Preview

Проблемы особо опасных инфекций

Расширенный поиск

Использование методов молекулярного типирования Bacillus anthracis в Референс-центре по мониторингу за возбудителем сибирской язвы

https://doi.org/10.21055/0370-1069-2011-4(110)-68-70

Полный текст:

Аннотация

В работе представлены результаты молекулярного типирования B. anthracis в рамках деятельности Референс-центра по мониторингу за возбудителем сибирской язвы. Обобщен опыт использования генотипирования при проведении эпидемиологического расследования вспышек сибирской язвы. Отмечено, что MLVA-генотипирование с анализом от 8 до 25 VNTR-локусов при изучении штаммов B. anthracis, выделенных в Российской Федерации и на сопредельных территориях, позволяет проводить корректное сравнение генотипов с данными всемирной MLVA-базы данных. Определены основные задачи Референс-центра по разработке подходов к генотипированию возбудителя сибирской язвы, к числу которых относится изучение возможности использования дополнительных методов генотипирования, таких как анализ SNP, SNR с оценкой вариабельности описанных локусов и поиском новых полиморфных областей.

Об авторах

А. Г. Рязанова
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


Е. И. Еременко
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


О. И. Цыганкова
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


Е. А. Цыганкова
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


А. Н. Куличенко
Ставропольский научно-исследовательский противочумный институт
Россия


Список литературы

1. Еременко Е.И., Рязанова А.Г., Цыганкова Е.А., Цыганкова О.И., Куличенко А.Н. Генотипические особенности штаммов Bacillus anthracis c разным проявлением признаков, ассоциированных с патогенностью. Пробл. особо опасных инф. 2010; 2(104):53-6.

2. Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности. Методические указания МУ 1.3.2569-09. М.; 2009.

3. Цыганкова О.И., Еременко Е.И., Брюханов А.Ф., Абгарян А.Г., Ефременко В.И., Рязанова А.Г. Генотипирование штаммов сибиреязвенного микроба на территории стран СНГ. Журн. микробиол, эпидемиол. и иммунобиол. 2003; 6(приложение):51-6.

4. Шишкова Н.А., Мокриевич А.Н., Платонов М.Е., Светоч Т.Э., Маринин Л.И. Изучение генетического разнообразия штаммов сибиреязвенного микроба из коллекции ГНЦ ПМБ. Пробл. особо опасных инф. 2010; 2(104):60-5.

5. Keim P., Price L.B., Klevytska A.M., Smith K.L., Schupp J.M., Okinaka R. et al. Multiple locus variable namber tandem repeat analysis reveals genetic relationships within Bacillus anthracis. J. Bacteriol. 2000; 182(10):2928-36.

6. Le Fleche P., Hauck Y., Onteniente L., Prieur A., Denoeud F., Ramisse V. et al. A tandem repeats database for bacterial genomes: application to the genotyping of Yersinia pestis and Bacillus anthracis. BMC Microbiology. 2001; 1:2.

7. Lista F., Faggioni G., Valjevac S., Ciammaruconi A., Vaissaire J., Doujet C. et al. Genotyping of Bacillus anthracis strains based on automated capillary 25-loci multiple locus variable-number tandem repeats analysis. BMC Microbiol. 2006; 6:33.

8. Stratilo C.W., Lewis C.T., Bryden L., Mulvey M.R., Bader D. Single-nucleotide repeat analysis for subtyping Bacillus anthracis isolates. J. Clin. Microbiol. 2006; 44(3):777-82.

9. Van Ert M.N., Easterday W.R., Huynh L.Y. et al. Global Genetic Population Structure of Bacillus anthracis. PLoS ONE. 2007; 2(5):e461.


Для цитирования:


Рязанова А.Г., Еременко Е.И., Цыганкова О.И., Цыганкова Е.А., Куличенко А.Н. Использование методов молекулярного типирования Bacillus anthracis в Референс-центре по мониторингу за возбудителем сибирской язвы. Проблемы особо опасных инфекций. 2011;(4(110)):68-70. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2011-4(110)-68-70

For citation:


Ryazanova A.G., Eremenko E.I., Tsygankova O.I., Tsygankova E.A., Kulichenko A.N. Application of Bacillus anthracis Molecular Typing Methods by the Reference Center for the Anthrax Agent Monitoring. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2011;(4(110)):68-70. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2011-4(110)-68-70

Просмотров: 82


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)