Холера: тенденции развития эпидемического процесса в 2021 г., прогноз на 2022 г.

Цель работы – обобщение результатов мониторинга холеры в 2021 г., оценка современных тенденций развития эпидемического процесса и прогнозирование эпидемиологической ситуации в Российской Федерации на 2022 г. В период 2012–2021 гг. в мире зарегистрировано 4117264 случая холеры с распространением инфекции в 83 странах всех континентов с тенденцией снижения заболеваемости в странах Азии и Африки. Динамика помесячной заболеваемости в 2021 г. связана с чрезвычайными ситуациями как факторами эпидемиологического риска. Эпидемии и вспышки холеры регистрировались на фоне пандемии COVID-19 и представляли двойную нагрузку для систем здравоохранения. Вместе с тем обобщение результатов мониторинга холеры на территориях субъектов РФ показало, что прогноз об эпидемическом благополучии на 2021 г. полностью оправдался. Определено, что увеличение количества нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae О1 (67), выделенных из водных объектов, по сравнению с 2020 г. (25) в основном связано с принадлежностью ряда изолятов к клональным комплексам. Изучение филогенетических связей продемонстрировало, что обнаружение штаммов, имеющих генотипы, которые уже выявлялись у выделенных в предыдущие годы, свидетельствовало об их персистентном потенциале. Выявление штаммов с новыми генотипами, которые ранее устанавливались у штаммов, циркулирующих на других территориях, указывало на возможность их периодических завозов. Прогноз эпидемиологической ситуации по холере в России на 2022 г. связан с продолжением существования рисков завоза. При отсутствии реализации данных эпидемиологических рисков прогнозируется стабильная эпидемиологическая обстановка по этой инфекции на территории страны. Предполагается продолжение обнаружения в водных объектах окружающей среды эпидемически незначимых штаммов холерных вибрионов O1 серогруппы, в том числе их клонов и/или клональных комплексов, включая штаммы, которые могут явиться этиологическим фактором спорадических случаев или вспышек заболеваний.

1. Charnley G.E.C., Kelman I., Murray K.A. Drought-related cholera outbreaks in Africa and the implications for climate change: a narrative review. Pathog. Glob. Health. 2022; 116(1):3–12. DOI: 10.1080/20477724.2021.1981716.

2. Crise Humanitaire Complexe – République démocratique du Congo: Rapport hebdomadaire de Situation Semaine 33 (du 16 au 22 août 2021) 06 septembre 2021. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/democratic-republic-congo/crise-humanitaire-complexe-r-publique-d-mocratique-du-congo-4 (дата обращения 09.09.2021).

3. Nigeria and Niger. Cholera outbreak. Crisis overview. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/sites/reliefweb.int/files/resources/20211117_acaps_thematic_report_cholera_outbreak_in_niger_and_nigeria.pdf (дата обращения 23.11.2021).

4. Uganda: Floods, Landslides and Hailstorm. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/sites/reliefweb.int/files/resources/MDRUG044du1.pdf (дата обращения 22.12.2021).

5. Uwishema O., Okereke M., Onyeaka H., Hasan M.M., Donatus D., Martin Z., Oluwatomisin L.A., Mhanna M., Olumide A.O., Sun J., Adanur I. Threats and outbreaks of cholera in Africa amidst COVID-19 pandemic: a double burden on Africa’s health systems. Trop. Med. Health. 2021; 49(1):93. DOI: 10.1186/s41182-021-00376-2.

6. Owoicho O., Abechi P., Olwal C.O. Cholera in the era of COVID-19 pandemic: a worrying trend in Africa? Int. J. Public Health. 2021; 66:1604030. DOI: 10.3389/ijph.2021.1604030.

7. Носков А.К., Кругликов В.Д., Москвитина Э.А., Монахова Е.В., Левченко Д.А., Янович Е.Г., Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Непомнящая Н.Б., Ежова М.И., Подойницына О.А. Характеристика эпидемиологической ситуации по холере в мире и в Российской Федерации в 2020 г. и прогноз на 2021 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2021; 1:43–51. DOI: 10.21055/0370-1069-2021-1-43-51.

