Вариабельность генов cef токсигенных и нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae О1


https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-4-50-55

Полный текст:


Аннотация

Целью исследования явился сравнительный биоинформационный анализ генов и белков Cef (CHO cell elongating factor) холерных вибрионов О1 серогруппы. Материалы и методы. В работе использовано 36 штаммов Vibrio cholerae О1 из коллекции Ростовcкого противочумного института. Секвенирование ДНК проводили на платформе MiSeq (Illumina), для идентифицации генов и анализа использовали программы BioEdit 7.2.5, BLASTN 2.2.29, BLASTP, MEGA 7, Vector NTI Advance 11. Результаты и выводы. Полученные данные подтвердили достаточно высокую консервативность Cef у холерогенных штаммов (несущих гены холерного токсина ctxAB в составе интегрированного в геном профага CTX): все они содержали близкородственные прототипные аллели cefС или cefЕ1. Аллель Е1 обнаружена также у ctxAB– штаммов, содержащих профаг pre-CTX, и всего у одного лишенного обоих профагов. У остальных CTX–/pre-CTX– вибрионов идентифицировано четыре новых, ранее не описанных варианта Cef, два из которых (Е2 и Е3), принадлежащие штаммам, выделенным в России, оказались уникальными, тогда как для двух других (Е4 и Е5) в NCBI были найдены полные гомологи. При этом в группу носителей cefЕ4 попали несколько штаммов, вызывавших у людей тяжелые холероподобные заболевания. Поскольку Cef является одним из факторов патогенности/персистенции холерных вибрионов, мы полагаем, что сохранение в процессе естественного отбора его измененных вариантов несет определенный биологический смысл с точки зрения возможного приобретения ими свойств, существенных для реализации возбудителями как патогенетического, так и персистентного потенциала.

Об авторах

Е. В. Монахова
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40


Р. В. Писанов
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40


С. В. Титова
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40


М. И. Ежова
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40


С. А. Иванов
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Россия
Российская Федерация, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М.Горького, 117/40


Список литературы

1. Монахова Е.В. Стратегия вирулентности холерных вибрионов и пути ее реализации. Пробл. особо опасных инф. 2013; 4:60–8.

2. Монахова Е.В., Писанов Р.В., Мазрухо А.Б., Маркина О.В., Алексеева Л.П. Свойства Cef (CHO cell elongating factor) холерных вибрионов: биоинформационный анализ и экспериментальные данные. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2012; 2:10–4.

3. Писанов Р.В., Монахова Е.В., Шалу О.А. Точковая мутация в гене cef (CHO cell elongating factor) Vibrio cholerae O139 приводит к изменению субстратной специфичности его продукта. Генетика. 2012; 48(2):275–9.

4. Islam A., Labbate M., Djordjevic S.P., Alam M., Darling A., Melvold J., Holmes A.J., Johura F.T., Cravioto A., Charles I.G., Stokes H.W. Indigenous Vibrio cholerae strains from a non-endemic region are pathogenic. Open Biol. 2013; 3:120181. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3603452. DOI: 10.1098/rsob.120181.

5. Lugo M.R., Merrill A.R. The father, son and cholix toxin: the third member of the DT group mono-ADP-ribosyltransferase toxin family. Toxins (Basel). 2015; 7(8):2757–72. DOI: 10.3390/toxins7082757.

6. McCardell B.A., Kothary M.H., Hall R.N., Sathyamoorthy V. Identification of a CHO-elongating factor produced by Vibrio cholerae O1. Microb. Pathog. 2000; 29(1):1–8. DOI: 10.1006/mpat.2000.0361.

7. McCardell B.A., Sathyamoorthy V., Michalski J., Lavu S., Kothary M., Livezey J., Kaper J.B., Hall R. Cloning, expression and characterization of the CHO cell elongating factor (Cef) from Vibrio cholerae O1. Microb. Pathog. 2002; 32(4):165–72. DOI: 10.1006/mpat.2001.0492.

8. Osama A., Gan H.M., The C.S., Yap K.P., Thong K.L. Genome sequence and comparative genomics analysis of a Vibrio cholerae O1 strain isolated from a cholera patient in Malaysia. J. Bacteriol. 2012; 194(24):6933. DOI: 10.1128/JB.01832-12.

9. Saha P.K., Koley H., Mukhopadhyay A.K., Bhattacharya S.R., Nair G.B., RamaKrishnan S.T., Takeda Y. Nontoxigenic Vibrio cholerae O1 serotype Inaba biotype El Tor associated with a cluster of cases of cholera in Southern India. J. Clin. Microbiol. 1996; 34(5):1114–7.

10. Vezzulli L., Pruzzo C., Huq A., Colwell R.R. Environmental reservoirs of Vibrio cholerae and their role in cholera. Environ. Microbiol. Rep. 2010; 2(1):27–3. DOI: 10.1111/j.1758-2229.2009.00128.x.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Монахова Е.В., Писанов Р.В., Титова С.В., Ежова М.И., Иванов С.А. Вариабельность генов cef токсигенных и нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae О1. Проблемы особо опасных инфекций. 2017;(4):50-55. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-4-50-55

For citation: Monakhova E.V., Pisanov R.V., Titova S.V., Ezhova M.I., Ivanov S.A. Variability of cef Genes in Toxigenic and Non-Toxigenic Vibrio cholerae O1 Strains. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2017;(4):50-55. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2017-4-50-55

Просмотров: 155

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)