Анализ заболеваемости бруцеллезом и молекулярно-генетическая характеристика популяции бруцелл на территории Российской Федерации

Представлены анализ заболеваемости бруцеллезом в России в 2013–2022 гг. и данные о генетическом разнообразии популяций Brucella melitensis и Brucella abortus, выделенных в России в 1939–2022 гг. В последние 10 лет эпидемиологическая ситуация в России характеризуется как неустойчивая на фоне стойкого неблагополучия по бруцеллезу крупного (КРС) и мелкого (МРС) рогатого скота. В период 2013–2022 (9 мес.) гг. зарегистрировано 4298 неблагополучных пунктов по бруцеллезу КРС (89164 больных животных) и 371 – по бруцеллезу МРС (13569). Наибольшее количество эпизоотических очагов бруцеллеза регистрировали в Северо-Кавказском и Южном федеральных округах. В 2013–2022 гг. в среднем ежегодно регистрировалось 327 случаев бруцеллеза среди людей, показатель заболеваемости на 100 тыс. населения – 0,24. До 70–90 % случаев бруцеллеза выявлено на юге европейской части страны. Отмечается тренд на ухудшение ситуации по бруцеллезу в Приволжском (Пензенская и Самарская области) и Центральном (Смоленская, Воронежская и Тульская области) федеральных округах. Имеется связь интенсивности эпидемических проявлений бруцеллеза с уровнем антропоургической энзоотичности территорий. В 2022 г. зарегистрировано 467 случаев бруцеллеза (0,32 на 100 тыс. населения), что превышает на 42,8 % среднегодовые значения за 10 лет. В 2023 г. можно прогнозировать некоторую стабилизацию уровня заболеваемости на 20–25 % выше средних многолетних величин. Количество людей, заболевших бруцеллезом, может находиться в диапазоне 380–410 случаев (0,26–0,28 на 100 тыс. населения). Результаты генотипирования штаммов B. melitensis указали на увеличение за последние 20–25 лет доли изолятов с MLVA-профилем, характерным для штаммов из энзоотичных по бруцеллезу стран Ближнего Востока и Северной Африки, что может свидетельствовать о завозе (заносе) с этих территорий в Россию инфекции с поголовьем овец, коз и/или биоматериалом от них.

1. Попова А.Ю., Куличенко А.Н., редакторы. 70 лет Ставропольскому научно-исследовательскому противочумному институту. Ставрополь: ООО «Дизайн-студия Б»; 2022. 232 с. [Электронный ресурс]. URL: https://snipchi.ru/updoc/book_stavnipchi_70years.pdf.

2. Онищенко Г.Г., Куличенко А.Н., редакторы. Бруцеллез. Современное состояние проблемы. Ставрополь: ООО «Губерния»; 2019. 336 c.

3. Пономаренко Д.Г., Скударева О.Н., Хачатурова А.А., Лукашевич Д.Е., Жаринова И.В., Даурова А.В., Германова А.Н., Логвиненко О.В., Ракитина Е.Л., Костюченко М.В., Манин Е.А., Малецкая О.В., Куличенко А.Н. Бруцеллез: тенденции развития ситуации в мире и прогноз на 2022 г. в Российской Федерации. Проблемы особо опасных инфекций. 2022; 2:36–45. DOI: 10.21055/0370-1069-2022-2-36-45.

4. Le Flèche P., Jacques I., Grayon M., Al Dahouk S., Bouchon P., Denoeud F., Nöckler K., Neubauer H., Guilloteau L.A., Vergnaud G. Evaluation and selection of tandem repeat loci for a Brucella MLVA typing assay. BMC Microbiol. 2006; 6:9. DOI: 10.1186/1471-2180-6-9.

5. Ma J.Y., Wang H., Zhang X.F., Xu L.Q., Hu G.Y., Jiang H., Zhao F., Zhao H.Y., Piao D.R., Qin Y.M., Cui B.Y., Lin G.H. MLVA and MLST typing of Brucella from Qinghai, China. Infect. Dis. Poverty. 2016; 5:26. DOI: 10.1186/s40249-016-0123-z.

