Вариабельные локусы генов napa, aspa, rhas, zwf и tcab как эффективные ДНК-мишени для генотипирования штаммов Yersinia pestis
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2010-2(104)-57-59
Аннотация
Выявлена изменчивость нуклеотидных последовательностей генов жизнеобеспечения napA, aspA, rhaS, zwf и tcaB у природных штаммов Yersinia pestis основного и неосновных подвидов из различных природных очагов чумы. Установлено, что использование вариабельных локусов этих генов позволяет проводить внутривидовую дифференциацию штаммов возбудителя чумы и определять принадлежность изучаемого штамма к определенному подвиду или биовару.
Об авторах
Г. А. Ерошенко
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Г. Н. Одиноков
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Л. М. Куклева
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
А. И. Павлова
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Н. Ю. Шавина
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Я. М. Краснов
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Н. П. Гусева
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
В. В. Кутырев
Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб»
Россия
Россия
Список литературы
1. Ерошенко Г.А., Видяева Н.А., Одиноков Г.Н. и др. Структурно-функциональный анализ гена araC у штаммов Yersinia pestis различного происхождения. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2009; 3:21-6.
2. Ерошенко Г.А., Одиноков Г.Н., Краснов Я.М., Гусева Н.П., Кутырев В.В. Вариабельность генов aspA у штаммов Yersinia pestis основного и неосновного подвидов. Пробл. особо опасных инф. 2009; 1(99):52-4.
3. Волков Ю.П., Ерошенко Г.А. Анализ эффективности некоторых методов построения филогенетических деревьев, используемых при оценке эволюционного родства микроорганизмов. Пробл. особо опасных инф. 2009; 1(99):35-41.
4. Куклева Л.М. Ерошенко Г.А., Куклев В.Е. и др. Изучение вариабельности нуклеотидной последовательности генов rha локуса у штаммов Yersinia pestis основного и неосновных подвидов. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2008; 2:23-7.
5. Achtman M., Zurth K., Morelli G. et al. Yersinia pestis, the cause of plague, is a recently emerged clone of Yersinia pseudotuberculosis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999; 96(24):14043-8.
6. Kotetishvili M., Kreger A., Wauters G. et al. Multilocus sequence typing for studying genetic relationships among Yersinia species. J. Clin. Microbiol. 2005; 43(6):2674-84.
7. Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1977; 74(12):5463-7.
Рецензия
Для цитирования:
Ерошенко Г.А., Одиноков Г.Н., Куклева Л.М., Павлова А.И., Шавина Н.Ю., Краснов Я.М., Гусева Н.П., Кутырев В.В. Вариабельные локусы генов napa, aspa, rhas, zwf и tcab как эффективные ДНК-мишени для генотипирования штаммов Yersinia pestis. Проблемы особо опасных инфекций. 2010;(2(104)):57-59. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2010-2(104)-57-59
For citation:
Eroshenko G.A., Odinokov G.N., Koukleva L.M., Pavlova A.I., Shavina N.Yu., Krasnov Ya.M., Gouseva N.P., Kutyrev V.V. Variable Loci of the napA, rhaS, zwf and tcaB Genes as Effective DNA-Targets for Yersinia pestis Strains Genotyping. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2010;(2(104)):57-59. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2010-2(104)-57-59
Просмотров:
537
Послать статью по эл. почте 