БИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ BACILLUS ANTHRACIS, ВЫДЕЛЕННЫХ ВО ВРЕМЯ ВСПЫШКИ СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ В ЯМАЛО-НЕНЕЦКОМ АВТОНОМНОМ ОКРУГЕ В 2016 Г.


https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-1-94-99

Полный текст:


Аннотация

Цель работы  –  определение  фенотипических  свойств  и  генетических  особенностей  штаммов Bacillus anthracis, выделенных во время вспышки сибирской язвы на Ямале в 2016 г.

Материалы и методы. Исследовали штаммы сибиреязвенного микроба по основным, дополнительным идентификационным тестам и методами canSNP-, MLVA-генотипирования и полногеномного секвенирования.

Результаты и выводы. Выявлена идентичность фенотипических свойств, генотипов и профилей полногеномного секвенирования штаммов вне зависимости от источника выделения. Подтвержден общий источник заражения людей. Определены филогенетические взаимоотношения исследованных штаммов и их место в глобальной популяции B. Anthracis. Впервые изучена вариабельность набора генов, связанных с патогенностью, и показана эффективность использования предложенного алгоритма генетического типирования.


Об авторах

А. Н. Куличенко
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


Е. И. Еременко
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


А. Г. Рязанова
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


Л. Ю. Аксенова
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


Д. А. Ковалев
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


С. В. Писаренко
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


Н. Г. Варфоломеева
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


А. М. Жиров
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


А. С. Волынкина
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


Н. П. Буравцева
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


Т. М. Головинская
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


Е. А. Котенева
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


О. И. Цыганкова
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru


И. А. Дятлов
Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org


В. С. Тимофеев
Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org


А. Г. Богун
Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org


И. В. Бахтеева
Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org


А. А. Кисличкина
Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org


Р. И. Миронова
Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org


Г. М. Титарева
Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org


Ю. П. Скрябин
Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org


Ю. О, Селянинов
Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии
Россия
601125, Владимирская обл., Петушинский р-н, п. Больгинский, ул. Академика Бакулова, 1, e-mail: VNIIVViM@niiv.petush.elcom.ru


И. Ю. Егорова
Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии
Россия
601125, Владимирская обл., Петушинский р-н, п. Больгинский, ул. Академика Бакулова, 1, e-mail: VNIIVViM@niiv.petush.elcom.ru


Д. В. Колбасов
Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии
Россия
601125, Владимирская обл., Петушинский р-н, п. Больгинский, ул. Академика Бакулова, 1, e-mail: VNIIVViM@niiv.petush.elcom.ru


Список литературы

1. Van Ert M.N., Easterday W.R., Huynh L.Y., Okinaka R.T., Hugh-Jones M.E., Ravel J., Zanecki1 S. R., Pearson T., Simonson S.T, U'Ren J.M., Kachur S.M., Leadem-Dougherty R.R., Rhoton S.D., Zinser G., Farlow J., Coker P.R., Smith K.L., Wang B., Kenefic L.J., Fraser-Liggett C.M., Wagner D.M., Keim P. Global Genetic Population Structure of Bacillus anthracis. PLoSONE. 2007; 2(5):e461. DOI: 10.1371/journal.pone.0000461.

2. Lista F., Faggioni G., Valjevac S., Ciammaruconi A.,Vaissaire J., Doujet C., Olivier G., De Santis R., Carattoli A., Ciervo A., Fasanella A., Orsini F., D’Amelio R., Pourcel C., Cassone A., Vergnaud G. Genotyping of Bacillus anthracis strains based on Automated capillary 25-loci Multiple Locus Variable-Number Tandem Repeats Analysis. BMC Microbiol. 2006; 6:33. DOI: 10.1186/1471-2180-6-33.

3. Kenefic L.J., Beaudry J., Trim C., Huynh L., Zanecki S., Matthews M., Schupp J., Van Ert M., Keim P. A high resolution four-locus multiplex single nucleotide repeat (SNR) genotyping system in Bacillus anthracis. J. Microbiol. Methods. 2008; 73(3):269-72. DOI: 10.1016/j.mimet.2007.11.014.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Куличенко А.Н., Еременко Е.И., Рязанова А.Г., Аксенова Л.Ю., Ковалев Д.А., Писаренко С.В., Варфоломеева Н.Г., Жиров А.М., Волынкина А.С., Буравцева Н.П., Головинская Т.М., Котенева Е.А., Цыганкова О.И., Дятлов И.А., Тимофеев В.С., Богун А.Г., Бахтеева И.В., Кисличкина А.А., Миронова Р.И., Титарева Г.М., Скрябин Ю.П., Селянинов Ю.О., Егорова И.Ю., Колбасов Д.В. БИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ BACILLUS ANTHRACIS, ВЫДЕЛЕННЫХ ВО ВРЕМЯ ВСПЫШКИ СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ В ЯМАЛО-НЕНЕЦКОМ АВТОНОМНОМ ОКРУГЕ В 2016 Г. Проблемы особо опасных инфекций. 2017;(1):94-99. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-1-94-99

For citation: Kulichenko A.N., Eremenko E.I., Ryazanova A.G., Aksenova L.Y., Kovalev D.A., Pisarenko S.V., Varfolomeeva N.G., Zhirov A.M., Volynkina А.S., Buravtseva N.P., Golovinskaya T.M., Koteneva E.A., Tsygankova O.I., Dyatlov I.A., Timofeev V.S., Bogun A.G., Bakhteeva I.V., Kislichkina A.A., Mironova R.I., Titareva G.M., Skryabin Y.P., Selyaninov Y.O., Egorova I.Y., Kolbasov D.V. BIOLOGICAL PROPERTIES AND MOLECULAR-GENETIC CHARACTERISTICS OF BACILLUS ANTHRACIS STRAINS, ISOLATED DURING THE OUTBREAK OF ANTHRAX IN THE YAMALO-NENETS AUTONOMOUS DISTRICT IN 2016 Problems of Particularly Dangerous Infections. 2017;(1):94-99. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-1-94-99

Просмотров: 1745

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)