных на наличие РНК лиссавирусов, была идентифицирована РНК, характерная для вида Mokola lyssavirus. Определена нуклеотидная последовательность фрагмента гена матриксного белка М вируса Мокола. Генетический материал вируса Мокола впервые обнаружен в Гвинейской Республике.

Objective is to study the role of small mammals, habitant in the Republic of Guinea, in Lyssavirus circulation. Materials and methods. Investigations were conducted using RT-PCR; nucleotide sequence of Lyssavirus cDNA fragments was identified with the help of sequencing with further phylogenetic analysis. Results and conclusions. Tested have been 356 brain samples from small mammals for the presence of Lyssavirus RNA using RT-PCR with genus-specific primers. The animals were caught in the suburbs of Kindia city in 2016. The samples were obtained from wild animals pertaining to Rodentia, Chiroptera, Eulipotyphla, and Carnivora orders.Lyssavirus RNA was detected in 31 samples (8.7 %). For 14 PCR positive samples the appurtenance to Lyssavirus was confirmed through identification and analysis of nucleotide sequences of the collected short cDAN fragments of viral genome. The presence of rabies virus RNA in positive tests was excluded from PCR with the help of species specific primers. The pool of samples from black rats, Rattus rattus, positive for Lyssavirus RNA, contained RNA characteristic of Mokola lyssavirus species. Specified has been nucleotide sequence of matrix protein M gene fragment of Mokola virus. Genetic material of Mokola virus was detected in the Republic of Guinea for the first time ever.

лиссавирусыГвинейская Республикавирус Моколачерная крысаlyssavirusesRepublic of GuineaMokola virusblack ratReferencesBanyard A.C., Evans J.S., Luo T.R., Fooks A.R. Lyssaviruses and Bats: Emergence and Zoonotic Threat. Viruses. 2014; 6:2974–90. DOI: 10.3390/v6082974.Banyard A.C., Evans J.S., Luo T.R., Fooks A.R. Lyssaviruses and Bats: Emergence and Zoonotic Threat. Viruses. 2014; 6:2974–90. DOI: 10.3390/v6082974.Boldbaatar B., Inoue S., Sugiura N., Noguchi A., Orbina J.R., Demetria C., Miranda M.E., Yamada A. Rapid detection of rabies virus by reverse transcription loop-mediated isothermal amplification. Jpn. J. Infect. Dis. 2009; 62(3):187–91.Boldbaatar B., Inoue S., Sugiura N., Noguchi A., Orbina J.R., Demetria C., Miranda M.E., Yamada A. Rapid detection of rabies virus by reverse transcription loop-mediated isothermal amplification. Jpn. J. Infect. Dis. 2009; 62(3):187–91.Global distribution of risk to humans of contracting rabies, 2013. [Cited 01 Mar 2017]. Available from: http://www.who.int/rabies/Global_distribution_risk_humans_contracting_rabies_2013.png?ua=1.Global distribution of risk to humans of contracting rabies, 2013. [Cited 01 Mar 2017]. Available from: http://www.who.int/rabies/Global_distribution_risk_humans_contracting_rabies_2013.png?ua=1.Hayman D.T., Fooks A.R., Marston D.A., Garcia-R J.C. The Global Phylogeography of Lyssaviruses – Challenging the ‘Out of Africa’ Hypothesis. PLoS. Negl. Trop. Dis. 2016; 10(12):e0005266. DOI: 10.1371/journal.pntd.0005266.Hayman D.T., Fooks A.R., Marston D.A., Garcia-R J.C. The Global Phylogeography of Lyssaviruses – Challenging the ‘Out of Africa’ Hypothesis. PLoS. Negl. Trop. Dis. 2016; 10(12):e0005266. DOI: 10.1371/journal.pntd.0005266.Hemachudha T., Ugolini G., Wacharapluesadee S., Sungkarat W., Shuangshoti S., Laothamatas J. Human rabies: neuropathogenesis, diagnosis and management. Lancet Neurol. 