microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2017-4-99-102microbe-448Research ArticleКРАТКИЕ СООБЩЕНИЯBRIEF COMMUNICATIONSАнализ результатов мониторинга холерных вибрионов в объектах окружающей среды на административных территориях России с помощью ГИС «Холера 1989–2014»Analysis of the Results of Cholera Vibrios Monitoring in Environmental Objects in the Administrative Territories of the Russian Federation Using GIS “CHOLERA 1989–2014”ЛевченкоД. А.LevchenkoD. A.

Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40

117/40, M.Gor`kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation

levchenko_da@antiplague.ruКругликовВ. Д.KruglikovV. D.

Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40

117/40, M.Gor`kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation

АрхангельскаяИ. В.Arkhangel’skayaI. V.

Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40

117/40, M.Gor`kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation

ЕжоваМ. И.EzhovaM. I.

Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40

117/40, M.Gor`kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation

МосквитинаЭ. А.MoskvitinaE. A.

Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40

117/40, M.Gor`kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation

ТитоваС. В.TitovaS. V.

Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40

117/40, M.Gor`kogo St., Rostov-on-Don, 344002, Russian Federation

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»РоссияRostov-on-Don Research Anti-Plague InstituteRussian Federation2017201220170499102Copyright © Левченко Д.А., Кругликов В.Д., Архангельская И.В., Ежова М.И., Москвитина Э.А., Титова С.В., 20172017Левченко Д.А., Кругликов В.Д., Архангельская И.В., Ежова М.И., Москвитина Э.А., Титова С.В.Levchenko D.A., Kruglikov V.D., Arkhangel’skaya I.V., Ezhova M.I., Moskvitina E.A., Titova S.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/448

Цель настоящей работы заключалась в сравнительном анализе результатов мониторинговых исследований штаммов Vibrio cholerae, выделенных на территориях федеральных округов, входящих в них субъектов и из конкретных водных объектов в период 2006–2016 гг. На основе методологии с использованием пополняемой геоинформационной системы «Холера 1989–2014» проведено сравнительное изучение динамики выделения и биологических свойств 586 штаммов холерных вибрионов О1, О139 и Р-вариантов, изолированных из водных объектов окружающей среды на административных территориях России. В результате установлено, что штаммы Vibrio cholerae различных серогрупп обнаруживались на территории всех федеральных округов, но не всех субъектов, входящих в них. Показано, что за изучаемый период наибольшее количество изолированных штаммов было зарегистрировано в Южном федеральном округе. Подавляющее количество штаммов холерных вибрионов, выделенных в стране, являлись нетоксигенными. Отмечено, что на фоне эпидблагополучия продолжалось обнаружение единичных эпидзначимых штаммов (Ростовская область). Штаммы ctxA– tcpA+  обнаруживались в Южном, Дальневосточном и Северо-Западном федеральных округах. Установлено, что до 2013 г. в пяти субъектах штаммы холерных вибрионов О1 и О139 в водных объектах не обнаруживались. Нетоксигенные штаммы холерных вибрионов О1 Эль Тор серовара Огава превалировали на территориях Южного и Уральского, а серовара Инаба – на территории остальных федеральных округов. Наиболее часто выделялись нетоксигенные штаммы Vibrio cholerae О1 с фаготипом 15, а изоляты с фаготипами 4, 5, 10, 14 и 17 встречались только на территории Южного федерального округа. Полученные данные обозначили подход, способствующий комплексной оценке эпидситуации по холере на территории России, и подчеркнули перспективы применения ГИС для повышения эффективности мониторинга холерных вибрионов в водных объектах окружающей среды.

