Целью исследований являлась оценка состояния паразитарных систем и активности природных очагов чумы Российской Федерации в 2016 г. И разработка эпизоотологического прогноза на 2017 г. В 2016 г. Эпизоотии чумы выявлены на территории Кош-Агачского района Республики Алтай и Монгунтайгинского, Овюрского и Тес-Хемского кожуунов Республики Тыва на общей площади 1692,6 км². Выделено 87 штаммов чумного микроба, в том числе от грызунов и зайцеобразных – 31, от блох – 47, от вшей – 7, от иксодовых клещей – 2. Обоснован эпизоотологический прогноз на сохранение в 2017 г. Напряженной эпидемиологической обстановки в Кош-Агачском районе Республики Алтай и в Монгунтайгинском, Овюрском и Тес-Хемском кожуунах Республики Тыва. Для снижения эпидемических рисков разработаны комплексные планы профилактических мероприятий. На территории остальных природных очагов чумы эпизоотических проявлений не ожидается. Только в Прикаспийском песчаном очаге на территории лаганского и Черноземельского районов Республики Калмыкия сохраняется вероятность находок единично зараженных животных в осенний период 2017 г.

При оценке эпидемиологической обстановки по холере в мире установлена тенденция снижения заболеваемости в 2016 г. при среднем ежегодном темпе 3,907 % (относительно 2007 г.). При сравнительном анализе помесячной заболеваемости в 2015 и 2016 гг., установлена круглогодичная регистрация холеры в ряде стран Африки и Карибского бассейна с подъемами в различные сезоны. Формирование эндемичных очагов продолжается. С 2007 по 2016 год в мире имели место 1733 импортированных случая холеры с преобладанием межгосударственных заносов в Азии. Для прогноза по холере в мире впервые проведена оценка риска активизации эпидемического процесса с учетом чрезвычайных ситуаций различного происхождения, социальных и природных условий с использованием экспертной оценки их в баллах. Эпидемические проявления холеры в России характеризовались заносами холеры в 2008, 2010, 2012 и 2014 гг.: выделением из поверхностных водоемов V. choleraeO1 биовара Эль Тор ctxA^– tcpA^–, clxA⁺ и V. choleraeO139 ctxA^– и tcpA^–, а также единичных V. choleraeO1 биовара Эль Тор сtхA⁺ tсра⁺. разработан алгоритм эпидемиологического расследования для выяснения причин и условий контаминации холерными вибрионами поверхностных водоемов. Прогноз по холере на глобальном уровне и в России на 2017 г. остается неблагоприятным.

Приведены результаты анализа эпидемиологической и эпизоотологической ситуации по сибирской язве в мире в 2016 г. В Российской Федерации зафиксировано 36 случаев заболевания людей сибирской язвой. Эпизоотии отмечены в 3 федеральных округах. Сибирская язва у людей регистрировалась в приграничных странах Средней Азии, в ряде стран Азии и Африки. Эпизоотические очаги выявлены повсеместно с преобладанием в государствах Африки и Азии, в которых также выявлены случаи заболевания сибирской язвой диких животных. В 2017 г. прогнозируется нестабильная обстановка по сибирской язве в Российской Федерации и приграничных государствах.

Представлен анализ эпидемиологической ситуации по Крымской геморрагической лихорадке (КГЛ) в Российской Федерации в 2016 г., обобщены результаты эпизоотологического обследования территории природного очага КГЛ на юге европейской части России, приведены результаты генетического типирования изолятов вируса ККГЛ. В 2016 г. В Российской Федерации зарегистрировано 162 больных КГЛ. Рост заболеваемости КГЛ отмечен в Астраханской, Волгоградской областях, Республике Калмыкия, Ставропольском крае. Впервые выявлен случай заболевания КГЛ в Кабардино-Балкарской республике. На стационарных точках долговременного наблюдения за природным очагом КГЛ в 2016 г. Сохраняются высокие индексы обилия личинок и нимф H. marginatum. В случае благоприятных для перезимовки иксодовых клещей погодно-климатических условий зимы 2016–2017 гг., а также позднего наступления жаркого и засушливого периода летом 2017 г. Возможно сохранение высокой численности и увеличение периода активности имаго H. marginatum, что может способствовать росту заболеваемости КГЛ.

