ЭПИДЕМИОЛОГИЯ 
Цель данного исследования состояла в разработке методики выявления административно-независимых потенциальных территорий риска при реализации внешних эпидемиологических угроз на примере холеры.
Материалы и методы. Анализ проводили с использованием бесплатного программного обеспечения с открытым исходным кодом (QGIS 2.8 и GRASS GIS 7.0) на основе данных, полученных от Росграницы и Федеральной службы государственной статистики. Построение картограмм риска проводили на основе евклидовой дистанции и оценки плотности ядер.
Результаты и выводы. Создана ГИС, содержащая информацию о пунктах пропуска через границу Российской Федерации, населенных пунктах, автомобильных дорогах и железнодорожных магистралях. Разработана методика выявления территорий риска завоза инфекционных болезней на модели холеры, при этом их суммарная площадь составила менее 1 % от всей площади страны. Установлено, что в ряде случаев территория риска располагается на некотором удалении от пункта пропуска, но наличие пункта пропуска не всегда приводит к формированию территории риска. Разработанная ГИС доступна на геоинформационном портале ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт».
Существующий в настоящее время порядок свободного позиционирования и регистрации мест забора проб полевого материала приводит к хаотическому нагромождению изображаемых на карте значков обследованных участков, затрудняющему пространственный анализ результатов мониторинга за тот или иной период.
Цель исследования. Разработка системы стандартизации, расположения и нумерации пунктов эпизоотологического обследования при мониторинге природных очагов чумы.
Материалы и методы. Топографические карты, материалы эпизоотологического картографирования и их анализ.
Результаты и выводы. Оптимальный размер точки эпизоотологического обследования (ТЭО): 10 секунд по широте, 15 секунд по долготе. В рамках одного сектора умещается 900 стандартных ТЭО. Предлагаемая система стандартизации обследуемых пунктов способна существенно упростить процесс эпизоотологического и эпидемиологического картографирования, улучшить визуализацию результатов мониторинга, а также расширить возможности и качество пространственного и ретроспективного анализа эпизоотической активности природных очагов чумы.
МИКРОБИОЛОГИЯ 
Цель исследований. Изучение в эксперименте влияния штаммов Yersinia pestis с различным плазмидным составом на алиментарную активность и смертность Citellophilus tesquorum altaicus, частоту и динамику формирования биопленки в их организме.
Материалы и методы. В опытах с C. tesquorum altaicus использованы штаммы: вирулентные трехплазмидный И-3230, изолированный в Монголии, и референтный для Тувинского очага И-2638, имеющий четыре плазмиды (pYT, pYV, pYP, pTP 33), а также селекционированный от него авирулентный изогенный клон И-3480, утративший две плазмиды (pYV, pYP).
Результаты и выводы. Установлено, что штаммы И-2638 и И-3480, несущие плазмиду pTP33, более активно формировали биопленку в организме блох, а смертность была выше среди насекомых, инфицированных штаммом И-3230. Четырехплазмидный штамм И-2638 по всем исследуемым показателям превосходил трехплазмидный И-3230 и двухплазмидный И-3480, что может свидетельствовать о коадаптации возбудителя чумы и C. tesquorum altaicus из Тувинского очага и возможности функциональной роли плазмиды pTP33 в усилении формирования биопленки in vivo.
Цель – разработка пероксидазного конъюгата на основе МКА H2F6 и изучение возможности его использования для выявления tcp+ штаммов холерных вибрионов О1/О139 серогрупп в прямых методах ИФА.
Материалы и методы. В работе использовали гибридный клон H2F6, синтезирующий в культуральную среду моноклональные антитела, специфичные к белку наружной мембраны холерного вибриона.
Результаты и выводы. На основе МКА сконструирован пероксидазный конъюгат, позволяющий выявлять tcp+ штаммы V. cholerae О1 и О139 в прямом ТИФА и дот-ИФА. Испытания препарата на наборе штаммов холерных вибрионов и гетерологичных микроорганизмов показали его специфичность в отношении V. cholerae О1 и О139. Моноклональный пероксидазный конъюгат H2F6 может быть использован для детекции в иммуноферментных методах эпидемически значимых штаммов холерных вибрионов О1/О139 серогрупп.
Цель исследования заключалась в моделировании взаимодействия Burkholderia pseudomallei с Tetrahymena pyriformis in vitro и изучении изменений в популяционном составе простейших при совместном культивировании с микроорганизмом.
