
«Проблемы особо опасных инфекций» – рецензируемый научно-практический журнал издается с 1968 г. Учредитель журнала – Федеральное казенное учреждение науки «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб».
Периодичность – 4 выпуска в год. Формат – А4, объем – 100–110 полос.
Журнал зарегистрирован Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций. Свидетельство о регистрации ПИ №ФС77-74153.
Журнал «Проблемы особо опасных инфекций» с 2001 г. входит в Перечень ведущих рецензируемых научных журналов и изданий Высшей аттестационной комиссии, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук. В настоящее время журнал «Проблемы особо опасных инфекций» входит в Перечень ВАК по трем научным специальностям: 1.5.11. – Микробиология (медицинские и биологические науки), 3.2.2 – Эпидемиология (медицинские и биологические науки), 3.2.6. – Безопасность в чрезвычайных ситуациях (медицинские науки).
В журнале публикуются статьи ведущих ученых противочумных и профильных научных учреждений России и стран СНГ, а также специалистов практического здравоохранения по вопросам эпидемиологии, микробиологии, генетики, биотехнологии, иммунологии, лабораторной диагностики и профилактики особо опасных и природно-очаговых инфекций, а также по проблемам санитарной охраны, биологической безопасности и биотерроризма. Одной из задач журнала является предоставление возможности публикации результатов диссертационных исследований. Журнал имеет следующие разделы: обзоры, оригинальные статьи, краткие сообщения, информация.
Все без исключения материалы, поступающие в редакцию журнала, проходят рецензирование. В состав редакционного совета входят ведущие специалисты России и зарубежных стран. Статьи публикуются на русском языке, резюме и сведения об авторах переводятся на английский, список литературы транслитерируется.
Журнал включен в Реферативный журнал и Базы данных ВИНИТИ, индексируется в Российском Индексе Научного Цитирования (РИНЦ) и размещен в Научной электронной библиотеке. Двухлетний импакт-фактор РИНЦ в 2020 г. – 1,054. Пятилетний импакт-фактор РИНЦ – 0,777.
С 24 апреля 2019 г. журнал вошел в Scopus.
Сведения о журнале ежегодно публикуются в международной справочной системе по периодическим и продолжающимся изданиям «Ulrich’s Directory».
Подписной индекс в объединенном каталоге подписных изданий «Пресса России» (раздел «Здоровье. Медицина») – 29448. Все номера журналов также можно заказать через редакцию. E-mail: jour@microbe.ru, тел. (845-2)51-82-22.
Текущий выпуск
ОБЗОРЫ 
В обзоре представлен анализ эпидемиологической и эпизоотологической ситуации по Крымской геморрагической лихорадке (КГЛ) в Российской Федерации в 2022 г. Зарегистрированный в 2022 г. уровень заболеваемости КГЛ (59 случаев) в 1,2 раза выше по сравнению с 2021 г., однако ниже среднемноголетних значений. Уровень летальности составил 10,2 %, что превышает показатели многолетних наблюдений (в 2012–2021 гг. – 3,2 %). В результате эпизоотологического обследования стационарных пунктов наблюдения установлено, что численность имаго Hyalomma marginatum в 2022 г. в целом соответствовала среднемноголетним показателям. Изоляты вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки (ККГЛ), циркулировавшие в Российской Федерации в 2017– 2022 гг., принадлежали к генетическим линиям «Европа-1» (V), «Европа-2» (VI) и «Европа-3» (VII). Соотношение геновариантов вируса ККГЛ в популяции на территории России в 2017–2022 г. не изменялось. На основе анализа показателей природно-климатических факторов составлен прогноз по заболеваемости КГЛ в Российской Федерации на 2023 г.
В обзоре собрана информация по палеогеномным исследованиям возбудителя чумы Yersinia pestis, охватывающим доисторическую эпоху, периоды первой и второй пандемий чумы, эпидемий и вспышек чумы конца XIX – XX в. Обобщены данные по реконструкции древних геномов Y. pestis периода позднего неолита, бронзового и железного веков, эпидемии «Юстинианова чума» первой пандемии чумы, эпидемии «Черная смерть» и последующих эпидемий второй пандемии чумы XIV–XVIII вв., а также по реконструкции путей распространения волн чумы в Евразии и направлений эволюции возбудителя чумы с формированием трансмиссивного пути передачи инфекции с помощью артропод. Приводятся результаты собственных исследований геномов Y. pestis из ключевых мест формирования этиологических агентов первой и второй пандемий чумы в горах Тянь-Шаня, исторических вспышек в Северном и Северо-Западном Прикаспии и других регионах России и сопредельных государств в конце XIX – XX в. Обсуждаются перспективные для проведения отечественных палеогеномных исследований чумы области Кавказа, Крыма, Северного Прикаспия, Сибири, Тянь-Шаня на территории России и сопредельных государств.
