References

microbe

Проблемы особо опасных инфекций

Problems of Particularly Dangerous Infections

0370-10692658-719X

Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe”

10.21055/0370-1069-2018-2-68-72

microbe-482

Research Article

ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

ORIGINAL ARTICLES

Применение принципов многофакторного генетического анализа возбудителей инфекционных болезней в работе СПЭБ Роспотребнадзора в период массовых мероприятий

Applying Principles of Multi-Factor Genetic Analysis of Infectious Disease Agents in the Work of the Rospotrebnadzor SAET during Mass Events

Кузнецова

И. В.

Kuznetsova

I. V.

labindic@mail.ru

Ефременко

Д. В.

Efremenko

D. V.

Куличенко

А. Н.

Kulichenko

A. N.

ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт», СтавропольРоссияStavropol Research Anti-Plague Institute, StavropolRussian Federation

2018

04072018

026872

2018

Кузнецова И.В., Ефременко Д.В., Куличенко А.Н.

Kuznetsova I.V., Efremenko D.V., Kulichenko A.N.

Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.

This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.

https://journal.microbe.ru/jour/article/view/482

Цель исследования – разработать и апробировать на практике при работе специализированной противоэпидемической бригады Роспотребнадзора в период крупных массовых мероприятий порядок использования молекулярногенетических методов для выявления и идентификации патогенных биологических агентов. Материалы и методы. В работе использованы отчетные документы по итогам деятельности СПЭБ Роспотребнадзора при обеспечении санитарно-эпидемиологического благополучия в период XXII Олимпийских зимних игр 2014 г. и других масштабных массовых мероприятий, проходивших в Сочи в 2015–2017 гг. Результаты и обсуждение. На практике при работе СПЭБ Роспотребнадзора в период крупных массовых мероприятий разработан и применен порядок использования молекулярно-генетических методов, основанный на структурированном подходе (алгоритме) индикации и генетической характеристики ПБА. Укомплектование СПЭБ диагностическими препаратами осуществляется в соответствии с обеспечением готовности к проведению исследований согласно трехуровневому алгоритму молекулярно-генетической характеристики патогенов: I уровень – индикация возбудителя методом ПЦР, II уровень – идентификация фрагментов генома возбудителя методом ПЦР, III уровень – генотипирование. Разработанный порядок успешно использовался при работе СПЭБ во время XXII Олимпийских зимних игр 2014 г. и других массовых мероприятий, проходивших в Сочи в 2015–2017 гг., что позволяет рекомендовать его для дальнейшего применения.

Objective of the study – to develop and test in operation of the Rospotrebnadzor Spesialized Anti-Epidemic Teams (SAET), deployed during the major mass events, the procedure for application of molecular-genetic methods for detection and identification of pathogenic biological agents. Materials and methods. Utilized are the reporting documentation drawn up by the results of work of the specialized anti-epidemic teams of the Rospotrebnadzor on the provision of sanitary epidemiological welfare during Olympic Games 2014 and other important mass events in Sochi in 2015–2017. Results and conclusions. Developed and tested in practice of the Rospotrebnadzor SAET during the major mass events has been procedure for application of molecular-genetic methods, based on structured approach (algorithm) of indication and genetic characterization of PBA. Equipping of the SAET with diagnostic preparations is carried out in accordance with the provision of preparedness for performing investigations by three-level algorithm of molecular-genetic characteristics of pathogens: level I – detection (indication) of a pathogen using PCR, level II – identification of the pathogen genome fragments using PCR, level III – genotyping. Developed procedure was used successfully by the SAET during the Olympic Games 2014 and other important mass events in Sochi in 2015–2017, which allows for recommending it for future use.

патогенные биологические агентыметоды генетического анализамассовые мероприятияСПЭБ

pathogenic biological agentsmethods of genetic analysismass eventsSAET

References1

Балахонов С.В., Андаев Е.И., Чеснокова М.В., Алленов А.В., Хоменко Т.В., Иванов Л.И., Никитин А.Я., Косилко С.А., Ковальский А.Г., Куликалова Е.С. Роль противочумных учреждений в обеспечении эпидемиологического благополучия при подготовке и проведении саммита АТЭС-2012. Проблемы особо опасных инфекций. 2013; 3:5–12. DOI:10.21055/0370-1069-2013- 3-5-12.

