Обзор эпизоотологической ситуации по высокопатогенному вирусу гриппа птиц в России в 2019 г.

В данной статье рассмотрена современная ситуация по высокопатогенному вирусу гриппа птиц в 2019 г. и сделан прогноз возможного дальнейшего распространения вирусов на территории России. В 2019 г. в мире отмечена циркуляция различных вариантов вируса, имеющих важное эпизоотологическое и эпидемиологическое значение. Зарегистрированы вспышки среди диких и домашних птиц, а также случаи заражения человека вирусами гриппа подтипов A/H5Nx, A/H7N9 и A/H9N2. В России в 2019 г. зарегистрировано только две вспышки, вызванные высокопатогенным вариантом вируса гриппа A/H5N8. Обе вспышки зафиксированы в первой и второй половине января на птицефабрике в Ростовской области. Помимо этого, в ходе мониторинга вируса гриппа птиц на территории Томской области в мае 2019 г. от дикой птицы выделен штамм вируса гриппа A/H14N7. В июне на территории Камчатского края выделен штамм подтипа A/H13N2, затем в августе 2019 г. вирус гриппа подтипа A/H13N6 выделен на территории Саратовской области. Выявлено, что некоторые штаммы вируса гриппа, выделяемые в России, имеют высокую степень идентичности со штаммами, циркулирующими в Юго-Восточной Азии. Это показано на примере филогенетического анализа вирусов гриппа A/H5Nx, выделенных ранее на территории Саратовской области и Социалистической Республики Вьетнам. Таким образом, в очередной раз доказано, что территория России играет важную географическую роль в глобальном распространении вируса гриппа птиц. 

1. Shaw M.L., Palese P. Orthomyxoviridae. In: Knipe D.M., Howley P.M., editors. Fields Virology. 6th ed. Philadelphia: Wolters Kluwer Health/Lippincott Williams & Wilkins; 2013. P. 1151–85.

2. Manrubia S.C., Escarmis C., Domingo E., Lazaro E. High mutation rates, bottlenecks, and robustness of RNA viral quasispecies. Gene. 2005; 347:273–82.

3. Turner P.E. Searching for the advantages of virus sex. Orig. Life Evol. Biosph. 2003; 33:95–108. DOI: 10.1023/A:1023973015054.

4. Kawaoka Y., Chambers T.M., Sladen W.L., Webster R.G. Is the gene pool of influenza viruses in shorebirds and gulls different from that in wild ducks? Virology. 1988; 163(1):247–50.

5. Slemons R.D., Johnson D.C., Osborn J.S., Hayes F. Type-A influenza viruses isolated from wild free-flying ducks in California. Avian Diseases. 1974; 18(1):119–24. PMID: 4205344.

6. Suarez D.L. Evolution of avian influenza viruses. Vet. Microbiol. 2000; 74(1–2):15–27. DOI: 10.1016/s0378-1135(00)00161-9.

7. Tong S., Li Y., Rivailler P., Conrardy C., Castillo D.A.A., Chen L.M., Recuenco S., Ellison J.A., Davis C.T., York I.A., Turmelle A.S., Moran D., Rogers S., Shi M., Tao Y., Weil M.R., Tang K., Rowe L.A., Sammons S., Xu X., Frace M., Lindblade K.A., Cox N.J., Anderson L.J., Rupprecht C.E., Donis R.O. A distinct lineage of influenza A virus from bats. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2012; 109(11):4269–74. DOI: 10.1073/pnas.1116200109.

8. Tong S., Zhu X., Li Y., Shi M., Zhang J., Bourgeois M., Yang H., Chen X., Recuenco S., Gomez J., Chen L.-M., Johnson A., Tao Y., Dreyfus C., Yu W., McBride R., Carney P.J., Gilbert A.T., Chang J., Guo Z., Davis C.T., Paulson J.C., Stevens J., Rupprecht C.E., Holmes E.C., Wilson I.A., Donis R.O. New World bats harbor diverse influenza A viruses. PLoS Pathog. 2013; 9:e1003657. DOI: 10.1371/journal.ppat.1003657.

9. Webster R.G., Bean W.J., Gorman O.T., Chambers T.M., Kawaoka Y. Evolution and ecology of influenza A viruses. Microbiol. Rev. 1992; 56(1):152–79. PMID: 1579108. PMCID: PMC372859.