Objective of the work was to compare the results of monitoring of Vibrio cholerae strains isolated in the territories of federal districts, their constituent entities and from certain water bodies between 2006–2016. Based on the methodology, using updated geoinformation system “Cholera 1989–2014”, a comparative study of the dynamics of isolation and biological properties of 586 Vibrio cholerae O1, O139 strains and R-variants, collected from the surface water bodies in the administrative territories of Russia, was carried out. Eventually it is established that Vibrio cholerae strains of various serogroups are found in the territory of all federal districts, but not in all the entities included in them. It is shown that the greatest number of isolated strains was registered in the Southern Federal District. The overwhelming number of Vibrio cholerae strains, isolated in the country, were non-toxigenic. It was noted that against the background of epidemiological welfare, the detection of single epidemiologically significant strains continued (Rostov Region).ctxA–tcpA+ strains were found in the Southern, Far Eastern and North-Western Federal Districts. It is established that until 2013 in five constituent entities strains of Vibrio cholerae O1 and O139 in water bodies were not detected. Non-toxigenic strains of Vibrio cholerae O1 El Tor Ogawa serovar prevailed in the territories of the Southern and Ural, and Inaba serovar – in the remaining Federal Districts.The most frequently isolated were non-toxigenic Vibrio cholerae O1 strains with phagotype 15, while isolates with phagotypes 4, 5, 10, 14 and 17 were traced only in the Southern Federal District. The data obtained formed the basis of the approach that contributes to a comprehensive assessment of the epidemiological situation on cholera in the territory of Russia and highlighted the prospects for using GIS to improve the effectiveness of cholera vibrio monitoring in surface water bodies.

геоинформационная системафедеральные округа России и их субъектыобъекты окружающей средыхолерные вибрионыфено- и генотипgeo-information systemFederal Districts of Russia and their constituent entitiesenvironmental objectsVibrio choleraepheno- and genotypesReferencesЗубкова Д.А., Кругликов В.Д., Архангельская И.В., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б., Водопьянов С.О. Генетические особенности штаммов холерных вибрионов О1 серогруппы ctxA–tcpA+ , выделенных из водных объектов РФ, охарактеризованные с помощью новой геоинформационной системы. Здоровье населения и среда обитания. 2014; 9:32–5.Nepomnyashchaya N.B., Vodop’yanov S.O. [Genetic peculiarities of cholera vibrio O1 strains ctxA– tcpA+ , isolated from surface water bodies of the Russian Federation, characterized using new geo-information system]. Zdor. Naselen. Sreda Obit. 2014; 9:32–5.Зубкова Д.А., Кругликов В.Д., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б., Шестиалтынова И.С., Архангельская И.В., Ежова М.И., Ускова Н.Н. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2014621055. Геоинформационная система «Холера 1989–2014».Zubkova D.A., Kruglikov V.D., Vodop’yanov A.S., Nepomnyashchaya N.B., Shestialtynova I.S., Arkhangel’skaya I.V., Ezhova M.I., Uskova N.N. [Certificate of the State Registration of a database No 2014621055. Geoinformation system “Cholera 1989–2014”].Титова С.В., Москвитина Э.А., Кругликов В.Д., Самородова А.В., Тюленева Е.Г., Монахова Е.В., Писанов Р.В., Водопьянов А.С., Архангельская И.В., Иванова С.М., Ковалева Т.В., Водопьянов С.О. Холера: оценка эпидемиологической обстановки в мире и России в 2006–2015 гг. Прогноз на 2016 г. Пробл. особо опасных инф. 2016; 1:20–7. DOI: 10.21055/0370-1069-2016-1-20-27.Titova S.V., Moskvitina E.A., Kruglikov V.D., Samorodova A.V., Tyuleneva E.G., Monakhova E.V., Pisanov R.V., Vodop’yanov A.S., Arkhangel’skaya I.V., Ivanova S.M., Kovaleva T.V., Vodop’yanov S.O. [Cholera: Analysis of Epidemiological Situation across the World and in Russia within a Period of 2006–2015]. Probl. Osobo Opasn. Infek. 2016; 1: 20–7. DOI: 10.21055/0370-1069-2016-1-20-27.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.