Balakhonov S.V., Andaev E.I., Chesnokova M.V., Allenov A.V., Khomenko T.V., Ivanov L.I., Nikitin A.Ya., Kosilko S.A., Koval’sky A.G., Kulikalova E.S. [The role of anti-plague institutions in provision of the epidemiological well-being during the preparation and carrying out of the APEC 2012 Summit]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2013; 3:5–12. DOI: 10.21055/0370-1069-2013-3-5-12.

Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Куличенко А.Н., Портенко С.А., Гуськов А.С., Почтарева Е.С., Савельева И.В., Волынкина А.С., Савельев В.Н., Михайлова М.Е., Кузнецова И.В., Бобенко О.А., Ефременко Д.В., Казакова Е.С., Красовская Т.Ю., Куклев В.Е., Касьян И.А., Билько Е.А., Мицевич Е.В., Мицевич И.П., Платонов М.Е., Теймуразов М.Г., Полосенко О.В., Елдинова В.Е., Бойко Е.А., Малай В.И., Клиндухов В.П., Гречаная Т.В., Николаевич П.Н., Бирюков В.А., Божко И.И., Щербина Л.И., Погудина О.А. Организация обследования и выявление возбудителя легионеллеза в объектах окружающей среды в период подготовки и проведения XXII Олимпийских и XI Паралимпийских зимних игр в Сочи. Проблемы особо опасных инфекций. 2015; 2:50–3. DOI:10.21055/0370-1069-2015-2-50-53.

Ezhlova E.B., Demina Yu.V., Kulichenko A.N., Portenko S.A., Gus’kov A.S., Pochtareva E.S., Savel’eva I.V., Volynkina A.S., Savel’ev V.N., Mikhailova M.E., Kuznetsova I.V., Bobenko O.A., Efremenko D.V., Kazakova E.S., Krasovskaya T.Yu., Kuklev V.E., Kas’yan I.A., Bil’ko E.A., Mitsevich E.V., Mitsevich I.P., Platonov M.E., Teimurazov M.G., Polosenko O.V., Eldinova V.E., Boiko E.A., Malay V.I., Klindukhov V.P., Grechanaya T.V., Nikolaevich P.N., Biryukov V.A., Bozhko I.I., Shcherbina L.I., Pogudina O.A. [Management of the investigation and detection of Legionellosis agent in the environmental samples during the preparation and hold- ing of the XXII Winter Olympics and XI Paralympics in Sochi]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2015; 2:50–3. DOI: 10.21055/0370-1069- 2015-2-50-53.

Казакова Е.С., Портенко С.А., Шарова И.Н., Карнаухов И.Г., Красовская Т.Ю., Куклев В.Е., Найденова Е.В., Билько Е.А., Касьян И.А., Щербакова С.А., Топорков А.В. Организация диагностических исследований в мобильном комплексе специализированной противоэпидемической бригады в период проведения массовых мероприятий. Проблемы особо опасных инфекций. 2014; 2:89–93. DOI:10.21055/0370-1069-2014-2-89-93.

Kazakova E.S., Portenko S.A., Sharova I.N., Karnaukhov I.G., Krasovskaya T.Yu., Kuklev V.E., Naidenova E.V., Bil’ko E.A., Kas’yan I.A., Shcherbakova S.A., Toporkov A.V. [Management of diagnostic investigations at the premises of specialized anti-epidemic team mo- bile complex at the time of running mass events]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2014; 2:89–93. DOI: 10.21055/0370-1069-2014-2-89-93.

Кузькин Б.П., Куличенко А.Н., Малецкая О.В., Ефременко Д.В., Манин Е.А., Котенев Е.С., Рязанова А.Г., Кузнецова И.В., Дикова С.П., Лисицкая Я.В., Волынкина А.С., Пономаренко Д.Г., Елдинова В.Е., Бойко Е.А., Клиндухов В.П., Оробей В.Г., Кутырев В.В., Казакова Е.С., Куклев В.Е., Дятлов И.А., Карцев Н.Н. Результаты работы СПЭБ ФКУЗ «Ставропольский противочумный институт» Роспотребнадзора в период проведения XXII Олимпийских и XI Паралимпийских зимних игр в Сочи. Проблемы особо опасных инфекций. 2015; 2:17–21. DOI:10.21055/0370-1069-2015-2-17-21.

