Preview

Проблемы особо опасных инфекций

Расширенный поиск

«Проблемы особо опасных инфекций» – рецензируемый научно-практический журнал издается с 1968 г. Учредитель журнала – Федеральное казенное учреждение науки «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека.

Периодичность – 4 выпуска в год. Формат – А4, максимальный объем – 200 полос.

Журнал зарегистрирован Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций. Свидетельство о регистрации ПИ №ФС77-74153.

Журнал «Проблемы особо опасных инфекций» с 2001 г. входит в Перечень ведущих рецензируемых научных журналов и изданий Высшей аттестационной комиссии, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук. В настоящее время журнал «Проблемы особо опасных инфекций» входит в Перечень ВАК по трем научным специальностям: 1.5.11. – Микробиология (медицинские и биологические науки), 3.2.2 – Эпидемиология (медицинские и биологические науки), 3.2.6. – Безопасность в чрезвычайных ситуациях (медицинские науки).

В журнале публикуются статьи ведущих ученых противочумных и  профильных научных учреждений России и стран СНГ, а также специалистов практического здравоохранения по  вопросам эпидемиологии, микробиологии, генетики, биотехнологии, иммунологии, лабораторной диагностики и профилактики особо опасных и природно-очаговых инфекций, а также по проблемам санитарной охраны, биологической безопасности и биотерроризма. Одной из задач журнала является предоставление возможности публикации результатов диссертационных исследований. Журнал имеет следующие разделы: обзоры, оригинальные статьи, краткие сообщения, информация.

Все  без исключения материалы, поступающие в редакцию журнала, проходят рецензирование. В состав редакционного совета входят ведущие специалисты России и зарубежных стран. Статьи публикуются на русском языке, резюме и сведения об авторах переводятся на английский, список литературы транслитерируется.

Журнал включен в Реферативный журнал и Базы данных ВИНИТИ, индексируется в Российском Индексе Научного Цитирования (РИНЦ) и размещен в Научной электронной библиотеке. Двухлетний импакт-фактор РИНЦ в 2024 г. – 2,168. Пятилетний импакт-фактор РИНЦ в 2024 г. – 1,258. 

С 1 января 2024 г. журнал отнесен к категории 1 Перечня ВАК. Уровень в ЕГПНИ (Белый список) – 1.

С апреля 2019 г. журнал вошел в Scopus, показатели за 2023 г.: CiteScore – 1,9; наивысший процентиль – 34 % (III квартиль).

Сведения о журнале ежегодно публикуются в международной справочной системе по периодическим и продолжающимся изданиям «Ulrich’s Directory».

Подписной индекс в объединенном каталоге подписных изданий «Пресса России» (раздел «Здоровье. Медицина») – 29448. Все номера журналов также можно заказать через редакцию. E-mail: jour@microbe.ru, тел. (845-2)51-82-22.

Текущий выпуск

№ 1 (2026)
Скачать выпуск PDF
6-16 130
Аннотация

Статья посвящена первому опыту российско-малагасийского сотрудничества в области обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения на о. Мадагаскар. Описаны результаты первой экспедиционной работы по изучению активности природных очагов чумы в регионе Amoron’i Mania Республики Мадагаскар.

Основной целью статьи являлось обобщение опыта, полученного в ходе совместной экспедиции, а также разработка рекомендаций по совершенствованию системы эпидемиологического надзора и профилактики.

Материалы и методы. В ходе экспедиции использовались методы эпидемиологического анализа, эпизоотологического мониторинга и лабораторной диагностики (ПЦР, LAMP, ИХА, бактериологический метод, секвенирование).

Результаты и обсуждение. В ходе эпизоотологического мониторинга обследовано 22 коммуны региона Amoron’i Mania, отловлено 116 мелких млекопитающих 6 видов. Исследованы на наличие маркеров возбудителей различной природы 232 объединенные пробы органов мелких млекопитающих (печень/селезенка и почки/ легкие), 82 объединенные пробы блох, 42 пула клещей. Исследование подтвердило наличие активных очагов чумы и других инфекционных заболеваний на Мадагаскаре. Экспедиция позволила выработать рекомендации по совершенствованию мониторинга за чумой. Работа открывает перспективы для дальнейшего взаимодействия Российской Федерации и Республики Мадагаскар в области эпидемиологического надзора за чумой, направленные на снижение рисков инфекционных заболеваний и защиту населения от биологических угроз.

ОБЗОРЫ

17-25 155
Аннотация

В 2025 г. сохранялась высокая эпизоотическая активность высокопатогенного вируса гриппа птиц (ВПВГП), о чем свидетельствуют более 7 тыс. вспышек среди домашней и дикой птицы в 75 странах мира, сопровождавшиеся гибелью или вынужденным уничтожением сельскохозяйственных птиц, число которых превысило 98 млн. Большинство зарегистрированных в мире вспышек связано с ВПВГП A(H5N1) клады 2.3.4.4b, преобладающим в циркуляции во всем мире с 2021 г. Помимо доминирующего подтипа A(H5N1) клады 2.3.4.4b, наблюдалась циркуляция других высокопатогенных подтипов, включая A(H5N5), A(H5N2), A(H5N8) и A(H5N9), а также A(H7), что указывает на продолжающуюся эволюцию вируса гриппа птиц в природных и антропогенных экосистемах. В США и ряде других стран ВПВГП A(H5N1) стал причиной многочисленных случаев заболевания диких и домашних млекопитающих, а также людей. В 2025 г. впервые в мире зарегистрирован случай заболевания человека гриппом A(H5N5) в США. Всего в 2025 г. зарегистрировано 74 случая зоонозной передачи ВПВГП человеку, в том числе 32 случая, вызванных вирусом A(H5) различных клад (2.3.4.4b, 2.3.2.1e, 2.3.2.1a), что указывает на продолжающийся рост межвидовой передачи, который несет потенциальную угрозу для общественного здоровья. В Российской Федерации в 2025 г. сохранялась напряженная эпизоотическая обстановка – зарегистрированы вспышки, вызванные ВПВГП A(H5N1) клады 2.3.4.4b, среди диких и домашних птиц. При этом на Дальнем Востоке отмечена циркуляция вируса A(H5N1), содержащего мутации повышенной вирулентности для млекопитающих. Также в части выделенных изолятов A(H5N1) обнаружены аминокислотные замены в антигенных сайтах. Несмотря на продолжающуюся эволюцию, на данный момент не наблюдается значительного изменения антигенных свойств ВПВГП A(H5N1), циркулирующих в Российской Федерации.