В обзоре освещены пути секреции основного фактора вирулентности холерного вибриона – холерного токсина – как через двухступенчатую Sec-зависимую систему секреции 2-го типа, так и с помощью везикул наружной мембраны Vibrio cholerae. Обсуждаются пути транспорта токсина в организм хозяина в зависимости от его формы. Хорошо изученный свободный холерный токсин секретируется внеклеточно и передается GM1-зависимым путем через богатые холестерином липидные рафты. Передача холерного токсина, связанного с везикулами, имеет преимущества по сравнению со свободным, так как вещества, находящиеся внутри везикул наружной мембраны, защищены от внешних протеаз и антител хозяина мембраной, формирующей везикулу. Везикулярный транспорт холерного токсина в клетку-мишень происходит по клатрин-зависимому и кавеолин-зависимому путям, а также посредством зависимого от липидных рафтов эндоцитоза, при этом конкретный путь определяется строением везикул. Клатрин-зависимый эндоцитоз описан для штаммов V. cholerae, культивируемых при низкой осмомолярности среды, везикулы наружной мембраны которых содержали внутри субъединицу А холерного токсина. Эндоцитоз, зависимый от липидных рафтов, характерен для везикул, у которых холерный токсин расположен на поверхности. Кроме того, описан эндоцитоз везикул наружной мембраны V. cholerae с помощью структур, известных как кавеолы.
Цель обзора – охарактеризовать эпидемиологическую ситуацию по клещевым риккетсиозам (КР) в Российской Федерации в 2022 г. в сравнении с «ковидными» 2020–2021 гг. и допандемическим периодом 2013–2019 гг., дать прогноз на 2023 г. На протяжении 2013–2022 гг. в динамике заболеваемости риккетсиозами группы клещевой пятнистой лихорадки (за исключением астраханской пятнистой лихорадки – АПЛ) отмечена закономерность, характерная и для большинства других природно-очаговых инфекций (ПОИ): резкое снижение показателей регистрируемой заболеваемости в 2020–2021 гг. с последующим их увеличением в 2022 г. и приближением к показателям допандемического уровня или превышением его в некоторых регионах. Отсутствие решающего влияния частоты контактов населения с переносчиками на снижение заболеваемости в период 2020–2021 гг. и рост в 2022 г. подтверждает регистрационный характер изменений. При условии должного внимания к проблеме эффективного выявления и регистрации случаев ПОИ, в большинстве эндемичных регионов в 2023 г. следует ожидать сохранения заболеваемости клещевыми риккетсиозами в пределах среднемноголетних значений. Ослабление внимания к проблеме ПОИ может привести к снижению регистрируемой заболеваемости сибирским клещевым тифом в Красноярском и Забайкальском краях, республиках Тыва и Хакасия, Новосибирской и Амурской областях; снижению заболеваемости АПЛ в Астраханской области. Основная проблема выявления и регистрации заболеваемости КР, объективной оценки и прогнозирования эпидемической ситуации по этой группе инфекций обусловлена отсутствием отечественных сертифицированных диагностических тест-наборов для их лабораторной верификации. Необходимо тесное взаимодействие эпидемиологов и специалистов клинического профиля для установления и регистрации случаев КР на основании клинико-эпидемиологических данных.
В обзоре представлен анализ эпизоотической и эпидемической ситуаций по бешенству в Российской Федерации в 2019–2021 гг. В этот период отмечено снижение активности эпизоотического процесса до уровня 1990-х гг., характеризующихся перепромыслом лисицы, енотовидной собаки и корсака. На 20 % сократилось число выявленных неблагополучных пунктов, а число зарегистрированных в них больных животных уменьшилось с 18 до 10. С 2018 г. в структуре заболеваний животных доля домашних стала преобладать над дикими, а в 2021 г. удельный вес выявленных случаев бешенства у диких животных был наименьшим (37,9 %) за 11 лет наблюдений (2011–2021 гг.). Ведущая роль в поддержании циркуляции возбудителя бешенства сохранялась за лисицей, определявшей в 2019–2021 гг. 34,8–29,9 % всех заболеваний животных. Енотовидная собака активно поддерживала циркуляцию вируса в европейской части России. С 2012 г. установлена тенденция снижения заболеваемости населения бешенством (Тсн. = –9,5 %), среднемноголетний показатель составлял 5 случаев в год. Среди источников гидрофобии преобладали вовлекаемые в эпизоотический процесс собаки и кошки – около 50 % случаев гидрофобии. Неудовлетворительное выполнение правил содержания домашних животных привело к росту заражений людей бешенством от этих животных в 2020–2021 гг. В 2019–2021 гг. установлено участие рукокрылых в заражении людей лиссавирусной инфекцией, что акцентирует внимание на необходимости изучения роли рукокрылых в циркуляции лиссавирусов, в первую очередь на Дальнем Востоке. Риск заражения бешенством сохранялся почти во всех регионах страны. В ХХI в. на территории России повсеместно распространены природные очаги инфекции.
