Выявление генетических маркеров возбудителей природно-очаговых инфекционных болезней в пробах иксодовых клещей, собранных на территории Гвинейской Республики

В разные периоды в Западной Африке выявлена циркуляция достаточно широкого спектра возбудителей природно-очаговых инфекционных болезней, передающихся клещами: боррелии, риккетсии, коксиеллы, вирусы Крымской-Конго геморрагической лихорадки (ККГЛ), Бханджа, синего языка овец Найроби и др. В настоящее время эпидемиологическая и эпизоотологическая ситуация по природно-очаговым инфекционным болезням, складывающаяся на территории Гвинейской Республики, выяснена не до конца.

Цель работы – выявление генетических маркеров (РНК/ДНК) возбудителей природно-очаговых инфекционных болезней в пробах иксодовых клещей, собранных в Гвинейской Республике, и определение спектра патогенов, циркулирующих на территории различных ландшафтно-географических зон страны.

Материалы и методы. Для проведения исследований на территории всех ландшафтно-географических зон Гвинейской Республики были собраны 4695 экземпляров иксодовых клещей 11 видов. С учетом видовой принадлежности, пола, фазы развития, а также места сбора составлена панель из 1645 проб. Методами полимеразной цепной реакции (ПЦР) и полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) проведена детекция генетических маркеров вирусов Крымской-Конго геморрагической лихорадки и клещевого энцефалита, а также Borrelia burgdorferi s.l., Ehrlichia chaffeensis, Ehrlichia muris, Anaplasma phagocytophilum, Coxiella burnetii, риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки (КПЛ) и Francisella tularensis.

Результаты и обсуждение. В результате в суспензиях иксодовых клещей обнаружены: ДНК риккетсий группы КПЛ (25,6 % от всех исследуемых образцов), ДНК C. burnetii (6,2 %), кДНК B. burgdorferi s.l. (9,1 %) и РНК вируса ККГЛ (2,5 %). Перечисленный спектр возбудителей зарегистрирован во всех ландшафтно-географических зонах Гвинеи. Генетические маркеры возбудителей туляремии, анаплазмозов, эрлихиозов и клещевого энцефалита в настоящем исследовании не выявлены. Полученные результаты позволили уточнить возможный спектр болезней, передаваемых клещами, на территории Гвинейской Республики, определили необходимость дальнейшего изучения циркуляции возбудителей природно-очаговых инфекционных болезней в Западной Африке и проведения регулярного эпизоотологического мониторинга.

1. WHO. Promising progress on neglected tropical diseases in Africa. [Электронный ресурс]. URL: https://www.afro.who.int/news/promising-progress-neglected-tropical-diseases-africa (дата обращения 18.10.2023).

2. van Vuuren M., Penzhorn B.L. Geographic range of vector-borne infections and their vectors: the role of African wildlife. Rev. Sci. Tech. 2015; 34(1):139–49. DOI: 10.20506/rst.34.1.2350.

3. Ehounoud C.B., Fenollar F., Dahmani M., N’Guessan J.D., Raoult D., Mediannikov O. Bacterial arthropod-borne diseases in West Africa. Acta Trop. 2017; 171:124–37. DOI: 10.1016/j.actatropica.2017.03.029.

4. Бутенко А.М. Изучение циркуляции арбовирусов в Гвинейской Республике. Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 1996; 2:40–5.

5. Карташов М.Ю., Гладышева А.В., Найденова Е.В., Захаров К.С., Швалов А.Н., Кривошеина Е.И., Сеничкина А.М., Ба М.Б., Терновой В.А., Бумбали С., Локтев В.Б. Молекулярно-генетическая характеристика многокомпонентного флавиподобного вируса Kindia tick virus (Flaviviridae), обнаруженного в иксодовых клещах на территории Гвинейской Республики. Вопросы вирусологии. 2022; 67(6):487–95. DOI: 10.36233/0507-4088-145.

6. Ehounoud C.B., Yao K.P., Dahmani M., Achi Y.L., Amanzougaghene N., Kacou N’Douba A., N’Guessan J.D., Raoult D., Fenollar F., Mediannikov O. Multiple pathogens including potential new species in tick vectors in Côte d’Ivoire. PLoS Negl. Trop. Dis. 2016; 10(1):e0004367. DOI: 10.1371/journal.pntd.0004367.

7. Mediannikov O., Diatta G., Fenollar F., Sokhna C., Trape J.-F., Raoult D. Tick-borne rickettsioses, neglected emerging diseases in rural Senegal. PLoS Negl. Trop. Dis. 2010; 4(9):e821. DOI: 10.1371/journal.pntd.0000821.

8. Mediannikov O., Fenollar F., Socolovschi C., Diatta G., Bassene H., Molez J.-F., Sokhna Ch., Trape J.-F., Raoult D. Coxiella burnetii in humans and ticks in rural Senegal. PLoS Negl. Trop. Dis. 2010; 4(4):e654. DOI: 10.1371/journal.pntd.0000654.

