Preview

Проблемы особо опасных инфекций

Расширенный поиск

Эндемичная холера в Индии и завозная холера в России: что общего?

https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-17-26

Полный текст:

Аннотация

Эндемичность холеры в Индии хорошо изучена. Среди ряда других эндемичных регионов Индийский субконтинент, по-видимому, является местом формирования нескольких вариантов холерных вибрионов, впоследствии распространившихся по всему миру. Напротив, в России все зарегистрированные случаи холеры имели завозное происхождение. В прошлом столетии такие завозы могли приводить к эпидемиям, которые заканчивались вместе с элиминацией токсигенных штаммов Vibrio cholerae (TVC) из пораженных регионов. В настоящее время выделение TVC как из водоемов, так и от возвратившихся из азиатских стран больных, является редкостью, в основном благодаря постоянному мониторингу и контролю. Кроме того, климатические условия большинства областей России неблагоприятны для длительного выживания возбудителя во внешней среде. Однако глобальные изменения климата, сопровождающиеся неожиданными аномалиями в ранее стабильных климатических зонах, могут способствовать распространению отдельных завозных TVC, что может привести к эпидосложнениям по холере. В некоторых регионах России сезонные погодные условия очень похожи на индийские. Молекулярные исследования штаммов из разных мест выделения показывают, что TVC распространились на новые территории и приобрели дополнительные свойства, отсутствующие у их недавних предшественников.
В настоящей работе описаны геномные характеристики TVC, выделенных в России, Индии и некоторых других странах. Обзор дополнен биоинформатическим анализом генетических маркеров, значимых для дифференциации клонов, появившихся в  эндемичных регионах и завезенных на территории, где холера прежде отсутствовала. Мы нашли добавочные свидетельства в пользу первичного индийского происхождения недавно возникших геновариантов и их продолжающейся трансформации, включая появление нового аллеля гена rtxA с делецией 60 п.н. в дополнение к ранее известной null-мутации. В определенных условиях TVC могут представлять потенциальную угрозу распространения эпидемической холеры в России и на других территориях. Борьба с  холерой требует совместных усилий исследователей, направленных на получение знаний о возбудителе на молекулярном уровне, в целях разработки эффективных стратегий защиты человечества во всем мире. 

Об авторах

Е. В. Монахова
Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт
Россия

Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М . Г орького, 117/40



А. Ghosh
ICMR-National Institute of Cholera and Enteric Diseases
Индия

J.C.Bose Chair Professor of the NASI

P-33, CIT Scheme XM, Beliaghata, Kolkata - 700 010, India



А. Mutreja
University of Cambridge
Великобритания

Department of Medicine

Level 5, Addenbrookes Hospital, Cambridge CB2 0QQ, United Kingdom



F.-X. Weill
Institut Pasteur, Unité des bactéries pathogènes entériques
Франция

28 rue du Dr Roux, 75724 Paris cedex 15, France



T. Ramamurthy
ICMR-National Institute of Cholera and Enteric Diseases
Индия

INSA-Senior Scientist

P-33, CIT Scheme XM, Beliaghata, Kolkata - 700 010, India



Список литературы

1. Kuleshov K.V., Vodop’ianov S.O., Dedkov V.G., Markelov M.L., Deviatkin A.A., Kruglikov V.D., Vodop’ianov A.S., Pisanov R.V., Mazrukho A.B., Titova S.V., Maleev V.V., Shipulin G.A. Travel-aassociated Vibrio cholerae O1 El Tor, Russia. Emerg. Infect. Dis. 2016; 22(11):2006–8. DOI: 10.3201/eid2211.151727.

2. Kuleshov K.V., Kostikova A., Pisarenko S.V., Kovalev D.A., Tikhonov S.N., Savelievа I.V., Saveliev V.N., Vasilieva O.V., Zinich L.S., Pidchenko N.N., Kulichenko A.N., Shipulin G.A. Comparative genomic analysis of two isolates of Vibrio cholerae O1 Ogawa El Tor isolated during outbreak in Mariupol in 2011. Infect. Genet. Evol. 2016; 44:471–8. DOI: 10.1016/j.meegid.2016.07.039.

