Preview

Проблемы особо опасных инфекций

Расширенный поиск

Структурно-функциональный анализ криптических плазмид штаммов Yersinia pestis из двух природных очагов чумы России

https://doi.org/10.21055/0370-1069-2015-4-82-85

Полный текст:

Аннотация

Определены полные нуклеотидные последовательности двух криптических плазмид - pCKF из Центрально-Кавказского высокогорного очага чумы и pTP33 из Тувинского горного очага чумы в России. Установлено, что размер плазмиды pCKF составляет 5,4 т.п.н., а ее состав Г+Ц пар равен 38,4 %. В плазмиде содержится 8 открытых рамок считывания, кодирующих функции транспорта и секреции, в частности, системы секреции IV типа. Размер другой криптической плазмиды pTP33 равен 33,8 т.п.н., а состав Г+Ц пар равен 50,3 %. В pTP33 содержится 52 открытые рамки считывания, большинство из которых идентифицировано как фаговые белки, из чего следует, что pTP33 является кольцевым геномом фага. В pTP33 присутствуют также два гена двухкомпонентной системы белков токсин-антитоксин YoeB/YefM, действующей на репликативный аппарат бактерий.

Об авторах

Е. Г. Оглодин
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


Г. А. Ерошенко
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


Л. М. Куклева
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


Г. Н. Одиноков
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


Н. П. Гусева
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


С. А. Бугоркова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


В. В. Кутырев
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия


Список литературы

1. Балахонов С.В., Афанасьев М.В., Шестопалов М.Ю., Остяк А.С., Витязева С.А., Корзун В.М., Вержуцкий Д.Б. Первый случай выделения Yersinia pestis subsp. pestis в Алтайском горном природном очаге чумы. Сообщение I. Микробиологическая характеристика, молекулярно-генетическая и масс-спектрометрическая идентификация изолята. Пробл. особо опасных инф. 2013; 1:12-6.

2. Кутырев В.В., Ерошенко Г.А., Попов Н.В., Видяева Н.А., Коннов Н.П. Молекулярные механизмы взаимодействия возбудителя чумы с беспозвоночными животными. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2009; 24(4):169-76.

3. Проценко С.Л., Сердюкова Т.В., Розанова Г.Н. Выявление новой плазмиды у пролинзависимых штаммов возбудителя чумы из Центрально-Кавказского природного очага и гетерогенность циркулирующих в нем штаммов по плазмидному составу. В кн.: Особо опасные инфекции на Кавказе. Ставрополь; 1987. С. 265-7.

4. Aziz R.K., Bartels D., Best A.A., DeJongh M., Disz T., Edwards R.A., Formsma K., Gerdes S., Glass E.M., Kubal M., Meyer F., Olsen G.J., Olson R., Osterman A.L., Overbeek R.A., McNeil L.K., Paarmann D., Paczian T., Parrello B., Pusch G.D., Reich C., Stevens R., Vassieva O., Vonstein V., Wilke A., Zagnitko O. The RAST Server: rapid annotations using subsystems technology. BMC genomics. 2008; 9:75.

5. Christie P.J., Atmakuri K., Krishnamoorthy V. Jakubovsky S., Cascales E. Biogenesis, architecture, and function of bacterial type IV secretion systems. Annu. Rev. Microbiol. 2005; 59:451-85.

6. Dong X.Q., Lindler L.E., Chu M.C. Complete DNA sequence and analysis of an emerging cryptic plasmid isolated from Yersinia pestis. Plasmid. 2000; 43:144-8.

7. Grant J.R., Stothard P. The CGView Server: a comparative genomics tool for circular genomes. Nucleic Acids Res. 2008; 36:W181-4.

8. Song Y., Tong Z., Wang J., Guo Z., Han Y., Zhang J., Pei D., Zhou D., Qin H., Pang X., Han Y., Zhai J., Li M., Cui B., Qi Z., Jin L., Dai R., Chen F., Li S., Ye C., Du Z., Lin W., Wang J., Yu J., Yang H., Wang J., Huang P., Yang R. Complete genome sequence of Yersinia pestis strain 91001, an isolate avirulent to humans. DNA Research. 2004; 11:179-97.


Для цитирования:


Оглодин Е.Г., Ерошенко Г.А., Куклева Л.М., Одиноков Г.Н., Гусева Н.П., Бугоркова С.А., Кутырев В.В. Структурно-функциональный анализ криптических плазмид штаммов Yersinia pestis из двух природных очагов чумы России. Проблемы особо опасных инфекций. 2015;(4):82-85. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2015-4-82-85

For citation:


Oglodin E.G., Eroshenko G.A., Kukleva L.M., Odinokov G.N., Guseva N.P., Bugorkova S.A., Kutyrev V.V. Structural-Functional Analysis of Cryptic Plasmids in Yersinia pestis Strains from Two Natural Plague Foci of Russia. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2015;(4):82-85. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2015-4-82-85

Просмотров: 179


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)