MALDI-TOF масс-спектрометрический анализ штаммов возбудителя чумы
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2016-2-91-94
Аннотация
Цель. Продемонстрировать целесообразность создания базы данных референсных масс-спектров возбудителей особо опасных инфекций методом MALDI-TOF масс-спектрометрии на примере штаммов возбудителей чумы. Материалы и методы. В работе использовался метод MALDI-TOF масс-спектрометрии для получения масс-спектров рибосомальных белков исследуемых микроорганизмов с помощью масс-спектрометров Microflex LT. Результаты и выводы. Проведено сравнение полученных масс-спектров 10 штаммов Y. pestis с референсными спектрами Y. pseudotuberculosis коммерческой базы данных MALDI Biotyper 3.1 (Bruker Daltonics, Германия). Произведено апробирование базы данных при проведении идентификации штаммов чумного микроба, выделенных из природных очагов чумы на территории Российской Федерации в 2012 и 2014 гг. Разработанная база данных позволяет осуществлять идентификацию штаммов Y. pestis до вида.
Об авторах
А. Н. Спицын
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Д. В. Уткин
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Н. Е. Щербакова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
С. А. Портенко
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
А. С. Абдрашитова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
И. А. Касьян
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
В. Г. Германчук
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
В. Е. Куклев
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Список литературы
1. Спицын А.Н., Уткин Д.В., Куклев В.Е., Портенко С.А., Германчук В.Г., Осина Н.А. Применение MALDI масс-спектрометрии в диагностике инфекционных болезней. Современное состояние и перспективы. Пробл. особо опасных инф. 2014; 3:77-82.
2. Ayyadurai S., Flaudrops C., Raoult D., Drancourt M. Rapid identification and typing of Yersinia pestis and other Yersinia species by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometry. BMC Microbiology. 2010; 10:285.
3. Bader O., Weig M., Taverne-Ghadwal L., Lugert R., Cross U., Kuhns M. Improved clinical laboratory identification of human pathogenic yeasts by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry. Clin. Microbiol. Infect. 2011; 17:1359-65. DOI: 10.1111/j.1469-0691.2010.03398.x.
4. Cherkaoui A., Hibbs J., Emonet S., Tangomo M., Girard M., Francois P., Schrenzel J. Comparison of Two Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry Methods with Conventional Phenotypic Identification for Routine Identification of Bacteria to the Species Level. J. Clin. Microbiol. 2010; 48(4):1169-75. DOI: 10.1128/JCM.01881-09.
5. Croxatto A., Prod’hom G., Greub G. Applications of MALDI-TOF mass spectrometry in clinical diagnostic microbiology. FEMS Microbiol. Rev. 2011; 36:380-407. DOI: 10.1111/j.1574-6976.2011.00298.x.
6. Veen van S.Q., Claas E.C.J., Kuijper Ed. J. High-Throughput Identification of Bacteria and Yeast by Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry in Conventional Medical Microbiology Laboratories. J. Clin. Microbiol. 2010; 48(3):900-7. DOI: 10.1128/JCM.02071-09.
7. Wittwer M., Lasch P., Drevinek M., Schmoldt S., Indra A., Jacob D., Grunow R. First Report: Application of MALDI-TOF MS within an External Quality Assurance Exercise for the Discrimination of Highly Pathogenic Bacteria from Contaminant Flora. Applied Biosafety. 2012; 17(2):59-63.
Рецензия
Для цитирования:
Спицын А.Н., Уткин Д.В., Щербакова Н.Е., Портенко С.А., Абдрашитова А.С., Касьян И.А., Германчук В.Г., Куклев В.Е. MALDI-TOF масс-спектрометрический анализ штаммов возбудителя чумы. Проблемы особо опасных инфекций. 2016;(2):91-94. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2016-2-91-94
For citation:
Spitsyn A.N., Utkin D.V., Shcherbakova N.E., Portenko S.A., Abdrashitova A.S., Kas’Yan I.A., Germanchuk V.G., Kuklev V.E. MALDI-TOF Mass-Spectrometry Analysis of Plague Agent Strains. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2016;(2):91-94. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2016-2-91-94
Просмотров: 813
Послать статью по эл. почте 