Preview

Проблемы особо опасных инфекций

Расширенный поиск

Современное состояние классификации некоторых патогенных представителей родов Bacillus, Brucella, Burkholderia, Francisella, Vibrio, Yersinia

https://doi.org/10.21055/0370-1069-2009-1(99)-42-49

Полный текст:

Аннотация

В работе рассмотрены современные принципы классификации прокариот, определение и границы прокариотического вида как единицы классификации и идентификации, критерии законности научных названий микроорганизмов. Прослежены основные изменения в классификации некоторых патогенных представителей родов Bacillus, Brucella, Burkholderia, Francisella, Vibrio, Yersinia, в первую очередь патогенов I-II групп, после выхода в 1980 г. Одобренных списков названий бактерий. Рассмотрены перспективы развития и совершенствования прокариотической классификации, основанной на филогении 16S рРНК.

Об авторах

И. В. Грачева
ФГУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46


Т. Б. Караваева
ФГУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46


Т. К. Меркулова
ФГУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46


О. П. Плотников
ФГУЗ «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов
Россия
410005, Саратов, ул. Университетская, 46


Список литературы

1. Блохина И.Н., Леванова Г.Ф., Антонов А.С. Систематика бактерий (с основами геносистематики). Нижний Новгород; 1992. 170 с.

2. Головлев Е.Л. Микробиология. 1998; 67(2):281-6.

3. Домарадский И.В. Чума. М.: Медицина; 1998. 175 с.

4. Изменения в таксономии и номенклатуре бактерий. Клин. микробиол., антимикроб. химиотер. 2004; 6(1):4-9.

5. Международный кодекс номенклатуры бактерий. М.; 1978. 207 с.

6. Одобренные списки названий бактерий. Ереван; 1982. 420 с.

7. Олсуфьев Н.Г., Мещерякова И.С. Внутривидовая таксономия возбудителя туляремии Francisella tularensis McCoy et Chapin. Журн. гигиены, эпидемиол., микробиол. и иммунол. 1982; 26(3):281-91.

8. Определитель бактерий Берджи. 9-е изд. М.; 1997. 799 с.

9. Романовская В.А., Рокитко П.В. Второе издание «Bergey's Manual of Systematic Bacteriology». Мiкробiол. журн. 2006; 68(3):72-85.

10. Ряпис Л.А., Беляков В.Д. Бактериальные виды и их структура. Журн. микробиол, эпидемиол. и иммунобиол. 1997; 5:110-4.

11. Ряпис Л.А. Концепция бактериального вида и эволюция генома прокариот. Там же. 2006; 6:97-101.

12. Achtman M., Zurth K., Morelli G. et al. Yersinia pestis, the cause of plague, is a recently emerged clone of Yersinia pseudotuberculosis. Proc. Natl. Acad. Sci USA. 1999; 96:14043-8.

13. Barns S.M., Grow C.C., Okinaka R.T. et al. Detection of diverse new Francisella-like bacteria in environmental samples Appl. Environ. Microbiol. 2005; 71(9):5494-5500.

14. Bercovier H., Molaret H., Alonso J. et al. Intra-and interspecies relatedness of Yersinia pestis by DNA hybridization and its relationship to Yersinia pseudotuberculosis. Curr. Microbiol. 1980; 4(4):225-9.

15. Cohan F.M. Towards a conceptual and operational union of bacterial systematics, ecology, and evolution. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 2006; 361(1475):1985-96.

16. Cohan F.M., Perry E.B. A systematics for discovering the fundamental units of bacterial diversity. Current Biology. 2007; 17(10):R373-86.

17. Definitions and abbreviations. Available from:http://www.bacterio.cict.fr.

18. List of bacterial names with standing in nomenclature Available from:http://www.bacterio.cict.fr.

19. Euzeby J.P. Definitions d'une genomospecies et d'une espece bacterienne. Available from:http://www.bacterio.cict.fr.

20. Forsman M., Sandstrom G., Sjostedt A. Analysis of 16S ribosomal DNA sequences of Francisella strains and utilization for determination of the phylogeny of the genus and for identification of strains by PCR. Int. J. Syst. Bacteriol. 1994; 44(1):38-46.

21. Gevers D., Dawyndt P., Vandamme P. et al. Stepping stones towards a new prokaryotic taxonomy. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 2006; 361(1475):1911-6.

22. Gierczyński R., Golubov A., Neubauer H. et al. Development of multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis for Yersinia enterocolitica subsp. palearctica and its application to bioserogroup 4/O3 subtyping. J. Clin. Microbiol. 2007; 45(8)2508-15.

23. Godfroid J., Cloeckaert A., Liautard J.-P. et al. From the discovery of the Malta fever's agent to the discovery of a marine mammal reservoir, brucellosis has continuously been a re-emerging zoonosis. Vet. Res. 2005; 36(3):313-26.

24. Godoy D., Randle G., Simpson A.J. et al. Multilocus sequence typing and evolutionary relationships among the causative agents of melioidosis and glanders, Burkholderia pseudomallei and Burkholderia mallei. J. Clin. Microbiol. 2003; 41(5):2068-79.