Kuz’kin B.P., Kulichenko A.N., Maletskaya O.V., Efremenko D.V., Manin E.A., Kotenev E.S., Ryazanova A.G., Kuznetsova I.V., Dikova S.P., Lisitskaya Ya.V., Volynkina A.S., Ponomarenko D.G., Eldinova V.E., Boiko E.A., Klindukhov V.P., Orobey V.G., Kutyrev V.V., Kazakova E.S., Kuklev V.E., Dyatlov I.A., Kartsev N.N. [Performance of the SAET of the Stavropol Anti-Plague Institute of the Rospotrebnadzor during the XXII Olympic and XI Paralympic Winter Games in Sochi]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2015; 2:17–21. DOI: 10.21055/0370-1069-2015-2-17-21.

Куличенко А.Н., Волынкина А.С., Лисицкая Я.В., Котенев Е.С., Кузнецова И.В., Подколзин А.Т., Зайцева Е.В., Паркина Н.В., Оробей В.Г. Генетическое профилирование актуальных для региона г.-к. Сочи возбудителей природно-очаговых и кишечных инфекций. Бактериология. 2016; 1(1):16–21. DOI: 10.20953/2500-1027-2016-1-16-21.

Kulichenko A.N., Volynkina A.S., Lisitskaya Ya.V., Kotenev E.S., Kuznetsova I.V., Podkolzin A.T., Zaitseva E.V., Parkina N.V., orobey V.G. [Genetic profiling of relevant for the region of cityresort Sochi agents of natural-focal and intestinal infections]. Bakteriologiya. 2016; 1(1):16–21. DOI: 10.20953/2500-1027-2016- 1-16-21.

Куличенко А.Н., Ефременко Д.В., Кузнецова И.В., Зайцева О.А. Обеспечение готовности специализированных противоэпидемических бригад к работе при проведении массовых мероприятий. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2014; 1:76–80.

Kulichenko A.N., Efremenko D.V., Kuznetsova I.V., Zaitseva E.V. [Provision of preparedness of the specialized anti-ep- idemic teams for work during mass events]. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2014; 1:76–80.

Онищенко Г.Г. Обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия в период подготовки и проведения саммита АТЭС-2012. Новосибирск: «Наука-Центр»; 2013. 419 с.

Onishchenko G.G. [Provision of Sanitary-Epidemiological Welfare during Preparation and Holding of the APEC Summit-2012]. Novosibirsk:”Nauka-Tsentr”; 2013. 419 p.

Онищенко Г.Г., Кузькин Б.П., Ракитин И.А., Башкетова Н.С., Коржаев Ю.Н., Гречанинова Т.А., Дятлов И.А., Кутырев В.В., Топорков А.В., Карнаухов И.Г., Топорков В.П., Щербакова С.А., Казакова Е.С., Шарова И.Н. Обеспечение санитарно- эпидемиологического благополучия в период подготовки и проведения саммита «Группы двадцати» в Санкт-Петербурге в 2013 г. Сообщение 2. Организация и приоритетные направления работы в период проведения Саммита. Проблемы особо опасных инфекций. 2013; 4:11–5. DOI:10.21055/0370-1069-2013-4-11-15.

Onishchenko G.G., Kuz’kin B.P., Rakitin I.A., Bashketova N.S., Korzhaev Yu.N., Grechaninova T.A., Dyatlov I.A., Kutyrev V.V., Toporkov A.V., Karnaukhov I.G., Toporkov V.P., Shcherbakova S.A., Kazakova E.S., Sharova I.N. [Sanitary-epidemiological welfare provision in the preparations to and management of the “G-20” Summit in Saint-Petersburg, 2013. Communication 2. Management and priority areas of anti-epidemic activities as regards “G-20”Summit campaign]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2013; 4:11–5. DOI: 10.21055/0370-1069-2013-4-11-15.

Онищенко Г.Г., Куличенко А.Н., Зайцева О.А., Ефременко Д.В. Опыт стран-организаторов Олимпиад по обеспечению защиты от биологической угрозы. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2014; 1:70–5.