Материалы и методы. В работе использовали штаммы B. pseudomallei 110, С141, 57576, 107, отличающиеся по вирулентности для мышей линии BALB/c. Аксеническую культуру T. pyriformis выращивали в LB-бульоне при температуре 28 °С. Буркхольдерии соединяли с тетрахименами в соотношении 100:1. Сокультуры инкубировали при температуре 28 °С в LB на протяжении срока наблюдения. Образцы сокультур просматривали при световой микроскопии, оценивая изменения в популяционном составе тетрахимен по количественному соотношению трофозоитов и цист. Для определения динамики размножения культур B. pseudomallei, ассоциированных с T. pyriformis, из сокультур ежедневно производили высев на плотную питательную среду для подсчета выросших колоний.
Результаты и выводы. В ассоциации с тетрахименами B. pseudomallei поглощается клетками простейших, размножается в них и индуцирует инцистирующую активность тетрахимен. При этом вирулентный штамм B. pseudomallei 110 осуществляет переход клеток T. pyriformis в состояние цист на 2–4-е сутки и их полное разрушение на 7–8-е сутки. Авирулентный штамм B. pseudomallei 107 вызывает полное инцистирование простейших не ранее 7 суток, и значительная часть цист остается неразрушенной на 10-е сутки. Динамика роста B. pseudomallei в сокультуре с T. pyriformis характеризуется в первые сутки отчетливым снижением количества жизнеспособных клеток, которое через 24 ч возрастает и постепенно достигает показателей, близких к исходным. Кривые подъема концентрации микроорганизмов зависят от вирулентности штамма: максимальное размножение культуры B. pseudomallei 110 наблюдается спустя 48 ч, тогда как для штамма B. pseudomallei 107 это время составляет не менее 7–8 сут.
Цель. Создание алгоритма оценки экспрессии структурных и регуляторных генов вирулентности Vibrio cholerae на модели генов ctxA и toxR, кодирующих и контролирующих биосинтез холерного токсина.
Материалы и методы. В работе использовано 10 штаммов Vibrio choleraе классического и Эль Тор биоваров. Клонирование фрагментов генов проводили путем лигирования и трансформации. ОТ-ПЦР проводили на амплификаторах «БИС М112» и «Rotor-GeneQ». Обработку результатов осуществляли с помощью программного обеспечения к прибору RotorGeneQ (Software 1.8.17.5).
Результаты и выводы. Разработан алгоритм оценки уровня экспрессии генов ctxА и toxR V. cholerae методом ОТ-ПЦР с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов в режиме реального времени. Указанный алгоритм позволяет быстро и эффективно проводить статистически значимое определение экспрессии структурных и регуляторных генов вирулентности V. cholerae и может быть использован для оценки вновь выделяемых штаммов холерного вибриона.
Цель исследования – изучение генетического разнообразия штаммов Brucella разных видов, изолированных от людей и мелких млекопитающих животных на территории Северо-Кавказского федерального округа методом MLVA14, определение взаимосвязи сформированных кластеров с местом, временем и объектом выделения.
Материалы и методы. Проведено MLVA14 генотипирование 91 штамма Brucella spp., выделенных от больных людей, мелких млекопитающих и сельскохозяйственных животных. Размеры ампликонов сравнивали с базой MLVA Bank 5.0 tutorial version 1.6. На основании полученных данных построена дендрограмма филогенетических связей изученных штаммов.
Результаты и выводы. На основании MLVA-генотипирования изученные штаммы разделены на 61 MLVA14 генотип. Штаммы подвидов B. suis, B. abortus, B. melitensis на дендрограмме формируют отдельные кластеры. Одинаковые MLVA14 типы B. melitensis имеют штаммы, выделенные во время групповых заболеваний людей бруцеллезом, штаммы B. suis приурочены к эпизоотиям среди мелких млекопитающих, которые могут протекать на различных административных территориях. Полученные данные могут быть использованы для мониторинга за возбудителем бруцеллеза, в том числе в качестве эффективного инструмента ретроспективного эпидемиологического анализа.
Модернизация системы непрерывного образования в области здравоохранения и повышение эффективности обучения связывают с использованием информационных и коммуникационных технологий, в том числе электронного обучения и дистанционного образования.