25. Hada H.S., Stemmler J., Grossbard M.L. et al. Characterization of non-O1 serovar Vibrio cholerae (Vibrio albensis). Syst. Appl. Microbiol. 1985; 6(2):203-9.

26. Helgason E., Okstad O.A., Caugant D.A. et al. Bacillus anthracis, Bacillus cereus, and Bacillus thuringiensis -one species on the basis of genetic evidence. Appl. Environ. Microbiol. 2000; 66(6):2627-30.

27. Hollis D.G., Weaver R.E., Steigerwalt A.G. et al. Francisella philomiragia comb. nov. (formerly Yersinia philomiragia) and Francisella tularensis biogroup novicida (formerly Francisella novicida) associated with human disease. J. Clin. Microbiol. 1989; 27(7):1601-8.

28. International Committee on Systematic Bacteriology; Subcommittee on the taxonomy of Brucella. Correspondence Report (Interim Report), 1991-1993. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006; 56:1167-8.

29. International Committee on Systematic Bacteriology; Subcommittee on the taxonomy of Brucella: Minutes of the meeting, 5 and 7 July 1994, Prague, Czech Republic. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006; 56: 1169-70.

30. International Committee on Systematics of Prokaryotes; Subcommittee on the taxonomy of Brucella: Minutes of the meeting, 17 September 2003, Pamplona, Spain. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006; 56: 1173-5.

31. International Committee on Systematics of Prokaryotes. Subcommittee on the Taxonomy of Brucella. Available from:http://www.the-icsp.org/subcoms/Brucella.htm

32. Keim P., Johansson A., Wagner D.M. Molecular epidemiology, evolution, and ecology of Francisella. Ann. N.Y. Acad. Sci. 2007; 1105:30-66.

33. Koeppel A, Perry E.B., Sikorski J. et al. Identifying the fundamental units of bacterial diversity: a paradigm shift to incorporate ecology into bacterial systematics. Proc. Natl. Acad. Sci USA. 2008; 105(7): 2504-9.

34. Konstantinidis K.T., Ramette A., Tiedje J.M. The bacterial species definition in the genomic era. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 2006; 361(1475):1929-40.

35. Ottem K.F., Nylund A., Karlsbakk E. et al. New species in the genus Francisella (Gammaproteobacteria; Francisellaceae); Francisella piscicida sp. nov. isolated from cod (Gadus morhua). Arch Microbiol. 2007; 188(5):547-50.

36. Sprague L.D., Neubauer H. Yersinia aleksiciae sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005; 55:831-5.

37. Stackebrandt E., Frederiksen W., Garrity G.M. et al. Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002; 52:1043-7.

38. Stackebrandt E. Defining Taxonomic Ranks. In: Dworkin M., Falkow S. The Prokaryotes: A Handbook on the Biology of Bacteria. 3rd ed. Springer, 2006. P. 29-57.

39. Stackebrandt E., Ebers J. Taxonomic parameters revisited: tarnished gold standards. Microbiol. Today. 2006; 33: 152-5.

40. Stine O.C., Sozhamannan S., Gou Q. et al. Phylogeny of Vibrio cholerae based on recA sequence. Infect. Immun. 2000; 68(12):7180-5.

41. Thompson F.L., Iida T., Swings J. Biodiversity of vibrios. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2004; 68(3):403-31.

42. Thompson F.L., Gevers D., Thompson C.C. et al. Phylogeny and molecular identification of vibrios on the basis of multilocus sequence analysis. Appl. Environ. Microbiol. 2005; 71(9):5107-15.

43. Verger J.M., Grimont F., Grimont P.A.D., Grayon M. Brucella, a monospecific genus as shown by deoxyribonucleic acid hybridization. Int. J. Syst. Bacteriol. 1985; 35(3):292-5.

44. Vilas-Boas G.T., Peruca A.P.S., Arantes O.M. Biology and taxonomy of Bacillus cereus, Bacillus anthracis, and Bacillus thuringiensis. Can. J. Microbiol. 2007; 53(6):673-87.

45. Yabuuchi E., Kosako Y., Oyaizu H. et al. Proposal of Burkholderia gen. nov. and transfer of seven species of the genus Pseudomonas homology group II to the new genus, with the type species Burkholderia cepacia (Palleroni and Holmes 1981) comb. nov. Microbiol. Immunol. 1992; 36(12):1251-75.


Для цитирования:


Грачева И.В., Караваева Т.Б., Меркулова Т.К., Плотников О.П. Современное состояние классификации некоторых патогенных представителей родов Bacillus, Brucella, Burkholderia, Francisella, Vibrio, Yersinia. Проблемы особо опасных инфекций. 2009;(1(99)):42-49. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2009-1(99)-42-49

For citation:


Gracheva I.V., Karavaeva T.B., Merkulova T.K., Plotnikov O.P. Present-Day State of Classification of Some Pathogenic Representatives of the Bacillus, Brucella, Burkholderia, Francisella, Vibrio, Yersinia Genera. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2009;(1(99)):42-49. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2009-1(99)-42-49

Просмотров: 67


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)