26-33 95
Аннотация

Мелиоидоз является особо опасным инфекционным заболеванием, поражающим людей и животных преимущественно в странах Юго-Восточной Азии и на территории северной Австралии. Прогнозируемые в ближайшие годы распространение естественного ареала возбудителя – Burkholderia pseudomallei – и рост заболеваемости мелиоидозом представляют серьезную угрозу для общественного здравоохранения. Поскольку для выделения и идентификации культуры B. pseudomallei требуется до семи суток, необходим надежный тест для его быстрого прямого обнаружения непосредственно в клинических образцах, что позволит начать лечение надлежащими антибиотиками, предотвращая рецидивы заболевания и снижая уровень смертности. Усложняет разработку инструментов диагностики значительная адаптационная пластичность генома B. pseudomallei, который приобретает новые кодирующие последовательности в результате горизонтального переноса генов от микроорганизмов, занимающих с возбудителем мелиоидоза общую экологическую нишу. Большинство разработанных иммунодиагностических тестов для выявления B. pseudomallei созданы без должной стандартизации и не являются коммерчески доступными. Эти экспериментальные препараты обладают недостаточными чувствительностью и специфичностью и лучше всего работают с выделенной бактериальной культурой, сводя к минимуму преимущества быстрой диагностики. Основной задачей при создании простого, эффективного и экономичного иммунодиагностического экспресс-теста для выявления B. pseudomallei по-прежнему является выбор диагностической мишени. В обзоре представлен анализ литературных данных об имеющихся и перспективных методических инструментах ускоренного обнаружения возбудителя мелиоидоза иммунологическими методами и поиске новых потенциальных антигенных мишеней.

34-42 101
Аннотация

В ХХI столетии сохраняется тенденция сокращения общего числа случаев заражения чумой в странах Африки, Северной и Южной Америки, Азии. Наиболее неблагоприятная эпидемиологическая ситуация складывалась в странах Африканского региона, где зарегистрировано свыше 90 % общемировой заболеваемости чумой. Целью обзора является анализ пространственно-временных особенностей эпидемических проявлений чумы на Африканском континенте в ХХ–ХХI столетиях. Обобщены литературные сведения, характеризующие вспышечную и спорадическую заболеваемость чумой в странах Африки в рассматриваемый период. В многолетнем аспекте проанализированы данные о числе случаев заражения чумой в 1935–2024 гг. Высокий уровень ежегодной заболеваемости чумой зарегистрирован в периоды 1935–1945 и 1986–2008 гг. В 1946–1985 и 2009–2024 гг. общее число случаев заражения значительно снижалось. Также показано, что в первой половине прошлого столетия (до 1950 г.) случаи заражения чумой зарегистрированы в 25 странах, расположенных в северных, западных, восточных и южных регионах Африканского континента. Во второй половине прошлого века число африканских стран, где имели место случаи заболевания чумой, сократилось до 20, а в начале текущего столетия – до 9. Обосновано, что в 1900–2024 гг. наиболее стойкий характер эпидемических проявлений имел место в странах Восточной Африки и на о. Мадагаскар. Отмечаемая стабильность эпидемических проявлений в действующих здесь природных и природно-антропоургических очагах чумы объясняется сочетанием экологических, эпизоотологических, эпидемиологических факторов, обеспечивающих постоянную циркуляцию эпидемиологически значимых линий Yersinia pestis (1.ANT, 1.ORI).

43-52 197
Аннотация

Цель работы – анализ эпидемиологической обстановки по чуме в мире в 2025 г. и прогноз эпизоотической активности природных очагов этой особо опасной инфекции в Российской Федерации на 2026 г. В 2016–2025 гг. отмечено сохранение тенденции снижения эпидемической активности природных очагов чумы во многих регионах мира. Общее число случаев заболевания составило 5626, из них летальных – 516 (показатель летальности – 9,2 %). В 2025 г. в мире случаи заболевания чумой зарегистрированы в четырех государствах: в Демократической Республике Конго (41 случай, 2 летальных), Республике Мадагаскар (18 случаев, 7 летальных), США (5 случаев, 1 летальный), Монголии (3 случая, 1 летальный). Всего зарегистрировано 67 случаев заболевания чумой, из которых 11 (16,4 %) закончились летальным исходом. На территории Российской Федерации в 2017–2025 гг., несмотря на наличие эпизоотически активных природных очагов, обеспечено эпидемиологическое благополучие по чуме. За анализируемый период зараженные чумой животные выявлены в трех природных очагах: ЦентральноКавказском высокогорном, Горно-Алтайском высокогорном, Тувинском горном. Всего за последнее десятилетие на энзоотичной по чуме территории Российской Федерации выделено 337 штаммов возбудителя чумы. Общая площадь выявленных эпизоотий чумы составила 14 570 км2 (6,5 % от всей площади очагов). В 2025 г. локальные эпизоотии чумы зарегистрированы на территории Карачаевского района Карачаево-Черкесской Республики и Эльбрусского района Кабардино-Балкарской Республики, Кош-Агачского района Республики Алтай, МонгунТайгинского кожууна Республики Тыва. Зараженные чумой животные выявлены на территории трех (ЦентральноКавказского высокогорного, Горно-Алтайского высокогорного и Тувинского горного) из 11 природных очагов чумы Российской Федерации. Общая площадь эпизоотий составила 523,01 км2. Всего в 2025 г. изолировано 13 культур возбудителя чумы, в том числе 12 – филогенетической ветви 4.ANT античного биовара и 1 – филогенетической ветви 2MED0 средневекового биовара основного подвида Yersinia pestis pestis. Отмечено, что в 2017–2025 гг., при проведении ежегодных профилактических (противоэпидемических) мероприятий в эпизоотически активных природных очагах чумы, неизменно достигался значительный оздоровительный эффект на энзоотичных территориях. В 2026 г. обосновано сохранение низкого эпизоотического потенциала равнинных природных очагов чумы Прикаспия и Забайкалья. Разработан прогноз на развитие в 2026 г. локальных эпизоотий чумы на территории Карачаево-Черкесской, Кабардино-Балкарской республик, республик Алтай и Тыва.