На территории стран, членов Европейского Союза, в России и Канаде в 2016 г. Наметилась тенденция к росту заболеваемости населения лихорадкой Западного Нила (ЛЗН), тогда как в США заболеваемость ЛЗН снизилась в сравнении с предыдущими периодами. Заболеваемость ЛЗН в Российской Федерации (РФ) в эпидемический сезон 2016 г. В целом по регионам была ниже среднемноголетних показателей, за исключением саратовской области, где было зарегистрировано 64 % от всех случаев ЛЗН в Российской Федерации. В 2016 г. Циркуляция (обнаружение маркеров) вируса Западного Нила (ВЗН) в носителях выявлена в 10 субъектах, а наличие специфических IgG антител у здоровых групп населения в 30 субъектах РФ. Генотипирование образцов ВЗН от умершего больного из астраханской области и проб комаров р. Сulex из Волгоградской области показало их принадлежность к 1 генотипу вируса. Прогноз развития эпидемической ситуации в 2017 г. Не исключает возможности локального повышения заболеваемости ЛЗН в отдельных субъектах РФ.

В статье приведен анализ эпидемиологической ситуации по клещевому вирусному энцефалиту в Российской Федерации за два десятилетних периода (1997–2006 и 2007–2016 гг.). Установлено, что в последнее десятилетие снижение показателей заболеваемости произошло во всех субъектах страны, отнесенных к группам с высокой и средней интенсивностью эпидемического процесса, за исключением Кировской области. Выявлены отличия в динамике снижения заболеваемости в группах субъектов с различной интенсивностью эпидемического процесса в европейской и азиатской частях России. Показано, что в современный период наиболее интенсивно эпидемический процесс протекает в азиатской части нозоареала клещевого вирусного энцефалита. В краткосрочной перспективе, при сохранении объемов профилактических мер, на территориях европейской и азиатской частей страны заболеваемость будет ниже средних многолетних показателей за 2007–2016 гг. или незначительно их превысит.

При оценке эпидемиологической обстановки по холере в мире установлена тенденция снижения заболеваемости в 2016 г. при среднем ежегодном темпе 3,907 % (относительно 2007 г.). При сравнительном анализе помесячной заболеваемости в 2015 и 2016 гг., установлена круглогодичная регистрация холеры в ряде стран Африки и Карибского бассейна с подъемами в различные сезоны. Формирование эндемичных очагов продолжается. С 2007 по 2016 год в мире имели место 1733 импортированных случая холеры с преобладанием межгосударственных заносов в Азии. Для прогноза по холере в мире впервые проведена оценка риска активизации эпидемического процесса с учетом чрезвычайных ситуаций различного происхождения, социальных и природных условий с использованием экспертной оценки их в баллах. Эпидемические проявления холеры в России характеризовались заносами холеры в 2008, 2010, 2012 и 2014 гг.: выделением из поверхностных водоемов V. choleraeO1 биовара Эль Тор ctxA^– tcpA^–, clxA⁺ и V. choleraeO139 ctxA^– и tcpA^–, а также единичных V. choleraeO1 биовара Эль Тор сtхA⁺ tсра⁺. разработан алгоритм эпидемиологического расследования для выяснения причин и условий контаминации холерными вибрионами поверхностных водоемов. Прогноз по холере на глобальном уровне и в России на 2017 г. остается неблагоприятным.

Представлен порядок и особенности организации оперативных диагностических и мониторинговых исследований материала во время вспышки сибирской язвы в Ямало-Ненецком автономном округе в 2016 г. Охарактеризованы основные направления работы лабораторной базы. Приведены результаты лабораторных исследований различного материала (клинические образцы, материал от животных, пробы объектов окружающей среды) на наличие возбудителя сибирской язвы.

Представлены особенности организации противоэпидемических мероприятий во время вспышки сибирской язвы в Ямало-Ненецком  автономном округе в 2016 г. В результате комплекса мер активно выявлены и госпитализированы больные, проведена иммунизация и экстренная антибиотикопрофилактика групп риска заражения, вакцинация северных оленей, утилизация туш павших животных. Осуществлены дезинфекционные, дератизационные и дезинсекционные мероприятия. Организована эвакуация коренных жителей из очага инфекции, проведена разъяснительная работа с населением, развернуты санитарные пропускники и пункты временного размещения. Благодаря оперативно реализованным противоэпидемическим мерам в межведомственном формате очаг сибирской язвы был локализован в течение одного инкубационного периода.