8. Cholera, 2013. WklyEpidem. Rec. WHO. 2014; 89(31):345– 356. [Электронный ресурс]. URL: https://www.who.int/wer/2014/wer8931.pdf?ua=1 (дата обращения 04.08.2014).

9. Cholera, 2014. WklyEpidem. Rec. WHO. 2015; 90(40):517– 529. [Электронный ресурс]. URL: https://www.who.int/wer/2015/wer9040.pdf?ua=1 (дата обращения 05.10.2015).

10. Cholera, 2015. WklyEpidem. Rec. WHO. 2016; 91(38):433–440. [Электронный ресурс]. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/250142/WER9138.pdf?sequence=1 (дата обращения 26.09.2016).

11. Cholera, 2016. WklyEpidem. Rec. WHO. 2017; 92(36):521–536. [Электронный ресурс]. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/258910/WER9236.pdf?sequence=1 (дата обращения 11.09.2017).

12. Cholera, 2017. WklyEpidem. Rec. WHO. 2018; 93(38):489–497. [Электронный ресурс]. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/274654/WER9338.pdf?ua=1 (дата обращения 24.09.2018).

13. Cholera, 2018. WklyEpidem. Rec. WHO. 2019; 94(48):561–580. [Электронный ресурс]. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/274654/WER9448.pdf?ua=1 (дата обращения 01.12.2019).

14. Cholera, 2019. WklyEpidem. Rec. WHO. 2020; 95(37):441–448. [Электронный ресурс]. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/334241/WER9537-eng-fre.pdf?ua=1 (дата обращения 12.09.2020).

15. Cholera, 2020. WklyEpidem. Rec. WHO. 2021; 96(37):445–460. [Электронный ресурс]. URL: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/334241/WER9537-eng-fre.pdf?ua=1 (дата обращения 29.09.2021).

16. Communicable disease threats report, 21–27 November 2021, week 47. [Электронный ресурс]. URL: https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/communicable-disease-threats-report21-27-november-2021-week-47 (дата обращения 29.11.2021).

17. Zohra T., Ikram A., Salman M., Amir A., Saeed A., Ashraf Z., Ahad A. Wastewater based environmental surveillance of toxigenic Vibrio cholerae in Pakistan. PLoS One. 2021; 16(9):e0257414. DOI: 10.1371/journal.pone.0257414.

18. Bugayong M.P., Izumiya H., Bilar J.M., Morita M., Arakawa E., Saito-Obata M., Oshitani H., Ohnishi M. Molecular characterization of Vibrio cholerae O1 isolates obtained from outbreaks in the Philippines, 2015–2016. J. Med. Microbiol. 2021; 70(11). DOI: 10.1099/jmm.0.001443.

19. Nayak S.R., Nayak A.K., Biswal B.L., Pati S., Pal B.B. Spread of Haitian variant Vibrio cholerae O1 causing cholera outbreaks in Odisha, India. Jpn. J. Infect. Dis. 2021; 74(2):137–43. DOI: 10.7883/yoken.JJID.2020.364.

20. Ekeng E., Tchatchouang S., Akenji B., Issaka B.B., Akintayo I., Chukwu C., Dano I.D., Melingui S., Ousmane S., Popoola M.O., Nzouankeu A., Boum Y., Luquero F., Ahumibe A., Naidoo D., Azman A., Lessler J., Wohl S. Regional sequencing collaboration reveals persistence of the T12 Vibrio cholerae O1 lineage in West Africa. Elife. 2021; 10:e65159. DOI: 10.7554/eLife.65159.

21. Pal B.B., Mohanty A., Biswal B., Nayak S.R., Das B.K., Lenka P.P. Haitian variant Vibrio cholerae O1 Ogawa caused cholera outbreaks in Odisha. Indian J. Med. Microbiol. 2021; 39(4):513–17. DOI: 10.1016/j.ijmmb.2021.03.019.