53-63 158
Аннотация

Представлен обзор эпидемиологической обстановки по лихорадке Западного Нила (ЛЗН) в мире и Российской Федерации в 2025 г., дан прогноз на 2026 г. При оценке интенсивности эпидемического процесса в Российской Федерации в 2025 г. установлено снижение заболеваемости (145 случаев) в 3 раза относительно 2024 г. (440) и 1,3 раза – среднемноголетнего значения (183,2). Заболеваемость зарегистрирована в 22 субъектах, в том числе в четырех – впервые: в Республике Северная Осетия – Алания, Кировской и Курганской областях, Забайкальском крае. По сравнению с данными многолетних наблюдений в 2025 г. отмечено позднее начало эпидемического сезона, доминирование среди заболевших лиц женского пола, существенное увеличение удельного веса заражений вирусом Западного Нила (ВЗН) по месту постоянного проживания в городах. Территориальное распределение случаев, возрастная и социальная структура заболеваемости и клинических проявлений ЛЗН соответствовали среднемноголетним данным. В 2025 г. сохранилась тенденция увеличения объемов и территориального охвата мониторинговыми исследованиями: активное выявление случаев ЛЗН проведено в 68 субъектах (в 2024 г. – 62, среднемноголетний показатель – 44), эпизоотологический мониторинг – 86 (81 и 68 соответственно), изучение иммунной прослойки – 78 (69 и 47 соответственно). Энзоотичная циркуляция ВЗН подтверждена в 14 субъектах, впервые – в Тамбовской области. Доля положительных находок в зоолого-энтомологическом материале в 2025 г. составила 0,12 % (в 2024 г. – 0,17 %, среднемноголетний показатель – 0,18 %), что может свидетельствовать о снижении интенсивности эпизоотического процесса ЛЗН в России. В 2025 г. на территории европейской части страны установлена циркуляция ВЗН 2-го генотипа, в структуре популяции которого превалировал геновариант ABB.1.1. В предстоящий сезон в эпидемический процесс наиболее активно будут вовлечены субъекты Южного, Центрального и Приволжского федеральных округов. При обеспечении эффективного мониторинга заболеваемости в среднесрочной перспективе ожидается сохранение показателей заболеваемости на уровне среднемноголетних значений, в долгосрочной – рост заболеваемости.

ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

64-72 147
Аннотация

Широкое распространение хантавирусной инфекции с тенденцией к постоянному увеличению числа заболевших является актуальной проблемой практического здравоохранения во всем мире. Цель работы – анализ особенностей эпизоотолого-эпидемиологической ситуации по геморрагической лихорадке с почечным синдромом в Ростовской области. Материалы и методы. Эпизоотологический мониторинг в 2023–2024 гг. проведен на 23 административных территориях Ростовской области. Исследованы 1202 особи 14 видов мелких млекопитающих на наличие маркеров ортохантавирусов: в 2023 г. – 755, 2024 г. – 447. Определен уровень иммунной прослойки местного населения к ортохантавирусам методом ИФА. Результаты и обсуждение. За период исследования маркеры ортохантавирусов выявлены на семи административных территориях Ростовской области: в Красносулинском, Миллеровском, Каменском, Багаевском, Азовском, Орловском районах и окрестностях г. Ростова-на-Дону – в популяциях шести видов грызунов: домовой мыши, малой белозубки, малой лесной мыши, обыкновенной полевки, общественной полевки, серой крысы. Скрининговое изучение сывороток крови лиц, ранее не болевших ГЛПС, показало наличие иммуноглобулинов класса G в 2023 г. – 18,6 %, в 2024 г. – 3,3 %. Регулярные находки маркеров ортохантавирусов в популяциях мелких млекопитающих и ежегодное выявление серопозитивных проб среди условно здорового населения подтверждают существование полигостального природного очага и свидетельствуют о контактах населения с компонентами паразитарной системы.

73-79 91
Аннотация

Цель работы – сравнительное изучение композиционного состава препаратов мембранных везикул (outer membrane vesicles – OMV) токсигенного и атоксигенных штаммов Vibrio cholerae O1 El Tor и О139 серогрупп.

