Preview

Проблемы особо опасных инфекций

Расширенный поиск

ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ШТАММОВ БРУЦЕЛЛ, ВЫДЕЛЕННЫХ В СЕВЕРО-КАВКАЗСКОМ ФЕДЕРАЛЬНОМ ОКРУГЕ

https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-3-58-62

Полный текст:

Аннотация

Цель исследования – изучение генетического разнообразия штаммов Brucella разных видов, изолированных от людей и мелких млекопитающих животных на территории Северо-Кавказского федерального округа методом MLVA14, определение взаимосвязи сформированных кластеров с местом, временем и объектом выделения.

Материалы и методы. Проведено MLVA14 генотипирование 91 штамма Brucella spp., выделенных от больных людей, мелких млекопитающих и сельскохозяйственных животных. Размеры ампликонов сравнивали с базой MLVA Bank 5.0 tutorial version 1.6. На основании полученных данных построена дендрограмма филогенетических связей изученных штаммов.

Результаты и выводы. На основании MLVA-генотипирования изученные штаммы разделены на 61 MLVA14 генотип. Штаммы подвидов B. suis, B. abortus, B. melitensis на дендрограмме формируют отдельные кластеры. Одинаковые MLVA14 типы B. melitensis имеют штаммы, выделенные во время групповых заболеваний людей бруцеллезом, штаммы B. suis приурочены к эпизоотиям среди мелких млекопитающих, которые могут протекать на различных административных территориях. Полученные данные могут быть использованы для мониторинга за возбудителем бруцеллеза, в том числе в качестве эффективного инструмента ретроспективного эпидемиологического анализа. 

Об авторах

И. В. Кузнецова
ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15


Д. А. Ковалев
ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15


Ю. М. Евченко
ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15


Л. И. Шакирова
ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15


Н. М. Швецова
ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15


Д. Г. Пономаренко
ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15


С. В. Писаренко
ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15


А. М. Жиров
ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15


А. А. Лукина
ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15


А. Н. Куличенко
ФКУЗ «Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
355035, Ставрополь, ул. Советская, 13–15


Список литературы

1. Анализ эпидемиологической ситуации по бруцеллезу в Российской Федерации в 2015 году и прогноз на 2016 год. http://www.snipchi.ru/updoc/obzor-epid.-situatsii-po-brutsellezu-v-rf-v-2015.pdf (дата обращения 01.06.16 г.).

2. Лямкин Г.И., Таран И.Ф., Щедрин В.И. Современные представления о бруцеллезе как природно-очаговом заболевании. Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 1995; 2:115–8.

3. Савилов Е.Д., Мамонтова Л.М., Астафьев В.А., Жданова С.Н. Применение статистических методов в эпидемиологиче- ском анализе. М.: МЕДпресс-информ; 2004. 112 с.

4. Таран И.Ф. Бруцеллезная инфекция с позиции природно-очагового заболевания. Эпидемиология и профилактика особо опасных инфекций в МНР и СССР. Улан-Батор; 1978. С. 193–4.

5. Le Flèche P., Jacques I., Grayon M., Al Dahouk S., Bouchon P., Denoeud F., Nöckler K., Neubauer H., Guilloteau L., Vergnaud G. Evaluation and selection of tandem repeat loci for a Brucella MLVA typing assay. BMC Microbiol. 2006; 6(9):1–14. DOI: 10.1186/1471-2180-6-9.

6. Jiang H., Wang H., Xu L., Hu G., Ma J., Xiao P., Fan W., Di D., Tian G., Fan M., Mi J., Yu R., Song L., Zhao H., Piao D., Cui B. MLVA Genotyping of Brucella melitensis and Brucella abortus Isolates from Different Animal Species and Humans and Identification of Brucella suis Vaccine Strain S2 from Cattle in China. PLOS ONE. 2013; 8(10):76332. DOI: 10.1371/journal.pone.0076332.

7. Ma J., Wang H., Zhang Х., Xu L., Hu G., Jiang H., Zhao F., Zhao H., Piao D., QinY., Cui B., Lin G. MLVA and MLST typing of Brucella from Qinghai, China. Infect. Dis. Poverty. 2016; 5(26):1–9. DOI: 10.1186/s40249-016-0123-z.

8. Massis F., Ancora M., Atzeni M., Rolesu S., Bandino E., Danzetta M., Zilli K., Giannatale E., Scacchia M. MLVA as an Epidemiological Tool To Trace Back Brucella melitensis Biovar 1 Re-Emergence in Italy. Transbound. Emerg. Dis. 2015; 62(5):463–9. DOI: 10.1111/tbed.12397.

9. MLVA bank for Microbes Genotyping. (Cited 01 Jun 2016). Available from: http://mlva.u-psud.fr.

10. START version 2. (Cited 01 Jun 2016). Available from: http://pubmlst.org/software/analysis/start2/.


Для цитирования:


Кузнецова И.В., Ковалев Д.А., Евченко Ю.М., Шакирова Л.И., Швецова Н.М., Пономаренко Д.Г., Писаренко С.В., Жиров А.М., Лукина А.А., Куличенко А.Н. ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ШТАММОВ БРУЦЕЛЛ, ВЫДЕЛЕННЫХ В СЕВЕРО-КАВКАЗСКОМ ФЕДЕРАЛЬНОМ ОКРУГЕ. Проблемы особо опасных инфекций. 2017;(3):58-62. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-3-58-62

For citation:


Kuznetsova I.V., Kovalev D.A., Evchenko Y.M., Shakirova L.I., Shvetsova N.M., Ponomarenko D.G., Pisarenko S.V., Zhirov A.M., Lukina A.A., Kulichenko A.N. THE STUDY OF GENETIC DIVERSITY OF BRUCELLA STRAINS ISOLATED IN THE NORTH CAUCASIAN FEDERAL DISTRICT. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2017;(3):58-62. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-3-58-62

Просмотров: 150


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)