Анализ особенностей эпидемиологической ситуации по холере в 2024 г. в мире, в Российской Федерации и прогноз ее развития на 2025 г.

Цель работы – анализ особенностей эпидемиологической ситуации по холере в мире и России в 2024 г.; прогноз на 2025 г. Результаты проактивного эпидемиологического надзора показали сохранение тенденции роста по линии тренда заболеваемости холерой в мире, несмотря на снижение этого показателя в 2024 г. (762 830 случаев заболеваний в 44 странах) по сравнению с 2023 г. (816 235 в 47 странах). Особенностью явился завоз из Танзании на о. Майотта полиантибиотикорезистентного штамма Vibrio cholerae О1 El Tor. Отмечена активность трудовой миграции в РФ из стран, неблагополучных по холере (11 686 иностранцев; 88,17 % – из Индии). Больные холерой (вибриононосители) в РФ не выявлены. Установлены особенности эпидситуации: в поверхностных водоемах выявлены два токсигенных штамма V. cholerae О1, подобных изолированному в 2023 г., и один токсигенный штамм НАГ, впервые зарегистрированный в РФ. Установлена принадлежность нетоксигенного штамма V. cholerae О1, вызвавшего случай острой кишечной инфекции (ОКИ), и водных штаммов О1, циркулирующих в России, к одному клону. Впервые от больного ОКИ изолирован нетоксигенный штамм V. cholerae О139. Отмечено увеличение числа нетоксигенных штаммов О1, выделенных из водных объектов (335 – в 2024 г., 52 – в 2023 г.), в основном за счет клонального комплекса (250 штаммов, Краснодарский край), распространенного посредством карстовых вод. Выявлены ОКИ, вызванные нетоксигенными НАГ-вибрионами, V. parahaemolyticus и V. fluvialis. Прогноз на 2025 г. включает: риски завоза холеры, в том числе вызванной антибиотикоустойчивыми штаммами; рост трудовой миграции из неблагополучных по холере стран; вероятность обнаружения в ООС токсигенных штаммов О1 и nonO1/nonO139; рост числа ОКИ, вызванных нетоксигенными холерными и другими патогенными вибрионами; возможно выявление внекишечных инфекций, увеличение в ООС числа нетоксигенных V. cholerae О1. Целесообразно более раннее начало (апрель) и позднее (октябрь) окончание мониторинговых исследований в РФ в 2025 г. на территориях I типа по эпидемическим проявлениям холеры.

1. Попова А.Ю., Носков А.К., Ежлова Е.Б., Кругликов В.Д., Монахова Е.В., Чемисова О.С., Лопатин А.А., Иванова С.М., Подойницына О.А., Водопьянов А.С., Левченко Д.А., Савина И.В. Эпидемиологическая ситуация по холере в Российской Федерации в 2023 г. и прогноз на 2024 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2024; (1):76–88. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-1-76-88.

2. Ali M., Nelson A.R., Lopez A.L., Sack D.A. Updated global burden of cholera in endemic countries. PLoS Negl. Trop. Dis. 2015; 9(6):e0003832. DOI: 10.1371/journal.pntd.0003832.

3. Cholera, 2015. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2016; 91(38):433–40. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/250142/WER9138.pdf?sequence=1.

4. Cholera, 2016. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2017; 92(36):521– 36. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/258910/WER9236.pdf?sequence=1.

5. Cholera, 2017. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2018; 93(38):489– 97. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/274654/WER9338.pdf?ua=1.

6. Cholera, 2018. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2019; 94(48):561– 80. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/274654/WER9448.pdf?ua=1.

7. Cholera, 2019. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2020; 95(37):441–8. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/334241/WER9537-eng-fre.pdf?ua=1.

8. Cholera, 2020. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2021; 96(37):445–60. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/345267/WER9637-eng-fre.pdf.

9. Cholera, 2021. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2022; 97(37):453– 64. [Электронный ресурс]. URL: http://iris.who.int/bitstream/handle/10665/362852/WER9737-eng-fre.pdf.