Материалы и методы. В работе использовали токсигенный и атоксигенные штаммы V. cholerae серогрупп О1 и О139, из которых были получены препараты OMV. Методом трансмиссионной электронной микроскопии изучали строение препаратов OMV. Полногеномное секвенирование ДНК проводили на платформе MiSeq и DNB-Seqg50. Компьютерный анализ полученных данных осуществляли с помощью программы SeqAnalayser версии 2.1. Для биоинформационного анализа использовали программы Exonerate версии 2.4.0 и SnapGene Viewer. Белковое профилирование проводили с помощью MALDI-TOF-масс-спектрометрии. Определение антигенных детерминант: холерного токсина и белков наружной мембраны (OmpT, OmpU) – методом иммуноферментного анализа. Ферментативные активности детектировали с использованием соответствующих сред и субстратов. Жирные кислоты детектировали методом газовой хромато-масс-спектрометрии.

Результаты и обсуждение. Проведен сравнительный анализ композиционного состава препаратов OMV, полученных из токсигенного и атоксигенных штаммов V. cholerae серогрупп О1 и О139. Выявлено отличие/сходство в композиционном составе препаратов OMV. По данным полногеномного секвенирования и биоинформационного анализа установлено наличие в составе препаратов OMV, полученных из штаммов с разным генотипом, фрагментов хромосом, содержащих различный набор генов и мобильных генетических элементов. OMV V. cholerae серогрупп О1 и О139 способны участвовать в сортинге и докинге содержимого клетки, в везидукции, способствуя эволюционным преобразованиям генома. OMV могут являться дополнительным фактором патогенности/адаптации/персистенции/конкурентоспособности возбудителя холеры.

80-89 94
Аннотация

Цель работы – анализ динамики эпидемического процесса и характеристика волн пандемии COVID-19 в десяти субъектах Сибирского и Дальневосточного федеральных округов (СФО и ДФО соответственно).

Материалы и методы. Проведен эпидемиологический анализ данных еженедельного мониторинга лабораторно подтвержденных случаев COVID-19, предоставленных управлениями Роспотребнадзора по десяти субъектам СФО и ДФО (республики Алтай, Бурятия, Тыва и Хакасия, Алтайский, Забайкальский и Красноярский края, Иркутская, Кемеровская и Томская области).

Результаты и обсуждение. Завоз новой коронавирусной инфекции из стран Западной Европы на территорию СФО и ДФО зарегистрирован в середине марта 2020 г. За время пандемии в десяти субъектах двух федеральных округов страны зарегистрировано 2 088 479 случаев заболевания COVID-19. Заболеваемость COVID-19 в десяти субъектах СФО и ДФО в период пандемии характеризовалась волнообразным течением эпидемического процесса. Описаны динамика эпидемического процесса и характеристика семи волн пандемии различной интенсивности и длительности. Наиболее выраженной стала пятая волна. Чаще болели лица старше 18 лет с преобладанием легких и среднетяжелых форм, преимущественным заражением в семейных очагах. Волнообразный характер заболеваемости связан с последовательной изменчивостью и сменой доминирующего геноварианта возбудителя SARS-CoV-2. Всемирной организацией здравоохранения объявлено о снятии режима чрезвычайной ситуации в области общественного здравоохранения, имеющей международное значение, на плато седьмой волны течения пандемии СOVID-19 в десяти субъектах СФО и ДФО.

90-98 77
Аннотация

В России эпидемическая ситуация по сибирской язве остается нестабильной, несмотря на достигнутые успехи в профилактике и лечении. Независимо от характера вспышки, эпидемиологическое расследование требует установления вероятного происхождения и генетического родства штамма, ее вызвавшего, что достигается при молекулярном типировании. Bacillus anthracis отличается высокой генетической мономорфностью, усложняющей молекулярное типирование. Вариант MLST, метод мультилокусного сиквенс-типирования генов вирулентности (MVLST) позволяет эффективно дифференцировать штаммы возбудителя. Цель работы – выбор оптимальной схемы MVLST для генетического типирования B. anthracis. Материалы и методы. Использовали полные геномы 49 штаммов B. anthracis. Для построения филограмм с алгоритмом UPGMA выявляли SNP в программе PhyloViz. Вирулентность белков оценивали и отбор кодируемых генов проводили с онлайн-ресурсом «VirulentPred: Prediction of prokariotic virulent protein». Определение индекса дискриминации D Хантера – Гастона проводили онлайн в программе Discriminatory Power Calculator. Результаты и обсуждение. MVLST-pXO1 включала пять генов: lef, cya, pagA, atxA, gerXC, – локализованных на плазмиде токсинообразования pXO1. Типирование по схеме MVLSTpXO1 49 штаммов позволило разделить их на 21 генотип (D=0,9209). Схема MVLST-pXO2 охватывала четыре структурных гена капсульного полипептида: capA, capB, capC, capD – и два регуляторных гена: acpA, acpB – плазмиды капсулообразования pXO2. Типирование по схеме MVLST-pXO2 разделило 49 штаммов на 14 генотипов (D=0,6675). Полученная схема MVLST-15 по сравнению с MVLST-19 обеспечивала более высокую дискриминирующую силу, так как разделяла 49 штаммов B. anthracis на 40 генотипов (D=0,9864), тогда как показатели MVLST-19 составляли соответственно 33 генотипа (D=0,9633). Результаты показывают, что оптимальной может быть схема MVLST-15, так как обеспечивает лучшую дискриминацию штаммов B. anthracis, используя меньший набор локусов при сохранении классической филогенетической структуры возбудителя сибирской язвы.

99-107 132
Аннотация

Краснодарский край – территория, сочетающая в себе разнообразные ландшафтно-географические условия и комфортный климат, что способствует формированию природных очагов инфекционных болезней. Высокая плотность населения, наличие рекреационных зон, развитое сельское хозяйство обусловливают высокий риск тесного контакта людей с переносчиками и резервуарами природно-очаговых инфекций, что требует постоянного контроля эпизоотолого-эпидемиологической ситуации для предупреждения массовой заболеваемости и определяет актуальность исследований в данном направлении. Цель работы – анализ эпизоотологоэпидемиологической обстановки по природно-очаговым инфекциям на территории Краснодарского края.