3. Onishchenko G.G., Moskvitina E.A., Vodop’janov A.S., Monakhova E.V., Pisanov R.V., Vodop’ianov S.O., Chemisova O.S., Kruglikov V.D., Titova S.V. [Retrospective molecular-epidemiological analysis of cholera epidemic in the Republic of Dagestan in 1994]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2016; (4):33–41. DOI: 10.21055/0370-1069-2016-4-33-41.

4. Weill F.-X., Domman D., Njamkepo E., Tarr C., Rauzier J., Fawal N., Keddy K.H. , Salje H., Moore S., Mukhopadhyay A.K., Bercion R., Luquero F.J. , Ngandjio A., Dosso M., Monakhova E., Garin B., Bouchier C., Pazzani C., Mutreja A., Grunow R., Sidikou F., Bonte L., Breurec S., Damian M., Njanpop-Lafourcade B.-M., Sapriel G., Page A.-L., Hamze M., Henkens M., Chowdhury G., Mengel M., Koeck J.-L., Fournier J.-M., Dougan G., Grimont P. A.D., Parkhill J., Holt K.E., Piarroux R., Ramamurthy T., Quilici M.-L., Thomson N.R. Genomic history of the seventh pandemic of cholera in Africa. Science. 2017; 358:785–9. DOI: 10.1126/science.aad5901.

5. Greig D.R., Schaefer U., Octavia S., Hunter E., Chattaway M.A., Dallman T.J., Jenkins C. Evaluation of whole-genome sequencing for identification and typing of Vibrio cholerae. J. Clin. Microbiol. 2018; 56:e00831-18. DOI: 10.1128/JCM.00831-18.

6. Patterson K.D. Cholera diffusion in Russia, 1823–1923. Soc. Sci. Med. 1994; 38(9):1171–91. DOI: 10.1016/0277-9536-(94)90183-x.

7. Siddique A.K., Cash R. Cholera outbreaks in the classical biotype era. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 2014; 379:1–16. DOI: 10.1007/82_2013_361.

8. Mukhopadhyay A.K., Takeda Y., Nair G.B. Cholera outbreaks in the El Tor biotype era and the impact of the new El Tor variants. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 2014; 379:17–47. DOI: 10.1007/82_2014_363.

9. Hu D., Liu B., Feng L., Ding P., Guo X., Wang M., Cao B., Reeves P.R., Wang L. Origins of the current seventh cholera pandemic. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2016; 113(48):E7730–9. DOI: 10.1073/pnas.1608732113.

10. Ramamurthy T., Mutreja A., Weill F.-X., Das B., Ghosh A., Nair G.B. Revisiting the global epidemiology of cholera in conjunction with the genomics of Vibrio cholerae. Front. Public Health. 2019; 7:203. DOI: 10.3389/fpubh.2019.00203.

11. Mutreja A., Kim D.W., Thomson N.R., Connor T.R., Lee J.H., Kariuki S., Croucher N.J., Choi S.Y., Harris S.R., Lebens M., Niyogi S.K., Kim E.J., Ramamurthy T., Chun J., Wood J.L., Clemens J.D., Czerkinsky C., Nair G.B., Holmgren J., Parkhill J., Dougan G. Evidence for several waves of global transmission in the seventh cholera pandemic. Nature. 2011; 477(7365):462–5. DOI: 10.1038/nature10392.

12. Pham T.D., Nguyen T.H., Iwashita H., Takemura T., Morita K., Yamashiro T. Comparative analyses of CTX prophage region of Vibrio cholerae seventh pandemic wave 1 strains isolated in Asia. Microbiol. Immunol. 2018; 62(10):635–50. DOI: 10.1111/1348-0421.12648.

13. Nguyen T.H., Pham T.D., Higa N., Iwashita H., Takemura T., Ohnishi M., Morita K., Yamashiro T. Analysis of Vibrio seventh pandemic island II and novel genomic islands in relation to attachment sequences among a wide variety of Vibrio cholerae strains. Microbiol. Immunol. 2018; 62(3):150–7. DOI: 10.1111/1348-0421.12570.