2013; 12:498–513. DOI: 10.1016/S1474-4422(13)70038-3.Hemachudha T., Ugolini G., Wacharapluesadee S., Sungkarat W., Shuangshoti S., Laothamatas J. Human rabies: neuropathogenesis, diagnosis and management. Lancet Neurol. 2013; 12:498–513. DOI: 10.1016/S1474-4422(13)70038-3.Kgaladi J., Wright N., Coertse J., Markotter W., Marston D., Fooks A.R., Freuling C.M., Müller T.F., Sabeta C.T., Nel L.H. Diversity and Epidemiology of Mokola Virus. PLoS Negl. Trop. Dis. 2013; 7(10):e2511. DOI:10.1371/journal.pntd.0002511.Kgaladi J., Wright N., Coertse J., Markotter W., Marston D., Fooks A.R., Freuling C.M., Müller T.F., Sabeta C.T., Nel L.H. Diversity and Epidemiology of Mokola Virus. PLoS Negl. Trop. Dis. 2013; 7(10):e2511. DOI:10.1371/journal.pntd.0002511.Kuzmin I.V., Niezgoda M., Franka R., Agwanda B., Markotter W., Beagley J.C., Urazova O.Y., Breiman R.F., Rupprecht C.E. Lagos Bat Virus in Kenya. J. Clin. Microbiol. 2008; 46(4):1451–61. DOI: 10.1128/JCM.00016-08.Kuzmin I.V., Niezgoda M., Franka R., Agwanda B., Markotter W., Beagley J.C., Urazova O.Y., Breiman R.F., Rupprecht C.E. Lagos Bat Virus in Kenya. J. Clin. Microbiol. 2008; 46(4):1451–61. DOI: 10.1128/JCM.00016-08.Malerczyk C., Freuling C., Gniel D., Giesen A., Selhorst T., Müller T. Cross-neutralization of antibodies induced by vaccination with Purified Chick Embryo Cell Vaccine (PCECV) against different Lyssavirus species. Hum. Vaccin. Immunother. 2014; 10(10):2799–804. DOI: 10.4161/21645515.2014.972741.Malerczyk C., Freuling C., Gniel D., Giesen A., Selhorst T., Müller T. Cross-neutralization of antibodies induced by vaccination with Purified Chick Embryo Cell Vaccine (PCECV) against different Lyssavirus species. Hum. Vaccin. Immunother. 2014; 10(10):2799–804. DOI: 10.4161/21645515.2014.972741.Paweska J.T., Blumberg L.H., Liebenberg C., Hewlett R.H., Grobbelaar A.A., Leman P.A., Croft J.E., Nel L.H., Nutt L., Swanepoel R. Fatal Human Infection with Rabies-related Duvenhage Virus, South Africa. Emerg. Infect. Dis. 2006; 12:1965–7. DOI: 10.3201/eid1212.060764.Paweska J.T., Blumberg L.H., Liebenberg C., Hewlett R.H., Grobbelaar A.A., Leman P.A., Croft J.E., Nel L.H., Nutt L., Swanepoel R. Fatal Human Infection with Rabies-related Duvenhage Virus, South Africa. Emerg. Infect. Dis. 2006; 12:1965–7. DOI: 10.3201/eid1212.060764.Virus Taxonomy: 2015 Release. EC 47, London, UK, July 2015. [Cited 01 Mar 2017]. Available from: http://www.ictvonline.org/virusTaxonomy.asp.Virus Taxonomy: 2015 Release. EC 47, London, UK, July 2015. [Cited 01 Mar 2017]. Available from: http://www.ictvonline.org/virusTaxonomy.asp.Warrell M. Rabies and African bat lyssavirus encephalitis and its prevention. Int. J. Antimicrob. Agents. 2010; 36(1):S47–52. DOI: 10.1016/j.ijantimicag.2010.06.021.Warrell M. Rabies and African bat lyssavirus encephalitis and its prevention. Int. J. Antimicrob. Agents. 2010; 36(1):S47–52. DOI: 10.1016/j.ijantimicag.2010.06.021.Youla A.S., Traore F.A., Sako F.B., Feda R.M., Emeric M.A. Canine and human rabies in Conakry: epidemiology and preventive aspects. Bull. Soc. Pathol. Exot. 2014; 107(1):18–21. DOI: 10.1007/13149-013-0321-x.Youla A.S., Traore F.A., Sako F.B., Feda R.M., Emeric M.A. Canine and human rabies in Conakry: epidemiology and preventive aspects. Bull. Soc. Pathol. Exot. 2014; 107(1):18–21. DOI: 10.1007/s13149-013-0321-x.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.