microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2010-2(104)-60-65microbe-528Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯMICROBIOLOGYИзучение генетического разнообразия штаммов сибиреязвенного микроба из коллекции ГНЦ ПМБStudy of the Genetic Diversity of the Anthrax Microbe Strains from the Collection of SRC AMBШишковаН. А.ShishkovaN. A.noemail@neicon.ruМокриевичА. Н.MokrievichA. N.noemail@neicon.ruПлатоновМ. Е.PlatonovM. E.noemail@neicon.ruСветочТ. Э.SvetochT. E.noemail@neicon.ruМарининЛ. И.MarininL. I.noemail@neicon.ruГосударственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологииРоссияState Research Center for Applied Microbiology and BiotechnologyRussian Federation20102004201002(104)6065Copyright © Шишкова Н.А., Мокриевич А.Н., Платонов М.Е., Светоч Т.Э., Маринин Л.И., 20102010Шишкова Н.А., Мокриевич А.Н., Платонов М.Е., Светоч Т.Э., Маринин Л.И.Shishkova N.A., Mokrievich A.N., Platonov M.E., Svetoch T.E., Marinin L.I.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/528

В работе представлены данные по VNTR - типированию сибиреязвенных штаммов из коллекции ГНЦ ПМБ. Всего проанализировано 25 штаммов Bacillus anthracis, имеющих разное происхождение и территориальную принадлежность. Использование схемы типирования по P.Keim et al. позволило соотнести российские штаммы со штаммами других коллекций. Было обнаружено 4 новых аллели: Dakkar - VrrA (296), 157 - VrrB2 (180), Dakkar - VrrC2 (478) и M-29 - pXO1 (138). Большая часть штаммов относится к группе A (величина VrrB1 фрагмента равна 229 п.о.) и лишь два штамма (1051 и 157) имеют величину VrrB1 фрагмента 256 п.н. Не укладываются ни в один из 89 описанных P.Keim et al. генотипов следующие штаммы из коллекции ГНЦ ПМБ: 1«Коломна», Ч-7, 15, M-29, 34, 81/1, 157, 228, 1051 и Dakkar. Показано генетическое разнообразие сибиреязвенных штаммов, выделенных из разных источников и находящихся в коллекции ГНЦ ПМБ.

Data on VNTR typing of anthrax strains from SRC AMB collection are presented. 25 Bacillus anthracis strains of different origin and isolated in different territories have been analyzed. Application of the typing scheme of P.Keim et al. enabled to correlate Russian strains with strains of other collections. 4 new alleles: Dakkar-VrrA(296), 157-VrrB2(180), Dakkar-VrrC2(478) and M-29-pXO1(138) were determined. Major part of the strains refers to the A group (the size of VrrB1 fragment is 229 b.p.) and only two strains (1051 and 157) possess VrrB1 fragment of 229 b.p. The following strains of SRC AMB collection: 1 Kolomna, Ch-7, 15, M-29, 34, 81/1, 157, 228, 1051 and Dakkar do not go in any of 89 genotypes described by P.Keim et al. Genetic diversity of the anthrax strains isolated from different sources and presented in SRC AMB collection is shown.

B. anthracisтипированиештаммгеномB. anthracistypingstraingenomeReferencesЦыганкова Е.А., Еременко Е.И., Цыганкова О.И. Генетическое разнообразие локуса vrrA у штаммов Bacillus anthracis, выделенных на территории стран СНГ. В кн.: Чрезвычайные ситуации международного значения в общественном здравоохранении в решениях Санкт-Петербургского саммита «Группы восьми» и санитарная охрана территорий государств-участников Содружества Независимых Государств. Оболенск; 2006. С. 125-6.Цыганкова Е.А., Еременко Е.И., Цыганкова О.И. Генетическое разнообразие локуса vrrA у штаммов Bacillus anthracis, выделенных на территории стран СНГ. В кн.: Чрезвычайные ситуации международного значения в общественном здравоохранении в решениях Санкт-Петербургского саммита «Группы восьми» и санитарная охрана территорий государств-участников Содружества Независимых Государств. Оболенск; 2006. С. 125-6.Andersen G.L., Simchock J.M., Wilson K.H. Identification of a region of genetic variability among Bacillus anthracis strains and related species. J. Bacteriol. 1996; 178(1):377-84.Andersen G.L., Simchock J.M., Wilson K.H. Identification of a region of genetic variability among Bacillus anthracis strains and related species. J. Bacteriol. 1996; 178(1):377-84.Jackson P.I., Walters E.A., Kalif A.S., Richmond K.L., Adair D.M., Hill K.K. et al. Сharacterization of the Variable-Namber Tandem Repeats in vrr A from different Bacillus anthracis isolates. Appl. Environ. Microbiol. 1997; 63(4):1400-5.Jackson P.I., Walters E.A., Kalif A.S., Richmond K.L., Adair D.M., Hill K.K. et al. Сharacterization of the Variable-Namber Tandem Repeats in vrr A from different Bacillus anthracis isolates. Appl. Environ. Microbiol. 1997; 63(4):1400-5.Keim P., Kalif A., Schupp J., Hill K., Travis S., Richmond K. et al. Molecular evolution and diversity in Bacillus anthracis as detected by amplified fragment length polymorphism markers. J. Bacteriol. 1997; 179(3):818-24.Keim P., Kalif A., Schupp J., Hill K., Travis S., Richmond K. et al. Molecular evolution and diversity in Bacillus anthracis as detected by amplified fragment length polymorphism markers. J. Bacteriol. 1997; 179(3):818-24.Keim P., Price L.B., Klevytska A.M., Smith K., Schupp J.M., Okinaka R. et al. Multiple-locus VNTR analysis (MLVA) reveals genetic relationships within Bacillus anthracis. J. Bacteriol. 2000; 182:2928-36.Keim P., Price L.B., Klevytska A.M., Smith K., Schupp J.M., Okinaka R. et al. Multiple-locus VNTR analysis (MLVA) reveals genetic relationships within Bacillus anthracis. J. Bacteriol. 2000; 182:2928-36.Jolley K.A. et al. Sequence type analysis and recombinational tests (START). Bioinformatics. 2001; 17:1230-1.Jolley K.A. et al. Sequence type analysis and recombinational tests (START). Bioinformatics. 2001; 17:1230-1.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.