Материалы и методы. В работе использованы результаты ежегодного эпизоотолого-эпидемиологического мониторинга, представленные Управлением Роспотребнадзора по Краснодарскому краю, ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Краснодарском крае», ФКУЗ «Причерноморская противочумная станция» Роспотребнадзора, ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора. Построение векторных карт осуществлялось в программе ArcGIS 10.

Результаты и обсуждение. По результатам мониторинга за последние пять лет установлено, что эпизоотолого-эпидемиологическая обстановка по природно-очаговым болезням в Краснодарском крае характеризуется как неустойчивая. За исследуемый период ежегодно регистрировалось от 39 до 318 случаев. В группу наиболее актуальных входят: иксодовый клещевой боррелиоз, лихорадка Западного Нила, лептоспироз, геморрагическая лихорадка с почечным синдромом, туляремия. Установлено наличие сопряженных очагов инфекционных болезней, что является фактором, способным отрицательно влиять на развитие эпидемиологической ситуации на территориях их существования. Среди первоочередных задач эпидемиологического надзора за природно-очаговыми инфекциями в крае выделены эпизоотологический мониторинг, внедрение современных методов эпидемиологического анализа (ГИС, многоплановый мониторинг, геномное профилирование изучаемой территории).

108-115 92
Аннотация

Цель работы – филогеографический и эволюционный анализ штаммов Brucella melitensis генетической линии II, выделенных на территории Российской Федерации, в контексте изучения глобальной популяции вида.

Материалы и методы. В исследовании использовали 282 штамма B. melitensis из коллекции патогенных микроорганизмов ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора. Полногеномное секвенирование осуществляли с помощью секвенатора DNBSEQ G50RS (MGI, Китай) с использованием набора реагентов MGIEasy FAST FS DNA Library Prep Set V2.1 (MGI, Китай) по стандартному протоколу. Эволюционный и филогеографический анализ проводили на базе программного пакета BEAST v2.7.5.

Результаты и обсуждение. Установлено, что штаммы B. melitensis в Российской Федерации принадлежат к четырем субгенотипам генетической линии II, дивергировавшей предположительно в XVI в.: IIb, IIg, IIh и IIi. Единичные случаи выявления в России изолятов субгенотипов IIb и IIg указывают на завоз инфекции из стран Ближнего Востока. Субгенотип IIh распространен в Сибири, Монголии, Китае и Казахстане. Варианты наиболее представительного и генетически гетерогенного субгенотипа IIi циркулируют на обширной территории от Северного Кавказа до Северного Китая и, как правило, выделяются в ходе эпидемиологических расследований вспышек бруцеллеза в европейской части страны. Полученные результаты указывают на перспективу использования полногеномного SNP-анализа как эффективного инструмента для своевременного выявления неэндемичных или атипичных вариантов возбудителя бруцеллеза в ходе геномного профилирования отдельных регионов.

116-122 81
Аннотация

Цель исследования – генотипирование штаммов Francisella tularensis subsp. mediasiatica с использованием маркерных SNP на основе данных полногеномного секвенирования. Материалы и методы. В работе использовали 50 полных геномов (WGS) штаммов F. tularensis subsp. mediasiatica из базы данных NCBI и 25 геномов, секвенирование которых проведено специалистами ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора. Выделение отдельных кластеров на дендрограмме проводили при значении бутстреп-поддержки как минимум >90 % (при использовании 1000 репликаций). Результаты и обсуждение. На репрезентативной выборке из 75 геномов F. tularensis subsp. mediasiatica были отобраны 5251 SNP, встречающиеся минимум у двух штаммов. В ходе биоинформационного анализа исключены геномы с более чем 500 SNP в участках, не охваченных WGS. На основе филогенетического анализа построена дендрограмма и выделены 11 крупных кластеров, названных по географическим локациям ранних или доминирующих штаммов, при бутстреп-поддержке >90 % (1000 репликаций). Для типирования штаммов в кластерах определены «маркерные» SNP, характерные для каждого кластера и его дочерних групп, но отсутствующие у остальных. Разработана программа «SNP Genotyper» для автоматического определения генотипа штаммов на основе маркерных SNP. Проведено изучение генетической вариабельности F. tularensis subsp. mediasiatica различного происхождения методом анализа wgSNP. Выявлено генетическое разнообразие штаммов subsp. mediasiatica, выделенных на территориях Алтайского края (Российская Федерация) и Республики Казахстан. На основе маркерных SNP разработан алгоритм для оперативного анализа WGS-данных геномов F. tularensis subsp. mediasiatica. Разработанная методика определения генетических линий может стать полезным инструментом как для оперативного анализа при выделении свежих штаммов, определения филогенетического родства штаммов, изучения генетического разнообразия популяции, так и при проведении ретроспективных исследований.

