Издательскую деятельность Российский научно-исследовательский противочумный институт "Микроб" осуществляет с 1922 г. До 1941 г. выпускался журнал «Вестник микробиологии, эпидемиологии и паразитологии». В дальнейшем издавались тематические сборники научных трудов противочумных учреждений страны. Журнал "Проблемы особо опасных инфекций" издается с 1968 г. С 2001 г. входит в Перечень ведущих рецензируемых научных журналов и изданий Высшей аттестационной комиссии.