Preview

Проблемы особо опасных инфекций

Расширенный поиск

Факторы вирулентности и филогенетическая характеристика уропатогенных штаммов Eschericihia coli, выделенных на территории г. Саратова

https://doi.org/10.21055/0370-1069-2019-4-56-60

Полный текст:

Аннотация

Цель. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов уропатогенных Escherichia coli, выделенных из мочи пациентов с инфекциями мочевыводящих путей на территории Саратова, с целью определения принадлежности к филогенетическим группам и подгруппам и выявления генетических маркеров, ассоциированных с вирулентностью. Материалы и методы. Исследовано 102 штамма уропатогенных E. coli, выделенных из мочи пациентов с инфекциями мочевыводящих путей. методом пцр определяли частоту встречаемости генов (fimH, pap, sfa, afa, iha, irp2, iuc, iroN, hlyA, vat, usp, set-1, kpsMT, iss, cva, ompT), ассоциированных с факторами адгезии, утилизации железа, токсигенности, устойчивости к действию сыворотки (комплемента) и персистенции, а также принадлежность к конкретным филогенетическим группам и подгруппам (путем амплификации генов chuA, yjaA и TspE4.C2). Результаты и обсуждение. Установлено, что исследованные штаммы E. coli принадлежали к различным филогенетическим группам и подгруппам (A1, B1, B23, D1 и D2) и различались набором генов, кодирующих основные факторы вирулентности. при этом частота выявления уропатогенных E. coli, относящихся к подгруппе B23, оказалась превалирующей. Более того, штаммы данной филогенетической подгруппы отличались наибольшим набором генов, кодирующих факторы вирулентности возбудителя. у всех изученных штаммов уропатогенных E. coli, принадлежащих к различным филогенетическим группам и подгруппам, выявлено наличие генов, ответственных за синтез сидерофоров (irp2, iuc, iroN), устойчивости и персистенции (ompT) и факторов адгезии (fimH, iha). Таким образом, штаммы уропатогенных E. coli, выделенные от пациентов с инфекциями мочевыводящих путей в Саратове, принадлежат к различным филогенетическим группам и подгруппам и обладают различным набором генетических маркеров вирулентности, что может оказывать влияние на степень патогенности возбудителя и отражаться на тяжести течения и длительности заболевания.

Об авторах

А. В. Казанцев
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»; Саратовский государственный медицинский университет им. В.И. Разумовского Министерства здравоохранения
Россия

Казанцев Андрей Васильевич.

410005, Саратов, ул. Университетская, 46; 410012, Саратов, ул. Большая Казачья, 112.



Н. А. Осина
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46.


Т. О. Глинская
Саратовская городская клиническая больница № 8
Россия

Саратов.



О. Н. Кошелева
Саратовская городская клиническая больница № 8
Россия

Саратов.



Ю. В. Максимов
Саратовская городская клиническая больница № 8
Россия

Саратов.



З. Л. Девдариани
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46.


А. Н. Микеров
Саратовский государственный медицинский университет им. В.И. Разумовского
Россия

410012, Саратов, ул. Большая Казачья, 112. 



Список литературы

1. Shah C., Baral R., Bartaula B., Shrestha L.B. Virulence factors of uropathogenic Escherichia coli (UPEC) and correlation with antimicrobial resistance. BMC Microbiol. 2019; 19(1):204. DOI: 10.1186/s12866-019-1587-3.

2. Sheikh A.F., Goodarzi H., Yadyad M.J., Aslani S., Amin M., Jomehzadeh N., Ranjbar R., Moradzadeh M., Azarpira S., Akhond M.R., Hashemzadeh M. Virulence-associated genes and drug susceptibility patterns of uropathogenic Escherichia coli isolated from patients with urinary tract infection. Infect. Drug Resist. 2019; 12:2039-47. DOI: 10.2147/IDR.S199764.

3. Kudinha T. The pathogenesis of Escherichia coli urinary tract infection. In: Samie A., editor. Escherichia coli - recent advances on physiology, pathogenesis and biotechnological applications. 1st ed. Croatia: IntechOpen; 2017. P. 45-70. DOl: 10.5772/intechopen.69030.

4. Staji H., Rassouli M., Jourablou S. Comparative virulotyping and phylogenomics of Escherichia coli isolates from urine samples of men and women suffering urinary tract infections. Iran. J. Basic Med. Sci. 2019; 22(2):211-4. DOI: 10.22038/ijbms.2018.28360.6880.

