Создание базы данных по характеристикам нуклеотидных последовательностей геномов штаммов возбудителей бактериальных и вирусных инфекций I–II групп патогенности

Ю. И. Яшечкин; Е. В. Найденова; Т. В. Бугоркова; С. А. Щербакова

doi:10.21055/0370-1069-2013-1-70-73

Создание базы данных по характеристикам нуклеотидных последовательностей геномов штаммов возбудителей бактериальных и вирусных инфекций I–II групп патогенности

Ю. И. Яшечкин, Е. В. Найденова, Т. В. Бугоркова, С. А. Щербакова

https://doi.org/10.21055/0370-1069-2013-1-70-73

Полный текст:

Аннотация

Разработана база данных (БД), содержащая характеристики вариабельных тандемных повторов, олигонуклеотидных праймеров и зондов геномов штаммов возбудителей бактериальных и вирусных инфекций I–II групп патогенности. БД позволяет накапливать информацию об участках геномов, а с использованием встроенных VB-приложений быстро проводить анализ данных и осуществлять информативно обоснованный расчет генодиагностических препаратов, основанных на различных форматах полимеразной цепной реакции.

Ключ. слова

база данных, ПЦР, VNTR, генодиагностические препараты, database, PCR, gene-diagnostic preparations,

Об авторах

Ю. И. Яшечкин

Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия

Е. В. Найденова

Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия

Т. В. Бугоркова

Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия

С. А. Щербакова

Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия

Список литературы

1. Красовская Т.Ю., Шарова И.Н., Щербакова С.А., Яшечкин Ю.И., Хуторецкая Н.В., Ларичев В.Ф., Бутенко А.М., Куличенко А.Н. Разработка и внедрение тест-системы для лабораторной диагностики лихорадки Западного Нила методом ПЦР. ЗНиСО. 2007; 6(171):42–6.

2. Найденова Е.В., Шарова И.Н., Щербакова С.А., Яшечкин Ю.И., Хуторецкая Н.В., Ларичев В.Ф., Саркисян К.А., Воробьева М.С., Бутенко А.М., Куличенко А.Н., Львов Д.К., Кутырев В.В. Тест-система для выявления РНК вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки методом ОТ-ПЦР. Пробл. особо опасных инф. 2006; 2(92):54–6.

3. Найденова Е.В., Яшечкин Ю.И., Щербакова С.А. Набор реагентов для выявления РНК вирусов Денге (I–IV типов) методом обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции. Национальные приоритеты России. 2011; 2(5):53.

4. Нортон П., Андерсен В. Разработка приложений в Access 97 в подлиннике. Пер. с англ. СПб: BHV-Санкт-Петербург; 2000. 656 с.

5. Попов Ю.А, Ерошенко Г.А., Булгакова Е.Г., Смирнова Н.И. Разработка комплексного алгоритма генотипирования и методов оценки генетического разнообразия природных штаммов возбудителей чумы и холеры. Пробл. особо опасных инф. 2009; 4(102):5–11.

6. Chang C.H., Chang Y.C., Underwood A., Chiou C.S., Kao C.Y. VNTRDB: a bacterial variable number tandem repeat locus database. Nucl. Acids Res. 2007; 35:416–21.

7. Visual Basic 6.0. Пер. с англ. СПб: BHV-Санкт-Петербург; 1998. 992 с.

Дополнительные файлы

Для цитирования: Яшечкин Ю.И., Найденова Е.В., Бугоркова Т.В., Щербакова С.А. Создание базы данных по характеристикам нуклеотидных последовательностей геномов штаммов возбудителей бактериальных и вирусных инфекций I–II групп патогенности. Проблемы особо опасных инфекций. 2013;(1):70-73. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2013-1-70-73

For citation: Yashechkin Y.I., Naydenova E.V., Bugorkova T.V., Shcherbakova S.A. Setting-up of the Database on the Nucleotide Sequences of the Genomes of the Strains of Bacterial and Viral Infections Agents of the I–II Pathogenicity Groups. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2013;(1):70-73. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2013-1-70-73

Обратные ссылки

Обратные ссылки не определены.

Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.

ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)

Логин
Пароль