6. MLVA bank for Microbes Genotyping. [Электронный ресурс]. URL: http://microbesgenotyping.i2bc.paris-saclay.fr/databases.

7. R Core Team (2020). R: A Language and Environment for Statistical Computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. [Электронный ресурс]. URL: https://www.r-project.org/.

8. Wickham H., Averick M., Bryan J., Chang W., D’Agostino McGowan L., François R., Grolemund G., Hayes A., Henry L., Hester J., Kuhn M., Pedersen T.L., Miller E., Bache S.M., Müller K., Ooms J., Robinson D., Seidel D.P., Spinu V., Takahashi K., Vaughan D., Wilke C., Woo K., Yutani H. Welcome to the tidyverse. JOSS. 2019; 4(43):1686. DOI: 10.21105/JOSS.01686.

9. Эпизоотическая ситуация в Российской Федерации 2022 (III квартал). [Электронный ресурс]. URL: https://fsvps.gov.ru/sites/default/files/files/iac/iac_3_kv.2022_goda.pdf.

10. Vergnaud G., Hauck Y., Christiany D., Daoud B., Pourcel C., Jacques I., Cloeckaert A., Zygmunt M.S. Genotypic expansion within the population structure of classical Brucella species revealed by MLVA16 typing of 1404 Brucella isolates from different animal and geographic origins, 1974–2006. Front. Microbiol. 2018; 9:1545. DOI: 10.3389/fmicb.2018.01545.

11. Wattam A.R., Foster J.T., Mane S.P., Beckstrom-Sternberg S.M., Beckstrom-Sternberg J.M., Dickerman A.W., Keim P., Pearson T., Shukla M., Ward D.V., Williams K.P., Sobral B.W., Tsolis R.M., Whatmore A.M., O’Callaghan D. Comparative phylogenomics and evolution of the Brucellae reveal a path to virulence. J. Bacteriol. 2014; 196(5):920–30. DOI: 10.1128/JB.01091-13.

12. Whatmore A.M., Koylass M.S., Muchowski J., Edwards- Smallbone J., Gopaul K.K., Perrett L.L. Extended multilocus sequence analysis to describe the global population structure of the genus Brucella: Phylogeography and relationship to biovars. Front. Microbiol. 2016; 7:2049. DOI: 10.3389/fmicb.2016.02049.

13. Хачатурова А.А., Пономаренко Д.Г., Ковалев Д.А., Германова А.Н., Лукашевич Д.Е., Русанова Д.В., Сердюк Н.С., Семенко О.В., Жиров А.М., Катунина Л.С., Куличенко А.Н. Анализ заболеваемости людей бруцеллезом и молекулярнобиологическая характеристика изолятов Brucella melitensis на длительно неблагополучных по бруцеллезу территориях юга европейской части России. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2022; 99(1):63–74. DOI: 10.36233/0372-9311-185.

14. Pisarenko S.V., Kovalev D.A., Volynkina A.S., Ponomarenko D.G., Rusanova D.V., Zharinova N.V., Khachaturova A.A., Tokareva L.E., Khvoynova I.G., Kulichenko A.N. Global evolution and phylogeography of Brucella melitensis strains. BMC Genomics. 2018; 19(1):353. DOI: 10.1186/s12864-018-4762-2.

15. Tan K.K., Tan Y.C., Chang L.Y., Lee K.W., Nore S.S., Yee W.Y., Mat Isa M.N., Jafar F.L., Hoh C.C., AbuBakar S. Full genome SNP-based phylogenetic analysis reveals the origin and global spread of Brucella melitensis. BMC Genomics. 2015; 16(1):93. DOI: 10.1186/s12864-015-1294-x.

16. Kovalev D.A., Ponomarenko D.G., Pisarenko S.V., Shapakov N.A., Khachaturova A.A., Serdyuk N.S., Bobrysheva O.V., Kulichenkо A.N. Phylogeny of Brucella abortus strains isolated in the Russian Federation. Asian Pac. J. Trop. Med. 2021; 14(7):323–9. DOI: 10.4103/1995-7645.320523.