microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2011-2(108)-36-41microbe-745Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯMICROBIOLOGYИдентификация и внутривидовое типирование штаммов чумного микроба с определением их потенциальной вирулентности методом ПЦРIdentification and Intraspecific Typing of Plague Microbe Strains with Their Potential Virulence Determination Using PCRГаеваА. В.GaevaA. V.microbe@san.ruБулгаковаЕ. Г.BoolgakovaE. G.noemail@neicon.ruСухоносовИ. Ю.SukhonosovI. Yu.noemail@neicon.ruАнисимоваЛ. В.AnisimovaL. V.noemail@neicon.ruНовичковаЛ. А.NovichkovaL. A.noemail@neicon.ruКутыревВ. В.KutyrevV. V.noemail@neicon.ruРоссийский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»РоссияRussian Research Anti-Plague Institute MicrobeRussian Federation20112004201102(108)3641Copyright © Гаева А.В., Булгакова Е.Г., Сухоносов И.Ю., Анисимова Л.В., Новичкова Л.А., Кутырев В.В., 20112011Гаева А.В., Булгакова Е.Г., Сухоносов И.Ю., Анисимова Л.В., Новичкова Л.А., Кутырев В.В.Gaeva A.V., Boolgakova E.G., Sukhonosov I.Y., Anisimova L.V., Novichkova L.A., Kutyrev V.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/745

Разработан способ идентификации и внутривидового типирования штаммов чумного микроба с определением их потенциальной вирулентности. Показана возможность внутривидовой дифференциации и определения очаговой принадлежности изученных штаммов чумного микроба в монолокусной VNTR-ПЦР и выявления основных детерминант вирулентности (области пигментации хромосомы и гены плазмиды кальцийзависимости) в мультиплексной ПЦР.

Developed is the method of identification and intraspecific typing of plague microbe strains along with their potential virulence determination. Intraspecific differentiation and focal attribution of the examined plague microbe strains can be determined by monolocus VNTR-PCR, and main virulence determinants (chromosomal pigmentation region and calcium-dependence plasmid genes) - by multiplex PCR.

возбудитель чумыгенетическое типированиеVNTR-анализвнутривидовые различиядетерминанты вирулентностиplague agentgenetic typingVNTR-analysisintraspecific differencesvirulence determinantsReferencesОнищенко Г.Г., Кутырев В.В., редакторы. Природные очаги чумы Кавказа, Прикаспия, Средней Азии и Сибири. М.; 2004. 192 с.Onishchenko G.G., Kutyrev V.V., editors. [Plague Natural Foci of Caucasus, Precaspian Region, Central Asia and Siberia]. M.: Meditsina; 2004. 192 p.Савостина Е.П., Попов Ю.А., Каштанова Т.Н., Яшечкин Ю.И. Анализ геномного полиморфизма типовых и атипичных штаммов возбудителя чумы с использованием полимеразной цепной реакции с универсальными праймерами. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2004; 1:22-6.Savostina E.P., Popov Yu.A., Kashtanova T.N., Yashechkin Yu.I. [Analysis of genomic polymorphism of typical and atypical strains of the plague pathogen using polymerase chain reaction with universal primers]. Mol. Gen. Mikrobiol. Virusol. 2004; 1:22–6.Klevytska A.M., Price L.B., Schupp J.M., Worsham P., Wong J., Keim P. Identification and characterization of Variable-Number Tandem Repeats in the Yersinia pestis genome. J. Clin. Microbiol. 2001; 39(9):3179-85.Klevytska A.M., Price L.B., Schupp J.M., Worsham P., Wong J., Keim P. Identification and characterization of Variable-Number Tandem Repeats in the Yersinia pestis genome. J. Clin. Microbiol. 2001; 39(9):3179-85.Li Y., Cui Y., Hauck Y., Platonov M., Dai E., Song Y., Guo Zh., Pourcel C., Dentovskaya S., Anisimov A., Yang R., Vergnaud G. Genotyping and phylogenetic analysis of Yersinia pestis by MLVA: insights into the worldwide expansion of Central Asia plague foci. PloS ONE. 2009; 4(6):e6000.Li Y., Cui Y., Hauck Y., Platonov M., Dai E., Song Y., Guo Zh., Pourcel C., Dentovskaya S., Anisimov A., Yang R., Vergnaud G. Genotyping and phylogenetic analysis of Yersinia pestis by MLVA: insights into the worldwide expansion of Central Asia plague foci. PloS ONE. 2009; 4(6):e6000.Lowell J.L., Wagner D.M., Atshabar B., Antolin M.F., Vogler A.J., Keim P., Chu M.C., Gage K.L. Identifying sources of human exposure to plague. J. Clin. Microbiol. 2005; 43:650-6.Lowell J.L., Wagner D.M., Atshabar B., Antolin M.F., Vogler A.J., Keim P., Chu M.C., Gage K.L. Identifying sources of human exposure to plague. J. Clin. Microbiol. 2005; 43:650-6.Portnoy D.A., Wolf-Watz H., Bolin I., Beeder A.B., Falkow S. Characterization of common virulence plasmids in Yersinia species and their role in expression of outer membrane proteins. Infect. Immun. 1984; 43:108-14.Portnoy D.A., Wolf-Watz H., Bolin I., Beeder A.B., Falkow S. Characterization of common virulence plasmids in Yersinia species and their role in expression of outer membrane proteins. Infect. Immun. 1984; 43:108-14.Pourcel C., Andre-Mazeaud F., Neubauer H., Ramisse F., Vergnaud G. Tandem repeats analysis for the high resolution phylogenetic analysis of Yersinia pestis. BMC Microbiol. 2004; 4:22.Pourcel C., Andre-Mazeaud F., Neubauer H., Ramisse F., Vergnaud G. Tandem repeats analysis for the high resolution phylogenetic analysis of Yersinia pestis. BMC Microbiol. 2004; 4:22.Zhou D., Tong Z., Song Y., Han Y., Pei D., Pang X., Zhai J., Li M., Cui B., Qi Z., Jin L., Dai R., Du Z., Wang J., Guo Z., Wang J., Huang P., Yang R. Genetics of metabolic variations between Yersinia pestis biovars and the proposal of a new biovar, microtus. J. Bacteriol. 2004; 186 (15):5147-52.Zhou D., Tong Z., Song Y., Han Y., Pei D., Pang X., Zhai J., Li M., Cui B., Qi Z., Jin L., Dai R., Du Z., Wang J., Guo Z., Wang J., Huang P., Yang R. Genetics of metabolic variations between Yersinia pestis biovars and the proposal of a new biovar, microtus. J. Bacteriol. 2004; 186 (15):5147-52.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.