microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2011-2(108)-61-63microbe-751Research ArticleДИАГНОСТИКАDIAGNOSTICSРазработка тест-системы для типирования штаммов V. cholerae с помощью VNTR-анализаDevelopment of VNTR-Based Test System for V. cholerae TypingКибиревЯ. А.KibirevYa. A.noemail@neicon.ruДармовИ. В.DarmovI. V.noemail@neicon.ruЛогиноваМ. А.LoginovaM. A.noemail@neicon.ruМаракулинИ. В.MarakulinI. V.noemail@neicon.ruЧухланцевД. А.ChukhlantsevD. A.noemail@neicon.ruДормидонтоваТ. И.DormidontovaT. I.noemail@neicon.ruКузнецовС. Л.KuznetsovS. L.noemail@neicon.ruКузнецовскийА. В.KuznetsovskiiA. V.noemail@neicon.ru48 Центральный научно-исследовательский институт Министерства обороны Российской ФедерацииРоссияRussian Federation Ministry of Defense 48 Central Research InstituteRussian Federation20112004201102(108)6163Copyright © Кибирев Я.А., Дармов И.В., Логинова М.А., Маракулин И.В., Чухланцев Д.А., Дормидонтова Т.И., Кузнецов С.Л., Кузнецовский А.В., 20112011Кибирев Я.А., Дармов И.В., Логинова М.А., Маракулин И.В., Чухланцев Д.А., Дормидонтова Т.И., Кузнецов С.Л., Кузнецовский А.В.Kibirev Y.A., Darmov I.V., Loginova M.A., Marakulin I.V., Chukhlantsev D.A., Dormidontova T.I., Kuznetsov S.L., Kuznetsovskii A.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/751

Для типирования штаммов V. cholerae, депонированных в музее микробных культур ФГУ «48 ЦНИИ Минобороны России», применен метод мультилокусного VNTR-анализа. Выбраны наиболее информативные локусы и фланкирующие их праймеры, составлены VNTR-профили и проведен анализ аллельного разнообразия исследованных штаммов, выпущены лабораторные серии тест-системы. Разработанная тест-система может быть использована для мониторинга эпидобстановки, при проведении эпидемиологических расследований, а также для паспортизации коллекционных штаммов.

Analysis of VNTRs was used for typing of V. cholerae strains deposited in microbial culture collection of 48 Central Research Institute. The most informative loci and flanking primers were chosen, VNTR profiles were compiled, and allele variability analysis of the strains was carried out. Laboratory series of test system were manufactured . The developed test system can be used for epidemiological monitoring and investigations, as well as for passportization of collection strains.

V. choleraeVNTR-анализтест-системаV. choleraeVNTRtest systemReferencesПокровский В.И., Онищенко Г.Г., редакторы. Актуальные проблемы холеры. М.: ГОУ ВУНМЦ МЗ РФ; 2000. 384 с.Pokrovskii V.I., Onishchenko G.G., editors. [Actual Issues of Cholera]. M.:Minzdrav RF; 2000. 384 p.Покровский В.И., редактор. Холера в СССР в период VII пандемии. М.: Медицина; 2000. 472 с.Pokrovskii V.I., editor. [Cholera in the USSR During VII Pandemic]. M.: Meditsina; 2000. 472 p.GPMS. Genomes, Polymorphism and Minisatellites with a focus on Molecular Epidemiology using Tandem Repeats [Internet]. Available from: http://minisatellites.u-psud.fr.The Microorganisms Tandem Repeats Database. Available from: http://minisatellites.u-psud.fr/ASPSamp/base_ms/bact.php.Kaper, J.B., Morris J.G., Levine M.M. Cholera. Clin. Microbiol. Rev. 1995; 8:48-86.Kaper, J.B., Morris J.G., Levine M.M. Cholera. Clin. Microbiol. Rev. 1995; 8:48-86.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.