Preview

Problems of Particularly Dangerous Infections

Advanced search

Variable Loci of the napA, rhaS, zwf and tcaB Genes as Effective DNA-Targets for Yersinia pestis Strains Genotyping

https://doi.org/10.21055/0370-1069-2010-2(104)-57-59

Abstract

Variability of the nucleotide sequences of the napA, rhaS, zwf and tcaB genes was elucidated in natural Yersinia pestis strains of the main and non-main subspecies from different natural plague foci. Use of variable loci of these genes enables to carry out intra-species differentiation of plague microbe strains and attribute the studied strain to certain subspecies or biovar.

About the Authors

G. A. Eroshenko
Russian Research Anti-Plague Institute Microbe
Russian Federation


G. N. Odinokov
Russian Research Anti-Plague Institute Microbe
Russian Federation


L. M. Koukleva
Russian Research Anti-Plague Institute Microbe
Russian Federation


A. I. Pavlova
Russian Research Anti-Plague Institute Microbe
Russian Federation


N. Yu. Shavina
Russian Research Anti-Plague Institute Microbe
Russian Federation


Ya. M. Krasnov
Russian Research Anti-Plague Institute Microbe
Russian Federation


N. P. Gouseva
Russian Research Anti-Plague Institute Microbe
Russian Federation


V. V. Kutyrev
Russian Research Anti-Plague Institute Microbe
Russian Federation


References

1. Ерошенко Г.А., Видяева Н.А., Одиноков Г.Н. и др. Структурно-функциональный анализ гена araC у штаммов Yersinia pestis различного происхождения. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2009; 3:21-6.

2. Ерошенко Г.А., Одиноков Г.Н., Краснов Я.М., Гусева Н.П., Кутырев В.В. Вариабельность генов aspA у штаммов Yersinia pestis основного и неосновного подвидов. Пробл. особо опасных инф. 2009; 1(99):52-4.

3. Волков Ю.П., Ерошенко Г.А. Анализ эффективности некоторых методов построения филогенетических деревьев, используемых при оценке эволюционного родства микроорганизмов. Пробл. особо опасных инф. 2009; 1(99):35-41.

4. Куклева Л.М. Ерошенко Г.А., Куклев В.Е. и др. Изучение вариабельности нуклеотидной последовательности генов rha локуса у штаммов Yersinia pestis основного и неосновных подвидов. Мол. генет., микробиол. и вирусол. 2008; 2:23-7.

5. Achtman M., Zurth K., Morelli G. et al. Yersinia pestis, the cause of plague, is a recently emerged clone of Yersinia pseudotuberculosis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999; 96(24):14043-8.

6. Kotetishvili M., Kreger A., Wauters G. et al. Multilocus sequence typing for studying genetic relationships among Yersinia species. J. Clin. Microbiol. 2005; 43(6):2674-84.

7. Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1977; 74(12):5463-7.


Review

For citations:


Eroshenko G.A., Odinokov G.N., Koukleva L.M., Pavlova A.I., Shavina N.Yu., Krasnov Ya.M., Gouseva N.P., Kutyrev V.V. Variable Loci of the napA, rhaS, zwf and tcaB Genes as Effective DNA-Targets for Yersinia pestis Strains Genotyping. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2010;(2(104)):57-59. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2010-2(104)-57-59

Views: 540


Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)