Цель исследования: оценка перспектив применения электронного и дистанционного обучения при профессиональной подготовке специалистов для работ с патогенными биологическими агентами.
Материалы и методы. Аналитическим методом изучены законодательные, нормативно-методические документы, публикации в области использования информационно-коммуникационных технологий в образовательной деятельности; безопасности работ с ПБА I–IV групп патогенности; профессиональные компетенции специалистов, допускаемых к работам с ПБА; учебные программы профессиональной переподготовки и повышения квалификации, реализуемые на базе противочумных учреждений Роспотребнадзора.
Результаты и выводы. Проведение курсов профессиональной переподготовки специалистов с помощью дистанционного обучения не представляется возможным. Целесообразно, перспективно и актуально применение элементов электронного обучения при реализации учебных программ профессиональной переподготовки, а элементов дистанционного и электронного обучения – программ повышения квалификации. Современные информационные технологии могут существенно повысить эффективность дополнительного профессионального образования на базе противочумных учреждений Роспотребнадзора.
Цель работы. Изучение биологических характеристик штаммов вируса гриппа, вызвавших вспышки в России в 2016–2017 гг.
Материалы и методы. Исследования выполнены с использованием современных вирусологических и молекулярно-биологических методов анализа на современном оборудовании.
Результаты и выводы. В 2016 г. на территории Российской Федерации зарегистрированы вспышки среди диких и домашних птиц, вызванные высокопатогенным вирусом гриппа H5N8-субтипа. В мае 2016 г. зафиксирована гибель диких птиц на территории Республики Тыва. В октябре–ноябре 2016 г. вирус H5N8 выделен на территории республик Татарстан, Калмыкия в Краснодарском крае и Астраханской области. В 2017 г. вирус гриппа H5N8 широко распространился в Европейской части России, где вызвал вспышки среди диких и домашних птиц. Результаты исследования выделенных штаммов показали, что все они являются высокопатогенными и относятся к генетической кладе 2.3.4.4. Молекулярно-генетический и вирусологический анализ выявил различия между штаммами 2016–2017 гг. и штаммом той же клады, циркулировавшим в России в 2014 г.
Целью работы является оценка и диагностической чувствительности и специфичности «Набора реагентов. Диагностикум эритроцитарный кокцидиоидомикозный и гистоплазмозный иммуноглобулиновый сухой», предназначенного для идентификации возбудителей кокцидиоидомикоза и гистоплазмоза в выделенных культурах микромицетов, а также клиническом и биологическом материале с помощью РНГА.
Материалы и методы. С использованием предложенного диагностикума проведено исследование 264 положительных проб (216 проб суспензий микромицетов, 48 проб биологического и клинического материала), содержащих возбудители гистоплазмоза, кокцидиоидомикоза в концентрации 3,12∙106 и 1,56∙106 кл/мл и 128 отрицательных проб, содержащих гетерологичные микроорганизмы в концентрации 5∙107 кл/мл. В работе использовали пробы биологического материала, искусственно контаминированные данными возбудителями особо опасных микозов, и полученные от биопробных животных с экспериментальной инфекцией.
Выводы и результаты. Установлено, что диагностическая чувствительность набора реагентов составила не менее 99,0 %, диагностическая специфичность – не менее 98,0 %. Воспроизводимость результатов во всех случаях 100 %. Полученные результаты указывают на перспективность внедрения разработанного препарата в практику здравоохранения.
Минимизация рисков заражения при подготовке специалистов для работы с микроорганизмами – возбудителями особо опасных инфекционных болезней – одна из основных задач сотрудников отдела образовательных программ и подготовки специалистов ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб».
Целью статьи явилась необходимость проанализировать пути снижения рисков инфицирования возбудителями особо опасных инфекций слушателей курсов и преподавателей при обучении работе с этой группой микроорганизмов. Выявлены приоритетные направления: обучение с использованием слабовирулентных, авирулентных штаммов возбудителей особо опасных инфекционных болезней, а также рекомбинантных штаммов непатогенных бактерий; использование современного инженерно-технического оборудования; создание у специалистов устойчивых навыков работы с ПБА и воспитание профессионально важных качеств в ходе реализации существующих образовательных программ. Определен оптимальный подход к оценке надежности профессиональной деятельности персонала, работающего с ПБА I–II групп патогенности, для чего разработан алгоритм определения уровня профессиональной подготовленности персонала, допускаемого к работам с ПБА I–II групп, созданы профессиограммы профессиональных групп работников, допускаемых к работам с ПБА I–II групп. Разработанные методики экспертной оценки профессионально важных качеств персонала позволяют провести их идентификацию с использованием наборов психологических тестов и имеют значение для целей профотбора и профориентации специалистов как при устройстве на работу, так и при обучении, а также позволяют снизить риски, связанные с влиянием человеческого фактора.