10. Olsen B., Munster V.J., Wallensten A., Waldenstrцm J., Osterhaus A.D.M.E., Fouchier R.A.M. Global patterns of influenza A virus in wild birds. Science. 2006; 312(5772):384–8. DOI: 10.1126/science.1122438.

11. Easterday B.C., Trainer D.O., Tůmová B., Pereira H.G. Evidence of infection with influenza viruses in migratory waterfowl. Nature. 1968; 219(5153):523–4. DOI: 10.1038/219523a0.

12. Kuiken T. Is low pathogenic avian influenza virus virulent for wild waterbirds? Proc. Biol. Sci. 2013; 280(1763):20130990. DOI: 10.1098/rspb.2013.0990.

13. Jourdain E., Gunnarsson G., Wahlgren J., Latorre-Margalef N., Brцjer C., Sahlin S., Svensson L., Waldenstrцm J., Lundkvist A., Olsen B. Influenza virus in a natural host, the mallard: experimental infection data. PLoS ONE. 2010; 5(1):e8935. DOI: 10.1371/journal.pone.0008935.

14. Runstadler J., Hill N., Hussein I.T.M., Puryear W., Keogh M. Connecting the study of wild influenza with the potential for pandemic disease. Infect. Genet. Evol. 2013; 17:162–87. DOI: 10.1016/j.meegid.2013.02.020.

15. Lam T.T., Ip H.S., Ghedin E., Wentworth D.E., Halpin R.A., Stockwell T.B., Spiro D.J., Dusek R.J., Bortner J.B., Hoskins J., Bales B.D., Yparraguirre D.R., Holmes E.C. Migratory flyway and geographical distance are barriers to the gene flow of influenza virus among North American birds. Ecol. Lett. 2012; 15(1):24–33. DOI: 10.1111/j.1461-0248.2011.01703.x.

16. Bahl J., Vijaykrishna D., Holmes E.C., Smith G.J.D., Guan Y. Gene flow and competitive exclusion of avian influenza A virus in natural reservoir hosts. Virology. 2009; 390(2):289–97. DOI: 10.1016/j.virol.2009.05.002.

17. Gonzбlez-Reiche A.S., Morales-Betoulle M.E., Alvarez D., Betoulle J.L., Mьller M.L., Sosa S.M., Perez D.R. Influenza A viruses from wild birds in Guatemala belong to the North American lineage. PLoS ONE. 2012; 7(3):e32873. DOI: 10.1371/journal.pone.0032873.

18. Bahl J., Pham T.T., Hill N.J., Hussein I.T.M., Ma E.J., Easterday B.C., Halpin R.A., Stockwell T.B., Wentworth D.E., Kayali G., Krauss S., Schultz-Cherry S., Webster R.G., Webby R.J., Swartz M.D., Smith G.J.D., Runstadler J.A. Ecosystem interactions underlie the spread of avian influenza A viruses with pandemic potential. PLoS Pathog. 2016; 12(5):e1005620. DOI: 10.1371/journal.ppat.1005620.

19. Chen H., Smith G.J.D., Li K.S., Wang J., Fan X.H., Rayner J.M., Vijaykrishna D., Zhang J.X., Zhang L.J., Guo C.T., Cheung C.L., Xu K.M., Duan L., Huang K., Qin K., Leung Y.H.C., Wu W.L., Lu H.R., Chen Y., Xia N.S., Naipospos T.S.P., Yuen K.Y., Hassan S.S., Bahri S., Nguyen T.D., Webster R.G., Peiris J.S.M., Guan Y. Establishment of multiple sublineages of H5N1 influenza virus in Asia: implications for pandemic control. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2006; 103(8):2845–50. DOI: 10.1073/pnas.0511120103.

20. Gauthier-Clerc M., Lebarbenchon C., Thomas F. Recent expansion of highly pathogenic avian influenza H5N1: a critical review. Ibis. 2007; 149(2):202–14. DOI: 10.1111/j.1474-919X.2007.00699.x.

21. Lu L., Leigh Brown A.J., Lycett S.J. Quantifying predictors for the spatial diffusion of avian influenza virus in China. BMC Evol. Biol. 2017; 17(1):16. DOI: 10.1186/s12862-016-0845-3.