Представлены анализ заболеваемости бруцеллезом в России в 2013–2022 гг. и данные о генетическом разнообразии популяций Brucella melitensis и Brucella abortus, выделенных в России в 1939–2022 гг. В последние 10 лет эпидемиологическая ситуация в России характеризуется как неустойчивая на фоне стойкого неблагополучия по бруцеллезу крупного (КРС) и мелкого (МРС) рогатого скота. В период 2013–2022 (9 мес.) гг. зарегистрировано 4298 неблагополучных пунктов по бруцеллезу КРС (89164 больных животных) и 371 – по бруцеллезу МРС (13569). Наибольшее количество эпизоотических очагов бруцеллеза регистрировали в Северо-Кавказском и Южном федеральных округах. В 2013–2022 гг. в среднем ежегодно регистрировалось 327 случаев бруцеллеза среди людей, показатель заболеваемости на 100 тыс. населения – 0,24. До 70–90 % случаев бруцеллеза выявлено на юге европейской части страны. Отмечается тренд на ухудшение ситуации по бруцеллезу в Приволжском (Пензенская и Самарская области) и Центральном (Смоленская, Воронежская и Тульская области) федеральных округах. Имеется связь интенсивности эпидемических проявлений бруцеллеза с уровнем антропоургической энзоотичности территорий. В 2022 г. зарегистрировано 467 случаев бруцеллеза (0,32 на 100 тыс. населения), что превышает на 42,8 % среднегодовые значения за 10 лет. В 2023 г. можно прогнозировать некоторую стабилизацию уровня заболеваемости на 20–25 % выше средних многолетних величин. Количество людей, заболевших бруцеллезом, может находиться в диапазоне 380–410 случаев (0,26–0,28 на 100 тыс. населения). Результаты генотипирования штаммов B. melitensis указали на увеличение за последние 20–25 лет доли изолятов с MLVA-профилем, характерным для штаммов из энзоотичных по бруцеллезу стран Ближнего Востока и Северной Африки, что может свидетельствовать о завозе (заносе) с этих территорий в Россию инфекции с поголовьем овец, коз и/или биоматериалом от них.
Цель обзора – охарактеризовать эпидемиологическую ситуацию по иксодовыми клещевым боррелиозам (ИКБ) в субъектах Российской Федерации в 2022 г., дать прогноз развития эпидемического процесса ИКБ в 2023 г. на основе анализа его тенденций в период 2013–2022 гг. Всего в 2022 г. в РФ зарегистрировано 7264 случая ИКБ, что в 1,9 раза больше, чем в 2021 г. Во всех регионах в 2022 г. после резкого снижения уровня регистрируемой заболеваемости в «ковидный» период 2020–2021 гг. произошло повышение показателей инцидентности к допандемическому уровню. На протяжении периода 2013–2022 гг. сохраняются отличительные особенности тенденций развития эпидемического процесса ИКБ на территориях различной степени эпидемической опасности. В 14 из 18 субъектов со среднемноголетним показателем (СМП) заболеваемости ИКБ выше 6,2 0 /0000 выявлена тенденция к снижению показателей инцидентности, за исключением г. Москвы и Калужской области, где возможен дальнейший рост заболеваемости ИКБ. В 6 из 16 регионов с СМП2013–2022 от 3,31 до 6,2 0 /0000 отмечена тенденция к росту, а в 8 – к снижению заболеваемости. Тренд к росту заболеваемости выявлен в 7 из 21 субъекта со среднемноголетним показателем инцидентности ИКБ от 1,21 до 3,3 0 /0000 и в 15 из 26 регионов с низким СМП2013–2022 (до 1,2 0 /0000). Проведенный анализ тенденций развития эпидемического процесса ИКБ в сопоставлении с тенденциями изменения частоты контактов населения с клещами, а также расчеты вероятного уровня заболеваемости позволили заключить, что для большинства федеральных округов, при условии сохранения существующих объемов профилактических мероприятий и отсутствии аномальных природно-климатических явлений, уровень заболеваемости ИКБ в 2023 г. будет варьировать около доверительных интервалов среднемноголетних значений, за исключением Центрального федерального округа, где вероятен рост числа случаев заболеваний ИКБ. Эффективный контроль эпидемической ситуации по ИКБ возможен при условии сохранения и совершенствования, а для таких регионов, как г. Москва, Московская область, Воронежская, Калужская, Орловская, Рязанская, Пензенская и Ростовская области, Республика Бурятия, – увеличения объемов профилактических мероприятий, усиления зоолого-энтомологического мониторинга активности и структуры природных очагов. Очевидна необходимость разработки алгоритмов молекулярно-генетического мониторинга возбудителей, циркулирующих в природных очагах, и усиления внимания к проблемам диагностики и профилактики клещевых трансмиссивных инфекций.