10. Cholera, 2022. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2023; 98(38):431–52. [Электронный ресурс]. URL: http://iris.who.int/bitstream/handle/10665/372986/WER9838-eng-fre.pdf.

11. Cholera, 2023. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2024; 98(36):481–94. [Электронный ресурс]. URL: http://iris.who.int/bitstream/handle/10665/378714/WER9936-eng-fre.pdf (дата обращения 20.09.2024).

12. Data show marked increase in annual cholera deaths. WHO [EN/FR/ZH]. [Электронный ресурс]. URL: https://www.who.int/news/item/04-09-2024-data-show-marked-increase-in-annual-cholera-deaths (дата обращения 06.09.2024).

13. Communicable disease threats report, 17–23 December 2023, week 51. [Электронный ресурс]. URL: https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/communicable-disease-threats-report17-23-december-2023-week-51.

14. PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update (19): Africa (West Africa). WAHOO. ArchiveNumber: 20240512.8716469. [Электронный ресурс]. URL: https://promedmail.org/promedpost/?id=8716469 (дата обращения 13.05.2024).

15. Global Cholera and Acute Watery Diarrhoea (AWD) Dashboard. [Электронный ресурс]. URL: https://who-globalcholera-and-awd-dashboard-1-who.hub.arcgis.com/ (дата обращения 23.12.2024).

16. Ng Q.X., De Deyn M.L.Z.Q., Loke W., Yeo W.S. Yemen’s cholera epidemic is a one health issue. J. Prev. Med. Public Health. 2020; 53(4):289–92. DOI: 10.3961/jpmph.20.154.

17. Yemen reports the highest burden of cholera globally [EN/ AR]. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/yemen/yemen-reports-highest-burden-cholera-globally-enar (дата обращения 24.12.2024).

18. UNICEF Afghanistan Humanitarian Situation Report. No. 10, 1–31 October 2024. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/afghanistan/unicef-afghanistan-humanitariansituation-report-no-10-1-31-october-2024 (дата обращения 21.11.2024).

19. Africa CDC Weekly Event Based Surveillance Report, December 2024. [Электронный ресурс]. URL: https://africacdc.org/download/africa-cdc-weekly-event-based-surveillance-reportdecember-2024/ (дата обращения 18.12.2024).

20. Décès communautaires de cas suspects de choléra (ACT_ DES_15092024). [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/haiti/deces-communautaires-de-cas-suspects-de-choleraactdes15092024 (дата обращения 10.12.2024).

21. Haiti_Factsheet: MSNA Haïti 2024: Artibonite – juillet 2024. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/haiti/factsheet-msna-haiti-2024-artibonite-juillet-2024 (дата обращения 16.12.2024).

22. PAHO urges protection of medical facilities and services in Haiti to ensure continued access amid escalating conflict. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/haiti/paho-urges-protection-medical-facilities-and-services-haiti-ensurecontinued-access-amid-escalating-conflict (дата обращения 24.12.2024).

23. Communicable disease threats report. Week 11, 10–16 March 2024. [Электронный ресурс]. URL: https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/communicable-disease-threatsreport-10-16-march-2024-week-11 (дата обращения 18.03.2024).

24. Martins-Filho P.R., Alves Dos Santos C. Potential re-emergence of cholera in Brazil. Lancet Reg. Health. Am. 2024; 34:100767. DOI: 10.1016/j.lana.2024.100767.

25. PRO/PORT> Colera – Brasil (BA), caso confirmado, autóctone, fonte de infecção desconhecida. Archive Number: 20240421.8716081. [Электронный ресурс]. URL: https://promedmail.org/promed-post/?id=8716081 (дата обращения 22.04.2024).

26. Янович Е.Г., Москвитина Э.А. Эпидемиологические риски: значение при районировании административных территорий и в активизации эпидемического процесса при инфекционных болезнях. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2019; 18(6):81–9. DOI: 10.31631/2073-3046-2019-18-6-81-89.

27. PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update (18): France (MT) fatal. Archive Number: 20240512.8716458. [Электронный ресурс]. URL: https://promedmail.org/promedpost/?id=8716458 (дата обращения 13.05.2024).

