Обобщены данные по состоянию численности основных носителей и переносчиков, а также эпизоотической активности природных очагов чумы различного типа на территории России в 2012 г., представлен краткосрочный эпизоотологический прогноз на 2013 г. Проанализированы причины современной низкой эпизоотической активности равнинных природных очагов чумы. Обсуждается роль климатических факторов в развитии длительных межэпизоотических периодов в природных очагах чумы Предкавказья, Прикаспия и Сибири. Выполнена оценка изменения потенциальной эпидемиологической опасности энзоотичных по чуме территорий под влиянием современного потепления климата. Обоснован долгосрочный прогноз эпизоотической активности природных очагов чумы на период до 2020 г.

В последнее десятилетие в мире выявлен рост в динамике заболеваемости холерой (с учетом прямолинейной линии тренда). На 2013 год прогнозируется сохранение этой тенденции. Эпидемии, вспышки и завозы инфекции имели место в 109 странах Азии, Африки, Америки, Европы и Австралии с Океанией. Продолжалось расширение нозоареала за счет вовлечения в эпидемический процесс новых административных территорий и стран, в том числе впервые за период 7-й пандемии. Помимо эндемичных территорий в Индии и Бангладеш, выявлено формирование эндемичных очагов в 12 странах Африки, последовательное во времени и поэтапное в пространстве (по провинциям, округам, штатам, регионам стран) распространение эпидемической холеры, что свидетельствует о продолжении 7-й пандемии. Штаммы
V. cholerae О1 Эль Тор , имеющие классический аллель ctx-B, распространяются в глобальном масштабе, что, наряду с вышеизложенным, определяет неблагоприятный прогноз по холере на глобальном уровне.

Проведен анализ эпидемиологической и эпизоотологической ситуации по сибирской язве в Российской Федерации и в мире в 2012 г., представлен прогноз заболеваемости на 2013 г.

Представлен анализ эпизоотической и эпидемической ситуации по бруцеллезу в Российской Федерации в 2012 г. Показано, что эпизоотическая обстановка по бруцеллезу в Российской Федерации остается напряженной, что определяет характер эпидемических проявлений. Прогнозируется стабилизация количества заболеваний людей бруцеллезом в 2013 г.

В эпидемический сезон 2012 г. на территории 21 субъекта Российской Федерации (РФ) зарегистрировано 453 случая заболевания лихорадкой Западного Нила (ЛЗН). Эпидемический процесс распространяется на более северные территории России. Наличие маркеров вируса лихорадки Западного Нила в источниках и переносчиках, а также выработанный иммунитет у населения к вирусу Западного Нила (ВЗН) установлены на территории 53 субъектов РФ. Эпидемический процесс ЛЗН в 2012 г. имеет ряд особенностей как в эпидемиологическом, так и клиническом аспектах. При активизации диагностической работы среди больных, имеющих клиническую симптоматику, схожую с ЛЗН, в первую очередь на территориях, где выявлены маркеры ВЗН, прогнозируется регистрация заболеваемости населения ЛЗН на значительной территории Российской Федерации.

В работе представлен эпидемиологический анализ заболеваемости Крымской геморрагической лихорадкой (КГЛ) в России в 2012 г., обобщены результаты эпизоотологического обследования территории природного очага КГЛ на юге европейской части России. На основании данных эпизоотологического мониторинга составлен прогноз развития эпидемиологической ситуации по КГЛ на 2013 г.

Проанализирована эпидемиологическая ситуация и меры профилактики клещевого энцефалита на территории России в 2012 г. На основе материалов о заболеваемости населения этой инфекцией в федеральных округах страны в 2007–2012 гг. для них дан краткосрочный прогноз на 2013 г.

Представлен анализ заболеваемости природно-очаговыми инфекционными болезнями бактериальной и вирусной этиологии, отражен объем их лабораторной диагностики на территории Сибири и Дальнего Востока в 2012 г. и прогноз развития эпидемиологической ситуации в 2013 г. Анализ выполнен на основании информации, поступившей в Референс-центр по мониторингу природно-очаговых инфекций при Иркутском научно-исследовательском противочумном институте из учреждений Роспотребнадзора Сибирского, Дальневосточного и Уральского федеральных округов, а также обзоров и прогнозов состояния природных очагов инфекций Алтайской, Тувинской, Читинской, Хабаровской и Приморской противочумных станций.

В обзоре обобщена и проанализирована современная ситуация по высокопатогенному гриппу птиц типа А подтипа H5N1 среди людей и животных за последние четыре года. Необычный рост заболеваемости, произошедший в Египте в 2009 г., а также групповые случаи заболевания людей, тесно связанных по времени и местоположению, и изменения вируса при его распространении в мире и расширении круга хозяев еще раз напоминают о том, что этот возбудитель обладает серьезным пандемическим потенциалом и требует постоянного и пристального внимания, чтобы обеспечить своевременное обнаружение происходящих эпидемиологических, клинических и вирусологических изменений.

Устойчивый подъем туристского сектора экономики Республики Дагестан усиливает необходимость своевременного и адекватного реагирования на эпидемические и экологические угрозы. Рассмотрены отдельные особенности, характеризующие хозяйственную деятельность и медицинское обеспечение населения республики, обуславливающие сохранение угроз эпидемиологическому благополучию населения и возрастание вероятности выноса инфекций за пределы природных очагов республики в связи с развитием туристской отрасли.

