Идентификация и внутривидовое типирование штаммов чумного микроба с определением их потенциальной вирулентности методом ПЦР
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2011-2(108)-36-41
Аннотация
Разработан способ идентификации и внутривидового типирования штаммов чумного микроба с определением их потенциальной вирулентности. Показана возможность внутривидовой дифференциации и определения очаговой принадлежности изученных штаммов чумного микроба в монолокусной VNTR-ПЦР и выявления основных детерминант вирулентности (области пигментации хромосомы и гены плазмиды кальцийзависимости) в мультиплексной ПЦР.
Ключевые слова
возбудитель чумы,
генетическое типирование,
VNTR-анализ,
внутривидовые различия,
детерминанты вирулентности
616.981.452:576.8.097.21
Об авторах
А. В. Гаева
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Е. Г. Булгакова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
И. Ю. Сухоносов
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Л. В. Анисимова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Л. А. Новичкова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
В. В. Кутырев
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Список литературы
1. Онищенко Г.Г., Кутырев В.В., редакторы. Природные очаги чумы Кавказа, Прикаспия, Средней Азии и Сибири. М.; 2004. 192 с.
2. Савостина Е.П., Попов Ю.А., Каштанова Т.Н., Яшечкин Ю.И. Анализ геномного полиморфизма типовых и атипичных штаммов возбудителя чумы с использованием полимеразной цепной реакции с универсальными праймерами. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2004; 1:22-6.
3. Klevytska A.M., Price L.B., Schupp J.M., Worsham P., Wong J., Keim P. Identification and characterization of Variable-Number Tandem Repeats in the Yersinia pestis genome. J. Clin. Microbiol. 2001; 39(9):3179-85.
4. Li Y., Cui Y., Hauck Y., Platonov M., Dai E., Song Y., Guo Zh., Pourcel C., Dentovskaya S., Anisimov A., Yang R., Vergnaud G. Genotyping and phylogenetic analysis of Yersinia pestis by MLVA: insights into the worldwide expansion of Central Asia plague foci. PloS ONE. 2009; 4(6):e6000.
5. Lowell J.L., Wagner D.M., Atshabar B., Antolin M.F., Vogler A.J., Keim P., Chu M.C., Gage K.L. Identifying sources of human exposure to plague. J. Clin. Microbiol. 2005; 43:650-6.
6. Portnoy D.A., Wolf-Watz H., Bolin I., Beeder A.B., Falkow S. Characterization of common virulence plasmids in Yersinia species and their role in expression of outer membrane proteins. Infect. Immun. 1984; 43:108-14.
7. Pourcel C., Andre-Mazeaud F., Neubauer H., Ramisse F., Vergnaud G. Tandem repeats analysis for the high resolution phylogenetic analysis of Yersinia pestis. BMC Microbiol. 2004; 4:22.
8. Zhou D., Tong Z., Song Y., Han Y., Pei D., Pang X., Zhai J., Li M., Cui B., Qi Z., Jin L., Dai R., Du Z., Wang J., Guo Z., Wang J., Huang P., Yang R. Genetics of metabolic variations between Yersinia pestis biovars and the proposal of a new biovar, microtus. J. Bacteriol. 2004; 186 (15):5147-52.
Рецензия
Для цитирования:
Гаева А.В., Булгакова Е.Г., Сухоносов И.Ю., Анисимова Л.В., Новичкова Л.А., Кутырев В.В. Идентификация и внутривидовое типирование штаммов чумного микроба с определением их потенциальной вирулентности методом ПЦР. Проблемы особо опасных инфекций. 2011;(2(108)):36-41. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2011-2(108)-36-41
For citation:
Gaeva A.V., Boolgakova E.G., Sukhonosov I.Yu., Anisimova L.V., Novichkova L.A., Kutyrev V.V. Identification and Intraspecific Typing of Plague Microbe Strains with Their Potential Virulence Determination Using PCR. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2011;(2(108)):36-41. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2011-2(108)-36-41
Просмотров: 557
Послать статью по эл. почте 