28. Газета.ru: Обнаружен штамм холеры, устойчивый к 10 антибиотикам. [Электронный ресурс]. URL: https://www.gazeta.ru/science/news/2024/12/17/24644546.shtml (дата обращения 17.12.2024).

29. Rouard C., Collet L., Njamkepo E., Jenkin C., Sacheli R., Benoit-Cattin T., Figoni J., Weill F.-X. Long-distance spread of a highly drug-resistant epidemic cholera. N. Engl. J. Med. 2024; 391(23):2271–3. DOI: 10.1056/NEJMc2408761.

30. Lassalle F., Al-Shalali S., Al-Hakimi M., Njamkepo E., Bashir I.M., Dorman M.J., Rauzier J., Blackwell G.A., Taylor-Brown A., Beale M.A., Cazares A., Al-Somainy A.A., Al-Mahbashi A., Almoayed K., Aldawla M., Al-Harazi A., Quilici M.L., Weill F.X., Dhabaan G., Thomson N.R. Genomic epidemiology reveals multidrug resistant plasmid spread between Vibrio cholerae lineages in Yemen. Nat. Microbiol. 2023; 8(10):1787–98. DOI: 10.1038/s41564-023-01472-1.

31. Ranjbar R., Sadeghy J., Shokri Moghadam M., Bakhshi B. Multi-locus variable number tandem repeat analysis of Vibrio cholerae isolates from 2012 to 2013 cholera outbreaks in Iran. Microb. Pathog. 2016; (97):84–8. DOI: 10.1016/j.micpath.2016.05.023.

32. Bhattacharya D., Dey S., Roy S., Parande M.V., Telsang M., Seem M.H., Parande A.V., Mantur B.G. Multidrug-resistant Vibrio cholerae O1 was responsible for a cholera outbreak in 2013 in Bagalkot, North Karnataka. Jpn. J. Infect. Dis. 2015; 68(4):347–50. DOI: 10.7883/yoken.JJID.2014.257.

33. Wang R., Yu D., Yue J., Kan B. Variations in SXT elements in epidemic Vibrio cholerae O1 El Tor strains in China. Sci. Rep. 2016; 6:22733. DOI: 10.1038/srep22733.

34. Eibach D., Herrera-León S., Gil H., Hogan B., Ehlkes L., Adjabeng M., Kreuels B., Nagel M., Opare D., Fobil J.N., May J. Molecular epidemiology and antibiotic susceptibility of Vibrio cholerae associated with a large cholera outbreak in Ghana in 2014. PLoS Negl. Trop. Dis. 2016; 10(5):e0004751. DOI: 10.1371/journal. pntd.0004751.

35. Irenge L.M., Ambroise J., Mitangala P.N., Bearzatto B., Kabangwa R.K.S., Duran J.F., Gala J.L. Genomic analysis of pathogenic isolates of Vibrio cholerae from eastern Democratic Republic of the Congo (2014–2017). PLoS Negl. Trop. Dis. 2020; 14(4):e0007642. DOI: 10.1371/journal.pntd.0007642.

36. Mashe T., Domman D., Tarupiwa A., Manangazira P., Phiri I., Masunda K., Chonzi P., Njamkepo E., Ramudzulu M., MtapuriZinyowera S., Smith A.M., Weill F.X. Highly resistant cholera outbreak strain in Zimbabwe. N. Engl. J. Med. 2020; 383(7):687–9. DOI: 10.1056/NEJMc2004773.

37. PRO/RUS> Холера (завозной случай) – Республика Казахстан (Алматы). Archive Number: 20240405.8715805. [Электронный ресурс]. URL: https://promedmail.org/promedpost/?id=8715805 (дата обращения 09.04.2024).

38. PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update (34): Estonia ex Azerbaijan, RFI. Archive Number: 20240724.8717738. Published Date: 2024-07-25. [Электронный ресурс]. URL: https://promedmail.org/promed-post/?id=8717738 (дата обращения 25.07.2024).

39. PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update (50): Bulgaria ex India. Archive Number: 20240915.8718795. [Электронный ресурс]. URL: https://www.stiripesurse.ro/alertain-bulgaria-a-fost-inregistrat-primul-caz-de-holera-dupa-103-ani_3433335.html#google_vignette (дата обращения 16.09.2024).

40. Фазылов В.Х., Баширова Д.К., Малышева Л.М., Зиатдинов В.Б., Нестерова Д.Ф., Малова А.А., Таирова Г.А. Клинико-эпидемиологическая характеристика вспышки холеры в Казани. Казанский медицинский журнал. 2003; 84(2):150–1.

41. Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю.М., Водопьянов С.О., Романова Л.В., Черепахина И.Я., Сучков И.Ю., Дуванова О.В., Шишияну М.В. Мультилокусное VNTR-типирование культур холерных вибрионов, выделенных в г. Казань во время вспышки холеры летом 2001 г. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2003; (6):11–5.

42. Крицкий А.А., Смирнова Н.И., Каляева Т.Б., Оброткина Н.Ф., Грачева И.В., Катышев А.Д., Кутырев В.В. Сравнительный анализ молекулярно-генетических свойств нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae O1 биовара Эль Тор, изолированных в России и на эндемичных по холере территориях. Проблемы особо опасных инфекций. 2021; (3):72–82. DOI: 10.21055/0370-1069-2021-3-72-82.

43. Миронова Л.В., Бочалгин Н.О., Гладких А.С., Феранчук С.И., Пономарева А.С., Балахонов С.В. Филогенетическое положение и особенности структуры геномов ctxAB–tcpA+ Vibrio cholerae из поверхностных водоемов на неэндемичной по холере территории. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; (1):115–23. DOI: 10.21055/0370-1069-2020-1-115-123.

44. Esteves K., Mosser T., Aujoulat F., Hervio-Heath D., Monfort P., Jumas-Bilak E. Highly diverse recombining populations of Vibrio cholerae and Vibrio parahaemolyticus in French Mediterranean coastal lagoons. Front. Microbiol. 2015; 6:708. DOI:10.3389/fmicb.2015.00708.

45. Kirchberger P.C., Orata F.D., Barlow E.J., Kauffman K.M., Case R.J., Polz M.F., Boucher Y. A small number of phylogenetically distinct clonal complexes dominate a coastal Vibrio cholerae population. Appl. Environ. Microbiol. 2016; 82(18):5576–86. DOI: 10.1128/AEM.01177-16.

46. Chowdhury F., Mather A.E., Begum Y.A., Asaduzzaman M., Baby N., Sharmin S., Biswas R., Uddin M.I., LaRocque R.C., Harris J.B., Calderwood S.B., Ryan E.T.,. Clemens J.D., Thomson N.R., Qadri F. Vibrio cholerae serogroup O139: isolation from cholera patients and asymptomatic household family members in Bangladesh between 2013 and 2014. PLoS Negl. Trop. Dis. 2015; 9(11):e0004183. DOI: 10.1371/journal.pntd.0004183.

47. Dorman M.J., Domman D., Uddin M.I., Sharmin S., Afrad M.H., Begum Y.A., Qadri F., Thomson N.R. High quality reference genomes for toxigenic and non-toxigenic Vibrio cholerae serogroup O139. Sci. Rep. 2019; 9(1):5865. DOI: 10.1038/s41598-019-41883-x.

48. Schirmeister F., Dieckmann R., Bechlars S., Bier N., Faruque S.M., Strauch E. Genetic and phenotypic analysis of Vibrio cholerae non-O1, non-O139 isolated from German and Austrian patients. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2014; 33(5):767–78. DOI: 10.1007s10096-013-2011-9.

49. Kechker P., Senderovich Y., Ken-Dror S., Laviad-Shitrit S., Arakawa E., Halpern M. Otitis media caused by V. cholerae O100: a case report and review of the literature. Front. Microbiol. 2017; 8:1619. DOI: 10.3389/fmicb.2017.01619.