123-128 80
Аннотация

В настоящее время большое внимание уделяется изучению механизмов адгезии патогенов к клеткам и тканям человека. Наряду со стандартными микробиологическими техниками с этой целью широко применяются современные биофизические методы, среди которых особое место занимает оптическая ловушка, позволяющая захватывать и перемещать отдельные бактериальные клетки с измерением силы связи между ними и целевыми молекулами. Цель работы состояла в оценке значимости коллагена и фибронектина в адгезии клеток Yersinia pseudotuberculosis O1b и вакцинного штамма Yersinia pestis EV НИИЭГ, выращенных при разной температуре, с использованием оптической ловушки. Материалы и методы. Бактерии, выращенные при двух температурах (+10 и +37 °С для клеток Y. pseudotuberculosis и +27 и +37 °С для клеток Y. pestis), захватывали лазерным лучом и пошагово подводили к стеклянным подложкам, обработанным целевыми белками. Спустя одну секунду после контакта клетку отводили в полуавтоматическом режиме с постоянной скоростью до наблюдения резкого скачка на хронограмме сигнала, величину которого пересчитывали в единицы силы. Различия между массивами данных определялись по средним и медианным силам, а также по результатам построения гистограмм распределения сил взаимодействия. Результаты и обсуждение. Показана значимость коллагена в адгезии бактерий Y. pseudotuberculosis, выращенных при +37 °С, но не при +10 °С. При работе с фибронектином не выявлено выраженных отличий между бактериями двух видов иерсиний при всех использованных температурных режимах их выращивания. Во всех случаях взаимодействие клеток иерсиний с коллагеном и фибронектином оказалось более прочным по сравнению с контролем (бычьим сывороточным альбумином): соответствующие значения силы связи составили 7,2, 8,1 и 2,0 пН для клеток 1b-10; 12,4, 7,6 и 4,7 пН для клеток 1b-37; 6,1, 6,6 и 4,4 пН для клеток EV-27; 7,4, 7,3 и 4,3 пН для клеток EV-37. Взаимодействие клеток иерсиний с обоими белками, вероятно, обусловлено физико-химическими свойствами поверхностных структур бактерий и компонентов соединительной ткани, а также условиями проведения экспериментов. Выявление механизмов таких взаимодействий требует постановки дополнительных опытов с использованием индивидуальных антигенов иерсиний, нанесенных на полистирольные микросферы. Использованные методические подходы могут быть востребованы при работе с другими патогенами.

129-136 134
Аннотация

Цель работы – использование климатических прогнозов, в том числе Межправительственной группы экспертов по изменению климата (МГЭИК), применительно к Республике Армения для оценки влияния климатических изменений на среду обитания и популяции основных резервуаров чумы и туляремии, а также на эпизоотический потенциал этих территорий; разработка модели экологической ниши природно-очагового инфекционного заболевания на примере очага туляремии в юго-восточной части Армении в современных условиях и прогноз состояния на 2040–2050 гг.

Материалы и методы. В работе использованы прогнозные сценарии изменений среднегодовых температур и осадков, литературные данные о влиянии изменения климата на очаги особо опасных инфекций, данные эпизоотологического обследования. Модель экологической ниши очага туляремии в юго-восточной части Армении разработана с применением искусственного интеллекта.

Результаты и обсуждение. Регистрируемые в настоящее время и прогнозируемые изменения климата Армении, характеризующиеся повышением среднегодовых температур и сокращением среднегодового количества осадков, приведут к увеличению количества засушливых регионов в республике. В связи с этим наблюдаемое расширение ареала малых песчанок на север предполагает риски возникновения эпизоотических проявлений чумы, вызванных циркуляцией штаммов, принадлежащих к основному подвиду Yersinia pestis ssp. pestis, в приграничных территориях Закавказского высокогорного и Приараксинского низкогорного природных очагов чумы. Изменяющиеся условия влияют на динамику ареала обыкновенной полевки, способствуя перемещению ее популяций на оптимальные участки обитания, расположенные на высотах от 2000 м над уровнем моря, в пределах которых, вероятно, возрастут эпизоотические и эпидемические риски для чумы и туляремии. Прогнозная модель экологической ниши очага туляремии, разработанная для юго-восточной части Армении, показала сокращение количества абиотических факторов, приемлемых для циркуляции возбудителя туляремии, что приведет к уменьшению интенсивности эпизоотических проявлений туляремии в 3–4 раза к 2040–2050 гг.

137-144 163
Аннотация

Исследование проводилось с целью выявления генетических маркеров (РНК, 16S рРНК или ДНК) возбудителей природно-очаговых инфекционных болезней бактериальной, вирусной и риккетсиозной природы в пробах иксодовых клещей, собранных на территории отдельных регионов Республики Конго. Материалы и методы. Наличие маркеров возбудителей лихорадки Ку, риккетсиозов, анаплазмозов, эрлихиозов, туляремии, Крымской геморрагической лихорадки, клещевого энцефалита определяли методом полимеразной цепной реакции с использованием диагностических препаратов российского производства. Исследовано 509 пулов эктопаразитов 5 видов, собранных в департаментах Пул, Кювет и окрестностях г. Браззавиль в 2025 г. Результаты и обсуждение. В материале от клещей обнаружены: РНК вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки (ККГЛ) (0,9 % от всех исследуемых проб), кДНК Borrelia burgdorferi s.l. (3,9 %), ДНК Coxiella burnetii (1,8 %) и риккетсии группы клещевых пятнистых лихорадок (45,2 %). Положительные результаты зарегистрированы в 264 пробах из 509 (51,9 %). Генетические маркеры возбудителей клещевого энцефалита, эрлихиоза, анаплазмоза и туляремии не обнаружены. Некоторые образцы, в которых были выявлены маркеры вируса ККГЛ, Rickettsia spp. и Coxiella burnetii в высокой концентрации, подвергали генетическому анализу методом высокопроизводительного секвенирования через нанопоры на платформе MinIon (Oxford Nanopore Technologies, Великобритания), в результате чего доказано их отношение к заявленным таксономическим группам. На основании генетического анализа последовательностей S-сегмента изолятов вируса ККГЛ продемонстрирована их принадлежность к генотипу «Африка-1» со степенью гомологии от 98,8 до 100 %. Полученные сведения показывают необходимость продолжения изучения распространения возбудителей природно-очаговых инфекционных болезней, передаваемых клещами, на территории Республики Конго и организации систематического эпизоотологического мониторинга.