14. Islam M.T., Alam M., Boucher Y. Emergence, ecology and dispersal of the pandemic generating Vibrio cholerae lineage. International Microbiology. 2017; 20(3):106–15. DOI: 10.2436/20.1501.01.291.

15. Smirnova N.I., Cheldyshova N.B., Zadnova S.P., Kutyrev V.V. Molecular-genetic peculiarities of classical biotype Vibrio cholerae, the etiological agent of the last outbreak Asiatic cholera in Russia. Microb. Pathog. 2004; 36:131–9. DOI: 10.1016/j.micpath.2003.10.004.

16. Narkevich M.I., Onischenko G.G., Lomov J.M., Moskvitina E.A., Podosinnikova L.S., Medinsky G.M. The seventh pandemic of cholera in the USSR, 1961–89. Bull. World Health Organ. 1993; 71:189–96. (Cited 10 Sept 2020). [Internet]. Available from: https://www.questia.com/library/journal/1G1-13913981/the-seventh-pandemic-of-cholera-in-the-ussr-1961-89.

17. Onishhenko G.G., Moskvitina E.A., Kruglikov V.D., Titova S.V., Adamenko O.L., Vodop'janov A.S., Vodop'janov S.O. [Epidemiological surveillance of cholera in Russia during the period of the seventh pandemic]. Vestnik Rossiiskoi Akademii Meditsinskikh Nauk [Annals of the Russian Academy of Medical Sciences]. 2015; 70(2):249–56. DOI: 10.15690/vramn.v70i2.1320.

18. Pisanov R., Ezhova M., Monakhova E., Cherkasov A., Krasnov Y., Vodop’yanov A., Kul’shan’ T., Livanova L., Portenko S., Abdrashitova A., Kruglikov V., Titova S. [Peculiarities of genome structure of toxigenic Vibrio cholerae El Tor Inaba strain, isolated from a surface water body in the territory of Rostov-on-Don in 2014]. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2015; (2):63–7. DOI: 10.21055/0370-1069-2015-2-63-67.

19. Emch M., Feldacker C., Islam M.S., Ali M. Seasonality of cholera from 1974 to 2005: a review of global patterns. Int. J. Health. Geogr. 2008; 7:31. DOI: 10.1186/1476-072X-7-31.

20. WHO. 517 Meeting of the Strategic Advisory Group of Experts on immunization, October 2009 – conclusions and recommendations. Wkly Epidemiol. Rep. 2009; 84:517–32. Available from: https://www.who.int/wer/2009/wer8450/en.

21. Sarkar B.L., Kanungo S., Nair G.B. How endemic is cholera in India? Indian. J. Med. Res. 2012; 135:246–8. PMCID: PMC3336858.

22. Kanungo S., Sah B.K., Lopez A.L., Sung J.S., Paisley A.M., Sur D., Clemens J.D., Nair G.B. Cholera in India: an analysis of reports, 1997–2006. Bull. World Health Organ. 2010; 88(3):185–91. DOI: 10.2471/BLT.09.073460.

23. Ali M., Gupta S.S., Arora N., Khasnobis P., Venkatesh S., Sur D., Nair G.B., Sack D.A., Ganguly N.K. Identification of burden hotspots and risk factors for cholera in India: an observational study. PLoS One. 2017; 12(8):e0183100. DOI: 10.1371/journal.pone.0183100.

24. Mironova L.V., Gladkikh A.S., Ponomareva A.S., Feranchuk S.I., Bochalgin N.O., Basov E.A., Khunkheeva Z.Yu., Balakhonov S.V. Comparative genomics of Vibrio cholerae El Tor strains isolated at epidemic complications in Siberia and at the Far East. Infect. Genet. Evol. 2018; 60:80–8. DOI: 10.1016/j.meegid.2018.02.023.