22. Smith A.M., Weill F.X., Njamkepo E., Ngomane H.M., Ramalwa N., Sekwadi P., Thomas J. Emergence of Vibrio cholera O1 sequence type 75, South Africa, 2018–2020. Emerg. Infect. Dis. 2021; 27(11):2927–31. DOI: 10.3201/eid2711.211144.

23. Thong K.L., Tham K.B.L., Ngoi S.T., Tan S.C., Wan Yussof W.N., Ahmad Hanapi R., Mohamad N., Teh C.S.J. Molecular characterization of Vibrio cholerae O1 El Tor strains in Malaysia revealed genetically diverse variant lineages. Transbound Emerg. Dis. 2021; Nov 1. DOI: 10.1111/tbed.14368.

24. Parvin I., Shahid A.S.M.S.B., Das S., Shahrin L., Ackhter M.M., Alam T., Khan S.H., Chisti M.J., Clemens J.D., Ahmed T., Sack D.A., Faruque A.S.G. Vibrio cholerae O139 persists in Dhaka, Bangladesh since 1993. PLoS Negl. Trop. Dis. 2021; 15(9):e0009721. DOI: 10.1371/journal.pntd.0009721.

25. Behera D.R., Nayak A.K., Nayak S.R., Nayak D., Swain S., Maharana P.K., Biswal B., Pany S., Pati S., Pal B.B. Genomic diversities of ctxB, tcpA and rstR alleles of Vibrio cholerae O139 strains isolated from Odisha, India. Environ. Microbiol. Rep. 2021; Oct 19. DOI: 10.1111/1758-2229.13016.

26. Ahmadi M.H. Global status of tetracycline resistance among clinical isolates of Vibrio cholerae: a systematic review and meta-analysis. Antimicrob. Resist. Infect. Control. 2021; 10(1):115. DOI: 10.1186/s13756-021-00985-w.

27. Disease Surveillance, Emergency Preparedness and Response in Eastern and Southern Africa. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/world/disease-surveillance-emergency-preparedness-and-response-eastern-and-southern-africa (дата обращения 10.05.2021).

28. Hassan O.B., Nellums L.B. Cholera during COVID-19: The forgotten threat for forcibly displaced populations. EClinicalMedicine. 2021; 32:100753. DOI: 10.1016/j.eclinm.2021.100753.

29. Alsabri M., Alhadheri A., Alsakkaf L.M., Cole J. Conflict and COVID-19 in Yemen: beyond the humanitarian crisis. Global Health. 2021; 17(1):83. DOI: 10.1186/s12992-021-00732-1.

30. Cholera prevention and control. Seventy-first world health assembly, Agenda item 11.2. 26 May 2018. [Электронный ресурс]. URL: http://apps.who.int/gb/ebwha/pdf_files/WHA71/A71_R4-en.pdf (дата обращения 23.09.2021).

31. Yemen Country Office Humanitarian Situation Report. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/sites/reliefweb.int/files/resources/UNICEF%20Yemen%20Humanitarian%20Situation%20Report%20-%201-31%20May%202021.pdf (дата обращения 19.07.2021).

32. Cholera, diarrhea & dysentery update (05): Africa. Archive Number: 20210326.8271347. [Электронный ресурс]. URL: https://promedmail.org/promed-post/?id=8271347 (дата обращения 31.03.2021).

33. Borno state ministry of health – Cholera outbreak situation report No. 2 (6th September 2021). [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/nigeria/borno-state-ministry-healthcholera-outbreak-situation-report-no2-6th-september-2021 (дата обращения 09.09.2021).

34. Ethiopia conducts an oral cholera vaccination campaign to protect populations in cholera affected districts. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/ethiopia/ethiopia-conductsoral-cholera-vaccination-campaign-protect-populations-cholera (дата обращения 04.02.2021).

35. République Démocratique du Congo: Cluster Santé Sitrep S33 Aout 2021. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/democratic-republic-congo/r-publique-d-mocratique-du-congo-cluster-sant-sitrep-s33-aout-2021 (дата обращения 01.09.2021).