Проведен анализ эпизоотолого-эпидемиологической обстановки по сибирской язве в мире в 2022 г., представлен прогноз заболеваемости на 2023 г. в Российской Федерации. В 2022 г. в России выявлено два случая заболевания сибирской язвой сельскохозяйственных животных и два случая кожной формы инфекции у людей в субъектах Северо-Кавказского федерального округа: Республике Дагестан и Ставропольском крае. Напряженная ситуация по сибирской язве зафиксирована в странах ближнего зарубежья: Азербайджане, Грузии, Казахстане, Кыргызстане, Таджикистане, Узбекистане и Украине. Эпизоотии инфекции с наибольшим числом пораженных сельскохозяйственных и диких животных были отмечены в государствах Африки, Азии, Северной Америки и Европы. Заболеваемость сибирской язвой людей в дальнем зарубежье (преимущественно в Африке и Азии) связана в основном с употреблением в пищу мяса больных и павших сельскохозяйственных животных, контактом с зараженными животными, продуктами животноводства. Уровень заболеваемости сибирской язвой животных и людей в Российской Федерации в 2023 г. в значительной степени будет зависеть от широты охвата специфической иммунизацией восприимчивых животных и лиц из групп риска инфицирования и при строгой реализации мер комплексного надзора ограничится регистрацией потенциально возможных единичных случаев инфекции.
Представлена гипотеза о том, что наиболее вероятной причиной гибели древнейшей мировой Индской (Хараппской) цивилизации стали эпидемии азиатской холеры. Дана краткая характеристика Индской цивилизации, существовавшей на протяжении двух тысячелетий (3300–1300 гг. до н.э.). Показано, что ранее описанные причины упадка успешной Индской цивилизации (изменение климата, обмеление Инда и сокращение паводков, катастрофические паводки, засуха, экономический кризис и т.д.) не дают непротиворечивого и исчерпывающего объяснения причин ее гибели. Между тем природные условия и особенности земледелия Индской цивилизации (ежегодные наводнения, затрагивающие не только поля, но и системы канализации) создавали идеальные условия для распространения холеры с водным путем передачи возбудителя. Обсуждается вопрос эволюции возбудителя азиатской холеры. Кратко рассмотрены результаты исследования палеогеномики этого патогена и их значение для реконструкции эволюционных событий. Описаны этапы эволюции Vibrio cholerae классического биовара и рассмотрены возможные механизмы сохранения возбудителя в межэпидемический период. Показано, что помимо холеры в истории человечества известны и другие катастрофические, разрушительные эпидемии.
ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ 
Цель работы – экспериментально обосновать возможность использования питательной среды на основе ферментативного гидролизата фибрина для получения специфических компонентов холерной химической вакцины: холерогена-анатоксина и О-антигена.
Материалы и методы. В работе использовали производственные штаммы Vibrio cholerae 569В и V. cholerae М-41. Глубинное малообъемное культивирование проводили на лабораторном ферментере в течение 8 ч с автоматическим поддержанием параметров культивирования и подкормкой глюкозой на питательной среде на основе ферментативного гидролизата фибрина с показателем рН (8,0±0,1), содержащей (1,0±0,1) г/л аминного азота. Холероген-анатоксин и О-антигены получали из детоксицированных формалинизированных центрифугатов культуральных жидкостей. Специфическую активность антигенов V. cholerae на этапах культивирования и выделения определяли иммунохимическими методами. Изготовление готовой лекарственной формы холерной вакцины и покрытие таблеток кишечнорастворимой оболочкой проводили в соответствии с нормативной документацией.
Результаты и обсуждение. Показано, что культивирование на среде на основе ферментативного гидролизата фибрина обеспечивает стабильный рост биомассы производственных штаммов V. cholerae с высоким уровнем специфической активности антигенов. Сравнительный анализ основных свойств готовой лекарственной формы лабораторных серий с коммерческой серией холерной химической вакцины показал соответствие требованиям нормативной документации. Полученные результаты позволили сделать вывод о возможности применения питательной среды на основе ферментативного гидролизата фибрина для культивирования производственных штаммов и получения специфических компонентов холерной вакцины.
Цель исследования – охарактеризовать моно- и микст-инфицированность возбудителями трансмиссивных инфекций клещей Dermacentor reticulatus, обитающих в одном из антропоургических очагов Томской области.
Материалы и методы. Клещи D. reticulatus собраны с растительности методом «на флаг» в августе и сентябре 2020–2021 гг. в лесопарковых зонах южной части г. Томска. Для выделения из гомогенатов клещей нуклеиновых кислот и последующей ПЦР-диагностики использовали наборы серии «РеалБест» (АО «ВекторБест», Новосибирск). Исследовано 184 индивидуальных образца нуклеиновых кислот на наличие молекулярногенетических маркеров вируса клещевого энцефалита (ВКЭ), патогенных боррелий, бабезий, риккетсий, анаплазм и эрлихий.
