microbeПроблемы особо опасных инфекцийProblems of Particularly Dangerous Infections0370-10692658-719XRussian Research Anti-Plague Institute “Microbe”10.21055/0370-1069-2013-4-51-55microbe-78Research ArticleМИКРОБИОЛОГИЯMICROBIOLOGYИзучение генетического разнообразия штаммов Yersinia pestis из Центрально-Кавказского высокогорного природного очага чумыStudies of Genetic Diversity of Yersinia pestis Strains Isolated in Central-Caucasian High-Mountain Natural Plague FocusЕвченкоЮ. М.EvchenkoYu. M.snipchi@mail.stv.ruЕфременкоД. В.EfremenkoD. V.snipchi@mail.stv.ruКузнецоваИ. В.KuznetsovaI. V.snipchi@mail.stv.ruМезенцевВ. М.MezentsevV. M.snipchi@mail.stv.ruБелявцеваЛ. И.BelyavtsevaL. I.snipchi@mail.stv.ruПлатоновМ. Е.PlatonovM. E.info@obolensk.orgЕвсееваВ. В.EvseevaV. V.info@obolensk.orgДентовскаяС. В.DentovskayaS. V.info@obolensk.orgАнисимовА. П.AnisimovA. P.info@obolensk.orgКуличенкоА. Н.KulichenkoA. N.snipchi@mail.stv.ruСтавропольский научно-исследовательский противочумный институтРоссияStavropol Research Anti-Plague InstituteRussian FederationГосударственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологииРоссияState Research Center for Applied Microbiology and BiotechnologyRussian Federation201320122013045155Copyright © Евченко Ю.М., Ефременко Д.В., Кузнецова И.В., Мезенцев В.М., Белявцева Л.И., Платонов М.Е., Евсеева В.В., Дентовская С.В., Анисимов А.П., Куличенко А.Н., 20132013Евченко Ю.М., Ефременко Д.В., Кузнецова И.В., Мезенцев В.М., Белявцева Л.И., Платонов М.Е., Евсеева В.В., Дентовская С.В., Анисимов А.П., Куличенко А.Н.Evchenko Y.M., Efremenko D.V., Kuznetsova I.V., Mezentsev V.M., Belyavtseva L.I., Platonov M.E., Evseeva V.V., Dentovskaya S.V., Anisimov A.P., Kulichenko A.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://journal.microbe.ru/jour/article/view/78

Изучены методом MLVA по 25 VNTR-локусам штаммы Yersinia pestis , изолированные в Центрально-Кавказском высокогорном природном очаге чумы с 1971 по 2012 год. Анализ приуроченности кластеров дендрограммы к определенным территориям, объектам и срокам изоляции штаммов проводили с использованием программы Arc GIS 10.1. Установлена взаимосвязь MLVA25-типов Y. pestis с участками и временем выделения штаммов в Центрально-Кавказском высокогорном природном очаге чумы, потребностью в пролине. Кластеры, группы и подгруппы штаммов приурочены к определенным территориям: группы – к ландшафтно-эпизоотологическим районам, подгруппы – к поселениям горных сусликов. Периодически группы штаммов распространяются в другие ландшафтно-эпизоотологические районы очага. Генетические варианты штаммов возбудителя чумы в пределах поселений горных сусликов меняются с течением времени, что является косвенным свидетельством действия механизма микроэволюции.

Studied have been Yersinia pestis strains isolated in Central-Caucasian high-mountain natural plague focus within the period of 1971–2012 using MLVA typing on 25 VNTR-loci. Analysis of dendrogram cluster association with certain areas, objects, and periods of the strain isolation has been carried out by means of Arc GIS 10.1 software. Established has been the connection between 25 MLVA Y. pestis types and spatial and temporal characteristics of strains isolation in the Central-Caucasian high-mountain natural plague focus, and proline requirement too. Clusters, groups and subgroups of the strains are confined to particular territories as it follows: groups are attributed to landscape-epizootiological regions, subgroups – to mountain souslik settlements. Occasionally groups of the strains disseminate onto the other landscape-epizootiological regions of the focus. Genetic variations of plague agent strains within the limits of mountain souslik settlements evolve over time which can be viewed as indirect evidence of microevolution mechanism effect.