25. Liashko V. Cholera outbreak in Donetsk Oblast, Ukraine, in 2011. EpiNorth Journal of the Network for Communicable Disease Control in Northern and Eastern Europe. 2012; 13:117–20. [Internet]. Available from: https://docplayer.ru/55732270-No-3-vol-journalof-the-network-for-communicable-disease-control-in-northern-andeastern-europe.html.

26. Domashenko O.N., Belomerya T.A., Martynova N.V., Daragan G.N., Demkovich O.O., Malakhova U.V., Zemlyanskaya G.I., Popova D.M. [Cholera in Azov area]. Zhurnal infectologii [Journal Infectology]. 2015; 7(2):92–7. DOI: 10.22625/2072-6732-2015-7-2-92-97.

27. Kul’shan’ T.A., Krasnov Y.M., Lozovsky Y.V., Smirnova N.I. Molecular MLVA typing of typical and genetically altered natural strains of Vibrio cholerae El Tor biovar. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2012; (4(114)):39–43. DOI: 10.21055/0370-1069-2012-4-39-43.

28. Balakhonov S.V., Mironova L.V., Basov E.A., Gladkikh A.S., Afanasev M.V., Ganin V.S., Urbanovich L.Y., Sidorova E.A. Whole-genome sequencing of a Vibrio cholerae El Tor strain isolated in the imported cholera focus in Siberia. Genome Announc. 2015; 3(2):e01550-14. DOI: 10.1128/genomeA.01550-14.

29. Didelot X., Pang B., Zhou Z., McCann A., Ni P., Li D., Achtman M., Kan B. The role of China in the global spread of the current cholera pandemic. PLoS Genet. 2015; 11(3):e1005072. DOI: 10.1371/journal.pgen.1005072.

30. Almagro-Moreno S., Taylor R.K. Cholera: environmental reservoirs and impact on disease transmission. Microbiol. Spectr. 2013; 1(2):OH-0003-2012. DOI: 10.1128/microbiolspec.OH-0003-2012.

31. Lutz C., Erken M., Noorian P., Sun S., McDougald D. Environmental reservoirs and mechanisms of persistence of Vibrio cholerae. Front. Microbiol. 2013; 4:375. DOI: 10.3389/fmicb.2013.00375.

32. Conner J.G., Teschler J.K., Jones C.J., Yildiz F.H. Staying alive: Vibrio cholerae's cycle of environmental survival, transmission, and dissemination. Microbiol. Spectr. 2016; 4(2):10.1128/microbiolspec.VMBF-0015-2015. DOI: 10.1128/microbiolspec.VMBF-0015-2015.

33. Mavian C., Paisie T.K., Alam M.T., Browne C., Beau De Rochars V.M., Nembrini S., Cash M.N., Nelson E.J., Azarian T., Ali A., Morris J.G. Jr, Salemi M. Toxigenic Vibrio cholerae evolution and establishment of reservoirs in aquatic ecosystems. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2020; 117(14):7897–904. DOI: 10.1073/pnas.1918763117.

34. Batabyal P., Mookerjee S., Palit A. Occurrence of toxigenic Vibrio cholerae in accessible water sources of cholera endemic foci in India. Jpn. J. Infect. Dis. 2012; 65(4):358–60. DOI: 10.7883/yoken.65.358.

35. Mishra A., Taneja N., Sharma M. Environmental and epidemiological surveillance of Vibrio cholerae in a cholera-endemic region in India with freshwater environs. J. Appl. Microbiol. 2012; 112(1):225–37. DOI: 10.1111/j.1365-2672.2011.05191.x.

36. Taneja N., Mishra A., Batra N., Gupta P., Mahindroo J., Mohan B. Inland cholera in freshwater environs of north India. Vaccine. 2019; 38(Suppl. 1):A63-A72. DOI: 10.1016/j.vaccine.2019.06.038.

37. Maramovich A.S., Urbanovich L.Ya., Kulikalova E.S., Shkaruba T.T. [The role and purpose of surface water bodies in the establishment and development of the VII cholera pandemic]. Epidemiologiya i Infektsionnye Bolezni [Epidemiology and Infectious Diseases]. 2009; (2):21–5.