145-151 92
Аннотация

В статье представлены результаты трех этапов сероэпидемиологического исследования населения на наличие антител к вирусу SARS-CoV-2.

Целью исследования была оценка коллективного иммунитета у населения Кыргызской Республики, стратифицированного по возрасту, полу и региону.

Материалы и методы. Материалом для исследования послужили образцы крови и персональные данные (анкеты) лиц, давших согласие на участие в исследовании.

Результаты и обсуждение. Результаты трех раундов исследования показали, что доля серопревалентных лиц на 1-м этапе составила 30,8 % (95 % ДИ 29,5–32,1), на 2-м этапе – 71,2 % (95 % ДИ 69,9– 72,5), на 3-м – 92,3 % (95 % ДИ 91,5–93,1). Высокий уровень коллективного иммунитета в популяции определялся коротким периодом и низким уровнем заболеваемости в четвертую волну пандемии по сравнению с мировыми показателями четвертой волны COVID-19. Неравномерное территориальное распределение серопревалентности наблюдалось на протяжении всех раундов исследования. Для всех трех фаз исследования характерно отсутствие симптомов коронавирусной инфекции у части серопозитивных лиц. Показатели наличия симптомов у серопозитивных лиц на втором и третьем этапах имели тенденцию к снижению. Процент серопозитивных к вирусу SARS-CoV-2 лиц среди детей был ниже, чем среди взрослого населения. Доля серопозитивных лиц ниже у мужчин по сравнению с женщинами. Анализ результатов сравнения парных сывороток, собранных через 8–20 месяцев, показал снижение уровня антител на 64,6 % по сравнению с результатом первой пробы, полученной через 1–2 месяца после болезни, в то же время повышенный уровень антител наблюдался у 35,4 % лиц.

152-157 75
Аннотация

Цель исследования – создание и изучение иммуногенных свойств штамма Francisella tularensis 15 НИИЭГ без гена sodC, кодирующего CuZn-зависимую супероксиддисмутазу. Материалы и методы. Делецию гена sodC из хромосомы туляремийного микроба проводили методом аллельного обмена с использованием суицидного плазмидного вектора pGM5. Модифицированный фрагмент хромосомы без структурной части гена sodC создавали объединением ампликонов, синтезированных методом ПЦР с помощью двух пар праймеров. Для переноса плазмид в бактерии Escherichia coli и F. tularensis использовали метод электропорации. Для иммунизации и заражения использовали мышей линии BALB/c. Для оценки реактогенности штаммов для мышей определяли средний вес животных в группах. Результаты и обсуждение. Методом аллельного обмена создан штамм F.  tularensis 15ΔsodC, в хромосоме которого отсутствовал фрагмент размером 545 п.о. со структурной частью гена sodC. Данный штамм не отличался по вирулентности и реактогенности от исходного штамма 15 НИИЭГ, но мыши, иммунизированные делетированным вариантом вакцинного штамма, легче переносили экспериментальную инфекцию, вызванную природным штаммом F. tularensis subsp. mediasiatica А-678. Сделано предположение, что удаление гена sodC может улучшить иммуногенные свойства штамма туляремийного микроба при целенаправленном конструировании перспективного кандидата для создания современной туляремийной вакцины со сниженной реактогенностью.

158-164 66
Аннотация

Цель работы – оценка результатов внешнего контроля качества исследований молекулярно-генетическим и иммунологическим методами на чуму в лабораториях противочумных учреждений с использованием шифрованных панелей. Материалы и методы. Участниками внешнего контроля качества являлись 19 противочумных учреждений. Оценивалось качество исследований, выполненных методами полимеразной цепной реакции (ПЦР) и флуоресцирующих антител (МФА), с использованием шифрованных панелей, которые содержали следующие образцы: для контроля исследований методом ПЦР – высушенные препараты ДНК Yersinia pestis EV НИИЭГ («положительные» образцы) и ДНК Yersinia pseudotuberculosis, Escherichia coli в концентрации не менее 1 нг, 15 % раствор сахарозы («отрицательные» пробы); для контроля индикации чумы с помощью МФА – фиксированные мазки штаммов тех же возбудителей (Y. pestis EV НИИЭГ, Y. pseudotuberculosis и E. coli) в концентрациях 1·106 м.к./мл. Результаты и обсуждение. Анализ результатов внешнего контроля качества деятельности лабораторий противочумных учреждений проведен за период с 2011 по 2025 г. Число ложноположительных проб при исследовании МФА составило 0,7 %, ложноотрицательных – 0,47 %; при индикации методом ПЦР количество ложноположительных случаев составило 1,27 %, ложноотрицательных – 0,36 %. Проведенный анализ позволил установить возможные ошибки при проведении исследований по индикации возбудителя чумы в лабораториях противочумных учреждений и пути их устранения. Для исключения возможных ошибок и недопущения получения неудовлетворительных результатов в лабораториях целесообразно осуществлять внутрилабораторный контроль качества исследований, своевременную закупку диагностических препаратов, оснащение необходимым оборудованием, соблюдать рекомендации производителей тест-систем в части использования адаптированных к методике приборов, подтверждать квалификацию персонала. Проведение процедуры внешнего контроля качества на чуму в противочумных учреждениях с применением шифрованных панелей образцов Y. pestis, имитирующих реальные биологические пробы, позволяет эффективно осуществлять контроль индикации возбудителя чумы, обеспечить качество лабораторных исследований и гарантировать достоверность получаемых результатов.