Центрально-Кавказский природный очаг чумыYersinia pestisгенотипированиегенетические вариантыCentral-Caucasian high-mountain natural plague focusgenotypinggenetic variationsReferencesЕвченко Ю.М. Сезонность эпизоотий на разных участках Центрально-Кавказского высокогорного природного очага чумы. Вестник Российской военно-медицинской академии. 2008; 2(Ч. II):615–6.Evchenko Yu.M. [Seasonal fluctuations of epizooties in different territories of Central-Caucasian high-mountain natural plague focus]. Vestnik Ros. Voenno-Med. Akad. 2008; 2(Pt. II):615–6.Ермаков О.А., Титов С.В., Савинецкий А.Б., Сурин В.Л., Зборовский C.С., Ляпунова Е.А., Брандлер О.В., Формозов Н.А. Молекулярно-генетические и палеоэкологические аргументы в пользу конспецифичности малого (Spermophilus pygmaeus) и горного (S. musicus) сусликов. Зоол. журн. 2006; 85 (12):1474–10.Ermakov O.A., Titov S.V, Savinetsky A.B., Surin V.L., Zborovsky S.S., Lyapunova E.A., Brandler O.V., Formozov N.A. [Molecular-genetic and paleo-economical provisions for con-specificity of little (Spermophilus pygmaeus) and mountain souslik]. Zool. Zh. 2006; 85(12):1474–10.Кузнецова И.В., Ефременко Д.В. Генотипирование штаммов Yersinia pestis, изолированных из Восточно-Кавказского высокогорного природного очага чумы в 2010 г. Медицинский вестник Северного Кавказа. 2013; 8(1):98–99.Kuznetsova I.V., Efremenko D.V. [Genotyping of Yersinia pestis strains isolated in East-Caucasian high-mountain natural plague focus in 2010]. Med. Vestnik Sever. Kavkaza. 2013; 8(1):98–99.Куличенко А.Н., Евченко Ю.М., Мозлоев Г.А., Григорьев М.П., Ляпустина Л.В., Чурикова Н.В. Эпизоотическая активность Центрально-Кавказского высокогорного природного очага чумы. Пробл. особо опасных инф. 2011; 4(110):23–5.Kulichenko A.N., Evchenko Yu.M., Mozloev G.A., Grigor’ev M.P., Lyapustina L.V., Churikova N.V. [Epizootic activity of the Central Caucasian high-mountain natural plague focus]. Probl. Osobo Opasn. Infek. 2011; 4(110):23–5.Онищенко Г.Г., Кутырев В.В., редакторы. Природные очаги чумы Кавказа, Прикаспия, Средней Азии и Сибири. М.: ОАО Изд-во Медицина; 2004. 192 с.Onishchenko G.G., Kutyrev V.V., editors [Natural Plague Foci in the Territory of the Caucasus, Pre-Caspian Region, Central Asia and Siberia]. M.: OAO “Meditsina”, 2004. 192 p.Сидоренко Е.В. Методы математической обработки в психологии. СПб: Речь; 2007. 220 с.Sidorenko E.V. [Mathematical Processing in Psychology]. St. Petersburg: Rech’; 2007. 220 p.Li Y., Cui Y., Hauck Y., Platonov M.E., Dai E., Song Y., Guo Z., Pourcel C., Dentovskaya S.V., Anisimov A.P., Yang R., Vergnaud G. Genotyping and phylogenetic analysis of Yersinia pestis by MLVA: insights into the worldwide expansion of Central Asia plague foci. PLoS One. 2009; 4(6):6000.Li Y., Cui Y., Hauck Y., Platonov M.E., Dai E., Song Y., Guo Z., Pourcel C., Dentovskaya S.V., Anisimov A.P., Yang R., Vergnaud G. Genotyping and phylogenetic analysis of Yersinia pestis by MLVA: insights into the worldwide expansion of Central Asia plague foci. PLoS One. 2009; 4(6):6000.Platonov M.E., Evseeva V.V., Svetoch T.E., Efremenko D.V., Kuznetsova I.V., Dentovskaya S.V., Kulichenko A.N., Anisimov A.P. Phylogeography of Yersinia pestis Vole Strains Isolated from Natural Foci of the Caucasus and South Caucasus. Mol. Genet. Microbiol. Virol. 2012; 27(3):108–4.Platonov M.E., Evseeva V.V., Svetoch T.E., Efremenko D.V., Kuznetsova I.V., Dentovskaya S.V., Kulichenko A.N., Anisimov A.P. Phylogeography of Yersinia pestis Vole Strains Isolated from Natural Foci of the Caucasus and South Caucasus. Mol. Genet. Microbiol. Virol. 2012; 27(3):108–4.Riehm J.M., Vergnaud G., Kiefer D., Damdindorj T., Dashdavaa O., Khurelsukh T., Zöller L., Wölfel R., Le Flèche P., Scholz H.C. Yersinia pestis lineages in Mongolia. PLoS One. 2012; 7(2):30624.Riehm J.M., Vergnaud G., Kiefer D., Damdindorj T., Dashdavaa O., Khurelsukh T., Zöller L., Wölfel R., Le Flèche P., Scholz H.C. Yersinia pestis lineages in Mongolia. PLoS One. 2012; 7(2):30624.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.