В работе представлены материалы, характеризующие исторические аспекты распространения сибирской язвы на территории Сибири и Дальнего Востока. Болезнь укоренилась и распространилась по всей Азиатской России, при этом большая часть почвенных очагов сибирской язвы сконцентрирована в южных ее субъектах. Для Сибири и Дальнего Востока характерен низкий уровень заболеваемости сибирской язвой среди людей. Это обусловлено особенностями содержания сельскохозяйственных животных и невысокой плотностью населения. Исторически, появление значительного количества стационарно неблагополучных пунктов и почвенных очагов – результат отсутствия должного ветеринарного наблюдения и обеспечения профилактических мероприятий по утилизации павших животных. Периодическое возникновение эпизоотических осложнений по сибирской язве в одних и тех же местах свидетельствует о стойкости почвенных очагов этой болезни.

В Сибири и на Дальнем Востоке учтен 7201 стационарно неблагополучный по сибирской язве пункт и 557 сибиреязвенных захоронений (скотомогильников). Эпизоотолого-эпидемиологическая ситуация по сибирской язве в азиатской части Российской Федерации на современном этапе характеризуется неравномерностью территориального распределения с выраженным неблагополучием в районах Крайнего Севера и южных субъектах региона; преобладанием старых неманифестных СНП (98,9 %); эпизоотий с эпидемическими осложнениями (82,5 %); доминированием удельного веса заболеваний оленей (80,2 %) над другими видами СХЖ. Основная доля заболеваний отмечалась среди непривитого против сибирской язвы (100 %) сельского населения (97,5 %), мужского пола (77,5 %), трудоспособного возраста, заражение происходило при вынужденном убое скота (90,5 %), с преобладанием кожной формы болезни (82,5 %) и контактного пути (86,7 %) передачи возбудителя. Основными факторами передачи B. Anthracis служили кровь, мясо и мясопродукты (97,5 %). Заболеваемость людей относилась к непрофессиональной группе приусадебного типа животноводческого подтипа (95,0 %). События 2016 г. В Ямало-Ненецком автономном округе подтвердили необходимость эффективного межведомственного взаимодействия и оптимизации нормативного законодательства по утилизации СХЖ, состоянию сибиреязвенных захоронений.

 Современная ситуация по сибирской язве характеризуется как нестабильная. Нестабильность связана с периодически возникающими эпизоотическими вспышками, осложняющимися заболеваемостью людей, так как люди заражаются преимущественно в результате контакта с больными животными, их трупами или продуктами животноводства. Выявлены новые механизмы распространения инфекции при аэрозольном заражении вследствие преднамеренного использования спор B. Anthracis в целях биотрерроризма и в результате использования африканских барабанов, контаминированных спорами сибиреязвенного микроба, парэнтеральном употреблении контаминированного героина, приведшем к выделению новой клинической формы сибирской язвы – инъекционной. Представления об эволюции возбудителя сибирской язвы пополнились знаниями о существовании патогенных штаммов бацилл, занимающих промежуточное положение между B. Anthracis и B. Cereus. В области экологии сибиреязвенного микроба наметились новые аспекты проблемы обитания во внешней среде, связанные со взаимодействием с бактериофагами, почвенной микрофлорой и ризосферой. Исследования, связанные с экологическими особенностями ниш обитания и генотипами сибиреязвенного микроба, объясняющими географическое распределение областей с высоким риском заболеваемости, могут позволить оптимизировать программы иммунизации животных, являющейся самой эффективной мерой профилактики сибирской язвы.

Эффективность и своевременность медицинской помощи инфекционным больным в значительной степени определяются оперативностью диагностики и рациональной организацией медицинской сортировки больных и контактных лиц. В 2016 г. На территории Ямало-Ненецкого автономного округа была зарегистрирована вспышка сибирской язвы. В непосредственной зоне эпизоотии находилось 327 человек, в том числе 135 детей, в угрожаемой зоне – 539 человек, в том числе 217 детей. Организация медицинской помощи пациентам и контактным лицам сопровождалась объективными трудностями, связанными с обширностью угрожаемой по распространению инфекции территории, наличием нетипичных и редких клинических форм сибирской язвы. Представлен анализ мероприятий по оказанию медицинской помощи больным сибирской язвой, предложены алгоритмы медицинской сортировки больных и организации экстренных инфекционных отделений.