50. Van Bonn S.M., Schraven S.P., Schuldt T., Heimesaat M.M., Mlynski R., Warnke P.C. Chronic otitis media following infection by non-O1/non-O139 Vibrio cholerae: a case report and review of the literature. Eur. J. Microbiol. Immunol. (Bp). 2020; 10(3):186–91. DOI: 10.1556/1886.2020.0001310.1556/1886.2020.00013.

51. Chowdhury G., Joshi S., Bhattacharya S., Sekar U., Birajdar B., Bhattacharyya A., Shinoda S., Ramamurthy T. Extraintestinal infections caused by non-toxigenic Vibrio cholerae non-O1/non-O139. Front. Microbiol. 2016; 7:144. DOI: 10.3389/fmicb.2016.00144.

52. Li M., Kotetishvili M., Chen Y., Sozhamannan S. Comparative genomic analyses of the vibrio pathogenicity island and cholera toxin prophage regions in nonepidemic serogroup strains of Vibrio cholerae. Appl. Environ. Microbiol. 2003; 69(3):1728–38. DOI: 10.1128/AEM.69.3.1728-1738.2003.

53. Olsvik O., Wahlberg J., Petterson B., Uhlén M., Popovic T., Wachsmuth I.K., Fields P.I. Use of automated sequencing of polymerase chain reaction-generated amplicons to identify three types of cholera toxin subunit B in Vibrio cholerae O1 strains. J. Clin. Microbiol. 1993; 31(1):22–5. DOI: 10.1128/jcm.31.1.22-25.1993.

54. Raychoudhuri A., Mukherjee P., Ramamurthy T., Nandy R.K., Takeda Y., Nair G.B., Mukhopadhyay A.K. Genetic analysis of CTX prophages with special reference to ctxB and rstR alleles of Vibrio cholerae O139 strains isolated from Kolkata over a decade. FEMS Microbiol. Lett. 2010; 303(2):107–15. DOI: 10.1111/j.15746968.2009.01856.x.

55. Ерошенко Г.А., Краснов Я.М., Фадеева А.В., Одиноков Г.Н., Кутырев В.В. Генетическая характеристика токсигенных штаммов Vibrio cholerae не О1/не О139 из Средней Азии. Генетика. 2013; 49(10):1165–74. DOI: 10.7868/S0016675813100032.

56. Carpenter M.R., Kalburge S.S., Borowski J.D., Peters M.C., Colwell R.R., Boyd E.F. CRISPR-Cas and contact-dependent secretion systems present on excisable pathogenicity islands with conserved recombination modules. J. Bacteriol. 2017; 199:e00842-16. DOI: 10.1128/JB.00842-16.

57. Монахова Е.В., Архангельская И.В., Титова С.В., Писанов Р.В. MSHA-подобные пили нетоксигенных штаммов холерных вибрионов. Проблемы особо опасных инфекций. 2019; (3):75–80. (Англ. яз.). DOI: 10.21055/0370-1069-2019-3-75-80.

58. Murase K., Arakawa E., Izumiya H., Iguchi A., Takemura T., Kikuchi T., Nakagawa I., Thomson N.R., Ohnishi M., Morita M.Genomic dissection of the Vibrio cholerae O-serogroup global reference strains: reassessing our view of diversity and plasticity between two chromosomes. Microb. Genom. 2022; 8(8):mgen000860. DOI: 10.1099/mgen.0.000860.

59. Onifade T.J.M., Hutchinson R., Van Zile K., Bodager D., Baker R., Blackmore C. Toxin producing Vibrio cholerae O75 outbreak, United States, March to April 2011. Euro Surveill. 2011; 16(20):19870.

60. Takahashi E., Ochi S., Mizuno T., Morita D., Morita M., Ohnishi M., Koley H., Dutta M., Chowdhury G., Mukhopadhyay A.K., Dutta S., Miyoshi S.I., Okamoto K. Virulence of cholera toxin gene-positive Vibrio cholerae non-O1/non-O139 strains isolated from environmental water in Kolkata, India. Front. Microbiol. 2021;12:726273. DOI: 10.3389/fmicb.2021.726273.