ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ШТАММОВ БРУЦЕЛЛ, ВЫДЕЛЕННЫХ В СЕВЕРО-КАВКАЗСКОМ ФЕДЕРАЛЬНОМ ОКРУГЕ

Цель исследования – изучение генетического разнообразия штаммов Brucella разных видов, изолированных от людей и мелких млекопитающих животных на территории Северо-Кавказского федерального округа методом MLVA14, определение взаимосвязи сформированных кластеров с местом, временем и объектом выделения.

Материалы и методы. Проведено MLVA14 генотипирование 91 штамма Brucella spp., выделенных от больных людей, мелких млекопитающих и сельскохозяйственных животных. Размеры ампликонов сравнивали с базой MLVA Bank 5.0 tutorial version 1.6. На основании полученных данных построена дендрограмма филогенетических связей изученных штаммов.

Результаты и выводы. На основании MLVA-генотипирования изученные штаммы разделены на 61 MLVA14 генотип. Штаммы подвидов B. suis, B. abortus, B. melitensis на дендрограмме формируют отдельные кластеры. Одинаковые MLVA14 типы B. melitensis имеют штаммы, выделенные во время групповых заболеваний людей бруцеллезом, штаммы B. suis приурочены к эпизоотиям среди мелких млекопитающих, которые могут протекать на различных административных территориях. Полученные данные могут быть использованы для мониторинга за возбудителем бруцеллеза, в том числе в качестве эффективного инструмента ретроспективного эпидемиологического анализа. 

1. Анализ эпидемиологической ситуации по бруцеллезу в Российской Федерации в 2015 году и прогноз на 2016 год. http://www.snipchi.ru/updoc/obzor-epid.-situatsii-po-brutsellezu-v-rf-v-2015.pdf (дата обращения 01.06.16 г.).

2. Лямкин Г.И., Таран И.Ф., Щедрин В.И. Современные представления о бруцеллезе как природно-очаговом заболевании. Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 1995; 2:115–8.

3. Савилов Е.Д., Мамонтова Л.М., Астафьев В.А., Жданова С.Н. Применение статистических методов в эпидемиологиче- ском анализе. М.: МЕДпресс-информ; 2004. 112 с.

4. Таран И.Ф. Бруцеллезная инфекция с позиции природно-очагового заболевания. Эпидемиология и профилактика особо опасных инфекций в МНР и СССР. Улан-Батор; 1978. С. 193–4.

5. Le Flèche P., Jacques I., Grayon M., Al Dahouk S., Bouchon P., Denoeud F., Nöckler K., Neubauer H., Guilloteau L., Vergnaud G. Evaluation and selection of tandem repeat loci for a Brucella MLVA typing assay. BMC Microbiol. 2006; 6(9):1–14. DOI: 10.1186/1471-2180-6-9.

6. Jiang H., Wang H., Xu L., Hu G., Ma J., Xiao P., Fan W., Di D., Tian G., Fan M., Mi J., Yu R., Song L., Zhao H., Piao D., Cui B. MLVA Genotyping of Brucella melitensis and Brucella abortus Isolates from Different Animal Species and Humans and Identification of Brucella suis Vaccine Strain S2 from Cattle in China. PLOS ONE. 2013; 8(10):76332. DOI: 10.1371/journal.pone.0076332.

7. Ma J., Wang H., Zhang Х., Xu L., Hu G., Jiang H., Zhao F., Zhao H., Piao D., QinY., Cui B., Lin G. MLVA and MLST typing of Brucella from Qinghai, China. Infect. Dis. Poverty. 2016; 5(26):1–9. DOI: 10.1186/s40249-016-0123-z.

8. Massis F., Ancora M., Atzeni M., Rolesu S., Bandino E., Danzetta M., Zilli K., Giannatale E., Scacchia M. MLVA as an Epidemiological Tool To Trace Back Brucella melitensis Biovar 1 Re-Emergence in Italy. Transbound. Emerg. Dis. 2015; 62(5):463–9. DOI: 10.1111/tbed.12397.

9. MLVA bank for Microbes Genotyping. (Cited 01 Jun 2016). Available from: http://mlva.u-psud.fr.

10. START version 2. (Cited 01 Jun 2016). Available from: http://pubmlst.org/software/analysis/start2/.