Результаты и обсуждение. Спектр патогенов, обнаруженных по результатам ПЦР-анализа клещей, собранных в одном из антропоургических очагов Томской области в 2020 и 2021 гг., включает ВКЭ, патогенные боррелии, риккетсии и бабезии. Наибольший уровень инфицированности D. reticulatus установлен в отношении кандидатных возбудителей клещевых риккетсиозов (Rickettsia sp.) и бабезиозов (Babesia sp.). Общая частота сочетанного инфицирования D. reticulatus составила 12,88 %. Обнаружены семь различных ассоциаций патогенов, инфицирующих D. reticulatus. Большинство (88,24 %) выявленных случаев микст-инфицирования являлись ассоциациями риккетсий. Двойное инфицирование зарегистрировано в 94 % случаев от общего числа микст-вариантов. В одном образце обнаружены маркеры одновременно четырех возбудителей клещевых инфекций (ДНК Rickettsia species, ДНК Babesia species, ДНК Borrelia burgdorferi s.l. и РНК ВКЭ). Изменение ареала обитания D. reticulatus на фоне увеличения их численности определяет необходимость анализа эпидемиологической значимости клещей данного вида в смешанных очагах клещевых инфекций, особенно в зоне симпатрии с иксодовыми клещами других видов.
Приобретение новых мобильных генетических элементов способствует генетическому разнообразию штаммов Vibrio cholerae. Важная роль в данном процессе принадлежит генетическому материалу, получаемому от фагов.
Цель работы – выявление фагоиндуцируемых PLE-островов в штаммах V. cholerae О1-серогруппы и определение устойчивости изолятов, содержащих и не имеющих данные мобильные генетические элементы, к литическому действию бактериофага холерного диагностического эльтор.
Материалы и методы. Использовали нуклеотидные последовательности полных геномов токсигенных и нетоксигенных штаммов V. cholerae О1, представленных в NCBI GenBank. Биоинформационный анализ проводили с применением алгоритма BLAST, MEGA X (или BioEdit v. 7.0.9.0). Тест с фагами ставили по методу А. Грациа.
Результаты и обсуждение. При анализе 39 токсигенных штаммов, завезенных на территорию РФ и сопредельных стран, выявлен штамм V. cholerae О1 классического биовара, содержащий остров PLE5, и 13 штаммов V. cholerae О1 биовара Эль Тор, включающих остров PLE4. В нетоксигенных штаммах PLE-острова не обнаружены. Показано, что штаммы с PLE4 относятся к геновариантам V. cholerae О1 биовара Эль Тор и имеют аллель гена ctxB1. Изоляты с данным мобильным элементом вызвали единичные случаи (1994–1999 гг.), а также вспышки холеры на территории РФ (1993–1994 гг., 1998 г. – Дагестан; 1993 г. – Татарстан) и Украины (1994–1995 гг.). Высказано предположение, что, возможно, присутствие острова PLE4 вносит определенный вклад в обеспечение устойчивости штаммов V. cholerae О1 биовара Эль Тор к холерному диагностическому фагу эльтор (выявлено 55,6 % фагоустойчивых изолятов), но существуют и другие, пока не выявленные, механизмы. Таким образом, получены данные о присутствии новых мобильных генетических элементов в геноме ранее завезенных токсигенных штаммов V. cholerae О1 биовара Эль Тор, что расширяет сведения об их генетической организации.
Риск завоза инфекционных заболеваний является актуальной угрозой санитарно-эпидемиологическому благополучию как на уровне отдельных стран и межгосударственных объединений, так и на уровне мирового сообщества в целом. Территория любой страны обладает фоном угроз, в связи с чем целью работы является комплексная оценка риска завоза инфекционных болезней на территорию России для раннего и эффективного реагирования на возникающие биологические угрозы.
Материалы и методы. В работе использованы данные о структуре пассажиропотока и количестве лиц, прибывших на территорию России, по данным портала Единой межведомственной информационно-статистической системы. Информация о заболеваемости инфекционными болезнями, требующими проведения мероприятий по санитарной охране территории России, приведена по данным официальных сайтов региональных бюро ВОЗ, региональных центров профилактики и контроля заболеваний (CDC), министерств здравоохранения соответствующих стран. Риск завоза инфекционных болезней оценивался в баллах по разработанной при участии авторов оригинальной методике.
Результаты и обсуждение. В работе определена структура пассажиропотока через границы России и выявлены наиболее актуальные инфекционные болезни, представляющие риск завоза, а также страны, завоз инфекций из которых является наиболее вероятным. По результатам проведенной оценки отмечено, что наиболее вероятным является завоз лихорадки денге и холеры из региона Юго-Восточной Азии, лихорадки денге – из Западно-Тихоокеанского региона, холеры и малярии – из Восточно-Средиземноморского региона, холеры, малярии и лихорадки денге – из Американского и Африканского регионов.