36. Левченко Д.А., Кругликов В.Д., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б. Способ идентификации нетоксигенных штаммов холерных вибрионов О1 серогруппы с помощью ПЦР для выделения генетических детерминант. Патент РФ № 2665542, опубл. 30.08.2018. Бюл. № 25.

37. Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Водопьянов С.О., Олейников И.П. Совершенствование методики SNP-типирования штаммов Vibrio cholerae на основе анализа первичных данных полногеномного секвенирования. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2020; 97(6):587–93. DOI: 10.36233/0372-9311-2020-97-6-9.

38. Reguera G., Kolter R. Virulence and the environment: a novel role for Vibrio cholerae toxin-coregulated pili in biofilm formation on chitin. J. Bacteriol. 2005; 187(10):3551–5. DOI: 10.1128/JB.187.10.3551-3555.2005.

39. Shin O.S., Tam V.C., Suzuki M., Ritchie J.M., Bronson R.T., Waldor M.K., Mekalanos J.J. Type III secretion is essential for the rapidly fatal diarrheal disease caused by non-O1, nonO139 Vibrio cholerae. mBio. 2011; 2(3):e00106–11. DOI: 10.1128/mBio.00106-11.

40. Dziejman M., Serruto D., Tam V.C., Sturtevant D., Diraphat P., Faruque S.M., Rahman M.H., Heidelberg J.F., Decker J., Li L., Montgomery K.T., Grills G., Kucherlapati R., Mekalanos J.J. Genomic characterization of non-O1, non-O139 Vibrio cholera reveals genes for a type III secretion system. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2005; 102(90):3465–70. DOI: 10.1073/pnas.0409918102.

41. Crisan C.V., Hammer B.K. The Vibrio cholerae type VI secretion system: toxins, regulators and consequences. Environ. Microbiol. 2020; 22(10): 4112–22. DOI: 10.1111/1462-2920.14976.

42. Pukatzki S., Provenzano D. Vibrio cholerae as a predator: lessons from evolutionary principles. Front. Microbiol. 2013; 4:384. DOI: 10.3389/fmicb.2013.00384.

43. Blokesch M. Competence-induced type VI secretion might foster intestinal colonization by Vibrio cholerae: Intestinal interbacterial killing by competence-induced V. cholerae. Bioessays. 2015; 37(11):1163–68. DOI: 10.1002/bies.201500101.

44. Jermyn W.S., Boyd E.F. Characterization of a novel Vibrio pathogenicity island (VPI-2) encoding neuraminidase (nanH) among toxigenic Vibrio cholerae isolates. Microbiology (Reading). 2002; 148(Pt 11):3681–93. DOI: 10.1099/00221287-148-11-3681.

45. Миронова Л.В., Пономарева А.С., Хунхеева Ж.Ю., Гладких А.С., Балахонов С.В. Генетическое разнообразие Vibrio cholerae О1 El Tor при эпидемических осложнениях в Сибирском и Дальневосточном регионах. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2019; 37(4):165–72. DOI: 10.17116/molgen201937041165.

46. Крицкий А.А., Смирнова Н.И., Каляева Т.Б., Оброткина Н.Ф., Грачева И.В., Катышев А.Д., Кутырев В.В. Сравнительный анализ молекулярно-генетических свойств нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae O1 биовара Эль Тор, изолированных в России и на эндемичных по холере территориях. Проблемы особо опасных инфекций. 2021; 3:72–82. DOI: 10.21055/0370-1069-2021-3-72-82.

47. Москвитина Э.А., Янович Е.Г., Куриленко М.Л., Кругликов В.Д., Носков А.К. Эколого-эпидемиологические аспекты контаминации V. cholerae О1 водных объектов в Республике Калмыкия. Здоровье населения и среда обитания –ЗНиСО. 2021; 29(12):79–86. DOI: 10.35627/2219-5238/2021-29-12-79-86.