5. Clermont O., Bonacorsi S., Bingen E. Rapid and simple determination of the Escherichia coli phylogenetic group. Appl. Environ. Microbiol. 2000; 66(10):4555-8. DOI: 10.1128/aem.66.10.4555-4558.2000.

6. Escobar-Paramo P., Grenet K., Le Menac'h A., Rode L., Salgado E., Amorin C., Gouriou S., Picard B., Rahimy M.C., Andremont A., Denamur E., Ruimy R. Large-scale population structure of human commensal Escherichia coli isolates. Appl. Environ. Microbiol. 2004; 70(9):5698-700. DOI: 10.1128/AEM.70.9.5698-5700.2004.

7. Tapader R., Basu S., Pal A. Secreted proteases: A new insight in the pathogenesis of extraintestinal pathogenic Escherichia coli. Int. J. Med. Microbiol. 2019; 309(3-4):159-168. DOI: 10.1016/j.ijmm.2019.03.002.

8. Yun K.W., Kim D.S., Kim W., Lim I.S. Molecular typing of uropathogenic Escherichia coli isolated from Korean children with urinary tract infection. Korean J. Pediatr. 2015; 58(1):20-27. DOI: 10.3345/kjp.2015.58.1.20.

9. Momtaz H., Karimian A., Madani M., Safarpoor Dehkordi F., Ranjbar R., Sarshar M., Souod N. Uropathogenic Escherichia coli in Iran: serogroup distributions, virulence factors and antimicrobial resistance properties. Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob. 2013; 12:8. DOI: 10.1186/1476-0711-12-8.

10. Khairy R.M., Mohamed E.S., Abdel Ghany H.M., Abdelrahim S.S. Phylogenic classification and virulence genes profiles of uropathogenic E. coli and diarrhegenic E. coli strains isolated from community acquired infections. PLoS One. 2019; 14(9):e0222441. DOI: 10.1371/journal.pone.0222441.

11. Ali I., Rafaque Z., Ahmed I., Tariq F., Graham S.E., Salzman E., Foxman B., Dasti J.I. Phylogeny, sequence-typing and virulence profile of uropathogenic Escherichia coli (UPEC) strains from Pakistan. BMC Infect Dis. 2019; 19(1):620. DOI: 10.1186/s12879-019-4258-y.

12. Asadi Karam M.R., Habibi M., Bouzari S. Urinary tract infection: Pathogenicity, antibiotic resistance and development of effective vaccines against uropathogenic Escherichia coli. Mol. Immunol. 2019; 108:56-67. DOI: 10.f016/j.molimm.2019.02.007.

13. Luthje P., Brauner A. Virulence factors of uropathogenic E. coli and their interaction with the host. Adv. Microb. Physiol. 2014; 65:337-72. DOI: 10.1016/bs.ampbs.2014.08.006.

14. Subashchandrabose S., Mobley H.L.T. Virulence and fit-ness determinants of uropathogenic Escherichia coli. Microbiol. Spectr. 2015; 3(4):10.1128/microbiolspec.UTI-0015-2012. DOI: f0.1128/microbiolspec.UTI-0015-2012.

15. Sarowska J., Futoma-Koloch B., Jama-Kmiecik A., Frej-Madrzak M., Ksiazczyk M., Bugla-Ploskonska G., Choroszy-Krol I. Virulence factors, prevalence and potential transmission of extraint-estinal pathogenic Escherichia coli isolated from different sources: recent reports. Gut Pathog. 2019; 11:10. DOI: 10.1186/s13099-019-0290-0.


Для цитирования:


Казанцев А.В., Осина Н.А., Глинская Т.О., Кошелева О.Н., Максимов Ю.В., Девдариани З.Л., Микеров А.Н. Факторы вирулентности и филогенетическая характеристика уропатогенных штаммов Eschericihia coli, выделенных на территории г. Саратова. Проблемы особо опасных инфекций. 2019;(4):56-60. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2019-4-56-60

For citation:


Kazantsev A.V., Osina N.A., Glinskaya T.O., Kosheleva O.N., Maksimov Yu.V., Devdariani Z.L., Mikerov A.N. Virulence Factors and Phylogenetic Characteristics of Uropathogenic Eschericihia coli Strains Isolated in Saratov. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2019;(4):56-60. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2019-4-56-60

Просмотров: 195


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)