Применение молекулярных методов типирования при изучении штаммов риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки и вируса бешенства


https://doi.org/10.21055/0370-1069-2012-1(111)-77-80

Полный текст:


Аннотация

Проведена идентификация и типирование 50 штаммов риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки (КПЛ) и 36 штаммов лиссавирусов из рабочих коллекций ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» с использованием молекулярно-биологических, эпидемиологических и биоинформационных подходов. Определено таксономическое положение исследованных культур риккетсий группы КПЛ. Проведено районирование территории Российской Федерации по распространению патогенных риккетсий группы КПЛ в хозяевах - иксодовых клещах. Рассмотрены вопросы распространения лиссавирусов на территории Сибири.

Об авторах

С. Н. Шпынов
Омский НИИ природно-очаговых инфекций. Омская государственная медицинская академия
Россия


Е. М. Полещук
Омский НИИ природно-очаговых инфекций
Россия


Н. В. Рудаков
Омский НИИ природно-очаговых инфекций. Омская государственная медицинская академия
Россия


И. Е. Самойленко
Омский НИИ природно-очаговых инфекций
Россия


Т. А. Решетникова
Омский НИИ природно-очаговых инфекций
Россия


Л. В. Кумпан
Омский НИИ природно-очаговых инфекций. Омская государственная медицинская академия
Россия


А. Н. Коломеец
Омский НИИ природно-очаговых инфекций
Россия


Г. Н. Сидоров
Омский НИИ природно-очаговых инфекций
Россия


С. Е. Ткачёв
Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
Россия


С. В. Грибенча
Научно-исследовательский институт вирусологии имени Д.И. Ивановского РАМН
Россия


Список литературы

1. Ботвинкин А.Д., Отгонбаатар Д. Бешенство на сопредельных территориях России и Монголии (исторический обзор). Сибирский мед. журн. 2006; 7:8-10.

2. Шпынов С.Н., Рудаков Н.В. Районирование территории Российской Федерации по распространению патогенных риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки. Мед. паразитол. и паразитарн. бол. 2008; 4:26-30.

3. Boldbaatar B., Inoue S., Tuya N., Dulam P., Batchuluun D., Sugiura N. et al. Molecular Epidemiology of Rabies Virus in Mongolia, 2005-2008. Jpn. J. Infect. Dis. 2010; 63(5):358-63.

4. Dessen P., Fondrat C., Valencien C., Mugnier C. BISANCE: a French service for access to biomolecular sequence databases. Comput. Appl. Biosci. 1990; 6(4):355-6.

5. Fournier P.-E., Roux V., Raoult D. Phylogenetic analysis of spotted fever group rickettsiae by study of the outer surface protein rOmpA. Int. J. Syst. Bacteriol. 1998; 48(3):839-49.

6. Fournier P.-E., Dumler J.S., Greub G., Zhang J., Wu Y., Raoult D. Gene sequence-based criteria for identification of new rickettsia isolates and description of Rickettsia heilongjiangensis sp. nov. J. Clin. Microbiol. 2003; 41(12):5456-65.

7. Johnson N., Black С., Smith J., Un H., McElhinney L.M., Aylan O., Fooks A.R. Rabies emergence among foxes in Turkey. J. Wildl. Dis. 2003; 39(2):262-70.

8. Kimura M.A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequence. J. Mol. Evol. 1980; 16:111-20.

9. Kumar S., Tamura K., Jakobsen I.B., Nei M. MEGA2: molecular evolutionary genetics analysis software. Bioinformatics. 2001; 17:1244-5.

10. Kuzmin I.V., Botvinkin A.D., McElhinney L.M. et al. Molecular epidemiology of terrestrial rabies in the former Soviet Union. J. Wildl. Dis. 2004; 40(4):617-31.

11. Poleshchuk Е.М., Tkachev S.E., Gribencha S.V., Sidorov G.N. Rabies virus in Russia: phylogenetic relationships based on N gene sequences. In: Japan-Russia International Workshop 2010. The 54th ISTC Japan Workshop. Current Life-Threatening Infections. Medical Countermeasures. Medical Exchange and Networks. Tokyo-Niigata; 2010. P. 28-9.

12. Roux V., Rydkina E., Eremeeva M., Raoult D. Citrate synthase gene comparison, a new tool for phylogenetic analysis, and its application for the rickettsiae. Int. J. Syst. Bacteriol. 1997;47:252-61.

13. Rudakov N.V., Schpynov S.N., Samoylenko I.E., Fournier P.-E., Reschetnikova T.A., Kumpan L.V., Raoult D. Characterisation of the Omsk collection of rickettsial strains. Clin. Microbiol. Infect. 2009; 15 Suppl 2:298-9.

14. Shpynov S.N., Fournier P.-E., Rudakov N.V., Samoilenko I.E., Reshetnikova T.A., Yastrebov V.K. et al. Short report: Molecular identification of a collection of spotted fever group rickettsiae obtained from patients and ticks from Russia. Am. J. Trop. Med. Hyg . 2006; 74(3):440-3.

15. Tordo N., Poch O., Ermine А., Keith G., Rougeon F. Walking along the rabies genome: Is the large G-L intergenic region a remnant gene? Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1986; 83:3914-8.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Шпынов С.Н., Полещук Е.М., Рудаков Н.В., Самойленко И.Е., Решетникова Т.А., Кумпан Л.В., Коломеец А.Н., Сидоров Г.Н., Ткачёв С.Е., Грибенча С.В. Применение молекулярных методов типирования при изучении штаммов риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки и вируса бешенства. Проблемы особо опасных инфекций. 2012;(1(111)):77-80. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2012-1(111)-77-80

For citation: Shpynov S.N., Poleshchuk E.M., Rudakov N.V., Samoilenko I.E., Reshetnikova T.A., Kumpan L.V., Kolomeets A.N., Sidorov G.N., Tkachev S.E., Gribencha S.V. Application of Molecular Typing Methods for Analysis of Strains of Rickettsiae of the Spotted Fever Group and Rabies Virus. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2012;(1(111)):77-80. (In Russ.) https://doi.org/10.21055/0370-1069-2012-1(111)-77-80

Просмотров: 42

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0370-1069 (Print)
ISSN 2658-719X (Online)