Цель – изучение взаимодействия Yersinia pestis с почвенными нематодами, выделенными на территории Горно-Алтайского высокогорного очага чумы.
Материалы и методы. В работе использованы флуоресцентный штамм Y. pestis КМ2083 – производный природного штамма филогенетической линии 4.ANT античного биовара основного подвида – и культура нематод, выделенные на одной территории Горно-Алтайского очага чумы. Систематическую принадлежность нематод определяли по участку гена 18S рРНК, филогенетический анализ проводили методом Maximum Likelihood на основе модели Tamura-Nei в программе Mega 7.0. Взаимодействие штамма Y. pestis КМ2083 и нематод изучали при культивировании на твердой агаровой среде NGM. Наблюдение за нематодами осуществляли с использованием микроскопов Stemi-2000C (Carl Zeiss, Германия) и Axio Imager Z2 (Carl Zeiss, Германия).
Результаты и обсуждение. Установлено, что использованные в работе нематоды из ГорноАлтайского высокогорного очага чумы относятся к роду Panagrolaimus. Культивирование нематод на газоне штамма Y. pestis основного подвида античного биовара филогенетической линии 4.ANT в течение 24 ч не привело к сокращению продолжительности жизни нематод по сравнению с контрольным образцом, что свидетельствует об отсутствии токсичности использованного штамма по отношению к нематодам Panagrolaimus. На кутикуле нематод отмечено образование биопленки в области половых органов и хвоста, в пищеварительном тракте наблюдали скопления флуоресцентных клеток возбудителя чумы. Полученные данные могут свидетельствовать о способности нематод к переносу возбудителя чумы в почвенном биоценозе.
Целью работы явилось определение эффективных ультрафиолетовых (УФ) доз, необходимых для обеззараживания контаминированных коронавирусом SARS-CoV-2 поверхностей, при использовании ртутной лампы низкого давления.
Материалы и методы. Для проведения оперативной дезинфекции поверхностей использован специально разработанный источник УФ-излучения мощностью 7,5 Вт с длиной волны 254 нм в форме портативного фонаря, который обладает высокой эффективностью выхода УФ-излучения и возможностью длительной работы в автономном режиме от компактной батареи. В исследованиях использовали суспензионную культуру коронавируса SARS-CoV-2 с биологической активностью 5,3∙106 БОЕ/мл. Объектами тестирования служили пластиковые чашки Петри (одноразовые) и офисная бумага (марка С, плотность 80 г/м2 ).
Результаты и обсуждение. Определены дозы УФ-излучения, обеспечивающие дезинфекцию поверхностей, контаминированных возбудителем COVID-19, с эффективностью от 99,0 % (бумага) до 99,95 % (пластик). Полученные результаты позволяют рекомендовать портативный УФ-облучатель для использования в практике профилактических мероприятий по борьбе с распространением заболевания, вызванного коронавирусом SARS-CoV-2.
В Казахстане вспышки ящура регистрировались в 2011–2013 гг. в южных и восточных областях, в которых проводится вакцинация от ящура. В январе 2022 г. в с. Киикты Шетского района Карагандинской области Республики Казахстан отмечены случаи заболевания крупного рогатого скота (КРС), клинически сходные с ящуром.
Целью исследования явилось установление причины возникновения болезни и типирование возбудителя.
Материалы и методы. Пробы от больных животных анализировали в ПЦР, секвенировали и типировали согласно протоколу, разработанному Международным эпизоотическим бюро.
Результаты и обсуждение. В культуре клеток ВНК-21 выделен цитопатогенный агент, идентифицированный методом ОТ-ПЦР-РВ и электронномикроскопически как вирус ящура. С целью определения происхождения вирусов проведено секвенирование и анализ нуклеотидной последовательности. В результате проведенных молекулярно-генетических исследований установлено, что заболевание КРС в Карагандинской области вызвано вирусом ящура, циркулирующим на территории приграничных с Казахстаном стран (Китай, Россия, Монголия) и относящимся к типу О, топотипу ME-SA генетической линии Ind-2001. Выделенный на территории Казахстана вирус ящура генетически связан с линией ящура из Азии и является новым для Казахстана генотипом, отнесенным к топотипу ME-SA генетической линии Ind-2001. Настоящее исследование еще раз доказывает необходимость постоянного генетического типирования вирусов ящура для повышения эффективности профилактических мероприятий.
Цель работы – изучение специфического системного влияния сульфатредуцирующих бактерий рода Desulfovibrio на системы организма путем создания экспериментальной модели внутрижелудочной бактериальной инвазии на фоне дисбиотических состояний желудочно-кишечного тракта грызунов.