Представлены результаты анализа отечественной нормативно-правовой базы в сопоставлении с аналогичными зарубежными документами, включая рекомендации ВОЗ, в области регулирования обращения патогенных биологических агентов. Показана необходимость своевременного внесения изменений в редакцию или пересмотра профильных отечественных нормативных документов. Отмечены проблемные вопросы, требующие поиска для решения. Представлены предложения по совершенствованию нормативно-правового регулирования. Высказывается целесообразность разработки единого нормативного документа, интегрирующего вопросы обеспечения биологической безопасности.

Выполнена комплексная микробиологическая, молекулярно-генетическая и масс-спектрометрическая идентификация штамма
Yersinia pestis основного подвида, который был изолирован в июне 2012 г. впервые за все время обследования Алтайского горного природного очага чумы. Установлена высокая универсальная вирулентность этого штамма. Результаты плазмидного скрининга, мультилокусного VNTR- и масс-спектрометрического анализов продемонстрировали, что этот штамм наиболее близок к варианту возбудителя чумы, циркулирующему на территории природного очага Хуух-Сэрх-Мунх-Хаирхан, Баян-Ульгийский аймак, Монголия.

В рамках деятельности референс-центра ФБУН ГНЦ ПМБ по мониторингу за туляремией генетически охарактеризованы 4 изолята туляремийного микроба, выделенные в 2011 г. на территории Алтайского края. Эти бактерии вирулентны для мышей линии BALB/c (DCL меньше 10 КОЕ). Методами однопраймерного ПЦР-типирования и мультилокусного анализа вариабельности числа тандемных повторов (MLVA) показана принадлежность трех изолятов к среднеазиатскому подвиду, а одного – к голарктическому. Среднеазиатский подвид туляремийного микроба впервые выделен на территории Российской Федерации.

Разработана база данных (БД), содержащая характеристики вариабельных тандемных повторов, олигонуклеотидных праймеров и зондов геномов штаммов возбудителей бактериальных и вирусных инфекций I–II групп патогенности. БД позволяет накапливать информацию об участках геномов, а с использованием встроенных VB-приложений быстро проводить анализ данных и осуществлять информативно обоснованный расчет генодиагностических препаратов, основанных на различных форматах полимеразной цепной реакции.

Разработана иммуноферментная тест-система для выявления антител к капсульному антигену Ф1 чумного микроба «ИФА-Ат-Ф1
Yersinia pestis». В модельных экспериментах на лабораторных мышах показано, что данная тест-система высокоспецифична, диагностический титр составляет 1/320. Диагностическая ценность тест-системы при исследовании образцов сывороток и суспензий крови, смывов с органов грудной полости животных, обработанных живой чумной вакциной, штаммами чумного микроба, содержащими и не содержащими pFra, а также гетерологичными бактериями, составила 83,3–88,9 %.

Показано, что иммунохроматографические тест-системы можно использовать для экспресс-выявления липополисахарида туляремийного микроба при проведении идентификации штаммов
Francisella tularensis, выделенных из природных очагов, а при эпизоотологическом обследовании – для исследования суспензий иксодовых клещей и внутренних органов, павших биопробных животных.

Разработана мультиплексная ПЦР-РТ тест-система для обнаружения возбудителя сибирской язвы с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени» «
Bacillus anthracis multiplex 3 FRT». Тест-система содержит внутренний контрольный образец для контроля этапа выделения ДНК, праймеры и зонды к специфическим мишеням ДНК двух плазмидных и хромосомного гена
B. anthracis. Это позволяет идентифицировать ди-, моно- и бесплазмидные штаммы
B. anthracis, определяя их генетический потенциал патогенности, дифференцировать штаммы возбудителя сибирской язвы и близкородственных сапрофитов рода
Bacillus.

Определены основные биокинетические показатели глубинного культивирования атоксигенных штаммов-продуцентов О-антигенов холерного вибриона. Апробирована технология концентрирования О-антигенов методом тангенциальной ультрафильтрации. Установлена принципиальная возможность использования этих штаммов для создания биологически безопасного производства химических холерных вакцин.

Представлена принципиальная схема приготовления экспериментальной питательной среды для культивирования легионелл на основе ферментативного гидролизата легкого свиньи. Показано, что питательная среда обладает хорошими ростовыми свойствами и соответствует требованиям нормативной документации, предъявляемым к питательным средам для выделения и культивирования возбудителя легионеллеза.

Разработана система дифференциальных уравнений, характеризующих кинетику роста биомассы, утилизацию источника углеродного питания (глюкозы) и накопления О-антигена в ходе глубинного культивирования
Vibrio cholerae М-41 Огава. Произведена идентификация параметров математической модели. С использованием разработанного программного обеспечения в среде Mathcad 15.0 найдены значения кинетических констант и коэффициентов. Показано, что математическая модель адекватно описывает процесс биосинтеза О-антигена. Полученные данные могут применяться при масштабировании технологии глубинного культивирования
V. cholerae М-41 Огава.