Целью работы является изучение роли резидентных плазмид pMT1, pCD1 и pPCP1в образовании экстрацеллюлярной формы липополисахарида (ЛПС) Yersinia pestis.
Материалы и методы. Работа выполнена на штамме Y. pestis EV76 (pMT1, pCD1 и pPCP1), содержащем полный набор плазмид, бесплазмидном варианте Y. pestis EV76 (pMT1–, pCD1–, pPCP1–) и изогенных клонах, содержащих одну плазмиду: Y. pestis EV76 (pMT1), Y. pestis EV76 (pCD1), Y. pestis EV76 (pPCP1). О присутствии внеклеточной формы ЛПС в среде икубации клеток Y. pestis EV76 судили по токсичности супернатантов для биопробных животных и по реакции LAL-теста.
Результаты и выводы. Установлено, что экстрацеллюлярную форму ЛПС образуют 37-градусные культуры Y. pestis EV76 полноценного штамма и вариантов, содержащих pMT1 или pCD1 плазмиды. Культуры, лишенные плазмид, и вариант, содержащий плазмиду pPCP1, такой способностью не обладают. По результатам LAL-теста процесс отделения ЛПС от мембраны клеточной стенки во внешнюю среду сопряжен с транслокацией белков, кодируемых плазмидами pMT1и pCD1, и является естественной формой жизнедеятельности клеток чумного микроба. Участие плазмиды pCD1 в реализации токсического потенциала ЛПС Y. pestis установлено впервые.
БИОТЕХНОЛОГИЯ, ИММУНОЛОГИЯ 
Цель работы. Оценка влияния иммуномодуляторов на интенсивность пост-апоптотического лизиса лейкоцитов сенсибилизированного организма в присутствии специфических антигенов туляремийного микроба в условиях in vitro.
Материалы и методы. В работе использовался метод проточной цитофлуориметрии для определения относительного содержания пролиферирующих и апоптотических спленоцитов мышей, иммунизированных против туляремии на фоне иммуномодуляции.
Результаты и выводы. В работе получена информация, которая согласуется с современными данными о массивном апоптозе и пост-апоптотическом аутолизисе (вторичном некрозе) лейкоцитов при туляремийной инфекции. Учитывая важную роль лейкоцитолиза в развитии системной воспалительной реакции, для снижения реактогенных свойств живой туляремийной вакцины может быть перспективно использование иммуномодуляторов, подавляющих апоптоз макрофагов и лизис погибших лейкоцитов при взаимодействии с антигенами Francisella tularensis.
Цель исследования: определение аллельных вариантов гаплотипов HLA II класса у лиц, проживающих в Республике Калмыкия на территории Прикаспийского песчаного природного очага чумы, иммунизированных по эпидпоказаниям вакциной живой чумной, и поиск ассоциаций гаплотипов HLA II класса с особенностями развития поствакцинального иммунитета.
Материалы и методы. В исследовании принимали участие 20 человек. HLA-типирование проводили методом мультиплексной ПЦР. Продукцию иммунорегуляторных цитокинов и титры антител к фракции 1 чумного микроба определяли методом иммуноферментного анализа. Статистическую обработку результатов проводили с использованием стандартных программ.
Результаты и выводы. Определены аллельные варианты гаплотипов HLA-DQA1, HLA-DQВ1 и HLA-DRB1 II класса главного комплекса гистосовместимости у 20 жителей Лаганского и Черноземельского районов Республики Калмыкия. Выявлены различия в соотношении аллельных вариантов HLA-DQA1 и продукции цитокинов INF-γ, TNF-α, IL-4 и IL-10 по районам проживания. Отмечено, что аллель HLA-DRB1*01 сопряжена с высоким уровнем спонтанной и индуцированной продукции IL-10 в различные сроки после ревакцинации ВЖЧ. Дальнейшее изучение генов, регулирующих развитие иммунитета, наряду с иммунологическими методами позволит персонифицировать применение существующей вакцины против чумы, а также прогнозировать иммуногенность и эффективность разрабатываемых профилактических препаратов.