Материалы и методы. Экспериментальное исследование проведено на крысах линии Wistar. Дисбиоз кишечника моделировался с помощью антибиотиков амоксициллина и метронидазола. В качестве инфекционного агента использован типовой штамм Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans VKM B-1799T .
Результаты и обсуждение. В результате проведенного эксперимента в период острой инфекции (на 15-й день эксперимента) наблюдалась прямая корреляция между концентрацией вводимой суспензии бактерий D. desulfuricans VKM B-1799T с уровнем сывороточного железа: чем выше заражающая доза инфекционного агента, тем ниже наблюдалась концентрация сывороточного железа. В период отдаленных последствий (38-й день эксперимента) при оценке концентрации уровня D. desulfuricans VKM B-1799T в кишечнике грызунов выявлена обратная корреляционная зависимость между концентрациями инфекционного агента и уровнем сывороточного железа: при увеличении концентрации D. desulfuricans VKM B-1799T от 103 КОЕ/г и выше уровень железа снижается с 43,5 до 38,5 мкмоль/л. В период острой инфекции и период отдаленных последствий у всех групп крыс при сравнении уровня трансферрина и ненасыщенной железосвязывающей способности наблюдалось повышение этих показателей, а процент насыщения трансферрина железом снижался, что свидетельствует о возникшем дефиците железа на фоне воздействия инфекционного агента. Дисбиоз кишечника способствует колонизации условно-патогенной флорой, в том числе Desulfovibrio spp. Изменения со стороны маркеров обмена железа в организме подопытных животных на фоне инвазии D. desulfuricans VKM B-1799T выше 103 КОЕ/г и способность данного микроорганизма к связыванию железа в недоступную форму позволяют думать, что бактерии рода Desulfovibrio являются одним из ключевых этиологических факторов развития железодефицитной анемии.
Тактика деятельности специализированной противоэпидемической бригады (СПЭБ) Роспотребнадзора на территории Республики Крым определялась условиями чрезвычайной ситуации (ЧС) санитарно-эпидемиологического и природного характера.
Цель работы – анализ особенностей и эффективности функционального реагирования СПЭБ Роспотребнадзора на динамику эпидемиологических рисков, обусловленных ЧС сочетанного характера на территории Республики Крым в 2020–2021 гг.
Материалы и методы. Использованы отчетные материалы СПЭБ Роспотребнадзора, информационные материалы Межрегионального управления Роспотребнадзора по Республике Крым и городу федерального значения Севастополю, данные сервиса «Коронавирус-монитор».
Результаты и обсуждение. Тактические решения по работе СПЭБ на территории Республики Крым имели этапный характер. При осложнении эпидемиологической ситуации по новой коронавирусной инфекции была задействована мобильная группа СПЭБ, которая совместно со специалистами Противочумной станции Республики Крым провела 211148 исследований клинического материала по обнаружению РНК возбудителя SARS-CoV-2 методом ПЦР в период 2020–2021 гг. В ответ на возникновение дополнительных рисков, вызванных последствиями опасного метеорологического явления, осуществлено усиление группы специалистов СПЭБ, а затем выдвижение мобильного комплекса (МК) СПЭБ Роспотребнадзора. В течение всего периода работы осуществлялась пролонгированная целевая ротация кадрового состава для адекватного лабораторного обеспечения мониторинга по эпидемиологическим показаниям в соответствии с характером возникающих рисков. Особенности тактики функционирования позволили провести 18591 скрининговое исследование клинического материала на острые респираторные вирусные инфекции, природно-очаговые и острые кишечные инфекции, а также исследование 280 проб воды на холеру. В результате использования адаптированной для работы в условиях ЧС последовательности операционных процедур из водных объектов было выделено 10 штаммов Vibrio cholerae О1 ctxA–tcpA–. Поэтапное задействование мобильной группы специалистов СПЭБ, а затем МК СПЭБ в сочетании с последовательной оперативной целевой ротацией кадрового состава с целью адекватного лабораторного обеспечения мониторинговых исследований определило тактические особенности функционирования СПЭБ. Оперативное изучение, обоснование потенциальных и реагирование на реализованные (фактические) эпидемиологические риски, связанные с экстраординарной ситуацией, позволили не допустить осложнения эпидемиологической ситуации на территории туристического кластера РФ.
Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом (ГЛПС) регистрируется в различных географических регионах Российской Федерации и занимает одно из первых мест среди природно-очаговых заболеваний человека в России.
Цель работы – оценка эпидемиологической ситуации по ГЛПС в Ростовской области.
Материалы и методы. Лабораторную диагностику полевого материала (проб от грызунов) на наличие антигенов возбудителей ГЛПС и скрининговое исследование сывороток крови доноров, жителей региона, на наличие антител класса G к вирусам, вызывающим ГЛПС, проводили методом иммуноферментного анализа в течение 2020 и 2021 гг.