38. Titova S.V., Monakhova E.V., Alekseeva L.P., Pisanov R.V. [Molecular genetic basis of biofilm formation as a component of Vibrio cholerae persistence in water reservoirs of Russian Federation]. Ekologicheskaya Genetika [Ecological genetics]. 2018; 16(4):23–32. DOI: 10.17816/ecogen16423-32.

39. Alam M.T., Weppelmann T.A., Longini I., DeRochars V.M.B., Morris J.G., Jr, Ali A. Increased isolation frequency of toxigenic Vibrio cholerae O1 from environmental monitoring sites in Haiti. PLoS One. 2015; 10(4):e0124098. DOI: 10.1371/journal.pone.0124098.

40. Baron S., Lesne J., Moore S., Rossignol E., Rebaudet S., Gazin P., Barrais R., Magloire R., Boncy J., Piarroux R. No evidence of significant levels of toxigenic V. cholerae O1 in the Haitian aquatic environment during the 2012 rainy season. PLoS Curr. 2013; 5:ecurrents.outbreaks.7735b392bdcb749baf5812d2096d331e. DOI: 10.1371/currents.outbreaks.7735b392bdcb749baf5812d2096d331e.

41. Rebaudet S., Moore S., Rossignol E., Bogreau H., Gaudart J., Normand A.C., Laraque M.J., Adrien P., Boncy J., Piarroux R. Epidemiological and molecular forensics of cholera recurrence in Haiti. Sci. Rep. 2019; 9(1):1164. DOI: 10.1038/s41598-018-37706-0.

42. Moore S., Thomson N., Mutreja A., Piarroux R. Widespread epidemic cholera caused by a restricted subset of Vibrio cholerae clones. Clin. Microbiol. Infect. 2014; 20(5):373–9. DOI: 10.1111/1469-0691.12610.

43. Deen J., Mengel M.A., Clemens J.D. Epidemiology of cholera. Vaccine. 2020; 38(Suppl. 1):A31-A40. DOI: 10.1016/j.vaccine.2019.07.078.

44. Antonova E.S., Hammer B.K. Quorum-sensing autoinducer molecules produced by members of a multispecies biofilm promote horizontal gene transfer to Vibrio cholerae. FEMS Microbiol. Lett. 2011; 322(1):68–76. DOI: 10.1111/j.1574-6968.2011.02328.x.

45. Chawdhury F.R., Nur Z., Hassan N., von Seidlein L., Dunachie S. Pandemics, pathogenicity and changing molecular epidemiology of cholera in the era of global warming. Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob. 2017; 16(1):10. DOI: 10.1186/s12941-017-0185-1.

46. Lekshmi N., Joseph I., Ramamurthy T., Thomas S. Changing facades of Vibrio cholerae: An enigma in the epidemiology of cholera. Indian J. Med. Res. 2018; 147(2):133–41. DOI: 10.4103/ijmr.IJMR_280_17.

47. Gupta S.S., Ganguly N.K. Opportunities and challenges for cholera control in India. Vaccine. 2020; 38(Suppl. 1):A25-A27. DOI: 10.1016/j.vaccine.2019.06.032.

48. Hu D., Yin Z., Yuan C., Yang P., Qian C., Wei Y., Zhang S., Wang Y., Yuan J., Wang M., Reeves P.R., Tu L., Chen M., Huang D., Liu B. Changing molecular epidemiology of Vibrio cholerae outbreaks in Shanghai, China. mSystems. 2019; 4(6):e00561-19. DOI: ms.00561-19.

49. Pal B.B., Khuntia H.K., Nayak S.R., Mohanty A., Biswal B. Vibrio cholerae O1 Ogawa strains carrying the ctxB7 allele caused a large cholera outbreak during 2014 in the tribal areas of Odisha, India. Jpn. J. Infect. Dis. 2017; 70(5):549–53. DOI: 10.7883/yoken.JJID.2016.585.