9. Naidenova E.V., Zakharov K.S., Kartashov M.Y., Agafonov D.A., Senichkina A.M., Magassouba N’F., Nourdine I., Nassour A.A., Bah M.B., Kourouma A., Boumbali S., Boiro M.Y., Scherbakova S.A., Kutyrev V.V., Dedkov V.G. Prevalence of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in rural areas of Guinea. Ticks Tick Borne Dis. 2020; 11(5):101475. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2020.101475.

10. Cazorla C., Socolovschi C., Jensenius M., Parola P. Tickborne diseases: tick-borne spotted fever rickettsioses in Africa. Infect. Dis. Clin. North Am. 2008; 22(3):531–44. DOI: 10.1016/j.idc.2008.03.009.

11. Каливоги С., Буаро М.Е., Константинов О.К., Плотникова Л.Ф. Иммунная структура населения и домашних животных Гвинейской Республики в отношении риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки и лихорадки Ку. Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 2013; 1:28–30.

12. Walker A.R., Bouattour A., Camicas J.-L., Estrada-Peña A., Horak I.G., Latif A.A., Pegram R.G., Preston P.M. Ticks of Domestic Animals in Africa: a Guide to Identification of Species. Edinburgh: Bioscience Reports; 2014. 227 p.

13. Biggerstaff B. PooledInfRate, Version 4.0: An Excel®Add-In to Compute Infection Rates from Pooled Data. Centers for Disease Control and Prevention Fort Collins: Colorado. 2016. [Электронный ресурс]. URL: https://github.com/CDCgov/PooledInfRate (дата обращения 10.10.2023).

14. Konstantinov O.K. Les tiques de la famille Ixodidae comme réservoir d’arbovirus en République de Guinée. II. Les arbovirus. Revue Élev. Méd. Vét. Pays Trop. 1990; 43(1):15–22. DOI: 10.19182/remvt.8883.

15. Makenov M.T., Toure A.H., Korneev M.G., Sacko N., Porshakov A.M., Yakovlev S.A., Radyuk E.V., Zakharov K.S., Shipovalov A.V., Boumbaly S., Zhurenkova O.B., Grigoreva Y.E., Morozkin E.S., Fyodorova M.V., Boiro M.Y., Karan L.S. Rhipicephalus microplus and its vector-borne haemoparasites in Guinea: further species expansion in West Africa. Parasitol. Res. 2021; 120(5):1563–70. DOI: 10.1007/s00436-021-07122-x.

16. Бутенко А.М., Трусова И.Н. Заболеваемость Крымской геморрагической лихорадкой в странах Европы, Африки и Азии (1943–2012 гг.). Эпидемиология и инфекционные болезни. 2013; 5:46–8.

17. O’Hearn A.E., Voorhees M.A., Fetterer D.P., Wauquier N., Coomber M.R., Bangura J., Fair J.N., Gonzalez J.-P., Schoepp R.J. Serosurveillance of viral pathogens circulating in West Africa. Virol. J. 2016; 13(1):163. DOI: 10.1186/s12985-016-0621-4.

18. Papa A., Mirazimi A., Köksal I., Estrada-Pena A., Feldmann H. Recent advances in research on Crimean-Congo hemorrhagic fever. J. Clin. Virol. 2015; 64:137–43. DOI: 10.1016/j.jcv.2014.08.029.

19. Найденова Е.В., Захаров К.С., Карташов М.Ю., Агафонов Д.А., Бойко А.В., Касьян Ж.А., Сеничкина А.М., Никифоров К.А., Оглодин Е.Г., Шиповалов А.В., Дубинина А.А., Поршаков А.М., Nourdine I., Diallo M.G., Nassour A.A., Kourouma A., Drame F., Сафронов В.А., Лопатин А.А., Boumbali S., Kalivogui S., Boiro M.Y., Щербакова С.А., Кутырев В.В. Выявление маркеров вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки в пробах иксодовых клещей, собранных на территории Гвинейской Республики. Проблемы особо опасных инфекций. 2019; 2:93–8. DOI: 10.21055/0370-1069-2019-2-93-98.

20. Рудаков Н.В., Самойленко И.Е. Риккетсии и риккетсиозы группы клещевой пятнистой лихорадки. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2017; 2:43–8.

21. Jensenius M., Davis X., von Sonnenburg F., Schwartz E., Keystone J.S., Leder K., Lopéz-Véléz R., Caumes E., Cramer J.P., Chen L., Parola P; GeoSentinel Surveillance Network. Multicenter GeoSentinel analysis of rickettsial diseases in international travelers, 1996–2008. Emerg. Infect. Dis. 2009; 15(11):1791–8. DOI: 10.3201/eid1511.090677.

22. Tawana M., Onyiche T.E., Ramatla T., Mtshali S., Thekisoe O. Epidemiology of ticks and tick-borne pathogens in domestic ruminants across Southern African Development Community (SADC) Region from 1980 until 2021: A systematic review and meta-analysis. Pathogens. 2022; 11(8):929. DOI: 10.3390/pathogens11080929.

