<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">microbe</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Проблемы особо опасных инфекций</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Problems of Particularly Dangerous Infections</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">0370-1069</issn><issn pub-type="epub">2658-719X</issn><publisher><publisher-name>Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe”</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.21055/0370-1069-2013-4-56-59</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">microbe-79</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>МИКРОБИОЛОГИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>MICROBIOLOGY</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Холерные вибрионы О1 серогруппы, выделенные из водных объектов Ростова-на-Дону в ходе мониторинга в 2008–2012</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>O1 Serogroup Cholera Vibrios Isolated from the Rostov-on-Don Water Bodies in the Course of Surveillance in 2008–2012</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Ежова</surname><given-names>М. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Ezhova</surname><given-names>M. I.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Кругликов</surname><given-names>В. Д.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kruglikov</surname><given-names>V. D.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Водопьянов</surname><given-names>А. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Vodop’Yanov</surname><given-names>A. S.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Водопьянов</surname><given-names>С. О.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Vodop’Yanov</surname><given-names>S. O.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Шестиалтынова</surname><given-names>И. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shestialtynova</surname><given-names>I. S.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Олейников</surname><given-names>И. П.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Oleynikov</surname><given-names>I. P.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Непомнящая</surname><given-names>Н. Б.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Nepomnyashchaya</surname><given-names>N. B.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Подойницына</surname><given-names>О. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Podoynitsyna</surname><given-names>O. A.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">plague@aaanet.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Rostov-on-Don Research Anti-Plague Institute</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2013</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>20</day><month>12</month><year>2013</year></pub-date><volume>0</volume><issue>4</issue><fpage>56</fpage><lpage>59</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Ежова М.И., Кругликов В.Д., Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Шестиалтынова И.С., Олейников И.П., Непомнящая Н.Б., Подойницына О.А., 2013</copyright-statement><copyright-year>2013</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Ежова М.И., Кругликов В.Д., Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Шестиалтынова И.С., Олейников И.П., Непомнящая Н.Б., Подойницына О.А.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Ezhova M.I., Kruglikov V.D., Vodop’Yanov A.S., Vodop’Yanov S.O., Shestialtynova I.S., Oleynikov I.P., Nepomnyashchaya N.B., Podoynitsyna O.A.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://journal.microbe.ru/jour/article/view/79">https://journal.microbe.ru/jour/article/view/79</self-uri><abstract><p>Выявлены особенности биологических свойств и происхождения штаммов холерных вибрионов О1 серогруппы, выделенных в процессе мониторинга из водных объектов Ростова-на-Дону с 2008 по 2012 год. Из 767 проб воды выделен и изучен 41 атоксигенный штамм V. cholerae O1. Показана стойкая тенденция увеличения количества выделяемых из водных объектов атоксигенных штаммов V. cholerae O1. При ПЦР-генотипировании с использованием специфических праймеров для детекции 45 нуклеотидных последовательностей, связанных с патогенностью V. cholerae у исследуемых штаммов выявлены гены дополнительных факторов патогенности. При VNTR-типировании с использованием авторских локусспецифических праймеров штаммы были распределены по 19 VNTR-генотипам, объединенным в 6 кластеров. Выявлены штаммы с одинаковыми генотипами из разных точек как в течение года, так и на протяжении нескольких лет. Штаммы, по всей видимости, имели завозной характер и обладали способностью к переживанию в водных объектах окружающей среды в течение определенного времени.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Identified are the peculiarities of biological properties and origin of cholera vibrio O1 serogroup strains isolated from the Rostov-on-Don water bodies in the course of surveillance in 2008–2012. 41 atoxigenic V. cholerae O1 strains have been isolated from 767 water samples and investigated. Stable tendency of isolation of increased numbers of atoxigenic V. cholerae O1 strains over time has been demonstrated. In addition, in the strains under study detected have been the genes of additional pathogenicity factors, by PCR genotyping using specific primers for 45 nucleotide sequences associated with V. cholerae pathogenicity. The strains have also been classified according to 19 VNTR-genotypes grouped into 6 clusters based on VNTR-typing using exclusive copyright locus-specific primers. Discovered have been the strains with similar genotypes though isolated at different points both throughout the year and over the period of several years. These ones have probably been imported. They are characterized by a capacity to persist in ambient water bodies for a certain period of time.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>холерные вибрионы</kwd><kwd>мониторинг</kwd><kwd>VNTR-типирование</kwd><kwd>генотип</kwd><kwd>ПЦР</kwd><kwd>дополнительные факторы патогенности</kwd><kwd>cholera vibrios</kwd><kwd>monitoring</kwd><kwd>VNTR-typing</kwd><kwd>genotype</kwd><kwd>PCR</kwd><kwd>additional pathogenicity factors</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Водопьянов, А.С., Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б., Сучков И.Ю., Мишанькин Б.Н. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio cholerae. Биотехнология. 2001; 6:85–8.