50. Zadnova S.P., Kul’shan’ T.A., Cheldyshova N.B., Kritsky A.A., Plekhanov N.A., Smirnova N.I. Comparative analysis of survival capacity among typical and genovariant strains of Vibrio cholerae, biovar El Tor in vivo and in vitro. Problemy Osobo Opasnykh Infektsii [Problems of Particularly Dangerous Infections]. 2015; (4):65–9. DOI: 10.21055/0370-1069-2015-4-65-69.

51. Hasan N.A., Choi S.Y., Eppinger M., Clark P.W., Chen A., Alam M., Haley B.J., Taviani E., Hine E., Su Q., Tallon L.J., Prosper J.B., Furth K., Hoq M.M., Li H., Fraser-Liggett C.M., Cravioto A., Huq A., Ravel J., Cebula T.A., Colwell R.R. Genomic diversity of 2010 Haitian cholera outbreak strains. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2012; 109(29):E2010-7. DOI: 10.1073/pnas.1207359109.

52. Ghosh P., Naha A., Pazhani G.P., Ramamurthy T., Mukhopadhyay A.K. Genetic traits of Vibrio cholerae O1 Haitian isolates that are absent in contemporary strains from Kolkata, India. PLoS One. 2014; 9(11):e112973. DOI: 10.1371/journal.pone.0112973.

53. Ghosh P., Kumar D., Chowdhury G., Singh P., Samanta P., Dutta S., Ramamurthy T., Sharma N.C., Sinha P., Prasad Y., Shinoda S., Mukhopadhyay A.K. Characterization of Vibrio cholerae O1 strains that trace the origin of Haitian-like genetic traits. Infect. Genet. Evol. 2017; 54:47–53. DOI: 10.1016/j.meegid.2017.06.015.

54. Ha S.-M., Chalita M., Yang S.-J., Yoon S.-H., Cho K., Seong W.K., Hong S., Kim J., Kwak H.-S., Chun J. Comparative genomic analysis of the 2016 Vibrio cholerae outbreak in South Korea. Front. Public Health. 2019; 7:228. DOI: 10.3389/fpubh.2019.00228.

55. Rashid M-U., Rashed S.M., Islam T., Johura F.T., Watanabe H., Ohnishi M., Alam M. CtxB1 outcompetes CtxB7 in Vibrio cholerae O1, Bangladesh. J. Med. Microbiol. 2016; 65(1):101–3. DOI: 10.1099/jmm.0.000190.

56. Weill F.-X., Domman D., Njamkepo E., Almesbahi A.A., Naji M., Nasher S.S., Rakesh A., Assiri A.M., Sharma N.C., Kariuki S., Pourshafie M.R., Rauzier J., Abubakar A., Carter J.Y., Wamala J.F., Seguin C., Bouchier C., Malliavin T., Bakhshi B., Abulmaali H.H.N., Kumar D., Njoroge S.M., Malik M.R., Kiiru J., Luquero F.J., Azman A.S., Ramamurthy T., Thomson N.R., Quilici M.-L. Genomic insights into the 2016–2017 cholera epidemic in Yemen. Nature. 2019; 565(7738):230–3. DOI: 10.1038/s41586-018-0818-3.

57. Dolores J., Satchell K.J.F. Analysis of Vibrio cholerae genome sequences reveals unique rtxA variants in environmental strains and an rtxA null-mutation in recent altered El Tor isolates. mBio. 2013; 4(2):e00624-12. DOI: 10.1128/mBio.00624-12.

58. Das M.M., Bhotra T., Zala D., Singh D.V. Phenotypic and genetic characteristics of Vibrio cholerae O1 carrying Haitian ctxB and attributes of classical and El Tor biotypes isolated from Silvassa, India. J. Med. Microbiol. 2016; 65(8):720–8. DOI: 10.1099/jmm.0.000282.