Цель исследования: экспериментальное обоснование возможности получения лекарственной формы противохолерного иммуноэнтеросорбента в форме таблетки.
Материалы и методы: Экспериментальный антитоксический противохолерный иммуноэнтеросорбент, стабилизированный методом лиофильного высушивания. Остаточную влажность лиофилизата энтеросорбента определяли с использованием влагомера Sartorius MA 150. Ситовой анализ порошков и гранулятов проводили просеиванием образцов сыпучего материала через набор сит с отверстиями различного размера. Определение насыпной плотности проводили с помощью прибора SVM-10. Гранулирование специфического энтеросорбента проводили на аппарате GPCG 2 LabSystem. Изготовление таблеток осуществляли на таблеточном прессе MiniTabT. Определение твердости таблеток проводили с использованием тестера TBH 125 TD. Испытания на истираемость таблеток осуществляли на приборе GTA 120.
Результаты и выводы. Экспериментально обосновано использование в качестве вспомогательных веществ для гранулирования лактозы моногидрата, целлюлозы микрокристаллической и поливинилпирролидона. Установлено, что полученный гранулят с удовлетворительными значениями технологических характеристик может являться основой для готовой лекарственной формы специфического энтеросорбента. Определена оптимальная масса таблеток-ядер противохолерного энтеросорбента. Показана возможность применения кишечнорастворимого покрытия Acryleze для нанесения защитной оболочки на таблетки. Изучена специфическая активность таблетированного энтеросорбента в тесте in vitro, подтверждена его устойчивость в условиях, моделирующих желудочно-кишечный тракт. В результате проведенных исследований разработана технология получения противохолерного антитоксического иммуноэнтеросорбента – таблетки, покрытой кишечнорастворимой оболочкой. В долгосрочных испытаниях при хранении сконструированного лечебно-профилактического препарата при температуре от 4 до 8 °С в течение 24 мес (срок наблюдения) выявлено сохранение активности энтеросорбента, что свидетельствует о его стабильности, определен срок годности специфического противохолерного иммуноэнтеросорбента в таблетированной форме.
Цель: оптимизация технологической схемы получения препарата для генной диагностики чумы с гибридизационно-флуоресцентным учетом результатов, связанная с подбором условий синтеза и метода очистки входящих в состав набора олигонуклеотидных зондов, несущих метки флуорофора (6-карбоксифлуоресцеин) и гасителя флуоресценции (Black Hole Quencher-1), оценка их качества и внедрения новой технологической линии в производство.
Материалы и методы. Объектом для исследования являлся набор реагентов «Ген Yersinia pestis идентификация–РГФ» и входящие в его состав праймеры и зонд, обеспечивающие амплификацию hmsH гена. Синтез праймеров и зондов осуществляли в восьмиканальном синтезаторе ДНК ASM-800 (Биоссет, Россия) твердофазным фосфитамидным методом. Для проведения исследований использовали очистку полученных зондов либо с помощью электрофореза в 20 % полиакриламидном геле размером 20×20 или 8×10 см с последующей очисткой на RP-картриджах в полуавтоматическом режиме на системе OPS-201 и вручную, либо только с RP- картриджами вручную, либо методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ). Специфическую активность полученных зондов проверяли в полимеразной цепной реакции с использованием ДНК, выделенной из бактериальных суспензий штамма Yersinia pestis C-624 с концентрациями 1·103 – 1·106 м.к./мл.
Результаты и выводы. Оптимизирована технология синтеза и подобран метод очистки олигонуклеотидных зондов, несущих флуорофор-6-карбоксифлуоресцеин и гаситель флуоресценции Black Hole Quencher-1. Показана целесообразность использования для очистки таких олигонуклеотидов, либо комплекса ВЭЖХ, либо электрофореза в 20 % полиакриламидном геле с 7 М мочевиной и последующей хроматографией на RP-картриджах в ручном режиме. Внедрение оптимизированной технологической схемы при производстве препаратов для генной индикации идентификации особо опасных патогенов с гибридизационно-флуоресцентной детекцией позволит сократить сроки их изготовления на 50 % и снизить себестоимость на 66 %.
ИНФОРМАЦИЯ 
ПАМЯТИ КОЛЛЕГИ 
ISSN 2658-719X (Online)