165-173 78
Аннотация

Цель работы – сравнительный анализ структуры генов, кодирующих регуляторные белки в штаммах геновариантов Vibrio cholerae О1 биовара Эль Тор, выделенных на эндемичных и неэндемичных по холере территориях в разные годы седьмой пандемии холеры, и их филогенетический анализ. Материалы и методы. Использовали нуклеотидные последовательности полных геномов 75 токсигенных геновариантов V. cholerae О1 Эль Тор с аллелями ctxB1 и ctxB7, представленных в NCBI GenBank, ENA, VGARus. Биоинформационный анализ проводили с применением алгоритма Blast (http://blast.ncbi), MEGA X. Филогенетический анализ осуществляли с использованием сервера REALPHY. Результаты и обсуждение. Изучена структура 13 локусов (toxT, aphA, aphB, luxO, luxT, gntR, hapR, lysR_vc2383, lysR_vc1617, hns, vieA, carR, carS). Установлено стабильное сохранение в геноме всех штаммов генов aphB и carS, у 99 % – toxT, aphA и luxT. У всех геновариантов присутствует измененный ген gntR (G565A), кодирующий белок, репрессирующий ферментацию глюконата. Большинство геновариантов имеют интактный ген hapR, в отличие от референтного штамма N16961, у которого в этом гене делетирован тимин в позиции 219. Некоторые зарубежные штаммы включают дополнительные мутации в данном гене. Выявлена высокая вариабельность гена luxO. Мутации в других регуляторных генах накапливались постепенно и стабильно сохранялись. При филогенетическом анализе все изученные штаммы, выделенные в разных эндемичных странах и завезенные в РФ и сопредельные страны, четко разделились на четыре кластера в соответствии со структурой регуляторных генов. Таким образом, высоковирулентные геноварианты, выделяемые в настоящее время на эндемичной территории и завозимые в РФ, имеют генотип hapR (insТ219), lysR_vc2383 (C110T), hns (G319A), lysR_vc1617 (A650C), vieA (C235T), carR (G265A).

174-181 78
Аннотация

ФКУН Российский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора является единственным производителем зарегистрированных на территории РФ медицинских изделий для фагодиагностики чумы и холеры. Основной стадией изготовления диагностических бактериофагов является их накопление в культуре штамма-продуцента, предполагающее использование питательных сред (ПС) на различной белковой основе. Исследователями отмечаются все более учащающиеся случаи нестандартности последних, что нередко приводит к ухудшению качественно-количественных показателей фаголизатов. Цель работы – исследование возможности применения пептона из фибрина в качестве альтернативной основы питательных сред на этапе накопления бактериофагов в производстве препаратов для фагодиагностики чумы и холеры. Материалы и методы. В качестве штаммов-продуцентов использовали Yersinia pestis EV НИИЭГ и специфичные к нему бактериофаги – диагностический Покровской и Л-413С; Vibrio cholerae cholerae O1 145 и V. cholerae El Tor O1 75М и специфичные к ним бактериофаги – классический (С) и эльтор (XII и XV) соответственно. Контроль активности и специфичности чумных бактериофагов, накопленных на экспериментальных ПС, проводили используя штаммы Y. pestis и Y. pseudotuberculosis I–VI серотипов. Контроль активности и специфичности холерных бактериофагов, накопленных на экспериментальных ПС, проводили используя соответствующие штаммы V. cholerae cholerae и V. cholerae El Tor O1. Состав жидких ПС на основе пептона из фибрина в зависимости от потребностей культивируемых микроорганизмов отличался по показателям: аминному азоту, содержанию кофакторов неорганической и органической природы, водородному показателю. Результаты и обсуждение. Применение пептона из фибрина в качестве основы ПС для накопления чумных (Покровской и Л-413С) и холерных (С, XII и XV) бактериофагов показало не уступающий или превосходящий результат в сравнении с контрольными питательными средами, нормируемыми производственными документами. Экспериментальные серии бактериофагов, в сравнении с коммерческими препаратами, показали соответствие требованиям нормативной документации.

КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ

182-185 141
Аннотация

Цель работы – установить инвазированность кровососущих комаров возбудителями дирофиляриоза на урбанизированных территориях Беларуси. Материалы и методы. Отлов самок кровососущих комаров проведен с мая по сентябрь 2021–2025 гг. на территории населенных пунктов трех областей Беларуси: Витебской, Могилевской, Гомельской. Собрано и исследовано 5039 экземпляров кровососущих комаров. Определение зараженности комаров возбудителями дирофиляриоза (Dirofilaria repens и D. immitis) проведено методом ПЦР в режиме реального времени. Показатель зараженности кровососущих комаров определен согласно методике расчета оценочного значения заражения. Результаты и обсуждение. На исследованных урбанизированных территориях Беларуси в 2021–2025 гг. обнаружено 23 вида кровососущих комаров из 5 родов (Aedes, Anopheles, Culex, Culiseta, Coquillettidia). Преобладающими по численности видами были представители рода Aedes: A. cantans (ИД 37,6) и A. sticticus (ИД 36,5). В качестве переносчиков возбудителей дирофиляриоза отмечены 11 видов кровососущих комаров (Aedes rossicus, A. cantans, A. cataphylla, A. excrucians, A. intrudens, A. riparius, A. sticticus, A. vexans, Anopheles claviger, A. maculipennis, Coquillettidia richiardii). Зараженность переносчиков рода Anopheles составила 12,8 %, рода Aedes – 1,0 %, рода Coquillettidia – 0,6 %. Общая зараженность переносчиков – 1,4 %. Инвазированность комаров D. repens – 1,3 %, D. immitis – 0,1 %. Индивидуальная зараженность кровососущих комаров варьировала от 0,3 % (Aedes intrudens) до 16,7 % (Anopheles maculipennis). ДНК дирофилярий в кровососущих комарах отмечалась с мая по август. Более высокая зараженность комаров возбудителями дирофиляриоза установлена в августе.

ПРАВИЛА ДЛЯ АВТОРОВ



Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.