59. Naha A., Mandal R.S., Samanta P., Saha R.N., Shaw S., Ghosh A., Chatterjee N.S., Dutta P., Okamoto K., Dutta S., Mukhopadhyay A.K. Deciphering the possible role of ctxB7 allele on higher production of cholera toxin by Haitian variant Vibrio cholerae O1. PLoS Negl. Trop. Dis. 2020; 14(4):e0008128. DOI: 10.1371/journal.pntd.0008128.

60. Kuleshov K.V., Vodop’ianov S.O., Dedkov V.G., Markelov M.L., Kermanov A.V., Kruglikov V.D., Vodop’ianov A.S., Pisanov R.V., Chemisova O.S., Mazrukho A.B., Titova S.V., Shipulin G.A. Draft genome sequencing of Vibrio cholerae O1 El Tor isolates collected in the Russian Federation from imported cholera cases. Genome Announc. 2014; 2(4):e00624-14. DOI: 10.1128/genomeA.00624-14.

61. Smirnova N.I., Krasnov Y.M., Agafonova E.Y., Shchelkanova E.Y., Alkhova Z.V., Kutyrev V.V. Whole-genome sequencing of Vibrio cholerae O1 El Tor strains isolated in Ukraine (2011) and Russia (2014). Genome Announc. 2017; 5(8):e01640-16. DOI: 10.1128/genomeA.01640-16.

62. Katz L.S., Petkau A., Beaulaurier J., Tyler S., Antonova E.S., Turnsek M.A., Guo Y., Wang S., Paxinos E.E., Orata F., Gladney L.M., Stroika S., Folster J.P., Rowe L., Freeman M.M., Knox N., Kim B.S., Gavin H.E., Satchell K.J. Distinct roles of the repeat-containing regions and effector domains of the Vibrio vulnificus multifunctional-autoprocessing repeats-in-toxin (MARTX) toxin. mBio. 2015; 6(2):e00324–15. DOI: 10.1128/mBio.00324-15.

63. Bwire G., Sack D.A., Almeida M., Li S., Voeglein J.B., Debes A.K., Kagirita A., Buyinza A.W., Orach C.G., Stine O.C. Molecular characterization of Vibrio cholerae responsible for cholera epidemics in Uganda by PCR, MLVA and WGS. PLoS Negl. Trop. Dis. 2018; 12(6):e0006492. DOI: 10.1371/journal.pntd.0006492.

64. Houmnanou Y.M.G., Leekitcharoenphon P., Kudirkiene E., Mdegela R.H., Hendriksen R.S., Olsen J.E., Dalsgaard A. Genomic insights into Vibrio cholerae O1 responsible for cholera epidemics in Tanzania between 1993 and 2017. PLoS Negl. Trop. Dis. 2019; 13(12):e0007934. DOI: 10.1371/journal.pntd.0007934.

65. Li F., Pang B., Yan H., Lu X., Li J., Zhou H., Cui Z., Zhao L., Mahemut, Huo D., Kan B., Jia L. Investigation of an imported cholera case in China with whole genome sequencing. Infect. Genet. Evol. 2020; 84:104362. DOI: 10.1016/j.meegid.2020.104362.

66. WHO. Global Task Force on Cholera Control. Ending Cholera. A Global Roadmap to 2030. 2017; 32 p. (Cited 18 June 2020). [Internet]. Available from: http://www.who.int/cholera/publications/global-roadmap.pdf.

67. Mutreja A., Dougan G. Molecular epidemiology and intercontinental spread of cholera. Vaccine. 2020; 38(Suppl. 1):A46–A51. DOI: 10.1016/j.vaccine.2019.07.038.


Для цитирования:


Монахова Е.В., Ghosh А., Mutreja А., Weill F., Ramamurthy T. Эндемичная холера в Индии и завозная холера в России: что общего? Проблемы особо опасных инфекций. 2020;(3):17-26. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-17-26

For citation:


Monakhova E.V., Ghosh A., Mutreja A., Weill F., Ramamurthy T. Endemic Cholera in India and Imported Cholera in Russia: What is Common? Problems of Particularly Dangerous Infections. 2020;(3):17-26. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-17-26

Просмотров: 175


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)