22. Kilpatrick A.M., Chmura A.A., Gibbons D.W., Fleischer R.C., Marra P.P., Daszak P. Predicting the global spread of H5N1 avian influenza. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2006; 103(51):19368–73. DOI: 10.1073/pnas.0609227103.

23. World Health Organization (WHO). Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza viruses and candidate vaccine viruses developed for potential use in human vaccines. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/vaccines/virus/201909_zoonotic_vaccinevirusupdate.pdf?ua=1.

24. World Health Organization (WHO). Influenza at the human-animal interface Summary and assessment, 10 April to 10 May 2019. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/human_animal_interface/Influenza_Summary_IRA_HA_interface_10_05_2019.pdf.

25. World organization for animal health (OIE). Update on highly pathogenic avian influenza in animals (type H5 and H7), 2019. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: http://www.oie.int/en/animal-health-in-the-world/update-on-avian-influenza/2019/.

26. Molini U.,Aikukutu G., Roux J.P., Kemper J., Ntahonshikira C., Marruchella G., Khaiseb S., Cattoli G., Dundon W.G. Avian Influenza H5N8 Outbreak in African Penguins (Spheniscus demersus), Namibia, 2019. J. Wildl. Dis. 2020; 56(1):214–8. DOI: 10.7589/2019-03-067.

27. European Food Safety Authority, European Centre for Disease Prevention and Control, European Reference Laboratory for Avian Influenza, Adlhoch C., Fusaro A., Kuiken T., Smietanka K., Staubach C., Guajardo M., Baldinelli F. Avian influenza overview August – November 2019. EFSA Journal. 2019; 17(12):e05988. DOI: 10.2903/j.efsa.2019.5988.

28. European Food Safety Authority, European Centre for Disease Prevention and Control, European Reference Laboratory for Avian Influenza, Adlhoch C., Brouwer A., Kuiken T., Miteva A., Mulatti P., Smietanka K., Staubach C., Gogin A., Guajardo M., Baldinelli F. Avian influenza overview November 2018 – February 2019. EFSA Journal. 2019; 17(3):e5664. DOI: 10.2903/j.efsa.2019.5664.

29. World Health Organization (WHO). Cumulative number of confirmed human cases of avian influenza A(H5N1) reported to WHO. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/human_animal_interface/2020_01_20_tableH5N1.pdf?ua=1.

30. World Health Organization (WHO), 2019. Influenza at the human-animal interface Summary and assessment, 13 February to 9 April 2019. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://www.who.int/influenza/human_animal_interface/influenza_Summary_IRA_HA_interface_09_04_2019.pdf.

31. World Health Organization (WHO), 2019. Avian Influenza Weekly Update Number 713. WHO, Geneva. 3 pp. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/279855/AI-20191101.pdf?sequence=43&isAllowed=y.

32. Qiu Y., Sun R., Hou G., Yu X., Li Y., Li J., Zhang Q., Zou F., Liu H., Jiang W. Novel reassortant H7N2 originating from the H7N9 highly pathogenic avian influenza viruses in China, 2019. J. Infect. 2019; 79(5):462–70. DOI: 10.1016/j.jinf.2019.08.016.

33. Sun H., Lin J., Liu Z., Yu Y., Wu M., Li S., Liu Y., Feng Y., Wu Y., Li M., Jiao P., Luo K., Liao M. Genetic, Molecular, and Pathogenic Characterization of the H9N2 Avian Influenza Viruses Currently Circulating in South China. Viruses. 2019; 11(11):1040. DOI: 10.3390/v11111040.

34. Yu Z., Cheng K., Gao Y. Poultry Infection with Influenza Viruses of Wild Bird Origin, China, 2016. Emerg. Infect. Dis. 2018; 24(7):1375–7. DOI: 10.3201/eid2407.171220.

35. Lycett S.J., Duchatel F., Digard P. A brief history of bird flu. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 2019; 374(1775):20180257. DOI: 10.1098/rstb.2018.0257.

36. World organization for animal health (OIE). Update on highly pathogenic avian influenza in animals (type H5 and H7), 2020. (Cited 31 Jan 2020). [Internet]. Available from: http://www.oie.int/en/animal-health-in-the-world/update-on-avian-influenza/2020/.