microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2011-1(107)-46-48microbe-586Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯMICROBIOLOGYПЦР дифференциация подвидов Francisella tularensis с помощью одного праймераPCR Differentiation of Francisella tularensis Subspecies Using One PrimerВахрамееваГ. М.VakhrameevaG. M.info@obolensk.orgЛапинА. А.LapinA. A.noemail@neicon.ruПавловВ. М.PavlovV. M.noemail@neicon.ruМокриевичА. Н.MokrievichA. N.noemail@neicon.ruМироноваР. И.MironovaR. I.noemail@neicon.ruДятловИ. А.DyatlovI. A.noemail@neicon.ruГосударственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологииРоссияState Research Center for Applied Microbiology and BiotechnologyRussian Federation20112002201101(107)4648Copyright © Вахрамеева Г.М., Лапин А.А., Павлов В.М., Мокриевич А.Н., Миронова Р.И., Дятлов И.А., 20112011Вахрамеева Г.М., Лапин А.А., Павлов В.М., Мокриевич А.Н., Миронова Р.И., Дятлов И.А.Vakhrameeva G.M., Lapin A.A., Pavlov V.M., Mokrievich A.N., Mironova R.I., Dyatlov I.A.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/586

Представлены экспериментальные данные распределения по размерам ампликонов, полученных с помощью праймера, содержащего chi-последовательность Escherichia coli, и ДНК из штаммов различных подвидов Francisella tularensis. Анализ данного распределения позволил выявить пять информативных областей картины электрофореграмм (в районах 190, 280, 500-570, 830 и 950 п.о.), дающих возможность проводить подвидовую дифференциацию штаммов туляремийного микроба. Несмотря на незначительную генетическую гетерогенность штаммов F. tularensis, ПЦР-анализ с использованием только одного праймера Chi 1f позволяет определять подвидовую принадлежность клинических изолятов возбудителя туляремии удобным, безопасным и быстрым способом.

Presented are experimental data of size distribution of amplicons obtained with the help of the primer consisting of Escherichia coli chi-sequence and DNA from different subspecies of Francisella tularensis strains. Analysis of this distribution permitted to determine five informative regions on the electrophoregrams (in the regions of 190, 280, 500-570, 830 and 950 b.p.), that made it possible to perform subspecies differentiation of tularemia microbe strains. Thus, the subspecies of F. tularensis clinical isolates can be identified by safe, fast and convenient method - the PCR analysis using only one primer Chi 1f despite the slight genetic heterogeneity of tularemia agent strains.

F. tularensisподвидПЦРтипированиепраймерF. tularensissubspeciesPCRtypingprimerReferencesОлсуфьев Н.Г. Таксономия, микробиология и лабораторная диагностика возбудителя туляремии. М.: Медицина; 1975. 192 с.Olsuf’ev N.G. [Taxonomia, microbiology and laboratory diagnostics of tularemia agent]. Moscow: Medicina; 1975. 192 p.Хесин Р.Б. Непостоянство генома. М.: Наука; 1984. 472 с.Khesin N.B. [Genome variability]. Moscow: Nauka; 1984. 472 p.Johansson A., Farlow J. Larsson P., Dukerich M., Chambers E., Bystrom M., Fox J., Chu M., Forsman M., Sjöstedt A., Keim P. Worldwide genetic relationships among Francisella tularensis isolates determined by multiple-locus variable-number tandem repeat analysis. J. Bacteriol. 2004; 186:5808-18.Johansson A., Farlow J. Larsson P., Dukerich M., Chambers E., Bystrom M., Fox J., Chu M., Forsman M., Sjöstedt A., Keim P. Worldwide genetic relationships among Francisella tularensis isolates determined by multiple-locus variable-number tandem repeat analysis. J. Bacteriol. 2004; 186:5808-18.Johansson A., Ibrahim A., Goransson I., Eriksson U., Gurycova D., Claridge III J.E., Sjostedt A. Evaluation of PCR-based methods for discrimination of Franciseella species and subspecies and development of a specific PCR that distinguishes two major subspecies of Francisella tularensis. J. Clin. Microbiol. 2000; 38(11):4180-5.Johansson A., Ibrahim A., Goransson I., Eriksson U., Gurycova D., Claridge III J.E., Sjostedt A. Evaluation of PCR-based methods for discrimination of Franciseella species and subspecies and development of a specific PCR that distinguishes two major subspecies of Francisella tularensis. J. Clin. Microbiol. 2000; 38(11):4180-5.Kobayashi I., Murialdo H., Crasemann J.M., Stahl M.M., Stahl F.W. Orientation of cohesive end site cos determines the active orientation of χ sequence in stimulating recA-recBC-mediated recombination in phage λ lytic infections. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1982; 79:5981-5.Kobayashi I., Murialdo H., Crasemann J.M., Stahl M.M., Stahl F.W. Orientation of cohesive end site cos determines the active orientation of χ sequence in stimulating recA-recBC-mediated recombination in phage λ lytic infections. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1982; 79:5981-5.Nutter J.E. Antigens of Pasteurella tularensis: preparative procedures. Appl. Microbiol. 1971; 22:44-8.Nutter J.E. Antigens of Pasteurella tularensis: preparative procedures. Appl. Microbiol. 1971; 22:44-8.De la Puente-Redondo V.A., del Blanco N.G., Gutierrez-Martin C.B., Garcia-Pena F.J., Ferri E.F.R. Comparison of different Approaches for typing of Francisella tularensis strains. J. Clin. Microbiol. 2000; 38(3):1016-22.De la Puente-Redondo V.A., del Blanco N.G., Gutierrez-Martin C.B., Garcia-Pena F.J., Ferri E.F.R. Comparison of different Approaches for typing of Francisella tularensis strains. J. Clin. Microbiol. 2000; 38(3):1016-22.Sambrook J., Fritch E.F., Maniatis T. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. NY: Cold Spring Harbor Laboratory; 1989.Sambrook J., Fritch E.F., Maniatis T. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. NY: Cold Spring Harbor Laboratory; 1989.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.