23. Dupont H.T., Cornet J.P., Raoult D. Identification of rickettsiae from ticks collected in the Central African Republic using the polymerase chain reaction. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1994; 50(3):373–80. DOI: 10.4269/ajtmh.1994.50.373.

24. Parola P., Inokuma H., Camicas J.L., Brouqui P., Raoult D. Detection and identification of spotted fever group Rickettsiae and Ehrlichiae in African ticks. Emerg. Infect. Dis. 2001; 7(6):1014–7. DOI: 10.3201/eid0706.010616.

25. Parola P., Paddock C.D., Raoult D. Tick-borne rickettsioses around the world: emerging diseases challenging old concepts. Clin. Microbiol. Rev. 2005; 18(4):719–56. DOI: 10.1128/CMR.18.4.719-756.2005.

26. Mediannikov O., Diatta G., Fenollar F., Sokhna C., Trape J.F., Raoult D. Tick-borne rickettsioses, neglected emerging diseases in rural Senegal. PLoS Negl. Trop. Dis. 2010; 4(9):e821. DOI: 10.1371/journal.pntd.0000821.

27. Pérez-Tanoira R., Ramos-Rincón J.M., Martín-Martín I., Prieto-Pérez L., Tefasmariam A., Tiziano G., Anda P., González-Martín-Niño R.M., Rodríguez-Vargas M., Górgolas M., Jado I. Molecular survey of Rickettsia spp., Anaplasma spp., Ehrlichia spp., Bartonella spp., and Borrelia spp. in fleas and lice in Ethiopia. Vector Borne Zoonotic Dis. 2020; 20(1):10–4. DOI: 10.1089/vbz.2019.2500.

28. Djiba M.L., Mediannikov O., Mbengue M., Thiongane Y., Molez J.-F., Seck M.T., Fenollar F., Raoult D., Ndiaye M. Survey of Anaplasmataceae bacteria in sheep from Senegal. Trop. Anim. Health Prod. 2013; 45(7):1557–61. DOI: 10.1007/s11250-013-0399-y.

29. Nakayima J., Hayashida K., Nakao R., Ishii A., Ogawa H., Nakamura I., Moonga L., Hang’ombe B.M., Mweene A.S., Thomas Y., Orba Y., Sawa H., Sugimoto C. Detection and characterization of zoonotic pathogens of free-ranging non-human primates from Zambia. Parasit. Vectors. 2014; 7:490. DOI: 10.1186/s13071-014-0490-x.

30. M’ghirbi Y., Bèji M., Oporto B., Khrouf F., Hurtado A., Bouattour A. Anaplasma marginale and A. phagocytophilum in cattle in Tunisia. Parasit. Vectors. 2016; 9(1):556. DOI: 10.1186/s13071-016-1840-7.

31. Trape J.F., Duplantier J.M., Bouganali H., Godeluck B., Legros F., Cornet J.P., Camicas J.L. Tick-borne borreliosis in West Africa. Lancet. 1991; 337(8739):473–5. DOI: 10.1016/0140-6736(91)93404-w.

32. Онищенко Г.Г., Кутырев В.В., редакторы. Специфическая индикация патогенных биологических агентов: Практическое руководство. 2-е изд., перераб. и доп. М.: Буква; 2014. 284 с.

33. Ghoneim N.H., Abdel-Moein K.A., Zaher H.M. Molecular detection of Francisella spp. among ticks attached to camels in Egypt. Vector Borne Zoonotic Dise. 2017; 17(6):384–7. DOI: 10.1089/vbz.2016.2100.

34. Szigeti A., Kreizinger Z., Hornok S., Abichu G., Gyuranecz M. Detection of Francisella-like endosymbiont in Hyalomma rufipes from Ethiopia. Ticks Tick Borne Dis. 2014; 5(6):818–20. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2014.06.002.

35. Mohamed S.E.R., Mubarak A.I., Alfarooq L.O. Francisella tularensis bacteremia: a case report from Sudan. Case Rep. Infect. Dis. 2012; 2012:405737. DOI: 10.1155/2012/405737.

36. Maurin M., Raoult D. Q fever. Clin. Microbiol. Rev. 1999; 12(4):518–53. DOI: 10.1128/CMR.12.4.518.

37. Vanderburg S., Rubach M.P., Halliday J.E., Cleaveland S., Reddy E.A., Crump J.A. Epidemiology of Coxiella burnetii infection in Africa: a One Health systematic review. PLoS Negl. Trop. Dis. 2014; 8(4):e2787. DOI: 10.1371/journal.pntd.0002787.

38. Панферова Ю.А. Молекулярные основы патогенности Coxiella burnetii. Инфекция и иммунитет. 2016; 6(1):7–24. DOI: 10.15789/2220-7619-2016-1-7-24.