БИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ BACILLUS ANTHRACIS, ВЫДЕЛЕННЫХ ВО ВРЕМЯ ВСПЫШКИ СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ В ЯМАЛО-НЕНЕЦКОМ АВТОНОМНОМ ОКРУГЕ В 2016 Г.
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-1-94-99
Аннотация
Цель работы – определение фенотипических свойств и генетических особенностей штаммов Bacillus anthracis, выделенных во время вспышки сибирской язвы на Ямале в 2016 г.
Материалы и методы. Исследовали штаммы сибиреязвенного микроба по основным, дополнительным идентификационным тестам и методами canSNP-, MLVA-генотипирования и полногеномного секвенирования.
Результаты и выводы. Выявлена идентичность фенотипических свойств, генотипов и профилей полногеномного секвенирования штаммов вне зависимости от источника выделения. Подтвержден общий источник заражения людей. Определены филогенетические взаимоотношения исследованных штаммов и их место в глобальной популяции B. Anthracis. Впервые изучена вариабельность набора генов, связанных с патогенностью, и показана эффективность использования предложенного алгоритма генетического типирования.
Об авторах
А. Н. КуличенкоРоссия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
Е. И. Еременко
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
А. Г. Рязанова
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
Л. Ю. Аксенова
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
Д. А. Ковалев
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
С. В. Писаренко
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
Н. Г. Варфоломеева
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
А. М. Жиров
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
А. С. Волынкина
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
Н. П. Буравцева
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
Т. М. Головинская
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
Е. А. Котенева
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
О. И. Цыганкова
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13-15, e-mail: snipchi@mail.stv.ru
И. А. Дятлов
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org
В. С. Тимофеев
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org
А. Г. Богун
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org
И. В. Бахтеева
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org
А. А. Кисличкина
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org
Р. И. Миронова
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org
Г. М. Титарева
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org
Ю. П. Скрябин
Россия
142279, Московская обл., Серпуховский р-н, п. Оболенск, e-mail: info@obolensk.org
Ю. О, Селянинов
Россия
601125, Владимирская обл., Петушинский р-н, п. Больгинский, ул. Академика Бакулова, 1, e-mail: VNIIVViM@niiv.petush.elcom.ru
И. Ю. Егорова
Россия
601125, Владимирская обл., Петушинский р-н, п. Больгинский, ул. Академика Бакулова, 1, e-mail: VNIIVViM@niiv.petush.elcom.ru
Д. В. Колбасов
Россия
601125, Владимирская обл., Петушинский р-н, п. Больгинский, ул. Академика Бакулова, 1, e-mail: VNIIVViM@niiv.petush.elcom.ru
Список литературы
1. Van Ert M.N., Easterday W.R., Huynh L.Y., Okinaka R.T., Hugh-Jones M.E., Ravel J., Zanecki1 S. R., Pearson T., Simonson S.T, U'Ren J.M., Kachur S.M., Leadem-Dougherty R.R., Rhoton S.D., Zinser G., Farlow J., Coker P.R., Smith K.L., Wang B., Kenefic L.J., Fraser-Liggett C.M., Wagner D.M., Keim P. Global Genetic Population Structure of Bacillus anthracis. PLoSONE. 2007; 2(5):e461. DOI: 10.1371/journal.pone.0000461.
2. Lista F., Faggioni G., Valjevac S., Ciammaruconi A.,Vaissaire J., Doujet C., Olivier G., De Santis R., Carattoli A., Ciervo A., Fasanella A., Orsini F., D’Amelio R., Pourcel C., Cassone A., Vergnaud G. Genotyping of Bacillus anthracis strains based on Automated capillary 25-loci Multiple Locus Variable-Number Tandem Repeats Analysis. BMC Microbiol. 2006; 6:33. DOI: 10.1186/1471-2180-6-33.
3. Kenefic L.J., Beaudry J., Trim C., Huynh L., Zanecki S., Matthews M., Schupp J., Van Ert M., Keim P. A high resolution four-locus multiplex single nucleotide repeat (SNR) genotyping system in Bacillus anthracis. J. Microbiol. Methods. 2008; 73(3):269-72. DOI: 10.1016/j.mimet.2007.11.014.
Рецензия
Для цитирования:
Куличенко А.Н., Еременко Е.И., Рязанова А.Г., Аксенова Л.Ю., Ковалев Д.А., Писаренко С.В., Варфоломеева Н.Г., Жиров А.М., Волынкина А.С., Буравцева Н.П., Головинская Т.М., Котенева Е.А., Цыганкова О.И., Дятлов И.А., Тимофеев В.С., Богун А.Г., Бахтеева И.В., Кисличкина А.А., Миронова Р.И., Титарева Г.М., Скрябин Ю.П., Селянинов Ю.О., Егорова И.Ю., Колбасов Д.В. БИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ BACILLUS ANTHRACIS, ВЫДЕЛЕННЫХ ВО ВРЕМЯ ВСПЫШКИ СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ В ЯМАЛО-НЕНЕЦКОМ АВТОНОМНОМ ОКРУГЕ В 2016 Г. Проблемы особо опасных инфекций. 2017;(1):94-99. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-1-94-99
For citation:
Kulichenko A.N., Eremenko E.I., Ryazanova A.G., Aksenova L.Yu., Kovalev D.A., Pisarenko S.V., Varfolomeeva N.G., Zhirov A.M., Volynkina А.S., Buravtseva N.P., Golovinskaya T.M., Koteneva E.A., Tsygankova O.I., Dyatlov I.A., Timofeev V.S., Bogun A.G., Bakhteeva I.V., Kislichkina A.A., Mironova R.I., Titareva G.M., Skryabin Yu.P., Selyaninov Yu.O., Egorova I.Yu., Kolbasov D.V. BIOLOGICAL PROPERTIES AND MOLECULAR-GENETIC CHARACTERISTICS OF BACILLUS ANTHRACIS STRAINS, ISOLATED DURING THE OUTBREAK OF ANTHRAX IN THE YAMALO-NENETS AUTONOMOUS DISTRICT IN 2016. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2017;(1):94-99. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-1-94-99