microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2011-4(110)-53-56microbe-704Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯMICROBIOLOGYИдентификация возбудителя сибирской язвы, выделенного из почвы скотомогильникаIdentification of Bacillus anthracis Isolated from Soil of the Animal Burial SiteШишковаН. А.ShishkovaN. A.info@obolensk.orgКравченкоТ. Б.KravchenkoT. B.noemail@neicon.ruМарининЛ. И.MarininL. I.noemail@neicon.ruМокриевичА. Н.MokrievichA. N.noemail@neicon.ruГосударственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологииРоссияState Research Center of Applied Microbiology and BiotechnologyRussian Federation20112008201104(110)5356Copyright © Шишкова Н.А., Кравченко Т.Б., Маринин Л.И., Мокриевич А.Н., 20112011Шишкова Н.А., Кравченко Т.Б., Маринин Л.И., Мокриевич А.Н.Shishkova N.A., Kravchenko T.B., Marinin L.I., Mokrievich A.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/704

Использование современных генно-инженерных методов позволяет не только провести идентификацию сибиреязвенных штаммов, выделенных из почвы, но и осуществить сравнительные молекулярно-генетические исследования этих штаммов. Проведено лабораторное исследование 80 проб земли, взятых из старого скотомогильника, с использованием микробиологических и генетических методов. Эпидемическую значимость выделенных штаммов оценивали по результатам ПЦР с видоспецифическими праймерами и по данным многолокусного VNTR-анализа. Выделено шесть штаммов, три из которых отнесены к B. anthracis, а остальные − к близкородственным бациллам. Показана принципиальная возможность использования данной комплексной методики для типизации сибиреязвенных штаммов и их дифференциации от близкородственных микроорганизмов.

The usage of modern gene engineering methods makes it possible not only to identify anthrax strains isolated from soil, but also to hold out comparative molecular genetic assays with these strains. Carried out was the laboratory research of 80 soil samples isolated from the old animal burial site using microbiological and genetic techniques. Epidemiological significance of the isolated strains was evaluated on the basis of the results of PCR with species-specific primers and multi-locus VNTR-analysis data. Extracted were the six strains, three of which were classified as B. anthracis, and the rest - as closely related bacillus. Demonstrated was the possibility to use this particular complex method for anthrax strains typing and their differentiation from closely related microorganisms.

почваскотомогильникиB. anthracisVNTR-анализsoilanimal burial sitesB. anthracisVNTR-analysisReferencesЛабораторная диагностика и обнаружение возбудителя сибирской язвы. Методические указания. МУК 4.2.2413-08. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора; 2009. 67 с.[Laboratory diagnostics and detection of Bacillus anthracis. Methodological instructive regulations. MIR 4.2.2413-08]. M.: State Ros¬ potrebnadzor Centre of Hygiene and Epidemiology; 2009. 67 p.Обеззараживание исследуемого материала, инфицированного бактериями I-IV групп при работе методом ПЦР. Методические указания. МУ 3.5.5.-1034-01. М: МЗ РФ; 2001. 8 с.[Decontamination of the test material, infected by the bacteria of the I–IV groups, while using PCR-based methods. Methodological instruc- tive regulations. MIR 3.5.5-1034-01]. M.: Ministry of Health of the Russian Federation; 2001. 8 p.Маринин Л.И., Дятлов И.А., Мокриевич А.Н., Бахтеева И.В., Белова Е.В., Борзилов А.И. и др. Методы изучения биологических свойств возбудителя сибирской язвы. М.: ЗАО МП «Гигиена»; 2009. 304 с.Marinin L.I., Dyatlov I.A., Mokrievich A.N., Bakhteeva I.V., Belova E.V., Borzilov A.I. et al. [Methods for examination of Bacillus anthracis bio- logical properties]. M.: ZAO MP “Gigiena”; 2009. 304 p.Кутырев В.В., Смирнова Н.И. Генодиагностика и молекулярное типирование возбудителей чумы, холеры и сибирской язвы. Мол. генет., микробиол., вирусол. 2003; 1:6-14.Kutyrev V.V., Smirnova N.I. [Gene diagnostics and molecular typing of etiological agents of plague, cholera, and anthrax]. Mol. Gen. Microbiol. Virusol. 2003; 1:6–14.Цыганкова О.И., Еременко Е.И., Цыганкова Е.А. и др. Фенотипические и генетические особенности культурально-морфологических вариантов Bacillus anthracis Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 2008; 4:6-11.Tsygankova O.I., Eremenko E.I., Tsygankova E.A. et al. [Phenotypic and genetic peculiarities of the cultural and morphologic Bacillus anthracis variants]. Zh. Microbiol. Epidemiol. Immunobiol. 2008; 4:6–11.Helgaso E., Okstad O.A., Caugant D.A., Johansen H.A, Fouet A., Mock M. et al. Bacillus anthracis, Bacillus cereus, and Bacillus thuringiensis: one species on the basis of genetic evidence. Appl. Environ. Microbiol. 2000; 66:2627-30.Helgaso E., Okstad O.A., Caugant D.A., Johansen H.A, Fouet A., Mock M. et al. Bacillus anthracis, Bacillus cereus, and Bacillus thuringiensis: one species on the basis of genetic evidence. Appl. Environ. Microbiol. 2000; 66:2627-30.Keim P., Price L.B., Klevytska A.M., Smith K.L., Schupp J.M., Okinaka R. et al. Multiple-locus VNTR analysis (MLVA) reveals genetic relationships within Bacillus anthracis. J. Bacteriol. 2000; 182:2928-36.Keim P., Price L.B., Klevytska A.M., Smith K.L., Schupp J.M., Okinaka R. et al. Multiple-locus VNTR analysis (MLVA) reveals genetic relationships within Bacillus anthracis. J. Bacteriol. 2000; 182:2928-36.Patra G., Sylverste P., Ramisse V. et al. Specific oligonucleotide primers for rapid identification of Bacillus anthracis strains. Proc. Inter. Workshop on Anthrax. Winchester, England, September 19-21, 1996. P. 45-6.Patra G., Sylverste P., Ramisse V. et al. Specific oligonucleotide primers for rapid identification of Bacillus anthracis strains. Proc. Inter. Workshop on Anthrax. Winchester, England, September 19-21, 1996. P. 45-6.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.