В 2016 г. На территории Ямало-Ненецкого автономного округа зарегистрировано 36 случаев заболевания людей различными клиническими формами сибирской язвы. Клинические проявления кожной формы сибирской язвы характеризовались наличием кожных аффектов по типу карбункула, однако отмечались объективные трудности клинической диагностики, связанные с нетипичностью клинических проявлений (эризипелоидная форма, образования по типу корочки). Клинические проявления орофарингеальной формы сибирской язвы характеризовались выраженной лихорадочной реакцией, интоксикационном синдромом, отеком подкожно-жировой клетчатки лица и шеи, поражением слизистых оболочек. Интестинальная форма сибирской язвы была диагностирована у одного пациента и характеризовалась острым началом с появления слабости, снижения аппетита, рвоты, болей в животе. На основании проведенного исследования были предложены мероприятия по оптимизации подходов к клинической диагностике сибирской язвы.

Приведены обобщенные данные по эпидемиологической и эпизоотологической обстановке по сибирской язве в Российской Федерации, проанализированы причины неустойчивости ситуации. Охарактеризованы современные клинико-эпидемиологические особенности сибиреязвенной инфекции. Представлены ключевые направления совершенствования эпидемиологического надзора и контроля за сибирской язвой в современных условиях, основанные на системном подходе и эффективном межведомственном взаимодействии.

Цель исследования. Анализ эпизоотологических и эпидемиологических рисков, способствовавших развитию вспышки сибирской язвы на полуострове Ямал в июле–августе 2016 г.

Материалы и методы. Для анализа рисков использовался комплексный подход, позволивший по материалам литературных, архивных, а также статистических данных в динамике оценить действие эпидемиологически значимых социальных, природных и биологических рисков. Особое внимание уделено оценке природно-климатических факторов, способствующих сохранению возбудителя в окружающей среде, таких как индекс NDVI, температура и влажность воздуха, а также почвы на различной глубине по данным спутникового мониторинга.

Результаты и выводы. Подтверждена гипотеза о стационарном неблагополучии почвенных очагов Ямала, сохраняющейся опасности осложнения эпизоотологической и эпидемиологической ситуации по сибирской язве на фоне меняющихся природных и социальных факторов риска, а также способности возбудителя выживать в почве неопределенно длительное время.

Цель работы  –  определение  фенотипических  свойств  и  генетических  особенностей  штаммов Bacillus anthracis, выделенных во время вспышки сибирской язвы на Ямале в 2016 г.

Материалы и методы. Исследовали штаммы сибиреязвенного микроба по основным, дополнительным идентификационным тестам и методами canSNP-, MLVA-генотипирования и полногеномного секвенирования.

Результаты и выводы. Выявлена идентичность фенотипических свойств, генотипов и профилей полногеномного секвенирования штаммов вне зависимости от источника выделения. Подтвержден общий источник заражения людей. Определены филогенетические взаимоотношения исследованных штаммов и их место в глобальной популяции B. Anthracis. Впервые изучена вариабельность набора генов, связанных с патогенностью, и показана эффективность использования предложенного алгоритма генетического типирования.

Целью работы являлось проведение идентификации референтных штаммов патогенных микроорганизмов из фонда Государственной коллекции патогенных бактерий ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб» с применением микробиологического анализатора Vitek 2 с последующим установлением их биохимических маркеров аутентичности.

Материалы и методы. В основу методического подхода заложено применение автоматизированной системы Vitek 2 Bio-Mérieux с последующим проведением анализа полученных результатов в программе bionumerics 7.5.

Результаты и выводы. Проведено подтверждение аутентичности 103 референтных штаммов патогенных микроорганизмов из ГКПБ ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб». Установлено, что семь из них (6,8 %) не соответствовали своим паспортным данным и не могут использоваться в научно-практической деятельности, вследствие чего были заменены на подтвержденные аналоги. Анализ результатов взаимодействия изучаемых штаммов с дифференцирующими субстратами, позволил определить для каждого из них маркеры аутентичности, необходимые для контроля подлинности коллекционной культуры при ее воспроизводстве и хранении. На основе полученных данных были обновлены паспорта изученных референтных штаммов.