Onishchenko G.G., Kulichenko A.N., Zaitseva E.V., Efremenko D.V. [Lessons learned by host countries during Olympiad from the provision of protection against biological threats]. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2014; 1:70–5.

Онищенко Г.Г., Куличенко А.Н., редакторы. XXII Олимпийские зимние игры и XI Паралимпийские зимние игры 2014 года в г. Сочи. Обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия. Тверь; 2015. 576 с.

Onishchenko G.G., Kulichenko A.N., editors. [XXII Olympic Winter Games and XI Winter Paralympics in Sochi, 2014. Provision of sanitary-epidemiological welfare]. Tver; 2015. 576 p.

Онищенко Г.Г., Кутырев В.В., редакторы. XXVII Всемирная летняя универсиада 2013 года в Казани. Обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия. Тверь: ООО «Издательство «Триада»; 2013. 528 с.

Onishchenko G.G., Kutyrev V.V., editors. [XXVII World Summer Universiade, 2013 in Kazan. Provision of SanitaryEpidemiological Welfare of the Population]. Tver: “Triada” Ltd., 2013. 528 p.

Онищенко Г.Г., Попова А.Ю., Смоленский В.Ю., Малецкая О.В., Таран Т.В., Дубянский В.М., Семенко О.В., Агапитов Д.С., Грижебовский Г.М., Манин Е.А., Клиндухов В.П., Оробей В.Г., Антоненко А.Д. Анализ зарубежного опыта обеспечения биологической безопасности при проведении Олимпийских игр. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2015; 2:105–9.

Onishchenko G.G., Popova A.Yu., Smolensky V.Yu., Maletskaya O.V., Taran T.V., Dubyansky V.M., Semenko O.V., Agapitov D.S., Grizhebovsky G.M., Manin E.A., Klindukhov V.P., Orobey V.G., Antonenko A.D. [Analysis of international experience in the p[rovision of biological safety during Olympic Games]. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2015; 2:105–9.

Попова А.Ю., Горский А.А., Гуськов А.С., Иванов Г.Е. Чикина Л.В., Степанов В.С., Почтарева Е.С., Аксенова О.И., Щербина Л.И., Пархоменко В.В., Куличенко О.А., Комарова Н.С., Шевченко Е.П., Клиндухов В.П., Гречаная Т.В., Потемкина М.А., Балаева М.И., Бирюков В.А., Божко И.И., Тешева С.Ч., Вечерняя Л.С., Егоров В.А., Дараган Ю.Г., Тушина О.В., Куличенко А.Н., Ефременко Д.В., Манин Е.А., Ковалев Д.А., Елдинова В.Е., Юничева Ю.В., Бойко Е.А. Обеспечение лабораторного мониторинга объектов окружающей среды в период проведения XXII Олимпийских зимних игр и XI Паралимпийских зимних игр в г.-к. Сочи. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2015; 14(3):12–6.

Popova A.Yu., Gorsky A.A., Gus’kov A.S., Ivanov G.E., Chikina L.V., Stepanov V.S., Pochtareva E.S., Aksenova O.I., Shcherbina L.I., Parkhomenko V.V., Kulichenko O.A., Komarova N.S., Shevchenko E.P., Klindukhov V.P., Grechanaya T.V., Potemkina M.A., Balaeva M.I., Biryukov V.A., Bozhko I.I., Tesheva S.Ch., Vechernyaya L.S., Egorov V.A., Daragan Yu.G., Tushina O.V., Kulichenko A.N., Efremenko D.V., Manin E.A., Kovalev D.A., Eldinova V.E., Yunicheva yu.V., Boiko E.A. [Support of laboratory monitoring of ambient environment objects during XXII Olympic Winter Games and XI Paralympic Games in Sochi]. Epidemiologiya i Vaktsinoprofilaktika. 2015; 3:12–6.

Abubakar I., Gautret P., Brunette G.W., Blumberg L., Johnson D., Poumero G., Memish Z.A., Barbeschi M., Khan A.S. Global perspectives for prevention of infectious diseases associated with mass gatherings. Lancet Infect. Dis. 2012; 12(1):66–74.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.