Результаты и обсуждение. Антигены хантавирусов в 2020 г. выявлены в пяти административных районах области, инфицированность вирусом ГЛПС мелких мышевидных грызунов составила 7,1 %. В 2021 г. спонтанная инфицированность носителей вируса выявлена в 2,8 % проб, обнаруженных в четырех районах области. Наличие маркеров вируса регистрировали в популяциях пяти видов мелких мышевидных грызунов: домовая мышь, лесная мышь, обыкновенная полевка, малая лесная мышь, желтобрюхая мышь. Изучение иммунной прослойки здорового населения показало, что на обследованных территориях антитела класса G в 2020 г. регистрировались у 6,8 %, в 2021 г. – 4,5 % жителей. Данные о выявлении маркеров вируса в пробах носителей и наличие естественной иммунной прослойки населения по отношению к вирусам – возбудителям ГЛПС могут свидетельствовать о возможности существования на территории Ростовской области природного очага ГЛПС.
Коронавирусы (семейство Coronaviridae, роды Alphacoronavirus и Betacoronavirus) являются возбудителями респираторных, кишечных и неврологических заболеваний человека и животных. Природные резервуары коронавирусов включают летучих мышей, грызунов и насекомоядных, однако в Российской Федерации циркуляция коронавирусов среди грызунов и насекомоядных не исследована.
Цель работы – исследование многообразия коронавирусов среди грызунов и насекомоядных, совместно обитающих в природных биотопах.
Материалы и методы. Грызуны (68 особей) и бурозубки рода Sorex (23 особи) отловлены на ограниченной лесной территории, не превышающей 1,5 кв. км, в окрестностях Новосибирска. Все образцы проанализированы методом обратной транскрипции – полимеразной цепной реакции с последующим секвенированием.
Результаты и обсуждение. В 4 видах отловленных мелких млекопитающих обнаружены 4 различных коронавируса. Ассоциированные с грызунами коронавирусы относились к роду Betacoronavirus, подрод Embecovirus, и демонстрировали филогенетическое группирование в соответствии с видом природного носителя. Уровень гомологии между новыми РНК-изолятами от красной полевки (Myodes rutilus), полевки-экономки (Microtus oeconomus) и полевой мыши (Apodemus agrarius) составлял 85,5–87,7 %. Нуклеотидные последовательности сибирских изолятов коронавируса близки (>93 % гомологии) ранее опубликованным последовательностям в каждой из групп носителей, обнаруженных на территории Европы и Китая, что предполагает их общее эволюционное происхождение. Коронавирус, выявленный в обыкновенной бурозубке (Sorex araneus), относился к роду Alphacoronavirus, однако значительно отличался (>36 % различий) от ранее выявленных штаммов, включенных в состав рода. Показано, что различные коронавирусы совместно циркулируют на ограниченной территории среди грызунов и насекомоядных.
КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ 
Цель работы – эпизоотолого-эпидемиологический анализ ситуации по бруцеллезу в Кыргызской Республике.
Материалы и методы. При анализе показателей заболеваемости бруцеллезом в Кыргызской Республике за 1983–2021 гг. использованы официальные данные Республиканского центра карантинных и особо опасных инфекций, Департамента профилактики заболеваний и государственного санитарно-эпидемиологического надзора Министерства здравоохранения Кыргызской Республики, Государственной инспекции по ветеринарной и фитосанитарной безопасности Кыргызской Республики, Национального статистического комитета Кыргызской Республики. Полученные материалы обработаны с использованием Microsoft Excel 2010.
Результаты и обсуждение. Показано, что в стране сохраняется неблагополучная ситуация по бруцеллезу среди населения: в исследуемый период средний уровень заболеваемости составил 29,3 случая на 100 тыс. населения. Нестабильная ситуация по бруцеллезу связана с постоянно протекающими эпизоотиями среди сельскохозяйственных животных, особенно мелкого рогатого скота, являющегося основным источником заражения людей. Отмечена выраженная летняя сезонность заболевания бруцеллезом, обусловленная участием людей в кампании окота и отела животных. С 2008 г. отмечено постепенное снижение уровня заболеваемости бруцеллезом среди людей после начала систематического проведения массовой вакцинации против бруцеллеза мелкого рогатого скота. Для стабилизации эпидемической и эпизоотической обстановки в стране необходимо проведение всего комплекса противобруцеллезных мероприятий и социальной мобилизации населения. Успешной реализации поставленной задачи будет способствовать разработка Государственной программы по борьбе с бруцеллезом для межведомственной интеграции всех усилий по профилактике этой опасной инфекционной болезни.
ПАМЯТИ КОЛЛЕГИ 
ПРАВИЛА ДЛЯ АВТОРОВ 
ISSN 2658-719X (Online)