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Vodop’yanov A.S., Vodop’yanov S.O., Mishan’kin M.B., Suchkov I.Yu., Mishan’kin B.N. [Variable tandem repeats elicited in the course of computerized analysis of Vibrio cholerae genome]. Biotekhnologiya. 2001; 6:85–8.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ежова М.И., Кругликов В.Д., Водопьянов С.О., Монахова Е.В., Непомнящая Н.Б., Шалу О.А., Олейников И.П. Свидетельство о государственной регистрации 2012620979 базы данных «Штаммы Vibrio cholerae», RU. Зарегистрировано в Реестре баз данных 21 сентября 2012 г.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ezhova M.I., Kruglikov V.D., Vodop’yanov S.O., Monakhova E.V., Nepomnyashchaya N.B., Shalu O.A., Oleynikov I.P. [Certificate of the State Registration of data base “Vibrio cholerae strains”, 2012620979, RU].</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Лабораторная диагностика холеры. МУК 4.2.2218-07. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора; 2007.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">[Laboratory diagnostics of cholera: Methodological Recommendations]. MR 4.2.2218-07. M.: Rospotrebnadzor Federal Center for Hygiene and Epidemiology; 2007. 87 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ломов Ю.М., Телесманич Н.Р., Кругликов В.Д., Авдеева Е.П., Ежова М.И., Шестиалтынова И.С., Шалу О.А., Непомнящая Н.Б., Архангельская И.В. Мониторинг вибриофлоры водных объектов окружающей среды в системе эпиднадзора за холерой. Эпидемиол. и инф. бол. 2010; 5:24–8.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Lomov Yu.M., Telesmanich N.R., Kruglikov V.D., Avdeeva E.P., Ezhova M.I., Shestialtynova I.S., Shalu O.A., Nepomnyashchaya N.B., Arkhangel’skaya I.V. [Monitoring over the ambient water bodies within the frames of epidemiological surveillance program as regards cholera]. Epidemiol. Infek. Bol. 2010; 5:24–8.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ломов Ю.М., Телесманич Н.Р., Кругликов В.Д., Авдеева Е.П., Ежова М.И., Шалу О.А., Агафонова В.В., Мазрухо А.Б., Архангельская И.В. Фенотипическая и молекулярно-биологическая характеристика штаммов холерных вибрионов эль-тор, выделенных из водных объектов окружающей среды Ростова-на-Дону в 2003–2008 гг. Эпидемиол. и инф. бол. 2011; 1:24–8.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Lomov Yu.M., Telesmanich N.R., Kruglikov V.D., Avdeeva E.P., Ezhova M.I., Shalu O.A., Agafonova V.V., Mazrukho A.B., Arkhangel’skaya I.V. [Phenotypic and molecular-biological characteristics of Vibrio cholerae El Tor strains isolated from ambient Rostov-on-Don water bodies in 2003–2008]. Epidemiol. Infek. Bol. 2011; 1:24–8.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю.М., Водопьянов С.О., Сучков И.Ю., Гончаров Е.К., Дуванова О.В., Шишияну М.В. Вариабельные тандемные нуклеотидные повторы (VNTR-анализ) у V. cholerae O139, выделенных от людей и из воды поверхностных водоемов России. Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 2004; 1:29–34.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mishan’kin M.B., Vodop’yanov A.S., Lomov Yu.M., Vodop’yanov S.O., Suchkov I.Yu., Goncharov E.K., Duvanova O.V., Shishiyanu M.V. [Variable nucleotide tandem repeats (VNTR-assay) in V. cholerae O139 isolated from humans and surface waters in the territory of Russia] Zh. Mikrobiol. Epidemiol. Immunobiol. 2004; 1:29–34.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Монахова Е.В., Смоликова Л.М., Божко Н.В. ПЦР-детекция генов системы секреции III типа (TTSS) и других факторов патогенности/персистенции у холерных вибрионов разных серогрупп. Эпидемиол. и инф. бол. 2010; 6:20–5.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Monakhova E.V., Smolikova L.M., Bozhko N.V. [PCR detection of TTSS genes (Third Type Secretion System) and other pathogenicity/persistence factors in cholera vibrios of various serogroups]. Epidemiol. Infek. Bol. 2010; 6:20–5.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Москвитина Э.А., Мазрухо А.Б., Адаменко О.Л., Кругликов В.Д. Холера в начале ХХ в. Прогноз на глобальном уровне. Пробл. особо опасных. инф. 2012; 1(111):62–5.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Monakhova E.V., Fedorenko G.M., Mazrukho A.B., Pisanov R.V., Kruglikov V.D., Markina O.V., Alekseeva L.P. [Study of biological effect of CHO-cell elongating factor of Vibrio cholerae on models in vitro and in vivo]. Probl. Osobo Opasn. Infek. 2012; 1(111): 62–65.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Порядок организации и проведения лабораторной диагностики холеры для лабораторий территориального, регионального и федерального уровней. Методические указания. МУК 4.2.2870-11. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора; 2011.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">[Operational practices and organizational procedures for the laboratory diagnostics of cholera in specialized facilities on the local, regional and national scale: Methodological recommendations]. MR 4.2.2870-11. M.: Rospotrebnadzor Federal Center for Hygiene and Epidemiology; 2011. 76 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">McCardell B.A., Kothary M.H., Hall R.N., Sathyamoorthy V. Identification of a CHO-elongating factor produced by Vibrio cholerae O1. Microb. Pathogen. 2000; 29(1):1–8.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">McCardell B.A., Kothary M.H., Hall R.N., Sathyamoorthy V. Identification of a CHO-elongating factor produced by Vibrio cholerae O1. Microb. Pathogen. 2000; 29(1):1–8.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Sheahan K.-L., Cordero C.L., Satchell K.J. Identification of a domain within the multifunctional Vibrio cholerae RTX toxin that covalently cross-links actin. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2004; 101(26):9798–803.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sheahan K.-L., Cordero C.L., Satchell K.J. Identification of a domain within the multifunctional Vibrio cholerae RTX toxin that covalently cross-links actin. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2004; 101(26):9798–803.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Wu Z., Nybon A., Magnusson K.E. Distinct effects of Vibrio cholerae hemagglutinin/protease on the structure and localization of the tight junction-associated proteins occludin and ZO-1. Cell Microbiol. 2000; 2:11–7.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Wu Z., Nybon A., Magnusson K.E. Distinct effects of Vibrio cholerae hemagglutinin/protease on the structure and localization of the tight junction-associated proteins occludin and ZO-1. Cell Microbiol. 2000; 2:11–7.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
